Как правильно сдавать кал: ОБЩИЕ РЕКОМЕНДАЦИИ И ПРАВИЛА ПОДГОТОВКИ ДЛЯ СБОРА И СДАЧИ АНАЛИЗОВ КАЛА

• ▪ Противомикробные препараты
• ▪ Иммунодепрессанты
• ▪ Химиотерапия

Ежедневное использование более трех месяцев:

• ▪ Ингибиторы протонной помпы

• ▪ В личном анамнезе были хронические желудочно-кишечные заболевания, в том числе функциональные желудочно-кишечные расстройства; воспалительное заболевание кишечника; глютеновая болезнь; другие хронические гастроэнтерологические заболевания или недавние аномальные желудочно-кишечные симптомы (например,g., диарея, гематохезия и т. д.)
• ▪ В личном анамнезе онкологические заболевания, включая рак желудочно-кишечного тракта или синдром полипоза, и семейный анамнез первой степени преждевременного рака толстой кишки
• ▪ В личном анамнезе системные аутоиммунные расстройства
• ▪ Ожирение (тело индекс массы> 30) и / или метаболический синдром / диабет
• ▪ Личный анамнез неврологических / нейродегенеративных расстройств
• ▪ Личный анамнез психических / неврологических состояний

• ▪ История ВИЧ, вирусов гепатита В или С, сифилиса, Т-лимфотропных вирусов человека I и II
• ▪ Текущая системная инфекция
• ▪ Использование запрещенных наркотиков
• ▪ Сексуальное поведение высокого риска
• ▪ Предыдущие ткани / трансплантация органов
• ▪ Недавняя госпитализация или выписка из учреждений длительного ухода
• ▪ Путешествия с повышенным риском
• ▪ Несчастный случай с уколом иглой за последние шесть месяцев
• ▪ Татуировка на теле, пирсинг, серьги, иглоукалывание за последние шесть месяцев
• ▪ Инфекция кишечным патогеном за последние два месяца
• ▪ Острый гастроэнтерит с подтверждающим тестом или без него за последние два месяца
• ▪ История вакцинации живым аттенуированным вирусом за последние два месяца

• ▪ Полный анализ крови
• ▪ Фермент печени (аминотрансферазы)
• ▪ Билирубин
• ▪ Креатинин
• ▪ C-реактивный белок
• ▪ Серология на вирус гепатита (HAV, HBV, HCV, HEV) и вирус иммунодефицита человека (ВИЧ)

• ▪
  Clostridium difficile
• ▪ Giardia lamblia, Cryptosporidium spp, Isospora и Microsporidia
• ▪ Простейшие, гельминты и паразиты (включая Blastocystis hominis и Dientamoeba fragilis ▪ ▪ Антибиотики, устойчивые к патогенным бактериям
• 3, включая бактерии, устойчивые к патогенным бактериям
• 3 Salmonella , Shigella , Campylobacter , продуцирующий токсин шига Escherichia coli , Yersinia и Vibrio cholerae
• ▪ Норовирус, ротавирус, аденовирус
• 2 9033 антигенерикобактерия 9033 9033

  Фактически, анализ крови должен включать полный анализ крови, ферменты печени, креатинин и С-реактивный белок для проверки общего клинического состояния, серологию на вирус гепатита и вирус иммунодефицита человека (ВИЧ).Кроме того, анализы крови могут быть рассмотрены в случае аномалий первого раунда лабораторных тестов, эндемического распространения некоторых патогенов, появления новых патогенов или отдельных случаев реципиентов (например, с подавленным иммунитетом). В частности, ведутся споры о полезности серологии для ВЭБ и ЦМВ, поскольку высокая распространенность предшествующего заражения среди взрослых людей ослабляет диагностические возможности этого подхода, ограничивая клиническую применимость IgM к ЦМВ у доноров, предназначенных для реципиентов с подавленным иммунитетом.Конечно, нецелесообразно исключать субъектов, ранее подвергавшихся воздействию ВЭБ или ЦМВ, из донорской крови из-за маловероятного риска передачи, кроме случаев клинического или лабораторного подозрения на реактивацию. Наконец, кандидаты могут быть рассмотрены для тестирования серологии на нематод на основе социальных и географических особенностей и наличия тестов [13].

  Анализ стула должен включать общие кишечные патогены, Clostridium difficile , фекальные паразиты и антиген Helicobacter pylori (это последнее исследование только для верхнего пути доставки FMT).Кишечные патогены, которые также должны быть исследованы у бессимптомных субъектов, должны быть обнаружены с помощью традиционных методов (посев, микроскопия или тест на антиген) и / или с помощью молекулярной диагностики (панели на основе ПЦР), которые показали высокую специфичность и чувствительность по сравнению с обычными методами. методы экспресс-обнаружения возбудителей болезней [60]. Кроме того, обязательно проверять все образцы фекалий на наличие устойчивых к антибиотикам бактерий (включая метициллин-устойчивые Staphylococcus aureus (MRSA), устойчивые к ванкомицину энтерококки (VRE), энтеробактерии, продуцирующие β-лактамазы расширенного спектра, и устойчивые к карбапенемам). Enterobacteriaceae / Enterobacteriaceae, продуцирующую карбапенемазу), учитывая бремя желудочно-кишечного носительства у бессимптомных субъектов [61,62] и сообщения о некоторых серьезных побочных эффектах, связанных с сепсисом после FMT [13].В настоящее время, в связи с надвигающейся пандемией Covid-19, группа международных экспертов предложила включить в тесты на Sars-CoV-2 тщательный мазок из носоглотки и / или определение РНК в кале [63].

  Наконец, если все анализы крови и кала отрицательны, кандидат принимается на роль донора стула. В частности, в программе банка фекалий донор должен быть доступен для многократного пожертвования с течением времени. По этой причине рекомендуется повторять скрининговые тесты каждые 8–12 недель и проводить короткую анкету в тот же день сдачи крови, чтобы проверить, нет ли недавно начавшихся вредных явлений.

  В этом параграфе мы изложили общие правила выбора и скрининга потенциального донора на FMT, главным образом для лечения ИКД, которая излечивается восстанавливающим эффектом фекального переноса на микробиоту кишечника. Однако для других клинических показаний, которые находят свое объяснение в модификации метаболических и воспалительных путей, опосредованных микробиотой кишечника, было бы целесообразно определить конкретного донора для каждого случая. Этот вопрос будет обсуждаться позже.

  4. Выбор оптимального донора для FMT для лечения определенных заболеваний

  Правильный набор здоровых доноров важен для стандартизированной и безопасной процедуры FMT [11,13].FMT считается безопасной процедурой; однако легкие побочные эффекты, связанные с FMT, наблюдаются примерно у одной трети реципиентов, такие как самоограничивающийся дискомфорт в животе или изменение привычек кишечника, и, к сожалению, около 2–6% пациентов испытали серьезные побочные эффекты, такие как инфекция, рецидив ранее существовавшего заболевания или смерть [64]. Более того, трудность выбора подходящих кандидатов возрастает из-за возникающих опасений, таких как возможность передачи предполагаемых проканцерогенных бактерий [65] или потенциальный риск серьезных угрожающих жизни инфекций с множественными лекарственно-устойчивыми организмами после FMT [66].Более того, недавние данные показали, что эффективность FMT при лечении рецидивирующей ИКД, в клинических испытаниях и в других медицинских учреждениях, по-видимому, связана с различными переменными, такими как способы доставки фекального инфузата, подготовка кишечника, количество инфузий, тяжесть заболевания и, в частности, микробное разнообразие и состав пересаженного стула [32,44,67]. Поскольку идея о том, что вероятность успеха FMT может быть связана с микробиотой кишечника или другими особенностями донора, был введен термин «супердоноры» для обозначения идеальных людей, чей стул может обеспечить лучший результат для реципиентов по сравнению с другими. фекальные пожертвования [68].Следовательно, предполагая, что расстройства, связанные с дисбактериозом, были связаны с различными несбалансированными микробными сигнатурами [15], для восстановления эубиоза разумно предположить, что достижение правильного соответствия донор-реципиент с помощью целевого FMT на основе конкретных микробных нарушений может быть ключ к улучшению реакции FMT. Накопление доказательств подкрепляет эту гипотезу, что приводит к отказу от концепции «один стул для всех» и к поиску оптимального донора [68], как и в других процедурах трансплантации органов [69].

  4.1. Clostridium Difficile Infection

  Очевидно, что исследование идеального донора при рецидивирующей ИКД является широко обсуждаемой темой исследования. Например, одно исследование определило оптимального донора среди девяти здоровых кандидатов-вегетарианцев или веганов, выбрав кандидата со сбалансированным соотношением Bacteroidetes / Firmicutes, самым высоким альфа-разнообразием среди лиц, прошедших скрининг, и высокой концентрацией бутирата. Через 10 недель после однократного или многократного FMT ни у одного из 10 пациентов не было рецидива ИКД [70].Интересно, что виром кишечника также может играть роль в лечении ИКД [71]. Действительно, у пациентов с ИКД были зарегистрированы изменения кишечного вирома, отмеченные увеличением численности Caudovirales вместе с уменьшением разнообразия, богатства и равномерности Caudovirales . Более того, эрадикация CD была связана с колонизацией большего количества донорских контигов Caudovirales , обнаруженных в ходе последующего наблюдения. Эти данные, возможно, могут объяснить, почему инфузия бактериального фекального фильтрата привела к эффективному лечению ИКД [72] и сместила внимание на важность бактериофагов и потенциальную роль отбора доноров на основе их кишечного вирома.Наконец, некоторые авторы сообщили, что отбор конкретных штаммов кишечных бактерий с бактериальными культурами от здоровых доноров для приготовления смеси заменителя стула может быть выигрышной стратегией для лечения рецидивирующего и устойчивого к антибиотикам колита C. difficile [73,74]. Однако вполне вероятно, что соответствующее влияние на успех FMT при ИКД зависит от переноса всего фекального микробиома, а не конкретных бактериальных штаммов; кроме того, многообещающие результаты, сообщенные в исследовании, в котором переносится только фекальный фильтрат, предполагают преобладающую роль бактериофагов, а не специфического характера относительной численности кишечной микробиоты донора, смещая центральную роль от бактерий к вирусам в терапевтической проблеме FMT. в CDI; однако эти данные все еще являются предварительными и требуют подтверждения в дальнейших исследованиях.

  4.2. Воспалительное заболевание кишечника

  Многие исследования анализировали микробный профиль доноров и пытались связать его с клиническими и лабораторными результатами у пациентов с ВЗК. Клинические исходы и иммунологические изменения после FMT у пациентов с ВЗК были в значительной степени связаны с вариациями нескольких конкретных штаммов у реципиентов фекальной микробиоты [75]. Например, интенсивный FMT у пациентов с ЯК был связан с отрицательными результатами в случае изобилия Fusobacterium spp и Sutterella spp в фекальной микробиоте реципиентов после FMT [76].Кроме того, исследование, в котором участвовали рефрактерные пациенты с ЯК, сообщило, что предварительное лечение антибиотиком плюс повторные FMT с использованием фекального материала от донора с высоким бактериальным богатством и высоким относительным содержанием Akkermansia muciniphila , неклассифицированных Ruminococcaceae и Ruminococcus spp . с большей вероятностью вызывал ремиссию по сравнению с одними антибиотиками [67]. Как также описано в других исследованиях [41,77,78], вполне вероятно, что выбор доноров на основе их таксономического состава, в частности низкой или высокой численности конкретных штаммов, может отражать возможность будущих испытаний при ВЗК.С этой целью изучаются методы, направленные на предотвращение воспалительного ответа кишечной иммунной системы реципиента путем отбора совместимых доноров по их микробным профилям [79]. Кроме того, виром кишечника может представлять собой потенциальный маркер ответа FMT у пациентов с ЯК. В частности, результаты небольшой серии случаев показали, что респонденты FMT уже продемонстрировали до прохождения FMT значительно более низкое вирусное богатство эукариот, чем люди, не отвечающие на лечение. Более того, богатство донорского вирома не было связано с исходом FMT, как это предполагалось для бактерий [80].

  4.3. Другие новые показания

  Несколько доклинических и клинических исследований подтвердили обоснование выбора донора на основе микробного профиля кишечника при других заболеваниях, связанных с дисбактериозом кишечника. Действительно, в области противоракового лечения сообщалось, что микробиота может влиять на ответ на химиотерапию [81]. Доклинические исследования показали клиническое улучшение у мышей модели меланомы на терапии анти-PD-1, получавшей FMT от доноров с микробной сигнатурой меланомы, «подобной респондеру» (с высоким альфа-разнообразием и численностью Ruminococcaceae, Faecalibacterium , Bifidobacterium longum , Collinsella aerofaciens и Enterococcus faecium ) по сравнению с мышами, которые получали «нереагирующий» микробиом (характеризующийся низким микробным разнообразием и высокой относительной численностью Bacteroidales) [82,83].Тем не менее, испытания на людях, проверяющие влияние FMT на повышение ответа на лечение рака, все еще продолжаются [84].

  Недавно рандомизированное плацебо-контролируемое исследование FMT при СРК показало, что численность Streptococcus , Dorea , Lactobacillus и Ruminococcaceae spp в донорской микробиоте была связана с эффективностью симптомов СРК [44]. ]. Интересно, что в небольшом открытом клиническом исследовании оценивалось влияние длительного FMT с предварительным лечением антибиотиками у детей с аутизмом; Авторы сообщили об уменьшении желудочно-кишечных симптомов и улучшении поведения, а также об увеличении специфических родов у реципиентов ( Bifidobacterium , Prevotella и Desulfovibrio ).Напротив, Prevotella и Desulfovibrio были больше представлены у реципиентов после FMT, чем в донорских образцах, что позволяет предположить, что неизвестные факторы изменили экосистему кишечника, сделав ее более благоприятной для этих штаммов [85].

  В контексте метаболических заболеваний влияние доноров с аллогенным FMT после желудочного обходного анастомоза по сравнению с донорами с метаболическим синдромом на метаболизм глюкозы и другие параметры у пациентов с метаболическим синдромом, не получавших лечения.Авторы оценили снижение чувствительности к инсулину у реципиентов, получавших FMT от доноров с метаболическим синдромом, по сравнению с использованием послеоперационных доноров. Более того, они идентифицировали несколько микробных ОТЕ, возможно, предсказывающих метаболический ответ, предполагая связанный с микробиотой трансмиссивный механизм инсулинорезистентности [86]. Аналогичным образом, в другом исследовании сообщалось о значительном повышении чувствительности к инсулину вместе с измененным составом микробиоты у пациентов с метаболическим синдромом, получавших аллогенный FMT от худых доноров, по сравнению с теми, кто прошел аутологичный FMT [46].

  На сегодняшний день эти результаты кажутся многообещающими, но частично противоречивыми; таким образом, результаты должны быть подтверждены более убедительными доказательствами и стандартизированными клиническими испытаниями. Необходимы дальнейшие исследования для определения благоприятной микробной сигнатуры донора или других идеальных характеристик в условиях конкретного заболевания.

  5. Выводы и перспективы на будущее

  В этом обзоре был описан процесс скрининга доноров стула и опубликованы недавние доказательства, которые пытаются определить оптимального донора для каждого клинического состояния (Рисунок S1).

  На сегодняшний день клинические характеристики донора хорошо определены; в частности, им рекомендуется быть здоровыми добровольцами, ведущими сбалансированный образ жизни, без хронических заболеваний или семейного анамнеза метаболических заболеваний или рака, а определенные лабораторные обследования должны подтверждать отсутствие заболевания в настоящее время. Однако определение идеального донора с помощью микробиологического типирования стула в настоящее время не подходит. Прежде всего, понимание роли кишечной микробиоты в каждом хроническом заболевании является непременным условием, прежде чем выдвигать гипотезу о персонализированном подходе с помощью FMT.Фактически, хотя восстановительный механизм FMT при рецидивирующей ИКД теперь понят, все еще необходимо понимать многие аспекты лечения других хронических состояний. Были получены интересные доказательства дисбактериоза при ВЗК или других хронических состояниях, но противоположные результаты, полученные в клинических испытаниях FMT, могут быть оправданы выбором неподходящих доноров. Выявление микробиологических характеристик идеального донора для каждого заболевания представляется достижимой целью, но еще далеко не достигнута из-за отсутствия клинических исследований.Текущие данные все еще ограничены и недостаточны для объяснения и разрешения сложности взаимодействия между кишечным барьером и его ролью в хронических заболеваниях кишечника. Однако необходимы дальнейшие исследования, чтобы подтвердить обнадеживающие результаты, о которых сообщалось в последние годы. В частности, необходимо будет типизировать фекальную микробиоту донора и реципиента и понять, как факторы окружающей среды, такие как диета или индивидуальные особенности, могут способствовать (или нет) клиническому ответу на FMT.Понимание микробных характеристик оптимального донора, в частности, если они поддаются модификации посредством изменения образа жизни или фармакологических мер, могло бы увеличить терапевтический потенциал FMT.

  Вклад авторов

  Концептуализация, S.B. и A.G .; курирование данных, S.B., C.R.S. и С.П .; письменная — подготовка оригинального черновика, С.Б. и C.R.S .; написание — просмотр и редактирование, S.B., C.R.S., S.P., E.B., G.I., G.C. и A.G. Все авторы прочитали и согласились с опубликованной версией рукописи.

  Финансирование

  Это исследование не получало внешнего финансирования.

  Конфликт интересов

  Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.

  Ссылки

  1. Марчези Дж. Р., Адамс Д. Х., Фава Ф., Гермес Г. Д., Хиршфилд Г. М., Холд Г., Кураиши М. Н., Кинросс Дж., Смидт Х., Туохи К. М. и др. Микробиота кишечника и здоровье хозяина: новый клинический рубеж. Кишечник. 2016; 65: 330–339. DOI: 10.1136 / gutjnl-2015-309990. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 2.Биббо С., Яниро Г., Гасбаррини А., Каммарота Г. Трансплантация фекальной микробиоты: прошлое, настоящее и будущее. Минерва Гастроэнтерол. Диетол. 2017; 63: 420–430. [PubMed] [Google Scholar] 3. Du H., Kuang TT, Qiu S., Xu T., Gang Huan CL, Fan G., Zhang Y. Фекальные лекарства, используемые в традиционной медицинской системе Китая: систематический обзор их названий, исходных видов, традиционных видов использования и современные исследования. Подбородок. Med. 2019; 14:31. DOI: 10.1186 / s13020-019-0253-х. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 4.Бороди Т.Дж., Уоррен Э.Ф., Лейс С.М., Сураче Р., Эшман О., Сиаракас С. Бактериотерапия с использованием фекальной флоры: игра с движениями человека. J. Clin. Гастроэнтерол. 2004. 38: 475–483. DOI: 10.1097 / 01.mcg.0000128988.13808.dc. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 5. Гасбаррини Г., Бонвичини Ф., Граменци А. История пробиотиков. J. Clin. Гастроэнтерол. 2016; 50: S116 – S119. DOI: 10.1097 / MCG.0000000000000697. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 6. Эйсман Б., Силен В., Баском Г.С., Каувар А.Дж. Фекальная клизма как вспомогательное средство при лечении псевдомембранозного энтероколита.Операция. 1958; 44: 854–859. [PubMed] [Google Scholar] 7. Шван А., Шолин С., Троттестам У., Аронссон Б. Рецидивирующий энтероколит, вызванный Clostridium difficile, излечивается ректальной инфузией гомологичных фекалий. Ланцет. 1983; 2: 845. DOI: 10.1016 / S0140-6736 (83)

  -5. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 8. Ван Нуд Э., Вризе А., Ньивдорп М., Фуэнтес С., Зетендал Э.Г., де Вос В.М., Виссер С.Е., Куиджпер Э.Дж., Бартельсман Дж.Ф., Тейссен Дж.Г. и др. Дуоденальная инфузия донорских фекалий при рецидиве Clostridium difficile.N. Engl. J. Med. 2013; 368: 407–415. DOI: 10.1056 / NEJMoa1205037. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 9. Cammarota G., Masucci L., Ianiro G., Bibbo S., Dinoi G., Costamagna G., Sanguinetti M., Gasbarrini A. Рандомизированное клиническое испытание: трансплантация фекальной микробиоты с помощью колоноскопии по сравнению с ванкомицином для лечения рецидивирующего Clostridium difficile инфекционное заболевание. Алимент. Pharmacol. Ther. 2015; 41: 835–843. DOI: 10.1111 / apt.13144. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 10. Юноша И., Рассел Г. Х., Пиндар К., Зив-Баран Т., Саук Дж., Хохманн Э.Л. Оральная капсулированная трансплантация замороженной фекальной микробиоты при рецидиве инфекции Clostridium difficile. ДЖАМА. 2014; 312: 1772–1778. DOI: 10.1001 / jama.2014.13875. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 11. Каммарота Г., Яниро Г., Тилг Х., Раджилич-Стоянович М., Камп П., Сатокари Р., Сокол Х., Арккила П., Пинтус К., Харт А. и др. Европейская консенсусная конференция по трансплантации фекальной микробиоты в клинической практике. Кишечник. 2017; 66: 569–580. DOI: 10.1136 / gutjnl-2016-313017.[Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 12. Ли С.Х., Штайнер Т., Петроф Э.О., Смейджа М., Роско Д., Нематаллах А., Виз Дж. С., Коллинз С., Моайеди П., Кроутер М. и др. Трансплантация замороженной и свежей фекальной микробиоты и клиническое разрешение диареи у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridium difficile: рандомизированное клиническое испытание. ДЖАМА. 2016; 315: 142–149. DOI: 10.1001 / jama.2015.18098. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 13. Каммарота Г., Яниро Г., Келли К.Р., Маллиш Б.Х., Аллегретти Дж. Р., Кассам З., Путиньяни Л., Фишер М., Келлер Дж. Дж., Костелло С. П. и др. Международная консенсусная конференция по хранению стула для трансплантации фекальной микробиоты в клинической практике. Кишечник. 2019; 68: 2111–2121. DOI: 10.1136 / gutjnl-2019-319548. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 14. Кавайон Дж. М., Легу С. Столетие со дня смерти Эли Мечникова: провидец и выдающийся руководитель группы. Микробы заражают. 2016; 18: 577–594. DOI: 10.1016 / j.micinf.2016.05.008.[PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 15. Vandana U.K., Barlaskar N.H., Gulzar A.B.M., Laskar I.H., Kumar D., Paul P., Pandey P., Mazumder P.B. Связь микробиоты кишечника с болезнями человека. Биоинформация. 2020; 16: 196–208. DOI: 10.6026 / 97320630016196. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 16. Иэбба В., Тотино В., Гальярди А., Сантанджело Ф., Каччиотти Ф., Транкассини М., Манчини К., Цицероне С., Корацциари Э., Пантанелла Ф. и др. Эубиоз и дисбактериоз: две стороны микробиоты.New Microbiol. 2016; 39: 1–12. [PubMed] [Google Scholar] 17. Лозупоне С.А., Стомбо Дж. И., Гордон Дж. И., Янссон Дж. К., Найт Р. Разнообразие, стабильность и устойчивость микробиоты кишечника человека. Природа. 2012; 489: 220–230. DOI: 10,1038 / природа11550. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 20. Forbes JD, Chen CY, Knox NC, Marrie RA, El-Gabalawy H., de Kievit T., Alfa M., Bernstein CN, Van Domselaar G. Сравнительное исследование кишечной микробиоты при иммуноопосредованных воспалительных заболеваниях общий дисбактериоз существует? Микробиом.2018; 6: 221. DOI: 10.1186 / s40168-018-0603-4. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 21. Аллегретти Дж. Р., Маллиш Б. Х., Келли К., Фишер М. Эволюция использования трансплантации фекальной микробиоты и новые терапевтические показания. Ланцет. 2019; 394: 420–431. DOI: 10.1016 / S0140-6736 (19) 31266-8. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 22. Леффлер Д. А., Ламонт Дж. Т. Clostridium difficile. Инфекция. N. Engl. J. Med. 2015; 373: 287–288. DOI: 10.1056 / NEJMra1403772. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 23.Десаи К., Гупта С.Б., Дубберке Э.Р., Прабху В.С., Браун К., Маст Т.С. Эпидемиологическое и экономическое бремя Clostridium difficile в США: оценки на основе моделирования. BMC Infect. Дис. 2016; 16: 303. DOI: 10.1186 / s12879-016-1610-3. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 24. Макдональд Л.К., Гердинг Д.Н., Джонсон С., Баккен Дж.С., Кэрролл К.С., Коффин С.Э., Дубберке Э. Руководство по клинической практике для инфекции Clostridium difficile у взрослых и детей: обновление 2017 г., подготовленное Американским обществом инфекционных болезней (IDSA) и Обществом эпидемиологии здравоохранения Америки (SHEA) Clin.Заразить. Дис. Выключенный. Publ. Заразить. Дис. Soc. Являюсь. 2018; 66: 987–994. DOI: 10,1093 / cid / ciy149. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 25. Кумар В., Фишер М. Экспертное заключение по трансплантации фекальной микробиоты для лечения инфекции Clostridioides difficile и не только. Мнение эксперта. Биол. Ther. 2020; 20: 73–81. DOI: 10.1080 / 14712598.2020.1689952. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 26. Каммарота Г., Яниро Г., Магалини С., Гасбаррини А., Ги Д. Снижение хирургического вмешательства при инфекции Clostridium difficile после запуска программы трансплантации фекальной микробиоты.Аня. Междунар. Med. 2015; 163: 487–488. DOI: 10.7326 / L15-5139. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 27. Бриттон Р.А., Янг В. Взаимодействие между кишечной микробиотой и хозяином при устойчивости к колонизации Clostridium difficile. Trends Microbiol. 2012; 20: 313–319. DOI: 10.1016 / j.tim.2012.04.001. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 28. Биббо С., Лопетузо Л.Р., Яниро Г., Ди Риенцо Т., Гасбаррини А., Каммарота Г. Роль микробиоты и врожденного иммунитета в рецидивирующей инфекции Clostridium difficile.J. Immunol. Res. 2014; 2014: 462740. DOI: 10.1155 / 2014/462740. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 29. Weingarden A.R., Chen C., Bobr A., ​​Yao D., Lu Y., Nelson V.M., Sadowsky M.J., Khoruts A. Трансплантация микробиоты восстанавливает нормальный состав фекальных желчных кислот при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile. Являюсь. J. Physiol. Гастроинтест. Liver Physiol. 2014; 306: G310 – G319. DOI: 10.1152 / ajpgi.00282.2013. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 30. Вайнгарден А., Гонсалес А., Васкес-Баеза Й., Вайс С., Хамфри Г., Берг-Лайонс Д., Найтс Д., Унно Т., Бобр А., Кан Дж. И др. Динамические изменения в краткосрочном и долгосрочном бактериальном составе после трансплантации фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile. Микробиом. 2015; 3: 10. DOI: 10.1186 / s40168-015-0070-0. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 31. Кураиши М.Н., Видлак М., Бхала Н., Мур Д., Прайс М., Шарма Н., Икбал Т. Систематический обзор с метаанализом: эффективность трансплантации фекальной микробиоты для лечения рецидивирующей и резистентной инфекции Clostridium difficile.Алимент. Pharmacol. Ther. 2017; 46: 479–493. DOI: 10.1111 / apt.14201. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 32. Ianiro G., Maida M., Burisch J., Simonelli C., Hold G., Ventimiglia M., Gasbarrini A., Cammarota G. Эффективность различных протоколов трансплантации фекальной микробиоты при инфекции Clostridium difficile: систематический обзор и метаанализ . United Eur. Гастроэнтерол. J. 2018; 6: 1232–1244. DOI: 10.1177 / 2050640618780762. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 33. Дебаст С.Б., Бауэр М.П., Куиджпер Э.Дж. Европейское общество клинических инфекций D. Европейское общество клинической микробиологии и инфекционных заболеваний: Обновление руководства по лечению инфекции Clostridium difficile. Clin. Microbiol. Заразить. 2014; 20: 1–26. DOI: 10.1111 / 1469-0691.12418. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 34. Суравич К.М., Брандт Л.Дж., Бинион Д.Г., Анантакришнан А.Н., Карри С.Р., Гиллиган П.Х., МакФарланд Л.В., Меллоу М., Цукербраун Б.С. Рекомендации по диагностике, лечению и профилактике инфекций Clostridium difficile.Являюсь. J. Gastroenterol. 2013; 108: 478–498. DOI: 10.1038 / ajg.2013.4. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 35. Каммарота Г., Яниро Г., Чианчи Р., Биббо С., Гасбаррини А., Курро Д. Вовлечение микробиоты кишечника в патогенез воспалительного заболевания кишечника: потенциал для терапии. Pharmacol. Ther. 2015; 149: 191–212. DOI: 10.1016 / j.pharmthera.2014.12.006. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 36. Хан И., Уллах Н., Чжа Л., Бай Ю., Хан А., Чжао Т., Че Т., Чжан С. Изменение микробиоты кишечника при воспалительном заболевании кишечника (ВЗК): причина или следствие? Лечение ВЗК, направленное на микробиом кишечника.Возбудители. 2019; 8: 126. DOI: 10.3390 / pathogens8030126. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 37. Лопетузо Л.Р., Яниро Г., Аллегретти Дж. Р., Биббо С., Гасбаррини А., Скальдаферри Ф., Каммарота Г. Трансплантация фекалий при язвенном колите: текущие доказательства и будущие применения. Мнение эксперта. Биол. Ther. 2020; 20: 343–351. DOI: 10.1080 / 14712598.2020.1733964. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 38. Каммарота Г., Яниро Г. FMT при язвенном колите: ближе к поворотной точке. Nat.Преподобный Гастроэнтерол. Гепатол. 2019; 16: 266–268. DOI: 10.1038 / s41575-019-0131-0. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 39. Имдад А., Николсон М.Р., Таннер-Смит Е.Е., Закулар Дж. П., Гомес-Дуарте О.Г., Болье Д. Б., Акра С. Трансплантация фекалий для лечения воспалительного заболевания кишечника. Кокрановская база данных Syst. Ред.2018; 11: CD012774. DOI: 10.1002 / 14651858.CD012774.pub2. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 40. Костелло С.П., Конлон М.А., Эндрюс Дж.М.Трансплантация фекальной микробиоты при язвенном колите-ответ.ДЖАМА. 2019; 321: 2240–2241. DOI: 10.1001 / jama.2019.3950. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 41. Моайеди П., Суретт М.Г., Ким П.Т., Либертуччи Дж., Вулф М., Ониски К., Армстронг Д., Маршалл Дж. К., Кассам З., Райниш В. и др. Трансплантация фекальной микробиоты вызывает ремиссию у пациентов с активным язвенным колитом в рандомизированном контролируемом исследовании. Гастроэнтерология. 2015; 149: 102–109. DOI: 10.1053 / j.gastro.2015.04.001. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 42. Тарик Р., Дисброу М.Б., Дибайз Дж.К., Оренштейн Р., Саха С., Соланки Д., Лофтус Е. В., Парди Д. С., Ханна С. Эффективность трансплантации фекальной микробиоты при рецидиве, C. Сложная инфекция при воспалительном заболевании кишечника. Воспаление. Кишечник. DOI 2019: 10.1093 / ibd / izz299. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 43. Яниро Г., Эусеби Л.Х., Блэк К.Дж., Гасбаррини А., Каммарота Г., Форд А.С. Систематический обзор с метаанализом: Эффективность трансплантации фекальной микробиоты для лечения синдрома раздраженного кишечника. Алимент. Pharmacol.Ther. 2019; 50: 240–248. DOI: 10.1111 / apt.15330. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 44. Эль-Салхи М., Хатлебак Дж. Г., Гилья О. Х., Братен Кристофферсен А., Хаускен Т. Эффективность трансплантации фекальной микробиоты для пациентов с синдромом раздраженного кишечника в рандомизированном двойном слепом плацебо-контролируемом исследовании. Кишечник. 2020; 69: 859–867. DOI: 10.1136 / gutjnl-2019-319630. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 45. Вризе А., Ван Нуд Э., Холлеман Ф., Салоярви Дж., Кутте Р.С., Бартельсман Дж.Ф., Даллинга-Ти Г.М., Акерманс М.Т., Серли М.Дж., Узир Р. и др. Перенос кишечной микробиоты от худых доноров увеличивает чувствительность к инсулину у людей с метаболическим синдромом. Гастроэнтерология. 2012; 143: 913–916. DOI: 10.1053 / j.gastro.2012.06.031. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 46. Кутте Р.С., Левин Э., Салоярви Дж., Смитс Л.П., Хартстра А.В., Удаяппан С.Д., Гермес Г., Бутер К.Э., Купен А.М., Холст Дж. Дж. И др. Повышение чувствительности к инсулину после обедненного донорского фекалий при метаболическом синдроме обусловлено исходным составом кишечной микробиоты.Cell Metab. 2017; 26: 611–619. DOI: 10.1016 / j.cmet.2017.09.008. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 47. Zhang Z., Mocanu V., Cai C., Dang J., Slater L., Deehan E.C., Walter J., Madsen K.L. Влияние трансплантации фекальной микробиоты на ожирение и метаболический синдром — систематический обзор. Питательные вещества. 2019; 11: 2291. DOI: 10.3390 / nu11102291. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 48. Bajaj J.S., Fagan A., Gavis E.A., Kassam Z., Sikaroodi M., Gillevet P.M. Отдаленные результаты трансплантации фекальной микробиоты у пациентов с циррозом печени.Гастроэнтерология. 2019; 156: 1921–1923. DOI: 10.1053 / j.gastro.2019.01.033. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 49. Баджадж Дж. С., Зальцман Н. Х., Ачарья К., Стерлинг Р. К., Уайт М. Б., Гэвис Е. А., Фаган А., Хейворд М., Хольц М. Л., Матерли С. и др. Капсулы для трансплантации фекальных микробов безопасны при печеночной энцефалопатии: Фаза 1, рандомизированное, плацебо-контролируемое испытание. Гепатология. 2019; 70: 1690–1703. DOI: 10.1002 / hep.30690. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 50. Хаттнер Б.Д., де Ластур В., Вассенберг М., Махаршак Н., Маурис А., Гальперин Т., Заничелли В., Капель Н., Беллангер А., Олеаро Ф. и др. 5-дневный курс пероральных антибиотиков с последующей трансплантацией фекалий для искоренения носительства Enterobacteriaceae с множественной лекарственной устойчивостью: рандомизированное клиническое испытание. Clin. Microbiol. Заразить. 2019; 25: 830–838. DOI: 10.1016 / j.cmi.2018.12.009. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 51. Канг Д.В., Адамс Дж.Б., Коулман Д.М., Поллард Э.Л., Мальдонадо Дж., Макдонаф-Минс С., Капорасо Дж.Г., Краймальник-Браун Р. Долгосрочная польза терапии переносом микробиоты на симптомы аутизма и микробиоту кишечника. Sci. Отчет 2019; 9: 5821. DOI: 10.1038 / s41598-019-42183-0. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 52. Qi X., Li X., Zhao Y., Wu X., Chen F., Ma X., Zhang F., Wu D. Лечение острого кишечного стероидно-резистентного острого заболевания трансплантат против хозяина трансплантацией фекальной микробиоты: пилотный проект Учиться. Фронт. Иммунол. 2018; 9: 2195. DOI: 10.3389 / fimmu.2018.02195. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 53.Вудворт М.Х., Карпентьери К., Ситченко К.Л., Крафт К.С. Проблемы отбора доноров фекалий и скрининга для трансплантации фекальной микробиоты: обзор. Кишечные микробы. 2017; 8: 225–237. DOI: 10.1080 / 194

  .2017.1286006. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 54. Кассам З., Дюбуа Н.Э., Линг К., Рамакриснха Б., Квази Т., Аллегретти Дж. Р., Фишер М., Келли С. Р., Будри С., Панчал П. и др. 512 — Скрининг здоровья доноров для трансплантации фекальной микробиоты: проспективная оценка 15317 кандидатов в доноры.Гастроэнтерология. 2019; 156: S100 – S101. DOI: 10.1016 / S0016-5085 (19) 37042-8. [CrossRef] [Google Scholar] 55. Баккен Дж. С., Полгрин П. М., Бикманн С. Э., Риедо Ф. Х., Страйт Дж. А. Подходы к лечению, включая трансплантацию фекальной микробиоты для рецидивирующей инфекции Clostridium difficile (RCDI) среди врачей-инфекционистов. Анаэроб. 2013; 24: 20–24. DOI: 10.1016 / j.anaerobe.2013.08.007. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 56. Эдельштейн К., Доу Дж. Р., Кассам З. В поисках безопасного стула: Канаде нужна универсальная модель донора.CMAJ Can. Med. Доц. J. J. L’Assoc. Med. Может. 2016; 188: E431 – E432. DOI: 10.1503 / cmaj.150672. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 57. Одамаки Т., Като К., Сугахара Х., Хашикура Н., Такахаши С., Сяо Дж. З., Абэ Ф., Осава Р. Возрастные изменения в составе кишечной микробиоты от новорожденного до столетнего: поперечное исследование. BMC Microbiol. 2016; 16:90. DOI: 10.1186 / s12866-016-0708-5. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 58. Франсен Ф., ван Бик А.А., Боргуис Т., Aidy S.E., Hugenholtz F., van der Gaast-de Jongh C., Savelkoul H.F.J., De Jonge M.I., Boekschoten M.V., Smidt H., et al. Престарелая кишечная микробиота способствует системному воспалению после передачи мышам без микробов. Фронт. Иммунол. 2017; 8: 1385. DOI: 10.3389 / fimmu.2017.01385. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 59. Деккер Б.К., Лау А.Ф., Деккер Дж. П., Сполдинг К. Д., Синай Н., Конлан С., Хендерсон Д. К., Сегре Дж. А., Франк К. М., Палмор Т. Колонизация кишечника медицинского персонала микроорганизмами с множественной лекарственной устойчивостью.Clin. Microbiol. Заразить. Выключенный. Publ. Евро. Soc. Clin. Microbiol. Заразить. Дис. 2018; 24: 82.e81–82.e84. DOI: 10.1016 / j.cmi.2017.05.010. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 60. Зборомирская Ю., Вила Дж. Продвинутая молекулярная диагностика желудочно-кишечных инфекций на основе ПЦР: проблемы и возможности. Эксперт Преподобный Мол. Диаг. 2016; 16: 631–640. DOI: 10.1586 / 14737159.2016.1167599. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 61. Василакопулу А., Каракоста П., Вурли С., Тарпатци А., Варда П., Костула М., Антониаду А., Пурнарас С. Желудочно-кишечное носительство устойчивых к ванкомицину энтерококков и устойчивых к карбапенему грамотрицательных бактерий в эндемических условиях: распространенность, факторы риска и исходы. Фронт. Здравоохранение. 2020; 8:55. DOI: 10.3389 / fpubh.2020.00055. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 62. Шеной Е.С., Парас М.Л., Нубари Ф., Валенский Р.П., Хупер Д.С. Естественная история колонизации метициллин-резистентным золотистым стафилококком (MRSA) и ванкомицин-резистентным энтерококком (VRE): систематический обзор.BMC Infect. Дис. 2014; 14: 177. DOI: 10.1186 / 1471-2334-14-177. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 63. Яниро Г., Маллиш Б.Х., Келли С.Р., Сокол Х., Кассам З., Нг С., Фишер М., Аллегретти Дж. Р., Масуччи Л., Чжан Ф. и др. Скрининг доноров фекальной микробиоты для трансплантации во время вспышки COVID-19: предложения по срочным обновлениям от международной группы экспертов. Ланцет Гастроэнтерол. Гепатол. 2020; 5: 430–432. DOI: 10.1016 / S2468-1253 (20) 30082-0. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 64.Ван С., Сюй М., Ван В., Цао Х., Пяо М., Хан С., Ян Ф., Цао Х., Ван Б. Систематический обзор: нежелательные явления трансплантации фекальной микробиоты. PLoS ONE. 2016; 11: e0161174. DOI: 10.1371 / journal.pone.0161174. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 65. Drewes J.L., Corona A., Sanchez U., Fan Y., Hourigan S.K., Weidner M., Sidhu S.D., Simner P.J., Wang H., Timp W. и др. Передача и удаление потенциальных проканцерогенных бактерий во время трансплантации фекальной микробиоты для рецидивирующей Clostridioides difficile.JCI Insight. 2019; 4 DOI: 10.1172 / jci.insight.130848. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 66. ДеФилипп З., Блум П.П., Торрес Сото М., Мансур М.К., Сатер М.Р.А., Хантли М.Х., Турбетт С., Чунг Р.Т., Чен Ю.Б., Хоманн Э.Л. Устойчивые к лекарствам бактерии E. coli, передаваемые при трансплантации фекальной микробиоты. N. Engl. J. Med. 2019; 381: 2043–2050. DOI: 10.1056 / NEJMoa1

  7. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 67. Камп П., Вурм П., Грохениг Х.П., Венцль Х., Петрич В., Халвакс Б., Вагнер М., Штадлбауэр В., Эхерер А., Хоффманн К.М. и др. Таксономический состав кишечной микробиоты донора является основным фактором, влияющим на эффективность трансплантации фекальной микробиоты при терапии рефрактерного язвенного колита. Алимент. Pharmacol. Ther. 2018; 47: 67–77. DOI: 10.1111 / apt.14387. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 68. Уилсон Б.С., Ватанен Т., Катфилд В.С., О’Салливан Дж.М. Феномен супердонора при трансплантации фекальной микробиоты. Фронт. Клетка. Заразить. Microbiol.2019; 9: 2. DOI: 10.3389 / fcimb.2019.00002. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 69. Блэк К.К., Терманини К.М., Агирре О., Хоксворт Дж. С., Сосин М. Трансплантация твердых органов в 21-м веке. Аня. Пер. Med. 2018; 6: 409. DOI: 10.21037 / атм.2018.09.68. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 70. Барнс Д., Нг К., Смитс С., Зонненбург Дж., Кассам З., Парк К. Трансплантация отобранной на конкурсной основе донорской фекальной микробиоты: концентрация и разнообразие бутирата как меры качества донора.J. Pediatr. Гастроэнтерол. Nutr. 2018; 67: 185–187. DOI: 10.1097 / MPG.0000000000001940. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 71. Zuo T., Wong S.H., Lam K., Lui R., Cheung K., Tang W., Ching J.Y.L., Chan P.K.S., Chan M.C.W., Wu J.C.Y. и др. Перенос бактериофага во время трансплантации фекальной микробиоты при инфекции Clostridium difficile связан с лечением и исходом. Кишечник. 2018; 67: 634–643. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 72. Отт С.Дж., Вациг Г.Х., Рехман А., Мольцау-Андерсон Дж., Bharti R., Grasis J.A., Cassidy L., Tholey A., Fickenscher H., Seegert D., et al. Эффективность переноса стерильного фекального фильтрата для лечения пациентов с инфекцией Clostridium difficile. Гастроэнтерология. 2017; 152: 799–811. DOI: 10.1053 / j.gastro.2016.11.010. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 73. Эмануэльссон Ф., Клаэссон Б.Э., Юнгстрем Л., Тведе М., Унг К.А. Трансплантация фекальной микробиоты и бактериотерапия при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile: ретроспективная оценка 31 пациента.Сканд. J. Infect. Дис. 2014; 46: 89–97. DOI: 10.3109 / 00365548.2013.858181. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 74. Петроф Э.О., Глор Г.Б., Ваннер С.Дж., Виз С.Дж., Картер Д., Дайно М.С., Браун Э.М., Шретер К., Аллен-Верко Э. Терапия трансплантацией заменителя стула для искоренения инфекции Clostridium difficile: «RePOOPulating» кишечника. Микробиом. 2013; 1: 3. DOI: 10.1186 / 2049-2618-1-3. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 75. Цзоу М., Цзе З., Цуй Б., Ван Х., Фэн К., Цзоу Ю., Чжан X., Ян Х., Ван Дж., Чжан Ф. и др. Трансплантация фекальной микробиоты приводит к вытеснению бактериального штамма у пациентов с воспалительными заболеваниями кишечника. FEBS Open Bio. 2020; 10: 41–55. DOI: 10.1002 / 2211-5463.12744. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 76. Парамсоти С., Камм М.А., Каакуш Н.О., Уолш А.Дж., ван ден Богерде Дж., Сэмюэл Д., Леонг Р.В.Л., Коннор С., Нг У., Парамсоти Р. и др. Многодонорная интенсивная трансплантация фекальной микробиоты при активном язвенном колите: рандомизированное плацебо-контролируемое исследование.Ланцет. 2017; 389: 1218–1228. DOI: 10.1016 / S0140-6736 (17) 30182-4. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 77. Vermeire S., Joossens M., Verbeke K., Wang J., Machiels K., Sabino J., Ferrante M., Van Assche G., Rutgeerts P., Raes J. Видовое разнообразие доноров определяет успех трансплантации фекальной микробиоты при воспалении Заболевание кишечника. Колит Дж. Крона. 2016; 10: 387–394. DOI: 10,1093 / ecco-jcc / jjv203. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 78. Тянь Ю., Чжоу Ю., Хуан С., Ли Дж., Чжао К., Ли X., Вэнь X., Ли X.A. Трансплантация фекальной микробиоты при язвенном колите: проспективное клиническое исследование. БМЦ Гастроэнтерол. 2019; 19: 116. DOI: 10.1186 / s12876-019-1010-4. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 79. Понсе-Алонсо М., Гарсия-Фернандес С., Агилера Л., Родригес-де-Сантьяго Э., Форуни Дж. Р., Рой Г., Делькампо Р., Кантон Р., Лопес-Санроман А. P782 Новый тест на совместимость для отбор донора для трансплантации фекальной микробиоты при язвенном колите. Колит Дж. Крона.2017; 11: S480 – S481. DOI: 10.1093 / ecco-jcc / jjx002.903. [CrossRef] [Google Scholar] 80. Консейсао-Нето Н., Дебутт В., Диркс Т., Макилс К., Ван Дж., Инда К.С., Маес П., Ван Ранст М., Йооссенс М., Раес Дж. И др. Низкое вирусное богатство эукариот связано с успехом трансплантации фекальной микробиоты у пациентов с ЯК. Кишечник. 2018; 67: 1558–1559. DOI: 10.1136 / gutjnl-2017-315281. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 81. Панебианко К., Андриулли А., Пазиенца В. Фармакомикробиомика: использование взаимодействий лекарств и микробиоты в противоопухолевой терапии.Микробиом. 2018; 6: 92. DOI: 10.1186 / s40168-018-0483-7. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 82. Гопалакришнан В., Спенсер К.Н., Нези Л., Рубен А., Эндрюс М.С., Карпинец Т.В., Прието П.А., Висенте Д., Хоффман К., Вей С.С. и др. Микробиом кишечника модулирует ответ на иммунотерапию анти-PD-1 у пациентов с меланомой. Наука. 2018; 359: 97–103. DOI: 10.1126 / science.aan4236. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 83. Матсон В., Фесслер Дж., Бао Р., Чонгсуват Т., Чжа Ю., Алегре М.Л., Люк Дж.Дж., Гаевски Т.Ф. Комменсальный микробиом связан с эффективностью анти-PD-1 у пациентов с метастатической меланомой. Наука. 2018; 359: 104–108. DOI: 10.1126 / science.aao3290. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 84. Маллард А. Онкологи исследуют микробиом, чтобы улучшить результаты иммунотерапии. Nat. Rev. Drug Discov. 2018; 17: 153–155. DOI: 10.1038 / nrd.2018.19. [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 85. Канг Д.В., Адамс Дж.Б., Грегори А.К., Бороди Т., Читтик Л., Фазано А., Хоруц А., Гейс Э., Мальдонадо Дж., МакДонаф-Минс С. и др. Терапия переноса микробиоты изменяет экосистему кишечника и улучшает симптомы желудочно-кишечного тракта и аутизма: открытое исследование. Микробиом. 2017; 5: 10. DOI: 10.1186 / s40168-016-0225-7. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar] 86. Де Гроот П., Шайтхауэр Т., Баккер Г.Дж., Продан А., Левин Э., Хан М.Т., Херрема Х., Акерманс М., Серли М.Дж.М., де Брау М. и др. Метаболические характеристики донора определяют влияние трансплантации фекальной микробиоты на чувствительность реципиента к инсулину, расход энергии и время прохождения через кишечник.Кишечник. 2019: 502–512. DOI: 10.1136 / gutjnl-2019-318320. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [CrossRef] [Google Scholar]

  Frontiers | Хранение стула для трансплантации фекальной микробиоты: методы и операции в большом банке стула

  Введение

  Трансплантация фекальной микробиоты (FMT), перенос стула с минимальными манипуляциями и связанной с ним микробиоты от здорового донора в желудочно-кишечный тракт пациента (Хоруц и Sadowsky, 2016; Allegretti et al., 2019a), является рекомендуемой терапией для рецидивирующей инфекции Clostridioides difficile (Surawicz et al., 2013; Дебаст и др., 2014; Макдональд и др., 2018; Mullish et al., 2018; Давидович и др., 2019). C. difficile Инфекция является наиболее распространенной инфекцией, связанной с оказанием медицинской помощи в США: в 2017 г. в США зарегистрировано 462 000 случаев и 20 500 случаев смерти (Центры США по контролю и профилактике заболеваний., 2019; Guh et al., 2020). Профиль безопасности FMT и его эффективность в предотвращении рецидива инфекции C. difficile , примерно 80-90% (van Nood et al., 2013; Youngster et al., 2014а; Янгстер и др., 2014b; Cammarota et al., 2015; Hirsch et al., 2015; Янгстер и др., 2016; Аллегретти и др., 2016; Kelly et al., 2016; Kao et al., 2017), вдохновили на исследование использования FMT для лечения широкого спектра показаний, опосредованных микробиотой (Allegretti et al., 2019a; Olesen et al., 2020).

  Существуют две основные модели, поставляющие стул для FMT: отобранных пациентом доноров и банка стула (Smith et al., 2015; Costello et al., 2016; Terveer et al., 2017; Panchal et al., 2018; Kragsnaes et al., 2020; McCune et al., 2020).

  В модели донора, выбранного пациентом, пациент или его опекун идентифицируют своего кандидата в доноры стула. Лечащий врач проверяет кандидата и превращает стул донора в препарат FMT. Донор обычно жертвует материал только для одного пациента. Такой подход возлагает на врача существенную логистическую нагрузку (Bakken et al., 2013) и создает задержки между определением показаний к FMT и проведением терапии.Например, если первый кандидат-донор пациента не прошел проверку, необходимо найти другого, который также может не пройти проверку, и все это до того, как пациенту можно будет начать лечение (Kim and Gluck, 2019; Kim et al., 2019). Кроме того, модель, ориентированная на пациента, сопряжена с определенными рисками. Во-первых, разные практикующие врачи могут использовать переменные стандарты скрининга, потенциально подвергая пациента некачественному скринингу. Во-вторых, донорский стул может быть обработан для лечения FMT в неконтролируемом рабочем пространстве ad hoc , например в кабинете врача, что увеличивает риск заражения.Также сообщалось, что препятствия на пути к быстрому доступу к FMT являются причинами, по которым пациенты обращаются к FMT «сделай сам» (DIY), что сопряжено со значительным риском для безопасности пациентов (Ekekezie et al., 2018).

  Банки стула устраняют многие логистические ограничения, присущие модели донора, выбранного пациентом. Банк стула — это централизованное учреждение, которое проверяет доноров, обрабатывает стул, хранит препараты FMT, выполняет запросы клиницистов и исследователей относительно этих препаратов и контролирует безопасность и эффективность материала (Panchal et al., 2018; Ким и Глюк, 2019). Централизованный скрининг доноров обеспечивает более строгие и последовательные стандарты безопасности, при этом уровень квалификации доноров составляет всего 2,5% (Kassam et al., 2019). Централизованная обработка более рентабельна и контролируется: квалифицированные доноры предоставляют материалы, которые можно использовать для лечения многих пациентов, а специально построенное помещение позволяет соблюдать строгие стандарты качества производства (Cammarota et al., 2019; Kragsnaes et al., 2020; McCune et al., 2020). Централизованное распределение сводит к минимуму задержку в лечении пациента, поскольку врачи могут получить доступ к хорошо проверенному препарату FMT гарантированного качества, доставленному в течение ночи.Централизованная отчетность по безопасности также может способствовать повышению безопасности FMT за счет лучшего понимания рисков, связанных с микробными терапевтическими средствами человеческого происхождения, и последующего внедрения улучшенных процессов скрининга и производства. Таким образом, создание банок стула направлено на повышение безопасности и доступности материала FMT.

  Хотя между банками стульев есть различия, отчасти из-за различий в регулировании FMT в разных странах (Scheeler, 2019), банки стульев обычно придерживаются общей методологии из шести частей, показанной ниже (Smith et al., 2015; Terveer et al., 2017; Йоргенсен и др., 2018; Mullish et al., 2018; Cammarota et al., 2019; Kragsnaes et al., 2020; Haifer et al., 2020; McCune et al., 2020). В некоторых банках эти шесть элементов объединены строгими системами качества (Kragsnaes et al., 2020; McCune et al., 2020).

  1. Привлечение доноров: поощрение кандидатов-доноров к прохождению оценки

  2. Оценка доноров: оценка того, соответствуют ли кандидаты-доноры требованиям для сдачи стула

  3. Производство: переработать донорский стул в составы, подходящие для использования в FMT

  4.Мониторинг здоровья и выдача: Подтвердите здоровье донора перед выпуском материала FMT из карантина

  5. Выполнение: Предоставьте материал FMT клиницистам и исследователям и отслеживайте этот материал

  6. Безопасность пациентов: Оцените безопасность и качество FMT и отреагируйте на возникающую безопасность и проблемы с качеством

  Несмотря на слияние области вокруг этой общей методологии, банки стульев продолжают развиваться, предоставляя материалы, которые более тщательно проверяются и более тщательно готовятся, с большей эффективностью и надежностью.Поскольку согласованные руководящие принципы для операций с банками стула в значительной степени основаны на практике существующих банков стула (Costello et al., 2016; Cammarota et al., 2017; Cammarota et al., 2019; Haifer et al., 2020), улучшенное совместное использование методологий различных банков (Woodworth et al., 2017), примером которых служат недавние отчеты английских и датских банков табачных изделий, в которых подчеркивается важность систем управления качеством (Kragsnaes et al., 2020; McCune et al., 2020), должны помочь продвигать согласованные стандарты и, в свою очередь, улучшать уход за пациентами.Улучшение совместного использования также поддержит развитие других банков стула и привлечет более широкое участие в улучшении методов хранения стула.

  Здесь мы сообщаем о методологии, использованной в 2018 г. OpenBiome (Кембридж, Массачусетс, США), большим банком стула, для выполнения запросов врачей о предоставлении материала FMT для лечения рецидивирующей инфекции C. difficile по усмотрению органов исполнительной власти (United States Food и Управление по лекарствам., 2013). С момента своего основания в 2013 году этот банк отправил более 56 000 препаратов FMT в сеть из 1250 медицинских учреждений.Мы описываем общую методологию банка в 2018 году, последнем завершенном году, когда началось это исследование, и результаты деятельности банка за этот год.

  Методы

  Банк стула соответствует фазам действующей надлежащей производственной практики (cGMP) (Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США, 2008 г.), которая включает четко определенные процедуры, строго контролируемую производственную среду и тщательный учет.

  В 2018 году банк использовал методологию из шести частей, описанную выше и описанную ранее: набор доноров, оценка доноров, производство, мониторинг состояния здоровья и выдача, выполнение и безопасность пациентов (Smith et al., 2015). Эта методология не обязательно отражает текущую деятельность банка, поскольку постоянно вносятся изменения, чтобы ограничить банковские операции, на основе последних научных данных и нормативных указаний. Банк выполняет запросы на материалы FMT для лечения инфекции C. difficile по усмотрению правоохранительных органов, а также запросы на материалы для исследовательских целей. Некоторые процедуры различаются между усмотрением правоприменения и исследованием. Для ясности здесь описаны только дискреционные процедуры принудительного исполнения.

  Набор доноров

  Банк поощряет людей в возрасте от 18 до 50 лет регистрироваться в качестве доноров стула, используя традиционные кампании в прессе и социальных сетях. Поскольку банк требует, чтобы подаренные табуреты передавались и передавались в помещении банка табуретов, а не дома, кампании нацелены только на городской район, где расположен банк табуретов. Лица, заинтересованные в том, чтобы стать донорами стула, заполняют первоначальную онлайн-анкету о состоянии здоровья, сфокусированную на критериях отбора, которые обычно приводят к априорному исключению (дополнительные материалы).Важные категории, используемые для предварительного скрининга, включают логистику (например, возможность сдавать кровь в банке стула не менее трех раз в неделю), инфекционный риск (например, история поездок с высоким риском) (Tangden et al., 2010) и нарушение микробного разнообразия ( например, недавнее использование антибиотиков) (Kassam et al., 2019). Кандидаты, отвечающие критериям участия в предварительной анкете, приглашаются для оценки на месте.

  Чтобы обеспечить безопасность и качество программ донорства стула, банк не публикует точные критерии включения и исключения доноров, а также точную методологию набора или оценки доноров, описанную ниже.Эта политика предназначена для обеспечения того, чтобы доноры или кандидаты в доноры предоставляли банку правдивую информацию, а не отвечали на вопросы таким образом, чтобы им было разрешено сдавать стул.

  Оценка донора

  Во время оценки на месте кандидаты предоставляют информированное согласие и подписывают письменные показания, подтверждающие, что предоставленная ими медицинская информация является достоверной и полной (Paramsothy, 2015). Затем кандидаты заполняют подробную анкету о здоровье донора, в которую входят вопросы о сопутствующих заболеваниях желудочно-кишечного тракта, метаболических состояниях, нейропсихиатрических сопутствующих заболеваниях, инфекционных заболеваниях, аутоиммунных заболеваниях, атопии, астме и аллергии, злокачественных новообразованиях (например,g., колоректальный рак), операции или другой анамнез, текущие симптомы и поведение (например, привычка к кишечнику), лекарства (например, противомикробная терапия), диета, социальный анамнез и семейный анамнез. Критерии отбора были ранее более подробно изложены банком (Kassam et al., 2019). Затем клинический сотрудник встречается с кандидатом, чтобы просмотреть и уточнить их ответы. Затем медицинский работник измеряет температуру тела кандидата, артериальное давление, частоту сердечных сокращений, частоту дыхания, индекс массы тела и окружность талии.Наконец, наблюдающий врач просматривает анкету и показатели жизненно важных функций.

  Кандидаты, прошедшие очную клиническую оценку, проходят лабораторный скрининг, состоящий из трех частей: кровь, стул и мазок из носа. Образцы отправляются во внешние лаборатории для тестирования (таблица 1), включая тесты, рекомендованные руководством Европейской рабочей группы FMT и международными согласованными рекомендациями (Bakken et al., 2011; Cammarota et al., 2019). Любые отклонения от нормы рассматриваются лечащим врачом банка.Кандидаты, прошедшие лабораторные анализы, принимаются в программу донорства стула. Кандидаты, не прошедшие лабораторные тесты, временно откладываются или навсегда исключаются из программы. Например, если обнаружен какой-либо проверенный организм с множественной лекарственной устойчивостью, кандидат навсегда исключается как донор стула, но пациента, несущего преходящий кишечный патоген, можно пригласить на повторный скрининг после временной отсрочки. Кандидатов и доноров информируют о любых существенных случайных выводах, обнаруженных в процессе оценки и мониторинга состояния здоровья, и направляют в соответствующие медицинские службы.Чтобы защитить безопасность и качество донорской программы, кандидаты, как правило, не информируются о причине их отсрочки или исключения, кроме как поделиться важными случайными выводами.

  Таблица 1 Оценка доноров, включая клиническую оценку и лабораторные обследования, использованная банком в 2018 году. Этот список не отражает текущую проверку банка *.

  Производство

  Доноры делают пожертвования, посещая пункт сбора стула, где им выдают набор для сбора стула.После прохождения стула на место доноры закрывают крышку контейнера и помещают его в закрывающийся пластиковый пакет для вторичного сдерживания. Сотрудник маркирует пожертвование идентификационным номером донора и временем передачи. Состояние здоровья донора повторно оценивается при каждой сдаче крови, как описано ниже. Доноры получают вознаграждение за время и поездки, необходимые для предоставления каждого обработанного пожертвования.

  Пожертвование переводится в специальный шкаф биобезопасности, который очищается спорицидным средством и этанолом.Квалифицированный техник открывает контейнер и оценивает стул на предмет любых видимых патологий (например, загрязнения, изменения цвета, крови или слизи). Пожертвования с плохой консистенцией (по Бристольской шкале стула за пределами 3-5) или с патологией зрения уничтожаются, а медицинский персонал уведомляется об отклонении. Пожертвования, вес которых не превышает 55 граммов, не рентабельны для обработки и уничтожаются. После визуального осмотра и взвешивания кал переносят в стерильный фильтр-мешок 330 мкм, разбавленный стерильным солевым раствором глицерина фармакопеи США (12.5% глицерина в 0,90% мас. / Об. NaCl в воде) и полностью гомогенизировали, находясь в фильтровальном мешке, с использованием лопастного смесителя в течение не менее 180 секунд. Волокнистый материал остается на одной стороне фильтра, в то время как бактерии, небольшие молекулы и вода прижимаются к другой стороне фильтра.

  Фильтрат разбавляют и делят на аликвоты в зависимости от конечного приготовления FMT. Каждый препарат FMT получен от одного донора; фильтраты от разных доноров никогда не смешиваются. Все пожертвования обрабатываются в течение шести часов после первого прохода донора, а материал, который не может быть обработан вовремя, уничтожается (Chu et al., 2017).

  В банке выпускаются два жидких препарата (рис. 1) и один капсульный препарат. Первый жидкий препарат — это 250 мл, разбавленный в соотношении 10: 1 (т.е. примерно 22,7 г стула на препарат), и предназначен для доставки с помощью колоноскопии, ректороманоскопии или клизмы. Второй жидкий препарат представляет собой 30 мл, разбавленный в соотношении 5: 2 (т.е. примерно 8,6 г стула), и предназначен для доставки с помощью эзофагогастродуоденоскопии или назоэнтерального зонда. Жидкие препараты FMT переносят в стерильные флаконы из полиэтилентерефталата с помощью стерильных одноразовых серологических пипеток.

  Рис. 1 Жидкие препараты FMT. (A) Препарат объемом 250 мл, предназначенный для нижней доставки. (B) Препарат объемом 30 мл, предназначенный для верхней доставки.

  Капсульный состав разработан для проглатывания и противодействия разложению желудочной кислотой до достижения тонкой кишки (Stollman et al., 2015). Каждая капсула (размер 00) состоит примерно из 275 мг стула. Стул в сочетании с липидным буфером и глицериновым буфером содержится во внутренней желатиновой капсуле и внешней кислотостойкой оболочке.Капсульная доза состоит из 30 капсул (примерно 8,25 г стула). Из каждого пожертвования, которое перерабатывается в препарат FMT, 30 мл безопасная аликвота откладывается для тестирования безопасности и обеспечения качества. Дополнительные аликвоты сохраняются для тестирования безопасности или в исследовательских целях. Все жидкие препараты и капсулы закрываются крышками для бутылок с защитой от вскрытия и хранятся при –80 ° C.

  Для обеспечения прослеживаемости каждый препарат FMT и аликвота маркируются штрих-кодом, который связывает их с пожертвованием.Все этапы производственного процесса отслеживаются и регистрируются в соответствии со стандартами cGMP. Завершенные препараты FMT хранятся в карантине до тех пор, пока не будет определено, что они свободны от определенных факторов риска, как описано ниже.

  Мониторинг состояния здоровья и выдача материалов

  Состояние здоровья донора и его право на дальнейшее донорство постоянно оцениваются с помощью пяти механизмов.

  Во-первых, доноры должны сообщать о поездках или изменении состояния здоровья, когда они активно участвуют в программе, включая лихорадку, кашель, заложенность носа, изменение привычки кишечника, тошноту, рвоту, сезонную аллергию, медицинские или стоматологические процедуры, телесные повреждения и использование пероральные или местные лекарства, отпускаемые без рецепта.Если сообщается о болезни или путешествии, донор дополнительно оценивается членом клинического персонала, который определяет, следует ли временно отложить донора или навсегда исключить его из программы донорства стула. Например, поездка в определенные страны влечет за собой высокий риск заражения устойчивыми к антибиотикам бактериями и может привести к временной отсрочке или постоянному исключению. Любой донор, которого временно отложили, проходит частичную или полную повторную проверку перед повторным допуском к программе.

  Во-вторых, при каждой сдаче стула доноры заполняют краткую анкету о состоянии здоровья. Если донор сообщает об изменении состояния здоровья или непосредственное наблюдение сотрудника клиники за донором заставляет их подозревать изменение состояния здоровья донора, врач проводит собеседование с донором для сбора дополнительной информации. Клинический персонал может решить, что пожертвование должно быть уничтожено, а донор может быть временно отложен или навсегда исключен. Если донор временно отложен из-за преходящего заболевания, донор должен пройти частичный или полный повторный скрининг перед повторным включением в программу.

  В-третьих, если техник-технолог обнаруживает подозрение на патологию стула при пожертвовании, как описано выше, он делает фотографию этого пожертвования, уничтожает пожертвование и делится фотографией с медицинским персоналом. Клинический персонал просматривает фотографию и проконсультируется с донором, чтобы определить, связана ли аномальная патология стула с риском инфекции или основным заболеванием.

  В-четвертых, доноры должны согласиться на выборочную проверку здоровья. Врач исследует жизненные показатели донора и оценивает состояние его здоровья, уделяя особое внимание особенностям кишечника, инфекционным факторам риска и новому поведению, которое может повлиять на микробиоту.Если клиницист обнаруживает какие-либо клинические проблемы, донор может быть временно отложен или навсегда исключен. Любой донор, которого временно отложили, проходит частичную или полную повторную проверку перед повторным допуском к программе.

  Наконец, каждый донор повторяет полный набор клинических и лабораторных исследований, тот же набор, который они прошли при первом включении в качестве донора, примерно каждые 60 дней. Эти переоценки «закрывают» 60-дневные периоды сбора. Препараты FMT, полученные из пожертвований стула во время периода сбора, выводятся из карантина только после того, как донор пройдет вторую полную оценку в конце периода сбора.Это не тот случай, когда проверяется каждое пожертвование. Вместо этого оценки здоровья донора в начале и в конце 60-дневного периода и обзор всех клинических данных, собранных во время окна сбора, принимаются как достаточные доказательства того, что промежуточные доноры подходят для использования в качестве препаратов FMT (Kazerouni et al. др., 2015; Смит и др., 2015).

  Люди, подвергшиеся воздействию ВИЧ или других патогенов, могут не получить положительный результат в течение нескольких дней после их первоначального заражения (CDC., 2014).Чтобы учесть возможность приобретения донором патогена с увеличенным временем сероконверсии, высвобождение материала FMT компенсируется повторными оценками: препараты FMT, полученные из стула, сданного менее чем за 21 день до повторной оценки, высвобождаются только в том случае, если донор проходит оценку в конце следующего 60-дневного периода сбора.

  Материал выводится из карантина только после полного анализа всех клинических и лабораторных данных в каждый период сбора и требует одобрения двух клиницистов и одного сотрудника службы контроля качества.Все выпуски материалов выполняются в соответствии со стандартами cGMP.

  Если донор впервые дал положительный результат теста на какие-либо инфекционные патогены или другие клинически значимые отклонения, указывающие на возможное наличие скрытого медицинского состояния, все препараты FMT, полученные в соответствующий период сбора, уничтожаются. Доноры, у которых недавно был обнаружен положительный результат на определенные патогены, включая C. difficile , а также хронические инфекции, такие как гепатит B и ВИЧ, навсегда исключаются из донорской программы, и весь материал, собранный с момента последнего скрининга донора, уничтожается.В других случаях, таких как ротавирус, инфекции носят временный характер, и доноры временно откладываются. Как указано выше, временно отложенные доноры должны пройти частичную или полную повторную проверку перед повторным допуском к программе.

  Выполнение

  Банк стула предоставляет препараты FMT гастроэнтерологам и врачам-инфекционистам, лечащим пациентов с рецидивирующей инфекцией C. difficile , не поддающейся лечению стандартными методами лечения (Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США., 2013). Банк также выполняет запросы на материалы FMT для исследовательских целей, но процедуры выполнения и мониторинга безопасности пациентов в этом случае различаются. Для ясности здесь описаны только дискреционные процедуры принудительного исполнения.

  Веб-сайт банка стула предоставляет информацию о правилах FMT в Соединенных Штатах, описание методов лечения FMT и клинические рекомендации, а также регистрационные формы, которые заинтересованные учреждения должны заполнить и отправить для получения материалов из банка.Во время регистрации собираются институциональная информация о доставке и выставлении счетов, а также контактная информация для контроля материалов, лечащего врача и сообщений о побочных эффектах. Когда зарегистрированные партнеры подают письменный заказ на поставку, препараты FMT удаляются из хранилища при –80 ° C и отправляются через ночной воздух на сухом льду в контейнерах из пенополистирола. Каждый контейнер поставляется с температурным индикатором, который показывает, что препараты оставались замороженными во время транспортировки.Препараты помечаются как истекающие через 6 месяцев после отправки, при условии хранения при –20 ° C.

  Зарегистрированные врачи или медицинские учреждения, получившие материал банка стула, отправляют обратно в банк стула три вида информации. Во-первых, они должны заполнить журнал, подтверждающий, что каждый препарат FMT был заморожен по прибытии, и сообщить, остается ли он в инвентаре, использовался ли он для обработки или был уничтожен из-за истечения срока годности или по другим причинам. Во-вторых, их просят заполнить форму последующего клинического наблюдения для каждого пациента в течение 8 недель после процедуры FMT, указав степень тяжести и подтип C.difficile , которую лечили, и исходы для пациента после FMT. Наконец, они по контракту обязаны сообщать о любом серьезном неблагоприятном событии (определяемом как смерть, опасное для жизни событие, госпитализация, инвалидность или необратимое повреждение, врожденная аномалия или другое серьезное важное медицинское событие) в банк стула в течение 24 часов после события. .

  Безопасность пациентов

  Когда врач сообщает банку о серьезном нежелательном явлении, банк начинает расследование.Персонал службы безопасности оценивает событие с точки зрения серьезности, серьезности, ожидаемости и взаимосвязанности. Персонал по безопасности привлекает профильных экспертов, в том числе клинический консультативный совет банка стула, который представляет собой независимую группу гастроэнтерологов, специалистов по инфекционным заболеваниям и других экспертов в данной области.

  Системы штрих-кодирования, отслеживания и обеспечения качества позволяют банку идентифицировать пожертвование и донора, связанного с неблагоприятным событием. Если нежелательное явление представляет риск для других лиц, которые могли бы получить материал от того же донора, существующий материал от этого донора немедленно помещается на карантин и больше не отправляется, пока персонал по безопасности и качеству не определит, что это безопасно.Если событие связано с инфекционным патогеном, сотрудники службы безопасности и контроля качества могут извлечь аликвоту безопасности, взятую из этого пожертвования, и проверить ее на наличие патогена. Если нежелательное явление связано с материалом FMT, помещенный на карантин материал от донора уничтожается, материал от донора, который уже был отправлен, может быть отозван, а донор может быть навсегда исключен из программы донорства. Если будет установлено, что нежелательное явление не связано с FMT, помещенный в карантин материал будет выпущен.

  Результаты расследования заносятся в базу данных по безопасности с использованием терминологии MedDRA. (MedDRA, терминология Медицинского словаря нормативной деятельности, представляет собой международную медицинскую терминологию, разработанную под эгидой Международного совета по гармонизации технических требований к фармацевтическим препаратам для использования человеком). Данные анализируются посредством анализа аналогичных событий для обнаружения сигналов безопасности, которые могут указывать на тенденцию или риск для безопасности. О серьезных нежелательных явлениях, которые считаются связанными с FMT, сообщается в соответствующие регулирующие органы через Совет международных организаций медицинских наук или систему MedWatch (Craigle, 2007).Регулярные обзоры данных о безопасности полетов дают информацию о дополнительных методах обеспечения безопасности и стратегиях управления рисками в процессе постоянного улучшения.

  Результаты

  В период с марта 2018 г. по июль 2018 г. 731 кандидат в доноры стула заполнили опрос, в котором спрашивали, почему они хотят сдавать стул. Мотивация большинства доноров включает помощь пациентам с инфекцией C.difficile , продвижение исследований и получение компенсации за каждое пожертвование (рис. 2). Доноры, прошедшие скрининг и зарегистрировавшиеся в программе, остаются на разное время: более половины доноров, сделавших пожертвования в 2018 году, были активными донорами менее 6 месяцев, но один донор, сделавший пожертвование в 2018 году, был активен в течение 3 месяцев.4 года (рисунок 3).

  Рис. 2 Доноры стула имеют несколько мотивов для предоставления стула. В период с марта по июль 2018 года 731 кандидат в доноры стула заполнили анкету, в которой спрашивали, почему они хотят сдать стул. В ходе опроса кандидатам предлагалось указать все мотивирующие факторы, которые к ним относились.

  Рис. 3 Доноры стула активны в течение длительного периода времени. В течение 2018 года 120 доноров сделали как минимум 1 пожертвование, которое было преобразовано в препарат FMT.Для каждого из этих доноров продолжительность регистрации рассчитывалась как время между первым пожертвованием донора (которое могло произойти до 2018 года) и его последним пожертвованием в 2018 году. Минимальная продолжительность регистрации составляла 21 день, а максимальная — 3,4 года. Средняя продолжительность охвата составила 5,8 месяца (межквартильный размах от 3,2 до 12,1 месяца).

  В 2018 году банк стула получил 7 536 пожертвований (Рисунок 4A) от 210 доноров (Рисунок 4B), в среднем 20,6 пожертвований в день. 7% пожертвований (516/7 536) были использованы для проверки стула, чтобы оценить здоровье доноров.36% пожертвований (2 749/7 536) были отклонены из-за низкого веса пожертвования, плохой оценки стула по Бристоле, визуальной патологии стула или из-за того, что пожертвование не могло быть обработано в течение 6 часов после передачи. Остальные 57% пожертвований (4 271/7 536) были переработаны в 22068 жидких и 2755 капсульных препаратов FMT (рис. 4A). Доноры различались по своей продуктивности и доле отбракованных или обработанных образцов (рис. 4B). Время между прохождением донорской крови и ее переработкой в ​​состав FMT варьировалось, но всегда составляло менее 6 часов (рис. 4C).

  Рис. 4 Пожертвованный стул проверяется на качество, перерабатывается в препараты для лечения FMT и отправляется в больницы и врачам. (A) В 2018 году в банк поступило 7 536 пожертвований. 2749 пожертвований (36%) были отклонены из-за визуального обнаружения потенциально патологической морфологии, низкого веса или неспособности обработать стул в течение шести часов после прохождения. 516 пожертвований (7%) были использованы в целях скрининга для оценки здоровья доноров. Из оставшихся 4271 пожертвований (57%) 3099 были переработаны в жидкие препараты с меньшей доставкой (например,g., для колоноскопии), 701 — в жидкие препараты для верхней доставки (например, для назоэнтериального введения), 285 — в капсульные препараты и 186 — в другие препараты. (B) В течение 2018 года 120 доноров стула предоставили как минимум 1 донорский стул, который был переработан в препарат FMT. Доноры различались по количеству пожертвований, а также по доле пожертвований, которые были обработаны, отклонены и проверены. Самый продуктивный донор сделал 402 пожертвования в 2018 году. (C) В 2018 году банк обработал 4271 пожертвование стула на препараты FMT.Все пожертвования были обработаны в течение шести часов после перехода. Самое быстрое время обработки составило 47 минут. Наибольшее время составило 5,99 часа. Среднее время обработки составило 3,9 часа (межквартильный интервал от 3,2 до 4,7 часа). (D) К 1 июля 2020 года банк отгрузил 15 233 препаратов FMT, произведенных в 2018 году. Препараты были отгружены в период от 2,2 до 28 месяцев после производства. Среднее время доставки составило 8,9 месяца (межквартильный размах от 6,3 до 13,3 месяца). Поскольку не весь материал, произведенный в 2018 году, был отгружен по состоянию на 1 июля 2020 года, данные смещены в сторону более ранней отгрузки.

  По состоянию на 1 июля 2020 г. 23% (5 049/22 068) жидких препаратов FMT, произведенных в 2018 г., были уничтожены до выхода из карантина. Наиболее частыми причинами разрушения были неудавшийся лабораторный скрининг (47%; 2367/5049), изменение клинического статуса донора, например, начало болезни (32%; 1616/5049), донор, не завершивший повторную проверку. -экран в пределах необходимого окна (7%; 378 / 5,049) и отклонения в процессе производства (5%; 273 / 5,049). К 1 июля 2020 года банк отправил 62% (15 233/24 823) препаратов FMT, произведенных в 2018 году, врачам и больницам для клинического использования для лечения рецидивирующих C.difficile инфекция. Из-за сложной логистики проверки состояния здоровья и карантинных выпусков очень немногие препараты FMT отправляются менее чем через 4 месяца после их производства. Среднее время между производством и выполнением заказа составило 8,9 месяца (рис. 4D).

  Чтобы количественно оценить, как разные больницы и врачи использовали разное количество материала банка, мы измерили количество препаратов FMT, отправленных каждому получателю в 2018 году, независимо от того, когда эти препараты были произведены.В 2018 году отгружено 12 453 препарата 968 получателям (рисунок 5). Один реципиент получил 141 препарат, в среднем 11,75 в месяц, но среднее количество препаратов было 9, или 0,75 в месяц. Таким образом, половина больниц и врачей, получивших материалы из банка, лечили в среднем менее 1 пациента в месяц с помощью FMT с использованием этого материала.

  Рисунок 5 Ежемесячный объем препаратов врачом / больницей в течение 2018 года. Количество препаратов в месяц было рассчитано путем деления общего количества отгруженных единиц на 12.Среднее количество заказанных препаратов среди врачей / больниц составляло 9 в год, или 0,75 процедур в месяц (межквартильный интервал от 0,25 до 1,4 месяца). Максимальное количество заказываемых препаратов — 11,75 в месяц. Большинство врачей / больниц заказывали в среднем менее 1 FMT в месяц.

  Обсуждение

  В 2018 году протокол банка стула был разработан в основном для повышения безопасности и доступности FMT для лечения инфекции C. difficile в определенных нормативных условиях (Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США., 2013), используя доноров из ограниченного географического местоположения и руководствуясь научным и медицинским пониманием FMT в то время. Описанный здесь протокол потребует модификации, если он будет реализован в другой нормативной среде (Scheeler, 2019; McCune et al., 2020), в географическом положении (Paramsothy et al., 2015) или с другими требованиями к ресурсам. Кроме того, по мере улучшения понимания профиля безопасности и молекулярных механизмов FMT в этой области появятся дополнительные возможности для оптимизации микробной терапии человеческого происхождения в целом и протоколов накопления стула в частности.Даже если использование FMT для лечения инфекции C. difficile перестанет подпадать под усмотрение правоохранительных органов и вместо этого будет регулироваться как биологический лекарственный продукт, общая методология, описанная здесь, по-прежнему является передовой практикой для хранения стула.

  Мы поделились этими методами, чтобы помочь сформировать согласованные стандарты с данными, собранными в реальных условиях, поддержать продвижение аналогичных операций и пригласить более широкое участие в улучшении этих методов. Чтобы помочь изучить тематические области, в которых протоколы хранения стула могут быть улучшены и адаптированы, мы изложим и обсудим пять сценариев жизненного цикла гипотетического донора.

  Сценарий 1: Здоровый донор

  В этом сценарии гипотетический донор проходит первоначальный скрининг и последующие проверки здоровья. Донорский стул используется для приготовления препаратов FMT, которые успешно излечивают инфекцию C. difficile пациентов. О побочных эффектах, связанных с материалом этого донора, не сообщается, и в конечном итоге донор покидает программу по своим причинам. Даже в этом сценарии возникает множество вопросов об оптимальных протоколах хранения стула.

  Во-первых, банк стула компенсирует донорам 40 долларов США в качестве вознаграждения за время и усилия, связанные с внесением полезного пожертвования на месте.Компенсация должна быть достаточно высокой, чтобы справедливо вознаграждать жертвователей за их усилия. Однако компенсация должна также избегать извращенного стимулирования или принуждения кандидатов-доноров к обмену частной медицинской информацией и биопробами человека. Оптимальная компенсация для доноров стула — открытый вопрос: в то время как доноры цельной крови и доноры органов в США не получают компенсацию, доноры плазмы, доноры спермы и доноры яйцеклеток получают (Национальный закон о трансплантации органов 1984 г .; Родригес дель Посо, 2008 г .; Глаузер , 2014; Farrugia et al., 2015; Американская ассоциация банков крови., 2019; Cammarota et al., 2019).

  Во-вторых, требование о передаче пожертвований на месте ограничивает круг доноров банка одним мегаполисом. Хотя кал любого донора, проходящего через экраны банка стула, оказывается одинаково эффективным для лечения инфекции C. difficile (Budree et al., 2017a; Budree et al., 2017b; Budree et al., 2018; Osman et al., 2018; Олесен, 2020), то же самое может не относиться к другим заболеваниям. Например, для доноров и реципиентов может быть важно или нет географическое «соответствие» для обеспечения максимально безопасного и эффективного FMT (Яцуненко и др., 2012; Голк и Шарптон, 2018; Pasolli et al., 2019).

  В-третьих, поскольку стул любого донора в программе банка кажется почти одинаково эффективным (Olesen, 2020), банк кала не направляет материал от определенных доноров конкретным пациентам, кроме как в рамках определенных протоколов исследований. Однако в какой-то момент может стать ясно, что отдельные доноры («супердоноры») (Wilson et al., 2019) или пожертвования с особыми характеристиками («superstool») (Olesen et al., 2018a) дают более эффективные препараты FMT для лечение C.difficile или по другим показаниям. По мере того, как понимание FMT на местах растет, универсальный донорский подход может потребовать корректировки.

  В-четвертых, активный ингредиент микробных терапевтических средств человеческого происхождения, таких как FMT, хотя и предположительно является живыми или жизнеспособными бактериями, окончательно не известен (Ott et al., 2017), что делает неясным оптимальный протокол производства. Текущие производственные процессы, такие как аэробная подготовка и замораживание препаратов FMT, подтверждаются клиническими данными (Lee et al., 2016; Mendolia et al., 2019; Allegretti et al., 2020), но может потребоваться корректировка по мере роста клинического и научного понимания FMT. В частности, оптимальная дозировка FMT для лечения C. difficile не совсем понятна (Ianiro et al., 2018; Allegretti et al., 2019b). Препараты FMT с меньшим или большим объемом, или с пропорционально большим или меньшим количеством донорского стула, могут быть более оптимальными. Более того, терапевтический активный ингредиент человеческого происхождения может не быть одинаковым для всех предполагаемых показаний (Olesen et al., 2018б). Текущее тестирование активности FMT сосредоточено на плотности жизнеспособных бактерий в донорской крови (Carlson, 2020), но есть вероятность, что будущие исследования вариабельности человеческого стула и корреляции между этими вариациями и эффективностью FMT для лечения различных показаний могут выявить более точный предиктор активности FMT (Olesen et al., 2018a).

  В-пятых, даже при тщательном обследовании состояния здоровья микробные терапевтические препараты человеческого происхождения представляют риски, с которыми пациенты должны получать консультации в процессе получения информированного согласия.Стандарты скрининга, используемые банком для материалов FMT, основаны на критериях, установленных регулирующими органами, банками крови, независимым клиническим консультативным советом, национальными и международными принципами консенсуса по банкам стула (Bakken et al., 2013; Cammarota et al., 2017; Mullish et al., 2018; Cammarota et al., 2019; Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США., 2019), а также исходы для пациентов, сообщенные партнерскими больницами и врачами. Однако не все известные патогены проходят скрининг, и ранее неизвестные патогены или другие факторы риска могут возникать в материале человеческого происхождения (Ianiro et al., 2020). Таким образом, стандарты скрининга микробных терапевтических средств человеческого происхождения требуют постоянной переоценки и обновления.

  Наконец, даже если микробный терапевтический материал человеческого происхождения проверяется на патоген или состояние, разные методы тестирования могут привести к разным результатам. В идеале скрининговый анализ надежно определяет, несет ли донорский материал минимальную инфекционную дозу патогена. На практике тот факт, что донор или его материал проверяет отрицательный результат на патоген в доступном анализе, не полностью исключает риск того, что их донорский материал несет этот патоген, и пациентов следует информировать о риске приобретения патогенов в процессе получения информированного согласия. .

  Сценарий 2: Донор не проходит первоначальный тест

  В этом сценарии потенциальный донор исключается во время предварительного обследования, оценки на месте клиническим персоналом или лабораторного тестирования. Кандидат никогда не предоставляет образец стула. В этом сценарии выделяются две основные области продолжающегося развития.

  Во-первых, точно так же, как правила донорства крови направлены на снижение риска «до минимального разумно достижимого уровня без чрезмерного уменьшения доступности [крови]» (Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США., 2021), поэтому процедуры скрининга доноров стула направлены на ограничение риска FMT без чрезмерного ограничения доступа к FMT. Однако оптимальная батарея скрининга остается областью активной разработки, и скрининг на все возможные патогены может быть не лучшим подходом. Например, учитывая высокую распространенность предшествующего контакта с вирусом Эпштейна-Барра (EBV) и цитомегаловирусом (CMV), а также отсутствие зарегистрированных событий у пациентов, связанных с передачей этих вирусов через FMT, международные руководящие принципы не рекомендуют донорам быть исключены на основании их подверженности этим вирусам (Cammarota et al., 2019). Вместо этого, пациенты с риском заражения ЦМВ или ВЭБ должны быть соответствующим образом проинформированы о рисках и должны быть рассмотрены альтернативы FMT. Этикетка на отправленных банком материалах содержит отказ от ответственности.

  Во-вторых, оптимальная батарея для скрининга может быть разной для разных групп пациентов или географических регионов. В качестве гипотетического примера может стать ясно, что тестирование на какой-либо патоген или фактор риска важно для безопасности FMT, но только при использовании в определенной популяции пациентов, такой как пациенты с ослабленным иммунитетом, что требует индивидуального соответствия между скринингом доноров и популяцией пациентов.Такая адаптация практикуется в банках крови, которые предоставляют, например, ЦМВ-отрицательную кровь пациентам, ранее не получавшим ЦМВ. Точно так же банки стула в разных регионах должны определять свои критерии скрининга, исходя из местного бремени болезни, для разработки соответствующих местных программ скрининга.

  Сценарий 3: Донор навсегда исключен из программы

  В этом сценарии активный донор заразится исключающей инфекцией, такой как C. difficile или ВИЧ, или ему поставлен диагноз дисквалифицирующего, потенциально связанного с микробиотой состояния, такие как гипертония или ревматоидный артрит, впервые.Донор навсегда исключается из программы пожертвований, и препараты FMT, сделанные из их пожертвований с момента их последней батареи отрицательных экранов, уничтожаются. Банк стула также может разрушить материал, полученный до предыдущего отрицательного скрининга.

  Как и в сценарии 2, оптимальные процедуры определения критериев для постоянного исключения доноров являются областью активной разработки. Хотя ВИЧ, гепатит B и гепатит C являются очевидными критериями для постоянного исключения, необходимость постоянного исключения доноров из-за других инфекционных заболеваний или из-за потенциально обусловленных микробиотой состояний будет продолжать уточняться.По мере того, как понимание роли микробиоты в болезнях растет и потенциальный риск передачи заболеваний, опосредованных микробиотой, становится более ясным, микробные терапевтические средства человеческого происхождения, включая FMT и процедуры хранения стула, вероятно, будут адаптироваться для повышения безопасности пациентов (Bibbò et al. , 2017; Giles et al., 2019; Kassam et al., 2019).

  Сценарий 4: Донор временно отстранен после заражения острым инфекционным заболеванием

  В этом сценарии донор сам сообщает, дает положительный результат теста или диагностируется острая инфекция, такая как вирусная инфекция верхних дыхательных путей или острый желудочно-кишечный тракт болезнь.Донор временно откладывается, и любой материал из текущего периода сбора стула уничтожается. Отсрочка сохраняется, по крайней мере, до тех пор, пока у донора не исчезнут симптомы заболевания, не вернется обычный образец стула и донор не пройдет частичный или полный повторный скрининг, который включает тесты на инфекционные заболевания. Клинический персонал банка кала на основе своей клинической оценки определяет, следует ли продлить отсрочку с учетом выделения патогенов, которое может продолжаться после исчезновения симптомов. Хотя периоды выделения из кала некоторых патогенов были изучены, не существует опубликованных клинических рекомендаций о подходящих интервалах для отсрочки донорства стула после острой инфекции, что делает этот аспект банка стула, который требует дальнейшего обсуждения и развития.

  Сценарий 5: Пациент испытывает нежелательное явление после FMT

  В этом сценарии врач, лечащий пациента материалом FMT из банка стула по усмотрению принуждения, сообщает, что у пациента возникло нежелательное явление. Централизованная отчетность и надзор за безопасностью могут способствовать повышению безопасности FMT за счет лучшего понимания рисков, связанных с микробными терапевтическими средствами человеческого происхождения, и последующего внедрения улучшенных процессов скрининга и производства, но есть важные области активного развития в отношении безопасности FMT.

  Во-первых, улучшение методов сбора, интеграции и практического использования данных о безопасности микробных препаратов человеческого происхождения является важной областью постоянных разработок. Данные о безопасности FMT получены из трех основных источников. В клинических испытаниях тщательно отслеживаются нежелательные явления у относительно небольшого числа включенных в исследование пациентов. Регистры, такие как Национальный педиатрический регистр FMT (Nicholson et al., 2020) и Национальный регистр FMT Американского гастроэнтерологического общества (Kelly et al., 2017), целью которого является отслеживание 4000 пациентов с FMT в течение десяти лет, являются важными инструментами для выявления и информирования о смягчении любых долгосрочных рисков FMT, области постоянного клинического интереса (Agrawal et al., 2016). Банки стула могут собирать большие объемы реальных данных (Osman et al., 2016), которые могут быть более репрезентативными для соответствующих популяций пациентов, чем данные, собранные в ходе клинических испытаний (Kelly et al., 2019), но улучшают отчетность о нежелательных явлениях для банки стула остаются важной проблемой для отрасли.Данные из каждого из этих трех источников являются ценными и взаимодополняющими, и их следует использовать совместно для улучшения протоколов скрининга доноров и производства всех микробных терапевтических средств человеческого происхождения.

  Во-вторых, оценка любой потенциальной причинно-следственной связи между материалом FMT и единичным зарегистрированным нежелательным явлением часто осложняется сопутствующими заболеваниями пациента. Например, хотя в нескольких отчетах описывается обострение воспалительных обострений кишечника после FMT, еще не определено, способствовал ли FMT этим обострениям: пациенты могли испытывать эти обострения, даже если они не подвергались FMT (Qazi et al., 2017). Контролируемые испытания и реестры остаются ключевыми инструментами для решения этих вопросов.

  В-третьих, в случае нежелательного явления, вызванного инфекцией, связывание патогенов в донорском кале с инфекционным патогеном у пациента является областью активного развития. Полногеномное секвенирование стало ведущим инструментом для оценки того, переносит ли FMT патоген (DeFilipp et al., 2019), но окончательное доказательство передачи или отсутствия передачи через материал человеческого происхождения не всегда возможно.В частности, сохраненные образцы стула от донора и пациента необходимы для окончательного расследования возможной передачи патогенов, но сбор образцов от пациента для поддержки сравнения с образцами донора, хранящимися в банках стула, еще не является обычной практикой в ​​большинстве учреждений (Kragsnaes et al. др., 2020).

  Заключение

  Оптимальные методы сохранения стула, вероятно, зависят от целевой популяции пациентов, развивающихся нормативов и новых научных знаний о микробиоме.Здесь мы описали и обсудили протокол хранения стула, который использовался большим банком стула в 2018 году, чтобы проиллюстрировать текущую практику и выделить области для потенциальных улучшений. Мы надеемся, что этот отчет станет шагом к анализу, который может помочь в разработке научно обоснованных протоколов сохранения стула.

  Члены команды OpenBiome

  («Команда OpenBiome» включает нынешних и бывших сотрудников OpenBiome, членов совета директоров OpenBiome и членов независимого неоплачиваемого клинического консультативного совета OpenBiome.) Джессика Р. Аллегретти, Канчана Амаратунга, Дэниел Блэклер, Майкл Бугас, Шриш Бадри, Лаура Бернс, Джессика В. Крозерс, Майкл Диккенс, Джейкоб Диксон, Нэнси Дюбуа, Кэролайн Эдельштейн, Майкл Эдмонд, Райан Дж. Эллиотт, Моника Фишер, Динара Габдрахманова, Ричард Хант, Стейси Кан, Дэлин Кауфман, Деберли Кауфман, Коллин Келли, Киаран Келли, Клара Кервин, Келли Линг, Дэниел Мартин, Джина Мендолия, Родриго Муньос, Келси О’Брайен, Майди Осман, Эллисон Перротта, Александра Кази, Сонни Кази Шилер, Моника Сенг, Мадлен Сови, Нил Столлман, Зак Штольцнер, Элейн Во, Курт Уоррен, Карл Йодер, Чарльз Янг.

  Заявление о доступности данных

  Исходные материалы, представленные в исследовании, включены в статью / дополнительные материалы. Дальнейшие запросы можно направить соответствующему автору.

  Вклад авторов

  JC и SO разработали проект и выполнили анализ. JC, AZ, BR и SO написали первоначальный черновик. Все авторы внесли свой вклад в статью и одобрили представленную версию.

  Конфликт интересов

  BR — бывший сотрудник Finch Therapeutics.Торговая марка MedDRA ^® зарегистрирована IFPMA от имени ICH.

  Остальные авторы заявляют, что исследование проводилось при отсутствии каких-либо коммерческих или финансовых отношений, которые могут быть истолкованы как потенциальный конфликт интересов.

  Дополнительные материалы

  Дополнительные материалы к этой статье можно найти в Интернете по адресу: https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fcimb.2021.622949/full#supplementary-material

  Ссылки

  Agrawal, M., Арониадис, О. К., Брандт, Л. Дж., Келли, К., Фриман, С., Суравич, К. и др. (2016). Долгосрочная эффективность и безопасность трансплантата фекальной микробиоты при рецидивирующей, тяжелой и сложной инфекции Clostridium difficile у 146 пожилых людей. J. Clin. Гастроэнтерол. 50, 403–407. DOI: 10.1097 / MCG.0000000000000410

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Аллегретти, Дж. Р., Фишер, М., Папа, Э., Эллиотт, Р. Дж., Кланк, Дж., Мендолия, Дж., и другие. (2016). Трансплантация Su1738 фекальной микробиоты, проводимая через оральные капсулы, обеспечивает микробное приживление, аналогичное традиционным методам доставки: безопасность, эффективность и результаты приживления, полученные в результате многоцентрового кластерного рандомизированного исследования по подбору дозы. Гастроэнтерология 150, S540 doi: 10.1016 / S0016-5085 (16) 31855-8

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Аллегретти, Дж. Р., Маллиш, Б. Х., Келли, К., Фишер, М. (2019a). Эволюция использования трансплантации фекальной микробиоты и новые терапевтические показания. Lancet (Лондон, Англия) 394, 420–431. doi: 10.1016 / S0140-6736 (19) 31266-8

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Аллегретти, Дж. Р., Фишер, М., Саги, С. В., Бом, М. Э., Фадда, Х. М., Ранмал, С. Р. и др. (2019b). Капсулы для трансплантации фекальной микробиоты с целевой доставкой в ​​толстую кишку и в желудок при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile : сравнительный когортный анализ высокой и малой доз. Дайджест. Дис. Sci. 64, 1672–1678.doi: 10.1007 / s10620-018-5396-6

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Аллегретти, Дж. Р., Эллиотт, Р. Дж., Ладха, А., Ньенга, М., Уоррен, К., О’Брайен, К. и др. (2020). Скорость обработки стула и продолжительность хранения не влияют на клиническую эффективность трансплантации фекальной микробиоты. Кишечные микробы 11, 1806–1808. doi: 10.1080 / 194

  .2020.1768777

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Баккен, Дж. С., Бороды, Т., Брандт, Л.J., Brill, J.V., Demarco, D.C., Franzos, M.A., et al. (2011). Лечение инфекции Clostridium difficile с помощью трансплантации фекальной микробиоты. Clin. Гастроэнтерол. Гепатол .: Выкл. Clin. Практик. Варенье. Гастроэнтерол. Доц. 9, 1044–1049. doi: 10.1016 / j.cgh.2011.08.014

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Баккен, Дж. С., Полгрин, П. М., Бикманн, С. Е., Риедо, Ф. Х., Стрейт, Дж. А. (2013). Подходы к лечению, включая трансплантацию фекальной микробиоты для рецидивирующей инфекции Clostridium difficile (RCDI) среди врачей-инфекционистов. Анаэроб. 24, 20–24. doi: 10.1016 / j.anaerobe.2013.08.007

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Биббо, С., Яниро, Г., Гасбаррини, А., Каммарота, Г. (2017). Трансплантация фекальной микробиоты: прошлое, настоящее и будущее. Минерва Гастроэнтерол. e Dietol. 63. doi: 10.23736 / S1121-421X.17.02374-1

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Budree, S., Tu, E., Leith, T., Allegretti, J. R., Rao, S., Day, R., и другие. (2017а). Ассоциация диеты доноров стула по микробному профилю и клиническим результатам трансплантации фекальной микробиоты при инфекции Clostridium Difficile . Гастроэнтерология 152, S630 – S631. doi: 10.1016 / S0016-5085 (17) 32234-5

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Budree, S., Wong, W. F., Tu, E., Rao, S., Allegretti, J. R., Fischer, M., et al. (2017b). Способствуют ли конкретные бактерии клиническому излечению при трансплантации фекальной микробиоты от инфекции Clostridium Difficile ?: Клиническая, микробная и метаболическая характеристика универсальных доноров FMT. Гастроэнтерология 152, S349. doi: 10.1016 / S0016-5085 (17) 31428-2

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Budree, S., Osman, M., Panchal, P., Shu, E., Carrellas, M., Kassam, Z., et al. (2018). 618. Влияют ли клинические факторы на приживление микробов после трансплантации фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile ? Заражение открытого форума. Дис. 5, S225–6 doi: 10.1093 / ofid / ofy210.625

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Cammarota, G., Masucci, L., Ianiro, G., Bibbò, S., Dinoi, G., Costamagna, G., et al. (2015). Рандомизированное клиническое испытание: трансплантация фекальной микробиоты с помощью колоноскопии по сравнению с ванкомицином для лечения рецидивирующей инфекции Clostridium difficile . Алимент. Pharmacol. Ther. 41, 835–843 doi: 10.1111 / apt.13144

  PubMed Реферат | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Cammarota, G., Ianiro, G., Tilg, H., Rajilić-Stojanović, M., Kump, P., Satokari, R., et al. (2017).Европейская консенсусная конференция по трансплантации фекальной микробиоты в клинической практике. Gut. 66, 569–580 doi: 10.1136 / gutjnl-2016-313017

  PubMed Реферат | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Cammarota, G., Ianiro, G., Kelly, C.R., Mullish, B.H., Allegretti, J.R., Kassam, Z., et al. (2019). Международная консенсусная конференция по хранению стула для трансплантации фекальной микробиоты в клинической практике. Кишечник 68, 2111–2121. doi: 10.1136 / gutjnl-2019-319548

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Chu, N.Д., Смит, М. Б., Перротта, А. Р., Кассам, З., Алм, Э. Дж. (2017). Профилирование живых бактерий позволяет подготовить трансплантацию фекальной микробиоты. PloS ONE. 12, e0170922 doi: 10.1371 / journal.pone.0170922

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Костелло, С. П., Такер, Э. К., Ла Брой, Дж., Шуман, М. Н., Эндрюс, Дж. М. (2016). Создание службы трансплантации фекальной микробиоты для лечения инфекции Clostridium difficile . Clin. Заразить. Дис. 62, 908–914. doi: 10.1093 / cid / civ994

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Craigle, V. (2007). MedWatch: Программа FDA по безопасности и сообщению о нежелательных явлениях. J. Med. Библиотека доц. 95, 224–225. doi: 10.3163 / 1536-5050.95.2.224

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Davidovics, Z. H., Michail, S., Nicholson, M. R., Kociolek, L. K., Pai, N., Hansen, R., et al. (2019). Трансплантация фекальной микробиоты для рецидивирующей инфекции Clostridium difficile и других состояний у детей. J. Pediatr. Гастроэнтерол. Nutr. 68, 130–143. DOI: 10.1097 / MPG.0000000000002205

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Дебаст, С. Б., Бауэр, М. П., Куиджпер, Э. Дж. (2014). Европейское общество клинической микробиологии и инфекционных заболеваний: обновление руководства по лечению инфекции, вызванной Clostridium difficile , . Clin. Microbiol. Заразить. 20, 1–26. doi: 10.1111 / 1469-0691.12418

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  ДеФилипп, З., Блум, П. П., Торрес Сото, М., Мансур, М. К., Сатер, М. Р. А., Хантли, М. Х. и др. (2019). Лекарственная устойчивость E. coli Бактериемия, передаваемая при трансплантации фекальной микробиоты. New Engl. J. Med. 381, 2043–2050. doi: 10.1056 / NEJMoa1

  7

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Ekekezie, C., Simmons, S., Perler, B., Burhke, T., Duff, C., Hott, B., et al. (2018). Понимание масштабов трансплантации фекальной микробиоты (FMT) «сделай сам». Am.J. Gastroenterol. 113, S102. doi: 10.14309 / 00000434-201810001-00180

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Glauser, W. (2014). Плата за плазму поднимает этические вопросы. CMAJ: Может. Med. Доц. 186, E446. doi: 10.1503 / cmaj.109-4855

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Guh, A. Y., Mu, Y., Winston, L. G., Johnston, H., Olson, D., Farley, M. M., et al. (2020). Тенденции в бремени инфекции, вызванной Clostridioides difficile, и последствиями в США. New Engl. J. Med. 382, ​​1320–1330. doi: 10.1056 / NEJMoa15

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Хайфер, К., Келли, К. Р., Парамзоти, С., Андресен, Д., Папаниколас, Л. Е., МакКью, Г. Л. и др. (2020). Заявления австралийского консенсуса по регулированию, производству и использованию трансплантации фекальной микробиоты в клинической практике. Кишечник 69, 801–810. doi: 10.1136 / gutjnl-2019-320260

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Hirsch, B.Э., Сарайя, Н., Поэт, К., Шварц, Р. М., Эпштейн, М. Э., Хониг, Г. и др. (2015). Эффективность переноса фекальной микробиоты с использованием пероральных капсул для рецидивирующей инфекции Clostridium difficile . BMC Infect. Дис. 15. doi: 10.1186 / s12879-015-0930-z

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Ianiro, G., Maida, M., Burisch, J., Simonelli, C., Hold, G., Ventimiglia, M., et al. (2018). Эффективность различных протоколов трансплантации фекальной микробиоты для инфекции Clostridium difficile : систематический обзор и метаанализ. U. Eur. Гастроэнтерол. J. 6, 1232–1244. doi: 10.1177 / 2050640618780762

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Яниро, Г., Маллиш, Б. Х., Келли, К. Р., Сокол, Х., Кассам, З., Нг, С. С. и др. (2020). Скрининг доноров трансплантата фекальной микробиоты во время вспышки COVID-19: предложения международной группы экспертов по срочным обновлениям. Ланцет Гастроэнтерол. Гепатол. 5, 430–432. doi: 10.1016 / S2468-1253 (20) 30082-0

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Jørgensen, S.M. D., Erikstrup, C., Dinh, K. M., Lemming, L. E., Dahlerup, J. F., Hvas, C. L., et al. (2018). Набор доноров фекалий среди доноров крови: результаты наблюдательного когортного исследования. Кишечные микробы. 1–11 doi: 10.1080 / 194

  .2018.1458179

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Kao, D., Roach, B., Silva, M., Beck, P., Rioux, K., Kaplan, G.G., et al. (2017). Эффект пероральной капсулы по сравнению с трансплантацией фекальной микробиоты, доставленной через колоноскопию, на рецидивирующую инфекцию, вызванную Clostridium difficile : рандомизированное клиническое испытание. JAMA 318, 1985. doi: 10.1001 / jama.2017.17077

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Кассам, З., Дюбуа, Н., Рамакришна, Б., Линг, К., Кази, Т., Смит, М., и др. (2019). Скрининг доноров при трансплантации фекальной микробиоты. New Engl. J. Med. 381, 2070–2072. doi: 10.1056 / NEJMc1

  0

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Келли, К. Р., Хоруц, А., Стейли, К., Садовски, М. Дж., Абд, М., Алани, М., и др.(2016). Влияние трансплантации фекальной микробиоты на рецидивы множественно-рецидивирующей инфекции Clostridium difficile — рандомизированное исследование. Ann. Internal Med. 165, 609. doi: 10.7326 / M16-0271

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Келли, К. Р., Ким, А. М., Лейн, Л., Ву, Г. Д. (2017). Национальный реестр трансплантации фекальной микробиоты AGA: важный шаг к пониманию рисков и преимуществ лечения микробиотой. Гастроэнтерология. 152, 681–684 doi: 10.1053 / j.gastro.2017.01.028

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Келли, К. Р., Фишер, М., Гринспан, А., Аллегретти, Дж. Р. (2019). Пациенты, имеющие право на испытания терапевтических средств на основе микробов, не представляют популяцию с рецидивирующей инфекцией Clostridioides difficile . Clin. Гастроэнтерол. Гепатол. 18, 1099–1101. doi: 10.1016 / j.cgh.2019.06.034

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Хоруц, А., Садовский, М. Дж. (2016). Понимание механизмов трансплантации фекальной микробиоты. Нат. Преподобный Гастроэнтерол. Гепатол. 13, 508–516. doi: 10.1038 / nrgastro.2016.98

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Ким, К. О., Глюк, М. (2019). Трансплантация фекальной микробиоты: обновленная информация о клинической практике. Clin. Эндоскопия. 53, 137–143. doi: 10.5946 / CE.2019.009

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Kim, K. O., Шварц, М. А., Лин, О. С. Т., Чиориан, М. В., Глюк, М. (2019). Снижение стоимости и сложности трансплантации фекальной микробиоты с использованием универсальных доноров для рецидивирующей инфекции Clostridium difficile . Adv. Ther. 36, 2052–2061. doi: 10.1007 / s12325-019-00974-x

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Kragsnaes, M. S., Nilsson, A. C., Kjeldsen, J., Holt, H. M., Rasmussen, K. F., Georgsen, J., et al. (2020). Как создать банк стула для трансплантации фекальной микробиоты в рамках службы трансплантации крови и тканей? Переливание 60, 1135–1141.doi: 10.1111 / trf.15816

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Lee, C.H., Steiner, T., Petrof, E.O., Smieja, M., Roscoe, D., Nematallah, A., et al. (2016). Замороженная трансплантация против свежей фекальной микробиоты и клиническое разрешение диареи у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridium difficile . JAMA 315, 142. doi: 10.1001 / jama.2015.18098

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  McCune, V.Л., Кураиши, М. Н., Манзур, С., Моран, К. Э., Банавати, К., Стид, Х. и др. (2020). Результаты первого английского банка кала с использованием трансплантата фекальной микробиоты в качестве лекарственного средства для лечения инфекции, вызванной Clostridioides difficile , . EClinicalMedicine 20, 100301. doi: 10.1016 / j.eclinm.2020.100301

  PubMed Реферат | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Макдональд, Л. К., Гердинг, Д. Н., Джонсон, С., Баккен, Дж. С., Кэрролл, К. К., Гроб, С.E., et al. (2018). Руководство по клинической практике для Clostridium difficile Инфекция у взрослых и детей: Обновление 2017 года Американского общества инфекционных болезней (IDSA) и Общества эпидемиологии здравоохранения Америки (SHEA). Clin. Заразить. Дис. 66, e1 – e48. doi: 10.1093 / cid / ciy149

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Mendolia, G. M., Bi, H. S., Kassam, Z., Chu, N., Smith, M., Alm, E., et al. (2019). P1036 — Анаэробные капсулы для трансплантации фекальной микробиоты по сравнению с аэробно приготовленными: экспериментальный сравнительный когортный анализ с использованием нового подхода к секвенированию. ACG Annu. Sci. Тезисы собраний .

  Google Scholar

  Маллиш Б. Х., Кураиши М. Н., Сегал Дж. П., МакКьюн В. Л., Бакстер М., Марсден Г. Л. и др. (2018). Использование трансплантата фекальной микробиоты для лечения рецидивирующей или рефрактерной инфекции Clostridium difficile и других потенциальных показаний: совместные рекомендации Британского общества гастроэнтерологии (BSG) и Общества инфекционистов здравоохранения (HIS). Кишечник 67, 1920–1941. doi: 10.1136 / gutjnl-2018-316818

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Николсон, М.Р., Митчелл, П. Д., Александер, Э., Баллал, С., Бартлетт, М., Беккер, П. и др. (2020). Эффективность трансплантации фекальной микробиоты для инфекции Clostridium difficile у детей. Clin. Гастроэнтерол. Гепатол. : Выключенный. Clin. Практик. Варенье. Гастроэнтерол. Доц. 18, 612–619.e1. doi: 10.1016 / j.cgh.2019.04.037

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Olesen, S. W., Gurry, T., Alm, E. J. (2018a). Планирование испытаний трансплантатов фекальной микробиоты, учитывающих различия в эффективности донорского стула. Стат. Методы Мед. Res. 27, 2906–2917. doi: 10.1177 / 0962280216688502

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Олесен, С. В., Лейер, М. М., Альм, Э. Дж., Кан, С. А. (2018b). В поисках табурета: максимальное использование терапевтического потенциала FMT. Нат. Преподобный Гастроэнтерол. Гепатол. 15, 387–388. DOI: 10.1038 / s41575-018-0019-4

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Olesen, S. W., Panchal, P., Chen, J., Будре, С., Осман, М. (2020). Глобальные различия в исследованиях трансплантации фекальной микробиоты. Ланцет Гастроэнтерол. Гепатол. 5, 241. doi: 10.1016 / S2468-1253 (19) 30452-2

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Олесен, С. В. (2020). «Донорские эффекты» трансплантации фекальной микробиоты не имеют клинического значения для инфекции Clostridioides difficile . Гастроэнтерология. doi: 10.1053 / j.gastro.2020.12.057

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Осман, М., O’Brien, K., Stoltzner, Z., Ling, K., Koelsch, E., Dubois, N., et al. (2016). Безопасность и эффективность трансплантации фекальной микробиоты для рецидивирующей инфекции Clostridium difficile из международного общественного банка стула: результаты многоцентровой когорты из 2050 пациентов. Заражение открытого форума. Дис. 3. doi: 10.1093 / ofid / ofw172.1668

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Осман, М., Абенд, А., Панчал, П., Кассам, З., Будри, С. (2018). Имеет ли значение донор? Секвенирование микробиома для оценки эффективности более низких доноров при трансплантации фекальной микробиоты при рецидивирующей инфекции Clostridium Difficile . Гастроэнтерология 154, С – 25-С-26. doi: 10.1016 / S0016-5085 (18) 30564-X

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Ott, S.J., Waetzig, G.H., Rehman, A., Moltzau-Anderson, J., Bharti, R., Grasis, J.A., et al. (2017). Эффективность переноса стерильного фекального фильтрата для лечения пациентов с инфекцией Clostridium difficile . Гастроэнтерология. 152, 799–811.e7 doi: 10.1053 / j.gastro.2016.11.010

  PubMed Abstract | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Panchal, P., Budree, S., Scheeler, A., Medina, G., Seng, M., Wong, W. F., et al. (2018). Масштабирование безопасного доступа к трансплантации фекальной микробиоты: прошлое, настоящее и будущее. Curr. Гастроэнтерол. Rep. 20, 14. doi: 10.1007 / s11894-018-0619-8

  PubMed Реферат | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Paramsothy, S., Borody, T. J., Lin, E., Finlayson, S., Walsh, A.J., Samuel, D., et al. (2015). Привлечение доноров для трансплантации фекальной микробиоты. Inflamm. Кишечник. 21, 1600–1606.doi: 10.1097 / MIB.0000000000000405

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Pasolli, E., Asnicar, F., Manara, S., Zolfo, M., Karcher, N., Armanini, F., et al. (2019). Обширное неизведанное разнообразие микробиома человека выявлено более чем 150 000 геномов из метагеномов, охватывающих возраст, географию и образ жизни. Ячейка. 176, 649–662.e20 doi: 10.1016 / j.cell.2019.01.001

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Qazi, T., Амаратунга, Т., Барнс, Э. Л., Фишер, М., Кассам, З., Аллегретти, Дж. Р. (2017). Риск обострения воспалительного заболевания кишечника после трансплантации фекальной микробиоты: систематический обзор и метаанализ. Кишечные микробы. 8, 574–588. doi: 10.1080 / 194

  .2017.1353848

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Родригес дель Посо, П. (2008). Платежные доноры и этика кровоснабжения. J. Med. Этика. 20, 31–35. DOI: 10.1136 / jme.20.1.31

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Scheeler, A. (2019). Где стул является лекарством: международные подходы к регулированию использования фекальной микробиоты для трансплантации. J. Law Med. Этика 47, 524–540. doi: 10.1177 / 1073110519897729

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Смит, М. Б., Кассам, З., Берджесс, Дж., Перротта, А. Р., Бернс, Л. Дж., Мендолия, Г. М. и др. (2015). Международный общественный банк стула: масштабируемая модель для стандартизированного скрининга и обработки донорского стула для трансплантации фекальной микробиоты. Гастроэнтерология 148, С – 211. doi: 10.1016 / S0016-5085 (15) 30704-6

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Stollman, N., Smith, M., Giovanelli, A., Mendolia, G., Burns, L., Didyk, E., et al. (2015). Замороженный инкапсулированный стул при рецидиве Clostridium difficile : Изучение роли таблеток в иерархии лечения пациентов, не ответивших на трансплантацию фекальной микробиоты. Am. J. Gastroenterol. 110, 600–601. doi: 10.1038 / ajg.2015.81

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Surawicz, C.М., Брандт, Л. Дж., Бинион, Д. Г., Анантакришнан, А. Н., Карри, С. Р., Гиллиган, П. Х. и др. (2013). Руководство по диагностике, лечению и профилактике инфекций, вызванных Clostridium difficile, . Am. J. Gastroenterol. 108, 478–498. doi: 10.1038 / ajg.2013.4

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Tangden, T., Cars, O., Melhus, A., Lowdin, E. (2010). Поездки за границу являются основным фактором риска колонизации кишечной палочкой Escherichia coli Производство лактамаз расширенного спектра CTX-M-типа: перспективное исследование с участием шведских добровольцев. Антимикробный. Агенты Chemother. 54, 3564–3568. doi: 10.1128 / AAC.00220-10

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Terveer, E. M., van Beurden, Y. H., Goorhuis, A., Seegers, J. F. M. L., Bauer, M. P., van Nood, E., et al. (2017). Как: создать и запустить банк табуретов. Clin. Microbiol. Заразить. 23, 924–930. doi: 10.1016 / j.cmi.2017.05.015

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Центры США по контролю и профилактике заболеваний и Ассоциация лабораторий общественного здравоохранения.(2014). Обновленные рекомендации по лабораторным исследованиям для диагностики ВИЧ-инфекции. doi: 10.15620 / cdc.23447

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США. (2013). Руководство для промышленности: Политика обеспечения соблюдения требований к исследуемым новым лекарственным средствам для использования фекальной микробиоты для трансплантации для лечения Clostridium difficile Инфекция, не поддающаяся стандартным методам лечения. 78 (FR) 42965. Доступно по адресу: https://www.federalregister.gov / d / 2013-17223

  Google Scholar

  van Nood, E., Vrieze, A., Nieuwdorp, M., Fuentes, S., Zoetendal, E.G., de Vos, W. M., et al. (2013). Дуоденальная инфузия донорских фекалий при рецидиве Clostridium difficile . New Engl. J. Med. 368, 407–415. doi: 10.1056 / NEJMoa1205037

  CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Уилсон, Б. К., Ватанен, Т., Катфилд, В. С., О’Салливан, Дж. М. (2019). Феномен супердонора при трансплантации фекальной микробиоты. Фронт. Клетка. Заразить. Microbiol. 9, 2. doi: 10.3389 / fcimb.2019.00002

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Woodworth, M. H., Neish, E. M., Miller, N. S., Dhere, T., Burd, E. M., Carpentieri, C., et al. (2017). Лабораторные исследования доноров и образцов кала для трансплантации фекальной микробиоты на рецидивирующую инфекцию, вызванную Clostridium difficile . J. Clin. Microbiol. 55, 1002–1010. doi: 10.1128 / JCM.02327-16

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Яцуненко, Т., Рей Ф. Э., Манари М. Дж., Трехан И., Домингес-Белло М. Г., Контрерас М. и др. (2012). Микробиом кишечника человека в зависимости от возраста и географии. Природа 486, 222–227. DOI: 10.1038 / nature11053

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Youngster, I., Russell, G.H., Pindar, C., Ziv-Baran, T., Sauk, J., Hohmann, E. L., et al. (2014a). Оральная капсулированная трансплантация замороженной фекальной микробиоты при рецидиве Clostridium difficile Инфекция. JAMA 312, 1772. doi: 10.1001 / jama.2014.13875

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Youngster, I., Sauk, J., Pindar, C., Wilson, R.G., Kaplan, J. L., Smith, M. B., et al. (2014b). Трансплантация фекальной микробиоты для рецидива инфекции Clostridium difficile с использованием замороженного инокулята от неродственных доноров: рандомизированное открытое контролируемое пилотное исследование. Clin. Заразить. Дис. 58, 1515–1522. doi: 10.1093 / cid / ciu135

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Юноша, И., Махабамунуге, Дж., Систром, Х. К., Саук, Дж., Халили, Х., Левин, Дж. И др. (2016). Капсулы для перорального трансплантата замороженной фекальной микробиоты (FMT) при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile. BMC Med. 14. doi: 10.1186 / s12916-016-0680-9

  PubMed Аннотация | CrossRef Полный текст | Google Scholar

  Пересадка фекальной микробиоты | UF Health, University of Florida Health

  Определение

  Трансплантация фекальной микробиоты (FMT) помогает заменить некоторые «плохие» бактерии толстой кишки «хорошими» бактериями.Процедура помогает восстановить полезные бактерии, которые были уничтожены или ограничены применением антибиотиков. Восстановление этого баланса в толстой кишке облегчает борьбу с инфекцией.

  Альтернативные названия

  Фекальная бактериотерапия; Пересадка стула; Пересадка кала; Колит, вызванный C. difficile — фекальная трансплантация; Clostridium difficile — фекальный трансплантат; Clostridioides difficile — фекальный трансплантат; Псевдомембранозный колит — трансплантация фекалий

  Описание

  FMT включает забор стула от здорового донора.Ваш лечащий врач попросит вас назвать донора. Большинство людей выбирают члена семьи или близкого друга. Донор не должен использовать антибиотики в течение предыдущих 2-3 дней. Они будут проверены на наличие инфекций в крови или кале.

  После сбора стул донора смешивают с физиологическим раствором и фильтруют. Затем смесь стула попадает в ваш пищеварительный тракт (толстую кишку) через трубку, которая проходит через колоноскоп (тонкая гибкая трубка с маленькой камерой). Полезные бактерии также могут попадать в организм через трубку, которая проходит в желудок через рот.Другой метод — проглотить капсулу, содержащую лиофилизированный донорский стул.

  Зачем проводится процедура

  В толстой кишке обитает большое количество бактерий. Эти бактерии, которые живут в вашем кишечнике, важны для вашего здоровья и сбалансированы.

  Одна из этих бактерий называется Clostridioides difficile ( C difficile) . В небольших количествах не вызывает проблем.

  • Однако, если человек получает многократные или высокие дозы антибиотиков от инфекции в другом месте тела, большая часть нормальных бактерий в кишечнике может быть уничтожена.Бактерии растут и выделяют токсин.
  • В результате может оказаться слишком много C difficile .
  • Этот токсин вызывает опухание и воспаление слизистой оболочки толстой кишки, вызывая лихорадку, диарею и кровотечение.

  Некоторые другие антибиотики могут иногда контролировать бактерии Cdifficile . Если это не помогает, FMT используется для замены некоторых из C difficile «хорошими» бактериями и восстановления баланса.

  FMT также может использоваться для лечения таких состояний, как:

  Лечение состояний, отличных от рецидивирующего колита Cdifficile , в настоящее время считается экспериментальным и широко не используется или не известно об его эффективности.

  Риски

  Риски FMT могут включать следующее:

  • Реакции на лекарство, которое вам дают во время процедуры
  • Сильное или продолжающееся кровотечение во время процедуры
  • Проблемы с дыханием
  • Распространение болезни от донора (если донор не прошел надлежащий скрининг, что бывает редко)
  • Инфекция во время колоноскопии (очень редко)
  • Сгустки крови (очень редко)

  Перед процедурой

  Донор, скорее всего, примет слабительное за ночь перед процедурой, чтобы он мог на следующее утро испражнение.Они соберут образец стула в чистую чашку и принесут с собой в день процедуры.

  Поговорите со своим поставщиком медицинских услуг о любых аллергиях и обо всех лекарствах, которые вы принимаете. НЕ прекращайте принимать какие-либо лекарства, не посоветовавшись со своим врачом. Вам нужно будет прекратить прием любых антибиотиков за 2–3 дня до процедуры.

  Возможно, вам потребуется соблюдать жидкую диету. Накануне процедуры вас могут попросить принять слабительное. Вам нужно будет подготовиться к колоноскопии за ночь до FMT.Ваш врач даст вам инструкции.

  Перед процедурой вам дадут лекарства от сонливости, чтобы вы не чувствовали дискомфорта и не вспомнили о процедуре.

  После процедуры

  После процедуры вы будете лежать на боку около 2 часов с раствором в кишечнике. Вам могут назначить лоперамид (имодиум), чтобы замедлить работу кишечника, чтобы раствор оставался на месте в течение этого времени.

  Вы пойдете домой в тот же день после процедуры, как только вы откажетесь от стула.Вам понадобится поездка домой, поэтому не забудьте организовать ее заранее. Вам следует избегать вождения автомобиля, употребления алкоголя и подъема тяжестей.

  Ночью после процедуры у вас может подняться субфебрильная температура. В течение нескольких дней после процедуры у вас может быть вздутие живота, газы, метеоризм и запор.

  Ваш врач проинструктирует вас о типе диеты и лекарствах, которые вам необходимо принять после процедуры.

  Перспективы (Прогноз)

  Это спасающее жизнь лечение отличается высокой безопасностью, эффективностью и низкой стоимостью.FMT помогает вернуть нормальную флору через донорский стул. Это, в свою очередь, помогает восстановить нормальную работу кишечника и здоровье.

  Ссылки

  Галандюк С., Нетц У., Морпурго Э., Тосато С.М., Абу-Фреха Н., Тайлер Эллис К. Толстая кишка и прямая кишка. В: Townsend CM Jr, Beauchamp RD, Evers BM, Mattox KL, ред. Сабистон Учебник хирургии. 21 изд. Сент-Луис, Миссури: Эльзевьер; 2022: глава 52.

  Гердинг Д.Н., Янг В.Б., Донски С.Дж. Инфекция, вызванная Clostridiodes difficile (ранее — Clostridium difficile).В: Bennett JE, Dolin R, Blaser MJ, eds. Принципы и практика инфекционных заболеваний Манделла, Дугласа и Беннета. 9 изд. Филадельфия, Пенсильвания: Эльзевьер; 2020: глава 243.

  Рао К., Сафдар Н. Трансплантация фекальной микробиоты для лечения инфекции Clostridium difficile. J Hosp Med. 2016; 11 (1): 56-61. PMID: 26344412 www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26344412/.

  Шнайдер А., Марич Л. Трансплантация фекальной микробиоты как терапия воспалительного заболевания кишечника.В: Шен Б., изд. Интервенционное воспалительное заболевание кишечника. Кембридж, Массачусетс: Elsevier Academic Press; 2018: глава 28.

  Терапия и трансплантация фекалий | Центр медицины и микробиома

  Лаборатория трансплантации фекальной микробиоты

  Дисбиоз микробиома кишечника был связан со многими аспектами болезней человека, включая рецидивирующую инфекцию Clostridium difficile . Трансплантация фекальной микробиоты (FMT) — это новый терапевтический подход к заселению микробиома пациента различными микроорганизмами, который восстанавливает здоровый микробиом и облегчает симптомы заболевания.FMT включает доставку специально подготовленного калового (фекального) материала от здорового донора пациенту-реципиенту. У пациентов с рецидивирующей инфекцией C.difficile , которым ранее не удавалось вылечиться после антибактериальной терапии, была показана высокая эффективность FMT, и теперь эта процедура рекомендована в национальных и международных руководствах.

  Программа FMT в Медицинском центре Университета Питтсбурга (UPMC) — это совместная инициатива отделов инфекционных заболеваний и гастроэнтерологии, которая была основана в 2013 году с основной клинической миссией по лечению пациентов с рецидивом C.difficile инфекции. Мы использовали два основных пути доставки FMT в зависимости от предпочтений пациента: колоноскопия или введение через назодуоденальный зонд (NDT). С 2013 года в рамках нашей программы было успешно выполнено 19 трансплантаций с общим успехом 89%. Основное внимание в нашей программе FMT уделяется краткосрочной и долгосрочной безопасности потенциальных получателей. Это достигается путем тщательного и всестороннего скрининга как доноров, так и реципиентов, а также путем обработки фекалий как фармацевтического вещества в специальной лаборатории FMT, одобренной Департаментом здравоохранения штата Пенсильвания.Обработка фекального материала выполняется в боксе биологической безопасности с использованием стерилизованного паром или одноразового стерильного оборудования / реагентов, одобренных для ухода за пациентами. Особое внимание уделяется предотвращению загрязнения материала донорского стула другими микроорганизмами, включая загрязнение окружающей среды и заражение от персонала, обрабатывающего образцы. В апреле 2016 года мы запустили банк замороженного стула для добровольцев, который аналогичен концепции банка крови, и будет предоставлять «лечебные дозы» стула по запросу от «элитных» здоровых доноров-добровольцев и обеспечивать дополнительную безопасность для реципиентов.

  Просим всех наших доноров и реципиентов участвовать в реестре FMT (UPMC IRB # PRO14060081), хранилище стула от доноров-доноров и реципиентов как до, так и после процедуры FMT. Мы ожидаем, что это хранилище станет важным ресурсом для исследователей, интересующихся микробиомом кишечника. Кроме того, мы заинтересованы в расширении нашей услуги FMT за пределы повторяющейся инфекции C. difficile , такой как воспалительное заболевание кишечника, рак и ВИЧ.В связи с этим программа FMT предлагает исследователям, заинтересованным во включении FMT в свои исследования или клиническую помощь в: (i) разработке предложений по исследованиям и / или протоколов; (ii) лабораторная оценка доноров и реципиентов; (iii) подготовка и хранение «доз» стула для трансплантации; (iv) клиническая поддержка процедур FMT; (v) и доступ к нашему исследовательскому хранилищу.

  Чтобы узнать больше, свяжитесь с нами по [email protected].

  Что побуждает людей жертвовать свои фекалии на медицину? Спрос на доноров стула растет по мере того, как признаются преимущества трансплантации фекальной микробиоты — ScienceDaily

  Обращение к заботе о других — лучший способ привлечь большинство людей для пожертвования своего стула на лекарства, в то время как денежное вознаграждение может быть дополнительным мотиватором для некоторых потенциальных доноры, согласно исследованию, запланированному для презентации на Digestive Disease Week® (DDW) 2018.

  Значение исследования «Существует срочная медицинская необходимость в донорстве стула, но многие люди не могут преодолеть« фактор риска », — сказала Брианна МакСуини, студентка-медик из Университета Альберты, Китай, и ведущий автор исследования. «К сожалению, потенциальных доноров бывает очень сложно нанять и удержать, поэтому мы хотели узнать больше о том, что мотивирует и удерживает людей от участия».

  Пересадка фекальной микробиоты (FMT) широко считается наиболее эффективным средством лечения опасной кишечной инфекции, известной как Clostridium difficile ( C.diff ), заболевание, которое вызывает почти полмиллиона инфекций ежегодно в США и связано примерно с 29000 смертей в год. Процедура включает пересадку фекалий от здорового донора, чтобы помочь создать колонии здоровых бактерий у пациентов, перенесших повторные инфекции. «Чтобы сделать эту жизненно важную терапию доступной, жизненно важно иметь большой банк здоровых доноров стула», — добавил МакСвини.

  В дополнение к лечению C.diff , FMT также исследуется как средство лечения других распространенных заболеваний пищеварительной системы, таких как синдром раздраженного кишечника и воспалительные заболевания кишечника, включая болезнь Крона и язвенный колит, поэтому потребность в донорстве стула, вероятно, будет расти.

  Дизайн исследования

  Исследователи из Университета Альберты опросили 802 человек в США, Канаде и Англии, чтобы выяснить, что может побудить людей стать донорами стула. Участники заполнили онлайн-опрос из 32 вопросов, и им было предложено ответить на открытые вопросы о донорстве стула.

  Результаты исследования

  Альтруизм был наиболее распространенным призывом, который, по словам респондентов, побуждал их делать пожертвования, при этом почти 42 процента всех респондентов назвали желание помочь другим в качестве основной причины делать пожертвования. Более 35% респондентов указали экономическую компенсацию как дополнительный фактор мотивации. Исследователи также заявили, что респонденты были бы более склонны сдавать кровь, если бы знали, как донорство стула помогает пациентам, положительно относились к пересадке фекалий или уже были донорами крови.

  Исследование показало, что затраты времени, логистика и неприятные ощущения, связанные со сбором и транспортировкой стула, были основными сдерживающими факторами для сдачи крови. «Хотя концепция донорства стула может показаться странной, важно помнить, что это может спасти чью-то жизнь», — сказал МакСвини.

  DDW Информация о презентации

  Брианна МакСуини представит данные исследования «Потенциальные мотиваторы и сдерживающие факторы для доноров стула: многоцентровое исследование», аннотация Tu1894, во вторник, 5 июня, в 9:30.м. ЛЕТНЕЕ СЕВЕРОАМЕРИКАНСКОЕ ВОСТОЧНОЕ ВРЕМЯ.

  История Источник:

  Материалы предоставлены Недели болезней органов пищеварения . Примечание. Содержимое можно редактировать по стилю и длине.

  Добавить комментарий Отменить ответ

  Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *

  Комментарий *

  Имя *

  Email *

  Сайт