Что такое бак посев кала: Как сдать материал на бактериологическое исследование -Лаборатории, параклиники

Как сдать материал на бактериологическое исследование -Лаборатории, параклиники

Как сдать материал на бактериологическое исследование

Бактериологическая лаборатория
-пациентам: как сдать материал на бактериологическое исследование

Общие требования к сбору и транспортировке проб биологического материала для бактериологического исследования:

• Пробы необходимо собирать до начала антибактериальной терапии, при отсутствии такой возможности – посредственно перед повторным приемом (введением) препарата.
• Пробы необходимо собирать с минимальным загрязнением материала нормальной микрофлорой, т.к. её наличие приводит к ошибочной трактовке результата
• Пробы необходимо собирать в стерильную одноразовую посуду, предназначенную для бактериологических исследований. Недопустимо мыть стерильный контейнер перед использованием!
• При сборе и транспортировке пробы не загрязнять наружную поверхность посуды и сопроводительные документы (направления)
• Собранные пробы доставляют в лабораторию не позднее 2-х часов с момента сбора, в случае использования транспортной системы (стерильная пробирка с транспортной средой и тампоном, стерильно упакованным вместе с пробиркой) – в течение 48-72 часов.

ВНИМАНИЕ!

Несоблюдение правил может привести к необходимости повторной сдачи анализа или неправильной трактовке результата

Посуда, используемая для транспортировки проб в бактериологическую лабораторию

Направление в бактериологическую лабораторию ГКБ №15 им. О.М.Филатова на бактериологическое исследование (бак. посев)
Копия страхового полиса

Посуда, используемая для транспортировки проб в бактериологическую лабораторию

Правила сбора биологических материалов, собираемых пациентами самостоятельно

МОЧА

• Перед сбором пробы необходимо тщательно промыть наружные половые органы и область заднего прохода теплой водой с мылом.
• Не допускается использование дезинфектантов для проведения обработки.
• Не допускается собирать мочу с постельного белья, из мочеприемника или судна.
• Для анализа следует собирать среднюю порцию утренней мочи. Начать мочеиспускание в унитаз, среднюю порцию собрать в стерильный одноразовый контейнер в количестве 10-20 мл, закончить мочеиспускание в унитаз.
• Пробу необходимо доставить в лабораторию не позднее 2 часов с момента сбора.

ФЕКАЛИИ

• Собирать фекалии для исследования следует утром.
• Дефекацию производят в сухую чистую, предварительно продезинфицированную ёмкость. Важно тщательно удалить дезинфектанты с поверхности емкости, ополоснуть кипятком и охладить до комнатной температуры.
• Перенести пробу кала 3-4 ложечки (1,5-2,0 г) в стерильный одноразовый контейнер при помощи вмонтированного в его крышку стерильного шпателя-ложечки. При наличии в испражнении патологических примесей – гной, слизь, кровь, хлопья – их необходимо включить в отбираемую пробу. — Если фекалии жидкие, контейнер заполняют не более чем на 1/3 объема.
• У реанимационных больных, маленьких детей допускается собирать материал со стерильной сухой пеленки, не касаясь ткани.
• Не допускать попадания в пробу кала мочи или воды.
• Пробу доставляют в лабораторию не позднее 2-х часов с момента сбора. В случае крайней необходимости (невозможности получить утреннюю пробу), допустимо оставить материал, полученный накануне во время вечерней дефекации, в холодильнике, и доставить его в лабораторию утром.
• Внимание! При назначении анализа кала на определение антигена токсинов Clostridium difficile исследованию подлежит только жидкий стул.

МОКРОТА

• Перед сбором мокроты пациент должен почистить зубы и прополоскать рот и горло теплой кипяченой водой.
• Важно, чтобы в контейнер не попало содержимое носоглотки или слюни.
• Пробу мокроты, полученную в результате глубокого кашля, собирают в стерильный одноразовый контейнер с завинчивающейся крышкой.
• Пробу доставляют в лабораторию не позднее 2-х часов с момента сбора.

ГРУДНОЕ МОЛОКО

• При сцеживании молока женщина моет руки с мылом и тщательно обрабатывает соски и околососковую область отдельными смоченными 700 спиртом ватными тампонами.
• Молоко из правой и левой молочных желез исследуется отдельно.
• Первые 5-10 мл молока выливаются, последующие 3-4 мл сцеживаются в стерильный одноразовый контейнер.
• Пробы доставляют в лабораторию в сроки не более 3 часов до момента исследования.
• Молоко, сцеженное накануне, исследованию не подлежит.

Стерильные одноразовые контейнеры для бактериологических исследований приобретаются самостоятельно в аптеках.

В бактериологической лаборатории проводится бактериологическое исследование других биологических материалов, которые забирает специалист в медицинских учреждениях.

Время приема биологического материала на бактериологическое исследование:

понедельник-пятница
8. 30-10.00
Тел. 8 (495) 375-12-24

Главный корпус больницы, центральный вход, справа от справочной

При сдаче материала на исследование необходимо при себе иметь документы:

1. Направление в бактериологическую лабораторию ГКБ №15 им. О.М.Филатова на бактериологическое исследование (бак. посев)
2. Копия страхового полиса

Посев кала на патогенную флору (диз. группа и тифопаратифозная группа) с определением чувствительности к антибиотикам

Микробиологическое исследование, позволяющее выявить в кале патогенную флору: возбудителей бактериальной дизентерии (шигеллеза), сальмонеллезов, в том числе брюшного тифа и паратифа, а также патогенные группы кишечной палочки (E. coli) – возбудителей эшерихиозов.

Синонимы русские

Посев кала на патогены.

Синонимы английские

Stool сulture, Salmonella sp., Shigella sp., Escherichia coli, bacteria identification and susceptibility, Stool culture, routine.

Метод исследования

Микробиологический метод.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Кал, ректальный мазок.

Как правильно подготовиться к исследованию?

• Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
• Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить (по согласованию с врачом) прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.), и препаратов, влияющих на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Патогенные микроорганизмы не входят в состав нормальной микрофлоры и в норме у человека отсутствуют. При попадании в организм они, как правило, приводят к инфекционным заболеваниям.

Бактерии дизентерийной группы вызывают дизентерию (шигеллез) – острое инфекционное заболевание с фекально-оральным механизмом передачи возбудителя. Она сопровождается преимущественным поражением толстой кишки с диареей, лихорадкой и болями в животе. В стуле пациента зачастую обнаруживается кровь, слизь или гной.

К бактериям тифо-паратифозной группы относятся Salmonella typhi (возбудитель брюшного тифа), Salmonella paratyphi A, B, C (возбудитель паратифа A, B, C соответственно), а также возбудители других сальмонеллезов. Сальмонеллез передается фекально-оральным путем и характеризуется преимущественным поражением желудочно-кишечного тракта, а его симптомы похожи на симптомы гастроэнтерита или энтерита: тошнота, рвота, спазмы в животе, диарея, лихорадка и головные боли.

Брюшной тиф – это острое инфекционное заболевание с фекально-оральным путем передачи, протекающее с постепенным развитием общего недомогания, бессонницы и головной боли, к которым присоединяются лихорадка, симптомы поражения центральной нервной системы в виде заторможенности, нарушений сознания и бреда, а также нарушения стула и сыпь в области живота и грудной клетки. Паратиф А и В по клинической картине и эпидемиологическим особенностям схожи с брюшным тифом, а паратиф С напоминает пищевую токсикоинфекцию.

Патогенные кишечные палочки являются причиной эшерихиозов – острых кишечных инфекций, которым в большей степени подвержены дети. Эшерихии делят на серогруппы по О-антигену. Среди патогенных эшерихий (кишечных палочек) выделяют:

1) энтеротоксигенные, приводящие к холероподобной диарее,

2) энтеропатогенные, вызывающие диарею главным образом у детей,

3) энтероинвазивные кишечные палочки, сходные по своим свойствам с возбудителями бактериальной дизентерии,

4) энтерогеморрагические, приводящие к дизентериеподобной диарее и гемоколиту.

Для всех перечисленных заболеваний характерно бактерионосительство – транзиторное (случайно выявленное), острое (в период выздоровления после острой дизентерии) или хроническое.

Идентифицировать патогенные микроорганизмы и определить их чувствительность к антибиотикам возможно только при помощи микробиологических методов, таких как культивирование на питательных средах (посев) с определением чувствительности выделенного микроорганизма к антибиотикам.

Для чего используется исследование?

• Для выявления бактериальной дизентерии, сальмонеллезов (в том числе брюшного тифа и/или паратифов), эшерихиозов.
• Как часть дифференциальной диагностики (наряду с другими исследованиями) инфекционных заболеваний, протекающих со сходными симптомами, таких как диарея, вызванная вирусами, простейшими или другими бактериями, воспалительные заболевания кишечника, рак толстой и прямой кишки, нарушения всасывания, некоторые эндокринные заболевания.
• Для выявления бактерионосителей.
• Для того чтобы выбрать рациональную антибактерильную терапию и оценить ее эффективность.

Когда назначается исследование?

• При подозрении на острую или хроническую бактериальную дизентерию, сальмонеллез или эшерихиоз.
• При обследовании лиц, контактировавших с бактерионосителями или переболевшими дизентерией, сальмонеллезами (в том числе и брюшным тифом, паратифами), эшерихиозами или другими кишечными инфекциями неясного происхождения в течение последнего года.
• При вспышках острых кишечных инфекций, особенно в «закрытых» коллективах.
• В качестве профилактического обследования лиц перед госпитализацией в стационар.

Что означают результаты?

Референсные значения: не обнаружены.

Положительный результат посева, то есть выявление возбудителей дизентерии, сальмонеллезов или эшерихиозов свидетельствует о соответствующем заболевании в острой форме (при наличии клинической картины) или в форме бессимптомного бактерионосительства (транзиторного – при однократном положительном результате посева, острого – при положительном результате посева в течение периода выздоровления, хронического – при неоднократных положительных результатах посева).

В случае сомнительного результата следует провести повторное исследование.

При отрицательном результате посева наличие заболевания маловероятно.

Что может влиять на результат?

К ложноотрицательному результату ведет предшествующая антибактериальная терапия или химиотерапия.


Скачать пример результата

Также рекомендуется

• Anti-Shigella flexneri 1-5, anti-Shigella sonnei
• Антитела к Vi-aнтигену Salmonella typhi
• Анализ кала на скрытую кровь
• Общий анализ крови
• Посев кала на условно-патогенную флору
• Анализ кала на цисты простейших

Кто назначает исследование?

Инфекционист, терапевт, врач общей практики, педиатр, гастроэнтеролог.

Литература

1. Энциклопедия клинических лабораторных тестов / под ред. Н.У. Тица. – М. : «Лабинформ», 1997 – 942 с.
2. Руководство по инфекционным болезням / под ред. Ю.В. Лобзина, С.С. Козлова, А.Н. Ускова. – CПб : Феникс, 2001. – 932 с.

Посев на патогенную кишечную флору, определение чувствительности к антимикробным препаратам и бактериофагам

Метод определения
Бактериологический, бактериоскопический

Исследуемый материал
Кал

Доступен выезд на дом

Определение этиологии ОКИЗ (острого кишечного инфекционного заболевания) и выбор рациональной антибиотикотерапии.

Рациональная терапия дизентерии основана на идентификации её возбудителя — бактерий рода Shigella.

Шигеллы (по имени японского учёного К. Шиги) грамотрицательные неподвижные неспороносные палочки длиной 23 мкм, шириной 0,6 мкм. По типу обмена аэробы и факультативные анаэробы.Они выделяют токсины, повреждающие эпителий кишечника, усиливают секрецию жидкости и солей в просвет кишки. Шигеллы быстро изменяют свою чувствительность к различным антибактериальным препаратам.

Заражение происходит фекально-оральным путём. Для возникновения заболевания достаточно инфицирование менее чем 100 микробными клетками шигелл. Инкубационный период от одних до 7 суток (в среднем 2 — 3 суток), но может сокращаться до 12 и даже до 2 часов. Заболевание начинается остро. Возникает общая интоксикация, повышается температура тела, появляются схваткообразные боли в животе (тенезмы), усиливающиеся перед дефекацией. В последние годы отмечается резкое увеличение количества больных тяжёлой дизентерией и её хроническими формами. Диагноз хронической дизентерии устанавливается в случае, если заболевание продолжается более 3 месяцев.

Лабораторное подтверждение дизентерии проводится бактериологическим и серологическим методами. Бактериологический метод (высев шигелл из испражнений) при 3-кратном исследовании обеспечивает подтверждение диагноза у большинства больных. Это обеспечивает дифференциальную диагностику с другими острыми диарейными заболеваниями — сальмонеллёзом, эшерихиозом, кишечным иерсиниозом, холерой, амёбиазом.

Сальмонеллы (по имени американского исследователя D. Salmon) – возбудители энтероколитов или пищевой токсикоинфекции, а также генерализованных тифопаратифозных инфекций. Мелкие грамотрицательные палочки, подвижны за счет жгутиков. По типу метаболизма – факультативные анаэробы. Факторы патогенности – термостабильные эндотоксины, термолабильный энтеротоксин, микрокапсулы, белки наружной мембраны клеточной стенки (способствуют адгезии на энтероцитах тонкой кишки). Сальмонеллезы – зоонозно-антропонозные инфекции, могут быть причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллы могут размножаться при 4-6 град. С и длительно сохраняться в замороженных продуктах. Брюшной тиф и др. сальмонеллезы являются инфекциями с фекально-оральным механизмом передачи, основной путь передачи — пищевой, главным образом через продукты животного происхождения. Заболевание протекает в форме гастроэнтерита, гастроэнтероколита, гастрита (без диареи), тифоподобной форме и септической форме. После перенесенного заболевания в 20% случаев возникает бактерионосительство, которое может продолжаться пожизненно. Лабораторная диагностика сальмонеллеза основана на выделении возбудителя при посеве различных видов биоматериала от больного (фекалии, рвотные массы, желчь, кровь при септических формах) при микробиологическом исследовании.

Выделяемые возбудители: шигеллы, сальмонеллы.

Обращаем внимание на необходимость предварительного приобретения стерильной пробирки с питательной средой, используемой при взятии биоматериала, в любом медицинском офисе ИНВИТРО.

Литература

1. Богомолов Г. И. Дифференциальная диагностика инфекционных болезней. М. 2000. 231 стр.




2. Энциклопедия клинических лабораторных тестов под ред. Н.У. Тица. Издательство «Лабинформ» — М. — 1997 — 942 с.




3. Руководство по медицинской микробиологии под.ред.А.С.Лабинской, Москва, 2010г.




4. Методики клинических лабораторных исследований под ред.В.В.Меньшикова, т.3, Москва, 2009г.




5. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология, Л.Б.Борисов, Москва, 2005г.




6. Gorbach S. Et al./ Infectious Diseases (3rd edition)/2003/ Lippincott Williams & Wilkins/2700 ps.




7. Jacobs D. et al. Laboratory test handbook/ Lexi-Comp./2002 — 1534 p.
   

Медицинский центр — Асклепий Бактериологические исследования

Бак.исследование кала на носительство возбудителей кишечных инфекций (дизгруппа)

Исследуемый материал: Кал, ректальный соскоб

Сроки исполнения: 7 р. д.

Подготовка к исследованию:
Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить (по согласованию с врачом) прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.), и препаратов, влияющих на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Об исследовании:
Микробиологическое исследование, позволяющее выявить в кале патогенную флору: возбудителей бактериальной дизентерии (шигеллеза), сальмонеллезов, в том числе брюшного тифа и паратифа, а также патогенные группы кишечной палочки (E. coli) – возбудителей эшерихиозов. Патогенные микроорганизмы не входят в состав нормальной микрофлоры и в норме у человека отсутствуют. При попадании в организм они, как правило, приводят к инфекционным заболеваниям.

Бактерии дизентерийной группы вызывают дизентерию (шигеллез) – острое инфекционное заболевание с фекально-оральным механизмом передачи возбудителя. Она сопровождается преимущественным поражением толстой кишки с диареей, лихорадкой и болями в животе. В стуле пациента зачастую обнаруживается кровь, слизь или гной.

К бактериям тифопаратифозной группы относятся Salmonella typhi (возбудитель брюшного тифа), Salmonella paratyphi A, B, C (возбудитель паратифа A, B, C соответственно), а также возбудители других сальмонеллезов. Сальмонеллез передается фекально-оральным путем и характеризуется преимущественным поражением желудочно-кишечного тракта, а его симптомы похожи на симптомы гастроэнтерита или энтерита: тошнота, рвота, спазмы в животе, диарея, лихорадка и головные боли.

Брюшной тиф – это острое инфекционное заболевание с фекально-оральным путем передачи, протекающее с постепенным развитием общего недомогания, бессонницы и головной боли, к которым присоединяются лихорадка, симптомы поражения центральной нервной системы в виде заторможенности, нарушений сознания и бреда, а также нарушения стула и сыпь в области живота и грудной клетки. Паратиф А и В по клинической картине и эпидемиологическим особенностям схожи с брюшным тифом, а паратиф С напоминает пищевую токсикоинфекцию.

Патогенные кишечные палочки являются причиной эшерихиозов – острых кишечных инфекций, которым в большей степени подвержены дети.

Посев на патогенную кишечную группу и определение чувствительности к антибиотикам (Stool Culture, Salmonella sp., Shigella sp. Bacteria Identification and Susceptibility)

Исследуемый материал
Кал

Определение этиологии ОКИЗ (острого кишечного инфекционного заболевания) и выбор рациональной антибиотикотерапии.

Рациональная терапия дизентерии основана на идентификации её возбудителя — бактерий рода Shigella.

Шигеллы (по имени японского учёного К. Шиги) грамотрицательные неподвижные неспороносные палочки длиной 23 мкм, шириной 0,6 мкм. По типу обмена аэробы и факультативные анаэробы.Они выделяют токсины, повреждающие эпителий кишечника, усиливают секрецию жидкости и солей в просвет кишки. Шигеллы быстро изменяют свою чувствительность к различным антибактериальным препаратам.

Заражение происходит фекально-оральным путём. Для возникновения заболевания достаточно инфицирование менее чем 100 микробными клетками шигелл. Инкубационный период от одних до 7 суток (в среднем 2 — 3 суток), но может сокращаться до 12 и даже до 2 часов.


Заболевание начинается остро. Возникает общая интоксикация, повышается температура тела, появляются схваткообразные боли в животе (тенезмы), усиливающиеся перед дефекацией.


В последние годы отмечается резкое увеличение количества больных тяжёлой дизентерией и её хроническими формами. Диагноз хронической дизентерии устанавливается в случае, если заболевание продолжается более 3 месяцев.

Лабораторное подтверждение дизентерии проводится бактериологическим и серологическим методами. Бактериологический метод (высев шигелл из испражнений) при 3-кратном исследовании обеспечивает подтверждение диагноза у большинства больных. Это обеспечивает дифференциальную диагностику с другими острыми диарейными заболеваниями — сальмонеллёзом, эшерихиозом, кишечным иерсиниозом, холерой, амёбиазом.

Сальмонеллы (по имени американского исследователя D. Salmon) – возбудители энтероколитов или пищевой токсикоинфекции, а также генерализованных тифопаратифозных инфекций. Мелкие грамотрицательные палочки, подвижны за счет жгутиков. По типу метаболизма – факультативные анаэробы. Факторы патогенности – термостабильные эндотоксины, термолабильный энтеротоксин, микрокапсулы, белки наружной мембраны клеточной стенки (способствуют адгезии на энтероцитах тонкой кишки). Сальмонеллезы – зоонозно-антропонозные инфекции, могут быть причиной внутрибольничных инфекций. Сальмонеллы могут размножаться при 4-6 град. С и длительно сохраняться в замороженных продуктах. Брюшной тиф и др. сальмонеллезы являются инфекциями с фекально-оральным механизмом передачи, основной путь передачи — пищевой, главным образом через продукты животного происхождения. Заболевание протекает в форме гастроэнтерита, гастроэнтероколита, гастрита (без диареи), тифоподобной форме и септической форме. После перенесенного заболевания в 20% случаев возникает бактерионосительство, которое может продолжаться пожизненно. Лабораторная диагностика сальмонеллеза основана на выделении возбудителя при посеве различных видов биоматериала от больного (фекалии, рвотные массы, желчь, кровь при септических формах) при микробиологическом исследовании.

Выделяемые возбудители: шигеллы, сальмонеллы.

Обращаем внимание на необходимость приобретения стерильной пробирки с питательной средой для взятия биоматериала под залог. Возврат залоговых средств осуществляется при сдаче анализа и при условии наличия чека за внесение залога.

Литература

1. Богомолов Г.И. Дифференциальная диагностика инфекционных болезней. М. 2000. 231 стр.




2. Энциклопедия клинических лабораторных тестов под ред. Н.У. Тица. Издательство «Лабинформ» — М. — 1997 — 942 с.




3. Руководство по медицинской микробиологии под.ред.А.С.Лабинской, Москва, 2010г.




4. Методики клинических лабораторных исследований под ред.В.В.Меньшикова, т.3, Москва, 2009г.




5. Медицинская микробиология, вирусология, иммунология, Л.Б.Борисов, Москва, 2005г.




6. Gorbach S. Et al./ Infectious Diseases (3rd edition)/2003/ Lippincott Williams & Wilkins/2700 ps.




7. Jacobs D. et al. Laboratory test handbook/ Lexi-Comp./2002 — 1534 p.
   

Сдать детям бак посев

Сдать детям бак посев необходимо для выявления возбудителей заболеваний и оценки эффективности лечения. Для исследования используются различные биологические материалы: кровь, моча, кал, отделяемое носоглотки и другие. Взятые определенным образом материалы помещаются на питательную среду. Это приводит к размножению возбудителя и позволяет определить его тип и вид. Кроме того, такой анализ дает возможность оценить чувствительность микробов к антибиотикам и назначить необходимое лечение. Чтобы получить наиболее достоверные результаты, сдать бак посев необходимо до начала антибиотикотерапии.

Бакпосев может назначить детский лор, гастроэнтеролог или другой специалист. Чаще всего бактериологическому исследованию подвергаются кровь, моча, кал, мазок из носа, горла.

Показанием к диагностике у детей являются:

• повышение температуры,
• подозрение на инфекционное заболевание, сепсис.

Рекомендуется сдавать кровь при максимальном показателе температуры тела. В этом случае количество микробов особенно велико и результат будет достоверным. Забор проводят до начала лечения или через 10-14 после его окончания, чтобы установить эффективность терапии.

Бактериологический анализ мочи на стерильность назначается при подозрении на заболевания почек, уретры, мочевого пузыря, а также для выявления отдельных инфекций. Для исследования желательно предоставить утреннюю порцию мочи. У грудных детей — любую, какую удастся собрать.

Бак посев кала необходимо сдать при подозрении на кишечные инфекции (сальмонеллез, дизентерию и др.). Анализ выявляет острые, хронические формы патологии и стадии носительства. На его основе составляется программа терапии, проводится контроль ее результатов.

При инфекционных болезнях верхних дыхательных путей (например, ангине, коклюше, скарлатине) показан посев из носа или горла. Это обследование также проводится перед поступлением ребенка в детский сад или школу. Проводить процедуру лучше утром, перед чисткой зубов, натощак.

Сдать детям бак посев предлагает детский медицинский центр «Здоровое поколение». Мы осуществляем все виды анализов в короткие сроки. На основе достоверных данных диагностики лечащий врач сможет назначить подходящую терапию.

Бакпосев кала на дисбактериоз + антибиотикограмма

Диагностическое направление

Инфекционное поражение организма

Общая характеристика

Изменения количественных или качественных характеристик нормальной микрофлоры создают условия для развития условнопатогенных бактерий (УПБ) — представителей родов клебсиел, энтеробактеров, протея, стафилококков, ацинетобактеров, псевдомонад и грибов рода Candidа. Нарушение нормальной микрофлоры кишечника характеризуется исчезновением или снижением числа облигатных ее представителей и увеличением популяционного уровня УПБ, отсутствующих или встречающихся в ничтожных количествах в норме. В итоге такие дисбиозные микробные ассоциации не в состоянии выполнять защитные и физиологические функции в кишечнике, которые они осуществляют в условиях нормобиоценоза.

Показания для назначения

Обследование на дисбактериоз лиц в группе риска по развитию дисбиоза кишечника: •новорождённые, у которых нарушению нормофлоры кишечника способствуют следующие факторы: бактериальный вагиноз и мастит у матери, низкая оценка по шкале Апгар и проведение реанимационных мероприятий, позднее прикладывание к груди, длительное пребывание в роддоме, физиологическая незрелость моторной функции кишечника, наличие малых гнойных инфекций, непереносимость грудного молока, синдром мальабсорбции, первичный иммунодефицит; •дети грудного и раннего возраста в случаях неблагоприятного течения периода новорожденности (в анамнезе), раннего искусственного вскармливания, диспептических нарушений, частых ОРВИ, рахита, анемии, гипотрофии, изменений в психоневрологическом статусе ребёнка, аллергического дерматита; •дети дошкольного и школьного возраста, находящиеся в замкнутых коллективах, с частыми ОРВИ, аллергическими реакциями; •взрослые: профессиональные вредности; стрессы; несбалансированное питание; кишечные инфекции; лечение антибактериальными препаратами; длительная гормонотерапия, лечение нестероидными противовоспалительными препаратами; проведение химио- и лучевой терапии у онкологических больных; иммунодефицитные состояния. •люди пожилого возраста: возрастные изменения свойств микрофлоры (уменьшение канцеролитических свойств кишечной палочки, увеличение числа штаммов, синтезирующих холестерин, увеличение количества гемолитической флоры).

Маркер

Комплексная оценка бактериологического состава исследуемого биоматериала с определением чуствительности УПМ к антибиотикам (определение характера нарушения нормального биоценоза кишечника).

Клиническая значимость

Определение состава микрофлоры толстого кишечника и пути коррекции в случае нарушения нормального биоценоза

Состав показателей:

Бактериологический посев + а/биотикограмма кала на дисбактериоз

Метод:
Микробиологический

Диапазон измерений:
10³

Единица измерения:
Колониеобразующих единиц на грамм

Референтные значения:

Возраст

Комментарии

Выполнение возможно на биоматериалах:

Биологический материал

Условия доставки

Контейнер

Объем

Кал

Условия доставки:

4 Час. при температуре от 2 до 8 градусов Цельсия

Контейнер:

Стерильный контейнер с крышкой

Объем:

50 Миллилитров

Правила подготовки пациента

Стандартные условия. Важно: Сдавать до начала или не раньше, чем через 14 дней после окончания курса антибактериальной, антимикотической терапии, терапии пробиотиками если другое не определено врачом. На протяжении 24 часов перед сбором биоматериала не применять препаратов местного действия (если другое не определено врачом). Не принимается материал для исследования, собранный после клизмы, приёма медикаментов, влияющих на перистальтику, приёма касторового или вазелинового масла. Кал собирается после самопроизвольной дефекации в стерильный контейнер в количестве не менее 5 гр (пол чайной ложки). Материал после забора необходимо доставить: в течении: 2-х часов — в отделение МЛ «ДІЛА» №1 (ул. Подвысоцкого, 6А). График приема биологического материала уточняйте по номеру горячей линии.

Вы можете добавить данное исследование в корзину на этой странице

Интерференция:

• Приём антимикробных и пробиотических препаратов значительно оказывает влияние на достоверность результата. Рекомендуется производить обследование через 14 – 21 день после отмены указанных препаратов.

Интерпретация:

• I степень — незначительные изменения в аэробной части микробиоценоза, посторонняя микрофлора отсутствует;II степень — на фоне сниженного количества лакто- и бифидофлоры проявляется качественные и количественные изменения эшерихий;III степень — резкое снижение или отсутствие бифидофлоры, лактобацилл, преобладают гемолитические микроорганизмы и дрожжеподобные грибы;IV степень — глубокие изменения микробиоценоза, увеличение количества условно-патогенной микрофлоры и их ассоциаций, появление протея.

Что такое фекальная трансплантация и зачем она нужна?

В. Что такое фекальная трансплантация и зачем она нужна?

A. Трансплантация фекалий — это медицинская процедура, при которой кал от здорового донора вводится в кишечник пациента в качестве лечения заболевания. Идея состоит в том, что стул от донора содержит полезную смесь кишечных бактерий, которые могут засеять кишечник пациента, принося здоровые результаты.

Хотя процедура может показаться весьма непривлекательной, она не является антисанитарной.Стул получают от донора или из банка стула, где его проверяют на патогены и обрабатывают для использования в медицинских целях.

Донорский стул можно вводить через пластиковую трубку, вводимую через нос в желудок или тонкий кишечник. Альтернативно, донорский стул может быть введен в толстую кишку с помощью клизмы или колоноскопии, или путем проглатывания капсулы стула.

Пересадка фекалий используется для лечения серьезной инфекции толстой кишки Clostridium difficile, вредной бактерии, которая может прижиться, если антибиотики убивают достаточное количество «хороших» кишечных бактерий человека.В 2011 году C. diff вызвал около полумиллиона инфекций, 29 000 смертей и 4,8 миллиарда долларов расходов на здравоохранение только в Соединенных Штатах.

Переломный момент в использовании трансплантации фекалий или того, что в медицинской литературе известно как трансплантация фекальной микробиоты, произошел в 1958 году, когда врачи опробовали эту процедуру в качестве последней героической меры у четырех пациентов с опасной для жизни C. разница Примечательно, что все четыре пациента выжили. Результаты были описаны как «немедленные и впечатляющие», но из-за всеобщего отвращения к мысли о проглатывании стула, пересадка фекалий все же не получила широкого признания.

Переломный момент наступил в 2013 году, когда было опубликовано знаменательное исследование, показывающее, что фекальный трансплантат превосходит ванкомицин, текущий золотой стандарт лечения C. diff. Вскоре более крупные исследования подтвердили и расширили эти результаты.

Пересадка фекалий в настоящее время изучается как средство лечения ожирения, рецидивирующих инфекций мочевыводящих путей, язвенного колита, синдрома раздраженного кишечника и множества других состояний.

Предварительные данные обнадеживают, но энтузиазм нужно умерить.Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов считает пересадку фекалий «новым исследуемым лекарством» и не одобрило его для общего использования. Медицинские страховые компании обычно покрывают трансплантацию фекалий только в качестве лечения рецидивирующей трудноизлечимой C. diff.

Сообщенные побочные эффекты были умеренными и включают диарею, судороги, тошноту, запор и метеоризм, хотя на сегодняшний день проведенных испытаний недостаточно для выявления потенциально более серьезных проблем.

Специалисты предлагают последний мудрый совет: «Не рекомендуется проводить трансплантацию стула дома без консультации врача.”

Трансплантация кала (бактериотерапия) | Отделение гастроэнтерологии и гепатологии Джона Хопкинса

Трансплантация фекалий (или бактериотерапия) — это перенос стула от здорового донора в желудочно-кишечный тракт с целью лечения рецидивирующего колита C. difficile .

Трансплантация фекалий: зачем она проводится

Трансплантация фекалий проводится в качестве лечения рецидивирующего колита C. difficile. Колит, вызванный C. difficile , осложнение антибактериальной терапии, может быть связано с диареей, спазмами в животе и иногда с лихорадкой.Если вам больше 65 лет и / или вы страдаете хроническими заболеваниями, у вас может быть повышенный риск более тяжелой инфекции. Диагноз ставится на основании анализа ДНК стула, который определяет этот организм.

Если вам поставили диагноз, ваш врач лечит начальную инфекцию антибиотиком, который нацелен на организм C. difficile . Антибиотики, используемые для лечения этой инфекции, включают метронидазол, ванкомицин и фидаксомицин. У 30 процентов пролеченных людей инфекция возвращается в течение нескольких дней или недель после окончания курса антибиотиков.Ваш врач может выбрать для лечения этого первого рецидива еще один курс антибактериальной терапии. Тем не менее, для тех людей, у которых сохраняется рецидивирующий колит C. difficile , возможна трансплантация фекалий. Недавнее исследование, опубликованное в 2013 году в журнале New England Journal of Medicine , показало, что трансплантация фекалий более эффективна, чем пероральный ванкомицин, в предотвращении дальнейших рецидивов у лиц, уже перенесших рецидивирующий колит C. difficile .

По состоянию на 2013 год трансплантация кала в плановом порядке не проводится по показаниям, отличным от рецидивирующего колита, вызванного C. difficile. По-прежнему необходимы дополнительные исследования, чтобы определить, следует ли проводить трансплантацию кала по другим клиническим показаниям. Трансплантацию кала по другим клиническим показаниям следует рассматривать как экспериментальную и проводить только в рамках исследовательского исследования, при котором ваша безопасность находится под пристальным контролем.

Трансплантация фекалий: чего ожидать

Перед трансплантацией фекалий вам необходимо будет определить потенциального донора. Доноры не должны:

• Имел антибиотики в течение последних шести месяцев
• Иммунодефицит
• Делали татуировку или пирсинг за последние шесть месяцев
• В анамнезе употребляли наркотики
• Иметь в анамнезе высокие рискованное сексуальное поведение
• Был ли в анамнезе лишение свободы
• Недавно посещал эндемичные районы
• Имеет какие-либо хронические желудочно-кишечные расстройства, такие как воспалительное заболевание кишечника

Потенциальный донор должен пройти обследование у своего врача на наличие инфекционных патогенов, следующие анализы:

• Анализы крови: серологические исследования на гепатиты A, B и C; ВИЧ; RPR
• Тесты стула: яйца и паразиты; С.difficile ПЦР; культура и чуткость; giardia antigen
• Доноров следует проинформировать о том, что их страховая компания может возложить на них финансовую ответственность за все тесты, необходимые перед трансплантацией. Лучше всего проконсультироваться у своего поставщика медицинских услуг и / или в страховой компании.

Процедура трансплантации кала

Трансплантация кала обычно выполняется с помощью колоноскопии и реже с помощью назодуоденальной трубки. Во время колоноскопии колоноскоп проходит через всю толстую кишку.Когда колоноскоп извлекается, донорский стул доставляется через колоноскопию в вашу толстую кишку.
Перед процедурой вам нужно будет выполнить специальные инструкции по подготовке. Ваш врач подробно обсудит их с вами.

• Вам нужно будет прекратить любую антибактериальную терапию за два дня до процедуры.
• Вам необходимо будет соблюдать жидкую диету с последующей клизмой или слабительным препаратом за ночь до запланированной процедуры.
• Сообщите врачу, если у вас есть аллергия.
• Ваш врач проинструктирует вас относительно любых рецептурных лекарств, которые вы принимаете.

Убедитесь, что в день процедуры вас сопровождает ответственный взрослый, чтобы отвезти вас домой после ее завершения. Когда вы приедете, вы зарегистрируетесь и предоставите свою историю болезни.

Во время колоноскопии:

1. Мы введем вам капельницу в вену для введения жидкости и седативных средств.

После завершения процедуры вам нужно будет оправиться от седативных средств.Ваш врач обсудит с вами результаты. Затем вы можете пойти домой, где вы сможете отдохнуть до конца дня.

Возникновение трансплантации фекалий своими руками

9 декабря 2015 г. — Халли нашла облегчение после 7 лет неослабевающей боли в животе на дне лягушачьего горшка своего 3-летнего племянника.

Она вытащила его стул из тренировочного туалета, «размазала его» физиологическим раствором в полиэтиленовом пакете, а затем впрыснула его в прямую кишку, используя пустой флакон для клизмы.

«Люди говорят:« Разве вас не возмутило? »И я бы сказал, что нет. Для меня это было как золото », — говорит 40-летняя Халли, живущая в Калифорнии. Она попросила нас не использовать ее полное имя для защиты членов ее семьи.

Все большее число пациентов, таких как Халли, стекаются в блоги и сайты социальных сетей, такие как YouTube и Facebook, чтобы поделиться советами и методами пересадки фекалий в домашних условиях. Веб-сайт PowerofPoop даже помогает связать людей с потенциальными донорами стула за небольшую плату, которая колеблется от 30 до 200 долларов за депозит.Получатель обычно также платит за любые лабораторные тесты, если они решают их сделать, для проверки своего донора.

Почему все делают своими руками?

По словам Кэтрин Дафф, исполнительного директора Fecal Transplant Foundation, некоммерческой организации, выступающей за более безопасное и более широкое распространение, люди выбирают самодельный путь, чтобы избавиться от всего: от детского аутизма до облысения по мужскому типу и неприятного запаха изо рта доступ к лечению. На основании телефонных и интернет-запросов на ее сайт, по ее оценкам, около 10 000 человек в США делают трансплантацию фекалий на дому.С. каждый год.

«Это безумие», — говорит Дафф, которая много лет назад сделала пересадку фекалий дома после того, как врачи сказали ей, что она умирает от кишечной инфекции. «Забавно, что я говорю это, потому что это спасло мне жизнь. Но теперь он превратился в Дикий Запад, и то, что люди делают, небезопасно », — говорит она.

Врачи сообщили о случаях внезапного увеличения веса и новых заболеваний кишечника после пересадки фекалий. И даже люди, которые кажутся здоровыми, могут незаметно переносить микробы, которые они могут передать другим.

Поскольку стул на 50% состоит из бактерий, теория трансплантации заключается в том, что он может заменить бактерии, которые исчезли из кишечника. Это может дать впечатляющие результаты даже после однократной процедуры. Процесс проведения в домашних условиях на удивление прост.

Продолжение

После того, как кто-то получил пожертвование, стул затем смешивается с физиологическим раствором — для этого хорошо подходит блендер для смузи, согласно одному учебному видео — и затем раствор впрыскивается в прямую кишку с помощью клизмы. или сумка.

«Если вы когда-либо делали молочный коктейль, вы можете это сделать», — говорит Майкл Сильверман, доктор медицинских наук, заведующий отделением инфекционных заболеваний в Медицинской школе Шулиха Западного университета в Торонто.

Около 10 лет назад Сильверман помог нескольким тяжелобольным сделать пересадку фекалий в домашних условиях. Все эти пациенты страдали от повторных приступов инфекции под названием C. diff , которая вызывает тяжелую, иногда смертельную диарею. Бактерии, вызывающие эту инфекцию, C.difficile , приобрела устойчивость почти ко всем антибиотикам, которые врачи используют для лечения.

Фекальные трансплантаты, при которых стул получают от здорового друга или родственника и вводят в толстую кишку во время процедуры колоноскопии, вылечивают C. diff примерно в 90-95% случаев. Это показатель излечения, который Сильверман и другие эксперты называют «совершенно замечательным».

Продолжение

Трансплантация фекалий стала стандартной процедурой для людей, перенесших повторные приступы C.diff . Получить их в медицинских учреждениях намного проще, чем это было еще 2 года назад. И стул больше не нужно доставать через колоноскопию. Врачи могут заказать новые капсулы с тщательно проверенным лиофилизированным донорским стулом, изготовленные биотехнологической компанией OpenBiome, которые пациенты проглатывают, чтобы получить почти такие же преимущества.

Но хотя FDA разрешает использование фекальных трансплантатов для C. diff , агентство имеет более жесткие ограничения для других состояний, лечение которых показало себя многообещающим, — например, для людей с синдромом раздраженного кишечника или язвенным колитом.В таких случаях пациенты могут сделать пересадку фекалий в медицинских учреждениях, только если они участвуют в клинических испытаниях.

И многие, особенно те, кому может потребоваться повторное лечение, говорят, что этот вариант для них просто недоступен. Они говорят, что не могут позволить себе ждать, пока наука или FDA наверстают упущенное.

Халли была одной из них.

«Я действительно был готов к чему угодно»

Около 10 лет назад она вернулась из поездки в Европу с легочной инфекцией.А потом загадочным образом заболел живот.

«Для меня это была тупая боль. Судороги не были такими, как я слышал у других. У меня действительно было вздутие живота, и у меня была изрядная боль во время еды, которой у меня не было раньше », — говорит она, вспоминая, что в конечном итоге боль достигла 7 или 8 по 10-балльной шкале.

Она изменила свою диету, потратила десятки тысяч долларов на консультации со специалистами и альтернативными практикующими. Она сменила работу, чтобы уменьшить стресс.Она переехала в другой дом. Ничего не помогло.

«Вода больно, чтобы вы могли понять, как у меня дела. Я не мог выпить воды ». Она похудела на 15 фунтов.

Потом ее сестра поделилась газетной статьей о трансплантации фекалий.

«К тому времени я действительно была готова попробовать что угодно», — говорит она. Примерно через 2 недели после первого самостоятельного лечения ей стало лучше.

Продолжение

Она повторила трансплантацию фекалий в домашних условиях примерно шесть раз в течение полутора лет.

«Я бы не сказал, что полностью выздоровел. У меня ненормальный желудок, но у меня боль от нуля до одного или двух, и я могу есть все, что захочу. Качество моей жизни резко улучшилось », — говорит она.

История матери

Еще одним очевидным, хотя и временным успехом, является женщина по имени Кэти Ламменс, которая разместила на YouTube популярное видео, в котором люди проходят процедуру пересадки фекалий в домашних условиях. Ламменс говорит в отзывах в Интернете, что она жертвует стул своей дочери для лечения дома два раза в неделю в течение более года.

До лечения у ее дочери Эммы, у которой был диагностирован язвенный колит, был кровавый болезненный стул — до 11 раз в день. Ее состояние ухудшилось, несмотря на то, что она ежедневно принимала коктейль из шести различных лекарств. Врачи предложили им два варианта: начать прием мощного биологического препарата или сделать операцию по удалению толстой кишки — вариант, при котором у 10-летнего ребенка может остаться мешок для колостомы на всю оставшуюся жизнь.

При поддержке врачей Ламменс начала делать трансплантацию фекалий дома.Результаты были почти мгновенными. Кровь остановилась. Эмме нужно было реже ходить в туалет каждый день. Они думали, что нашли чудо. Но через 10 месяцев болезнь вернулась. Они добавили второго донора стула, чтобы попытаться увеличить разнообразие бактерий в ее кишечнике. Даже пересадки делали чаще, но симптомы вернулись. К 2013 году семья снова искала другие варианты.

Врач: «Есть ряд рисков»

Исследования показали, что когда трансплантация фекалий проводится под наблюдением врача, у них низкий уровень осложнений.

Но некоторые врачи и другие специалисты заметили признаки проблемы. Коллин Келли, доктор медицины, гастроэнтеролог и доцент Медицинской школы Уоррена Альперта при Университете Брауна. С 2008 года она делает пересадку фекалий для лечения C. diff .

Большинство из них прошли хорошо, но у двоих из ее пациентов были проблемы. Одна женщина, получившая стул от своей дочери, страдающей ожирением, после трансплантации быстро набрала 30 фунтов.

Келли не знает, почему женщина набрала вес, но исследования на животных показали, что кишечные бактерии могут играть важную роль в том, как организм обрабатывает и сохраняет калории.

«Я определенно более осторожен. Сейчас я использую только тощих доноров », — говорит она. «Теоретического риска достаточно, чтобы мы относились к нему осторожно».

У Келли также была пара других пациентов, у которых были обострения ранее существовавшего воспалительного заболевания кишечника после лечения фекальными трансплантатами для C. diff . А одному пациенту после трансплантации кала поставили новый диагноз: заболевание кишечника.

Продолжение

«Это связано с рядом рисков, — говорит Келли.«Это действительно мощная терапия. Вы передаете целое сообщество микроорганизмов от одного человека другому вместе со всеми генами, которые эти бактерии несут, и всеми метаболическими функциями этих бактерий ».

«Здесь может быть и обратная сторона. И мы действительно не знаем, что это могут быть на данный момент », — добавляет она.

Это одна из причин того, что сотрудники OpenBiome — места, где производятся эти новые одобренные Управлением по контролю за продуктами и лекарствами капсулы с лиофилизированным стулом — чрезвычайно разборчивы в отношении своих фекалий.Доноры должны пройти тщательный отбор. По словам исполнительного директора и соучредителя компании Джеймса Берджесса, принимаются только 3% претендентов.

Берджесс говорит, что они исключают кандидатов на разных этапах процесса отбора. Часто это происходит потому, что у потенциального донора в стуле содержится микроб, о котором он даже не подозревал.

Он говорит, что его команда нашла много людей, у которых есть кишечные вирусы, такие как ротавирус, и которые переносят их без симптомов. «Это то, что вы не хотели бы передавать», — говорит он.«Они кажутся очень здоровыми, но когда вы идете проверять их, они дают положительный результат».

Продолжение

Дафф из Фонда по трансплантации фекалий говорит, что она слышала о проблемах после того, как люди сами сделали себе капсулы с какашками, чтобы глотать их дома.

Капсулы, используемые OpenBiome, изготовлены из специального материала, который медленно растворяется в пищеварительном тракте и высвобождает свое содержимое в толстую кишку.

Дафф говорит, что люди пытались скопировать этот подход, используя желатиновые капсулы, купленные через Интернет. Эти капсулы растворяются гораздо быстрее, выделяя стул в места, которых он не должен быть, например, в желудке или тонком кишечнике. Когда это происходит, это может вызвать состояние, называемое SIBO, сокращение от избыточного бактериального роста в тонком кишечнике, которое вызывает боль, вздутие живота, запор и диарею, которые могут сохраняться в течение многих лет.

Дафф является частью комитета экспертов, которые работают с FDA над переклассификацией бактериальных препаратов. Новое определение будет применяться к любым бактериям, которые собираются и повторно наносятся на организм.Группа, которая впервые собралась в начале декабря, продолжит периодически встречаться в течение следующих 2 лет.

Продолжение

Дафф надеется, что эти усилия помогут сделать фекальные трансплантаты более безопасными и доступными, чем они есть в настоящее время, так что меньше людей будет чувствовать, что им нужно делать это в одиночку.

Халли говорит, что увидев ее успех, другой член семьи также попробовал сделать пересадку фекалий своими руками для лечения своих проблем с пищеварением, которые она описала как «газообразование из-за углеводов.

В его случае, по ее словам, это не сработало.

11-летие «Аполлона»: астронавты оставили свои корма на Луне. НАСА должно вернуться за это дерьмо.

Прошло почти 50 лет после высадки на Луну «Аполлона-11». Знаковый след Нила Армстронга все еще там, нетронутый; нет атмосферы, нет ветра на Луне, чтобы унести ее.

Но самый большой человеческий след на Луне, возможно, — это 96 мешков с человеческими отходами, оставленные шестью миссиями Аполлона, которые там приземлились.

Да, наши храбрые астронавты сбрасывали мусор по пути на Луну, возможно, даже на Луну, а они оставили свои подгузники в мешочках на пороге человечества в большой космос.

Мешки там задержались, и никто не знает, что с ними . Теперь ученые хотят вернуться назад и ответить на вопрос, который имеет огромное значение для наших будущих исследований Марса: есть ли в них что-нибудь живое?

Эти следы все еще остаются на Луне. Как и мусор космонавтов. НАСА

Человеческие фекалии могут быть отвратительными, но они также полны жизни. Около 50 процентов их массы составляют бактерии, представляющие более 1000 видов микробов, обитающих в вашем кишечнике. В куске какашки живет целая чудесная экосистема.

Планета Земля стала местом обитания этой и многих других жизней на протяжении более 3,9 миллиарда лет. Насколько нам известно, Луна все это время была бесплодной и безжизненной.

Высадившись на Луну Аполлона-11, мы перенесли микробную жизнь на Земле в самые экстремальные условия, в которых она когда-либо находилась.Это означает, что человеческие фекалии — вместе с мешками с мочой, пищевыми отходами, рвотой и другими отходами в мешках, которые также могут содержать микробную жизнь — на Луне представляют собой естественный, хотя и непреднамеренный эксперимент.

Вопрос, на который ответит эксперимент: насколько устойчива жизнь перед лицом суровых условий Луны? И если на то пошло, если микробы могут выжить на Луне, смогут ли они выжить в межзвездных путешествиях, что сделает их способными сеять жизнь по всей Вселенной, в том числе в таких местах, как Марс?

Постойте, космонавты какали на Луне и просто оставили ее там ?!

После того, как Нил Армстронг спустился с посадочного модуля Eagle, став первым человеком, ступившим на Луну, на самом первом снимке, сделанном им на поверхности, видно, да, покрытая кратерами поверхность Луны, но также и выброшенный белый мешок для мусора (или мешок для мусора). ).

Я не могу подтвердить, что в этом конкретном пакете есть фекалии (Базз Олдрин отказался комментировать эту историю), но определенно есть такой на Луне, который содержал или все еще содержит человеческие отходы, согласно данным Управления истории НАСА.

Ракетная сумка, лежащая под лунным модулем Аполлона в 1969 году. NASA

Астронавт «Аполлона-16» Чарли Дюк провел 71 час на Луне в 1972 году. Во время недавнего телефонного разговора он подтвердил, что экипаж оставил после себя человеческие отходы.

«Мы сделали», — говорит он. «Мы оставили мочу, которая была собрана в резервуар … и я считаю, что у нас было несколько испражнений — но я не уверен — они были в мешке для мусора. У нас было несколько мешков с мусором, которые мы выбросили на поверхность Луны ».

(Вы могли бы подумать: «Подождите, он пробыл на Луне почти три дня, и не уверен, какал ли он там?» Как он сказал мне: «Три дня неплохо иметь без испражнения». Достаточно справедливо. ?)

Тем не менее, говорит он, они выбросили мусор, думая, что все будет очищено солнечным излучением.«Я был бы очень удивлен, если бы хоть что-нибудь уцелело», — говорит он. К тому же, забрать его с собой было не вариант.

«Полеты на Луну были спроектированы очень тщательно, и вес был очень большой проблемой», — говорит Эндрю Шергер, ученый из Флоридского университета в области космической жизни, который недавно стал соавтором статьи о жизнеспособности микробов, выживших на Луне. «Так что, если вы собираете лунные камни, было бы разумно выбросить вещи, которые не были необходимы для увеличения вашего запаса прочности.”

Во время полета на Луну астронавты полагались на «пластиковый пакет, который был прикреплен к ягодицам для сбора фекалий», согласно НАСА. Это был отвратительный, громоздкий процесс.

На самой Луне астронавты использовали «одежду максимальной впитываемости» для «сдерживания фекалий». Но забудьте о технических формулировках. Это подгузник.

В связи с 50-й годовщиной высадки на Луну «Аполлона-11» 20 июля наблюдается возобновление интереса к возвращению людей на Луну в ближайшем будущем.У администрации Трампа есть цель вернуться туда не раньше 2028 года. И у НАСА есть бюджетный импульс для работы над «лунными воротами», обитаемой космической станцией, которая будет вращаться вокруг Луны, что позволит выполнять более долгосрочные лунные миссии и подготовиться к возможной миссии человека на Марс.

По мере того, как мы готовимся к этим путешествиям и за их пределами, фекалии — еще одна причина, по которой мы должны вернуться.

Дело о том, что бактерии в фекалиях мертвы

Вопрос, который задают ученые о том, есть ли что-нибудь живое в этих сумках, может показаться глупым, но может привести к важному пониманию того, в каких экстремальных условиях может выдержать жизнь.Но это также будет говорить о нашем человеческом потенциале заражать небесные тела — или даже засеивать на них жизнь — когда мы будем исследовать. Этого достаточно, чтобы вернуться на Луну и собрать образцы.

Эти реактивные мешки «наиболее защищены от всего, что может иметь высокий уровень грибков, [бактерий] и вирусов с Земли», — говорит Шуэргер. (Грибы — это еще одна форма микробной жизни, которая могла выжить.) Для астробиологов это означает, что эти мешочки — самые интересные объекты на Луне.

Тем не менее, шансы, что что-нибудь уцелело в любой из этих сумок, невелики, говорит Шергер. Он и его коллеги недавно завершили анализ, моделирующий вероятность того, что какие-либо микробы с Земли все еще живы на любой из поверхностей космического корабля, оставленного на Луне. Беговые мешки могут быть лучше защищены (подробнее об этом чуть позже), но применяются те же суровые условия.

Земля настолько гостеприимна для жизни, а Луна — нет. У него нет защитного магнитного поля для отражения самого мощного и разрушительного космического излучения.Он не имеет озонового слоя, поглощающего солнечные ультрафиолетовые лучи.

Лунный вакуум негостеприимен для жизни. А без атмосферы Луна подвергается резким колебаниям температуры днем ​​и ночью: она может быть минус 173 градуса по Цельсию (минус 279,4 градуса по Фаренгейту) ночью и 100 ° C (212 ° F, или точка кипения воды на солнце). наша поверхность) в течение дня.

Есть большая вероятность, что сочетание радиации и экстремальной температуры убило микробы в мешках для мусора.Шергер говорит, что вероятность того, что в них что-то сохранилось, «мала». «Но это самая высокая вероятность того, что что-нибудь упадет на Луну».

Дело о том, что бактерии фекалий живы

Условия на поверхности суровые, но не теряйте надежды: «Микробам не нужна особая защита», — говорит Маргарет Рэйс, биолог из института SETI.

В конце концов, бактериальная жизнь была обнаружена на Земле практически везде, куда бы мы ни посмотрели: на самом дне океана, недалеко от горячих термальных источников, в 2 милях под одним из ледников Гренландии. Во время миссии «Аполлон-16» астронавты провели эксперимент, в ходе которого они держали образцы девяти видов микробов снаружи космического корабля, подвергая их воздействию самых суровых условий в космосе. Многие из них выжили (хотя несколько дней в космосе — это не то же самое, что 50 лет в космосе).

Прибор для оценки микробной экологии, установленный на Аполлоне 16. Это был эксперимент, целью которого было выяснить, сможет ли микробная жизнь выжить в космическом путешествии. НАСА

«У нас нет определения жизни, которое гласило бы:« Она никогда не сможет выйти за пределы этой температуры, за эту соленость, за этот кислотный уровень », — говорит Рэйс. «Каждый раз, когда мы смотрим на места, мы находим жизнь».

Для того, чтобы микробы были живы — или, по крайней мере, их можно было возродить, нужно сделать многое. Бактерии не могут размножаться (то есть расти) без влаги. Человеческие отходы должны были быть действительно хорошо упакованы, чтобы их среда оставалась влажной.«В [влажной] среде закрытого подгузника, по-видимому, вы должны иметь возможность репликации», — говорит Марк Луписелла, ученый НАСА, который выполняет некоторые предварительные работы над потенциальной миссией по извлечению сумок и их изучению.

Сумки для реактивных снарядов должны быть в целости и сохранности, что не является обязательным, учитывая резкие колебания температуры на Луне; они могли быть разорваны механическими силами, связанными с нагревом и охлаждением.

«Кроме того, мы не знаем, какой будет внутренняя температура сумки, когда она будет подвергаться воздействию солнца», — говорит Шергер.По его словам, если температура превысит 100 ° C, бактерии, вероятно, проживут на Луне всего несколько дней или недель.

Луписелла говорит, что даже если все живое в мешках для реактивных снарядов мертво, мешки все равно стоит изучить. Ученые могли бы выяснить, как долго микробы жили на Луне и эволюционировали ли они или адаптировались к окружающей среде вообще. «Это натянуто, но вполне возможно, что мы сможем определить, мутировали ли эти формы жизни на ранней стадии», — говорит он.

Он говорит, что существует малая вероятность того, что естественный отбор мог сработать внутри этих мешков, что привело к тому, что микроорганизмы эволюционировали, чтобы выжить.Если бы в фекалиях было всего несколько микроорганизмов, способных выжить на Луне, они могли бы расти и распространяться.

Опять же, это самое экстремальное место, в котором мы когда-либо покидали жизнь — возможно, самое экстремальное место, где когда-либо была жизнь. Нам нужно увидеть, насколько он устойчив (или нет) в этой среде.

Также существует вероятность того, что некоторые микробы могут быть воскрешены. То есть, после десятилетий покоя на Луне, некоторые из этих микробов могут быть возвращены к жизни при правильных условиях. Споры бактерий (спящие бактерии, которые образуют защитный внешний слой) в Арктике возродились после тысячелетнего замораживания во льду. Было бы замечательно, если бы споры в фекалиях могли возродиться после десятилетий на Луне.

Эти уроки были бы интересны для микробиологии — оценки крайних пределов микробной жизни — но они были бы неоценимы для путешествия на Марс.

Лунные фекалии имеют значение для будущих миссий на Марс

Если микробы могут выжить в течение определенного периода на Луне, у них еще больше шансов выжить на Марсе, который имеет разреженную атмосферу, более гостеприимную среду и признаки проточной воды.

Один из главных вопросов ученых о Марсе: «Есть ли здесь или была ли здесь когда-либо жизнь?» Преобладает мнение, что если там существует жизнь, она, вероятно, очень похожа на бактерии или какой-то другой тип очень простого одноклеточного организма.

Но если мы доберемся до Марса, а затем случайно заразим планету нашим буквальным дерьмом, ответить на этот вопрос будет труднее. Как мы узнаем, является ли жизнь , которую мы находим на Марсе, марсианской или чем-то, что пришло с Земли? И если наши микробы с Земли полюбят Марс и распространятся, возможно, это уже никак не исправить.

Договор ООН по космосу, подписанный в 1967 году, за два года до посадки Аполлона-11, предусматривает, что государства-члены «должны избегать вредного загрязнения космоса и небесных тел». Это может быть сложно, если мы доберемся до Марса, потому что куда бы мы ни пошли, наши фекалии тоже идут.

Размышления о фекалиях на Луне помогают нам задуматься о возможном происхождении жизни на Земле

Поскольку планируются новые миссии на Луну, нам нужно тщательно подумать о необходимости сохранения артефактов, оставленных на местах высадки Аполлона.Нелл Гринфилдбойс из NPR недавно сообщила, что даже приземление в пределах 100 метров от объекта Apollo может потенциально повредить его.

Защита истории освоения Луны человеком означает также защиту мусора — его историческая ценность огромна, но не менее важна и научная ценность. Нам необходимо сохранить эти места, чтобы ученые могли вернуться к ним и взять образцы.

Для меня знание того, что на Луне есть целые мешки с человеческими отходами, дает мне топливо в топку моего воображения.Например, рассмотрим гипотезу о том, что жизнь вообще не зародилась на Земле. Скорее всего, он был засеян микробами из другого мира.

Теперь предположим, что астероид пролетает мимо, врезается в луну и проецирует фекалии миссии «Аполлон» в глубокие пределы космоса (крайне гипотетическая ситуация). Может ли это семя жизни в более широкой вселенной? Может быть.

И в таком случае, могла ли жизнь на Земле быть засеяна фекалиями какого-нибудь инопланетного астронавта? «Я не знаю общепринятой теории, касающейся подгузников космонавта, но вся эта идея научно правдоподобна», — говорит Луписелла.

Если микробная жизнь может выжить на Луне даже в спящем состоянии, это может означать, что микробы могут выжить в течение долгого времени в глубоких космосах, путешествуя между мирами, распространяя жизнь по пути.

«Может ли простая жизнь распространяться по космосу, как радиоволны [просто естественно перемещаясь по Вселенной, сама по себе], или ей нужно ждать миллиарды лет, пока не появятся технологические виды с космическими кораблями, чтобы распространить ее?» планетолог Фил Мецгер недавно спросил в Твиттере.«Это лишь один из МНОГИХ важных научных вопросов, на которые мы попытаемся ответить, когда вернемся на Луну».

Жизнь — драгоценное чудо, даже жизнь, содержащаяся в наших фекалиях. Давайте будем трепетать перед тем, что некоторые из них могут быть живы на Луне. Это означало бы, что жизнь посеяна в мертвом мире, каким бы маленьким он ни был.

Мусор Аполлона-11 все еще находится на Луне. Мы должны сохранить его для изучения будущими учеными. НАСА

Графика Хавьера Заррачина / Vox

Новая пневматическая высевная тележка среднего размера от Deere

Большой брат C850 передал много новейших технологий в конструкцию C650, включая весы для резервуаров, боковой дисплей

В новой пневматической тележке

Deere была использована передовая технология, разработанная для старшего брата C850, и встроена в C650 среднего размера. Тележку на 650 бушелей можно буксировать между трактором и сеялкой.

Важной особенностью модели C850, которая теперь используется в модели C650, является цифровой дисплей со стороны тележки, который позволяет оператору безопасно стоять на земле, а не бегать вверх и вниз по лестнице. «Вся задача по заполнению и калибровке выполняется в одном месте на раме тележки», — сказал менеджер по продуктам для посева Брайан Тул.

Он сказал, что боковой дисплей тележки устраняет необходимость в переносном iPad, который оператор приносит обратно в тележку и иногда забывает или оставляет на шине.

Дисплей выполняет три функции:

• Показывает вес каждого из четырех резервуаров с считыванием показаний в реальном времени при заполнении.
• Показывает давление в баллоне, поэтому окончательную регулировку можно произвести перед подъемом в кабину.
• Показывает все веса и ввод данных для калибровки измерителя перед подъемом в кабину.

«C650 оснащен нашей системой AirPower2, в которой используются два вентилятора: один для семян и один для удобрений. Это позволяет нам выдвигать 550 фунтов на акр продукта на 15-градусном склоне с углом наклона 5.5 миль в час », — сказал Тул, добавив, что точность сохраняется при использовании самых широких инструментов для посева.

«У нас есть гидравлические тормоза на задних колесах. Этот шаг представляет собой сочетание корпоративной ответственности и фермерского спроса. По мере того, как посевное оборудование становится все больше и тяжелее, мы видим, что наши инженеры все больше осознают безопасность.

«Когда вы добираетесь до тележек такого размера, тормоза больше подходят для транспорта. Если вы тянете эту установку с посевным инструментом, даже наполовину полным, вы можете тянуть 30 000 фунтов.Это также 30 000 фунтов, толкающих ваш трактор, поэтому вам нужны хорошие тормоза на тележке, чтобы все было ровно ».

Фермеры, работающие в холмистой местности, часто вынуждены регулярно использовать тормоза пневматической тележки и тормоза трактора на спуске, чтобы поезд не ушел. Известно, что в некоторых случаях это приводит к поджариванию тормозов, что приводит к авариям. А бросив якорь, погрузив инструменты в землю, вы закопаете семена и удобрения на полпути к Китаю.

«Я насмотрелся тех страшных фотографий буровых установок, сложенных у подножия крутого холма», — сказал Тул.

«В прошлом году был еще один из Монтаны. Если вам придется несколько минут подряд ездить на тормозах, они нагреются, и вы их потеряете. Когда вы надавливаете на дисковый тормоз в течение длительного периода времени, возникает сильный жар. Парням из Альберты, Саскачевана и Манитобы обязательно стоит поговорить со своим дилером, если у них есть спуски.

«С нашей системой, когда вы нажимаете педаль тормоза или нажимаете кнопку на дисплее, вы получаете пять секунд непрерывного гидравлического давления, даже если оно вам не нужно.Это должно обеспечить достаточное тормозное давление позади трактора, чтобы все двигалось прямо. И это тормозное действие пневматической тележки происходит раньше, чем это происходит на тракторе, идея снова состоит в том, чтобы все это оставалось на прямой. Гидравлическое давление создается тормозной системой трактора ».

Согласно руководству оператора требуется подключение тормоза прицепа. Если трактор не оборудован гидравлическим соединением тормозов агрегата, закажите установочный комплект у дилера John Deere или у квалифицированного поставщика услуг.Убедитесь, что сливной шланг корпуса подключен при использовании тормозов на пневмоприцепе.

Комплект модернизации для обнаружения относительной блокировки потока является значительным улучшением по сравнению с предыдущей системой обнаружения блокировки, сказал Тул. Прежняя система была похожа на выключатель света — либо выключен, либо включен, либо заблокирован, либо не заблокирован.

Боковой дисплей тележки позволяет оператору считывать вес каждого отдельного резервуара при загрузке C650. | Фотография John Deere

Новая система сообщает оператору поток относительно других колонн высевающего аппарата.Если в одной градирне наблюдается даже небольшое снижение потока продукта, оператор немедленно получает уведомление на дисплее Gen 4. Чувствительность устанавливается оператором в зависимости от размера и веса семян, проходящих по трубам.

«Исторически нашей основной тележкой была модель 1910 года. Она существует всегда. Это хорошая машина, но ее максимальная производительность составляет 550 бушелей, и этого недостаточно для мелкозерновых ферм с большой площадью акров », — сказал Тул.

«Итак, мы начали с нуля и представили C850, который обладал необходимой производительностью, а также множеством передовых технологий.Эта тележка предназначена только для буксировки, и некоторым фермерам это не нравится.

«Это оставило нам большой разрыв от 550 бушелей. 1910 до 850. Очевидное исправление — 650 бу. тележка. Поэтому мы взяли все эти передовые технологии из C850 и включили их в C650. А C650 может буксировать между собой или сзади, что является вопросом личных предпочтений фермера. У каждого есть свои преимущества и недостатки ».

Tow-between не позволит вам видеть сеялку во всю ширину из кабины.

Tow-between позволяет установить камеру заднего вида на тележку.

Промежуточная буксировка гарантирует, что последнее, что покидает поле, — это сеялка, а не тележка.

Буксирный трактор лучше справляется со склонами, так как он расположен ближе к дышлу трактора.

«Некоторые фермеры не хотели вкладывать средства в 850 бушелей. тележка. У вас никогда не может быть слишком много семян и удобрений. Используете ли вы 40-футовую сеялку или 80-футовую сеялку, тележка большего размера позволит вам работать дольше.Однако 850 бушелей. тележка стоит дороже и требует большей мощности трактора. Вы рассчитываете на 600 лошадиных сил. С 650 буш. телега, у вас все в порядке с 500 лошадиными силами. Это фактор стоимости «.

C650 унаследовал и другие технологии от большей тележки.

Дир сообщил, что ActiveCal — это система по запросу, позволяющая операторам автоматически калибровать счетчики прямо с дисплея Gen 4 в кабине. Интегрированный жгут проводов обеспечивает соединения для пяти мест расположения камер: по одной в каждом баке и пятое, обеспечивающее обзор задней навески. Тележку можно заполнить из расчета 100 буш. в минуту.

Сама тележка способствует точности высева. SectionCommand управляет внесением семян и удобрений, сводя к минимуму перекрытия и пропуски. C650 совместим с некоторыми сеялками-культиваторами и сеялками для нулевой обработки почвы. Тележки C650 уже доступны. Прейскурантная цена составляет 125 000 долларов США.

Терапия трансплантации заменителем стула для искоренения инфекции Clostridium difficile: «RePOOPulating» кишечника | Microbiome

Дизайн исследования

Протокол исследования в соответствии с Руководством по надлежащей клинической практике был одобрен Советом по этике исследований на людях Королевского университета и Университета Гвельфа и соответствует положениям Хельсинкской декларации (1964 г., поправки внесены в 2008 г.) ) Всемирной медицинской ассоциации.

Критерии включения в исследование включали наличие в анамнезе предыдущих ИКД, подтвержденных иммуноанализом на фекальные токсины C. difficile , появление новых симптомов после завершения полного курса лечения ИКД, положительный результат Анализ токсинов C. difficile , подтверждающий рецидив ИКД и возраст 18 лет и старше. Пациенты были осмотрены специалистами по инфекционным заболеваниям и гастроэнтерологии, и другие возможные причины диареи были исключены. В исследование были включены два пациента, которые соответствовали критериям включения, и было получено письменное информированное согласие.

Microbiology

Разработка и приготовление RePOOPulate

Пробиотическая или синтетическая смесь стула человека RePOOPulate была разработана путем экстенсивного культивирования микробного разнообразия из стула здоровой 41-летней женщины-донора. Шестьдесят два различных бактериальных изолята были выделены на различных типах сред (включая агар Brain Heart Infusion, агар Уилкинса – Чалгрена, усиленный клостридиальный агар и агар deMan, Rogosa и Sharpe) с использованием строгих анаэробных условий (для выделения как строгих, так и факультативных анаэробов). Очищенные изоляты идентифицировали секвенированием гена 16S рРНК и подвергали профилированию чувствительности к антибиотикам. Восприимчивость к противомикробным препаратам определялась либо путем прямого измерения чувствительности, либо путем заключения на основе других культивируемых представителей. Например, в случаях, когда контрольные точки минимальной ингибирующей концентрации не задокументированы, чувствительность определялась с использованием дисков Кирби-Бауэра для избранных антибиотиков, обладающих анаэробной активностью; если бактериальный газон вырос до края диска, то он считался устойчивым и этот изолят не использовался.Для изолятов, у которых была зона ингибирования сомнительной значимости, приемлемый уровень ингибирования был сделан на основе других культивируемых представителей. Если были какие-либо сомнения, и организм вообще подозревался в устойчивости, то его не использовали в смеси.

Тридцать три изолята, представляющие комменсальные виды, которые в целом были чувствительны к ряду противомикробных препаратов и относительно легко культивировались, были отобраны для окончательной рецептуры заменителя стула. Полноразмерные последовательности 16 S рРНК были сопоставлены с сервером NAST [6], а затем классифицированы с использованием сервера классификации GreenGenes [7]. Было использовано наиболее конкретное имя в классификации GreenGenes, и мы сообщаем оценку максимального правдоподобия ДНК для каждой классификации (Таблица 1).

Таблица 1
Состав заменителя стула (RePOOPulate)

Чтобы сделать вывод об относительном соотношении отобранных изолятов для включения в состав продукта RePOOPulate, было проведено сравнение нашего списка культивируемых видов бактерий с коллекцией метагеномной базы данных MetaREP наборов образцов стула от здоровых доноров [8].Используя браузер таксономии, был выбран набор данных, наиболее точно соответствующий нашему профилю культивируемых изолятов (SRS058723), который использовался в качестве руководства для вывода относительной численности каждого вида — за исключением Bifidobacterium spp. были добавлены к более высокой численности, что отражает широко наблюдаемую заниженную численность актинобактерий, и особенно этого рода, в метагеномных анализах стула человека [9, 10]. Было получено приблизительное соотношение на основе биомассы культивируемых клеток, измеренное с использованием стандартных 10 мкл микробиологических петель (таблица 1).

Каждый из 33 изолятов был индивидуально культивирован на Fastidious Anaerobe Agar (Lab M Ltd. Heywood, Lancashire, UK) в анаэробных условиях, а затем культуры были составлены в заранее определенном соотношении, как описано выше, в 100 мл предварительно восстановленных стерильных продуктов. 0,9% физиологический раствор до расчетной концентрации 3,5 × 10 ⁹ колониеобразующих единиц / мл. Бактериальную суспензию помещали в пониженную атмосферу в контейнер с двойным уплотнением при 4 ° C и использовали в течение 24 часов после приготовления.

Выделение и риботипирование C. difficile из образцов кала пациентов

C. difficile было выделено из образцов стула в соответствии с методами, описанными ранее [11], с использованием селективных сред на основе бульона моксалактама и норфлоксацина (CDMN; Oxoid, Nepean, Онтарио, Канада), обогащенный 0,1% таурохолатом натрия. Типирование изолятов проводили с использованием метода риботипирования ПЦР, описанного Bidet с соавторами [12].

Введение заменителя стула

Антибактериальная терапия была приостановлена ​​на 2 дня, и пациенты прошли стандартное очищение толстой кишки вечером перед колоноскопией.На следующее утро во время колоноскопии половина (50 мл) раствора была отложена в области слепой кишки / проксимального отдела восходящей ободочной кишки, а другая половина была разбрызгана по поперечной ободочной кишке, когда колоноскоп был извлечен. У обоих пациентов была выявлена ​​выраженная дивертикулярная болезнь. Сразу после процедуры пациенты находились в положении Тренделенбурга в течение 60 минут перед выпиской домой. Пациентам было рекомендовано придерживаться диеты, богатой клетчаткой, и не употреблять продукты, содержащие пробиотики. За пациентами наблюдала медсестра-исследователь, чтобы взять образцы стула и внимательно следить за их клинической реакцией.

Анализ последовательности

Экстракция гДНК из образцов стула

гДНК экстрагировали с использованием протокола, включающего комбинацию взбивания шариков, набора ДНК стула EZNA® (Omega Bio-Tek, Норкросс, Джорджия, США) и ДНК Maxwell® 16 Набор для очистки (Promega, Мэдисон, Висконсин, США). Вкратце, 200 мкл образца стула, 300 мкл E.Z.N.A. Набор буфера SLX, 10 мкл 20 мг / мл протеиназы K (в 0.1 мМ CaCl ( ₂ ) и 200 мг стеклянных шариков добавляли в пробирку Эппендорфа с завинчивающейся крышкой и разрушали в миксере для шариков в течение 3 минут. После последующей инкубации при 70 ° C в течение 10 минут и при 95 ° C в течение 2 минут 100 мкл E.Z.N.A. Набор буфера P2 добавляли к каждому образцу и инкубировали на льду в течение 5 минут. Затем образцы центрифугировали при 14000 × g в течение 5 минут, и супернатант переносили в новые пробирки, каждая из которых содержала 200 мкл E. Z.N.A. Набор реагента HTR. После тщательного перемешивания образцы инкубировали при комнатной температуре в течение 2 минут и центрифугировали при 14000 × g , а супернатант переносили в картриджи Maxwell® 16 DNA Purification Kit.Остальную часть протокола выделения ДНК проводили в приборе Maxwell® 16 в соответствии с инструкциями производителя (Promega).

Амплификация рРНК V6

ПЦР-амплификацию бактериальной области рРНК V6 проводили с левым праймером CWACGCGARGAACCTTACC и правым праймером ACRACACGAGCTGACGAC. Эти последовательности праймеров были выбраны потому, что они точно соответствуют> 95% последовательностей рРНК организмов, идентифицированных в проекте микробиома человека (GBG, неопубликованные наблюдения).Кроме того, праймеры с левой стороны содержали стандартный адаптер Ion Torrent (Ion Torrent Systems Inc., Гилфорд, Коннектикут, США) и ключевую последовательность на их конце 5 ^‘ (CCATCTCATCCCTGCGTGTCTCCGACTCAG). Один из следующих 5-мерных штрих-кодов был расположен между концом 3 ^‘ ключевой последовательности и концом 5 ^‘ праймера: TATCG, TAGAC, TGCAT, ATGAG, ACAGT, AGATG, CTCAC, CTGTA, CGTGA, CGACT, AACTC или CCTAT. В повторяющихся образцах не использовались одни и те же штрих-коды. Правый праймер имел другую стандартную последовательность адаптера Ion Torrent (CCTCTCTATGGGCAGTCGGTGAT), присоединенную к его концу 5 ^‘.Амплификацию проводили в течение 25 циклов в 40 мкл с использованием бесцветной мастер-смеси горячего старта GO-Taq (Promega) в соответствии с инструкциями производителя со следующим трехступенчатым температурным профилем: 95 ° C, 55 ° C и 72 ° C в течение 1 минуты. на каждом этапе, затем количественно определяли 5 мкл полученной амплификации с использованием реагента для флуориметрического количественного определения двухцепочечной ДНК QuBit (InVitroGen, Life technologies Inc., Берлингтон, Онтарио, Канада). Образцы были объединены при примерно равных концентрациях и очищены с использованием набора Wizard PCR Clean-Up Kit (Promega).

Секвенирование

Реакции с последовательностью проводили на чип-платформе Ion Torrent 314 и 316. До 12 образцов были мультиплексированы на каждом чипе за счет использования индивидуальных тегов последовательности. Данные всех запусков были объединены, когда образцы были обработаны более чем на одном чипе.

Обработка данных последовательности

На платформе Ion Torrent было проведено пять реакций секвенирования: три реакции на чипе 314 и две реакции на чипе 316. Чипы различаются только плотностью пятен и, следовательно, количеством последовательности, которую можно получить (чип 316 примерно в пять-шесть раз плотнее, чем чип 314).Последовательность была предоставлена ​​в формате fastq. Затем все последовательности были отфильтрованы в соответствии со следующими критериями: точное совпадение с используемыми штрих-кодами, точное совпадение с левым праймером, включая повторяющиеся положения в праймере, точное совпадение с первыми шестью нуклеотидами правого праймера и длина между левым и правым праймером составляет от 71 до 83 нуклеотидов. Эта длина была выбрана потому, что она включает прогнозируемый размер продукта ампликона от всех связанных с человеком бактериальных организмов, которые были культивированы и секвенированы в рамках проекта микробиома человека.

Приблизительно от 40 до 50% считываний прошли эти фильтры в последних запусках Ion Torrent; чтения, не прошедшие фильтры, в дальнейшем не исследовались. Считывания обрабатывались, как описано Gloor и коллегами [13], за исключением того, что кластеризация с USEARCH была выполнена с идентичностью 97%. Обнаружение химер было выполнено с помощью UCHIME (версия v5.2.32) с использованием метода de novo [14]. Только четыре химерные последовательности наблюдались из 30 419 уникальных последовательностей в объединенном наборе данных, и все они были редкими.Эта частота аналогична частоте, о которой сообщалось ранее для амплификации и секвенирования области рРНК V6 с использованием платформы Illumina [13]. Химерные последовательности не считались проблемой в этом наборе данных.

Таблица подсчетов для последовательностей, сгруппированных по 97% операционной таксономической единице (OTU) и 100% идентичности идентичности единиц последовательности, была создана для каждого образца, как и раньше [13], сохраняя все идентичные единицы последовательности или последовательности OTU, которые были представлены в любой отсчет на частоте> 0. 5%. Считывания, которых никогда не было в большом количестве ни в одной выборке (<0,5%), были сгруппированы в остаток и отброшены. От 12,6 до 51,9% (медиана 31%) считываний идентичных единиц последовательности и от 1,4 до 17,2% (медиана 5,8%) считываний OTU приходилось на оставшуюся группу. Эти значения примерно в пять раз больше, чем те, которые наблюдаются для идентичных единиц последовательности, секвенированных на платформе Illumina, но примерно эквивалентны наблюдениям платформы Illumina при кластеризации считываний.

Таксономическая классификация

Классификация последовательностей с помощью классификаторов GreenGenes или RDP оказалась ненадежной из-за небольшой длины области V6.Поэтому классификация последовательностей, представленных в таблице подсчета, была выполнена с использованием параметра ближайшего соответствия RDP для полноразмерного высококачественного изолированного подмножества. Было определено максимальное количество наилучших совпадений, и была собрана таксономическая классификация наилучшего совпадения и соотношения. Классификация этих совпадений была принята для всех уровней, где классификация была одинаковой для всех лучших совпадений, в противном случае классификация была помечена как неопределенная. Область V6 не может определить уровень рода или вида для ряда клад, поэтому все анализы проводились на уровне семейства.Эта стратегия работала для всех распространенных семейств — за исключением Bifidobacterium , которые были аннотированы как таковые в результате поиска BLAST в базе данных микробной 16 S рРНК NCBI. Таксономическая классификация была добавлена ​​в таблицу подсчета последовательностей, и данные были представлены в следующих форматах, которые могут быть приняты QIIME 1.5.0 [15]. Выравнивание последовательностей было построено с использованием Muscle [16], а дерево соединения соседей было создано с помощью ClustalW2 [17]. Бета-разнообразие рассчитывалось с помощью алгоритма UniFrac [18].Таблицы были импортированы в MacQIIME, которая является версией QIIME 1.5.0 в комплекте с OS X, и были проанализированы с использованием параметров по умолчанию.

Обжимные устройства для соломы серии CR25 | Land Pride

Примечание. На некоторых фотографиях деталей может быть изображена похожая модель, а не конкретная модель, показанная на этой странице.

Quick-Hitch Совместимость

Наша система Quick-Hitch позволяет быстро подсоединять и отсоединять орудие — в большинстве случаев, не вставая с сиденья трактора.Это экономия времени при работе над несколькими проектами.

Термообработанные диски

Закаленные диски для более длительного износа. Лезвия притуплены так, чтобы солома гофрировалась, а не разрезалась, и чтобы не повредить почву.

Подставки для хранения

В каждом углу есть подставка для хранения, которая помогает при хранении на земле, а также для подсоединения к трактору.

Дополнительные резервуары для воды

Добавьте до 600 фунтов. веса, чтобы помочь в условиях уплотненного грунта. Легко уменьшайте вес, постепенно опорожняя бак. Резервуары для воды более безопасны из-за точной подгонки по сравнению с штабелированием объектов разного размера.

Расстояние между лезвиями

Лезвия разнесены на 6-1 / 2 дюйма друг от друга для обеспечения оптимального обжима.

Трубчатая конструкция

Трубка 2 1/2 «x 2 1/2» x 3/16 «по сравнению с угловым железом обеспечивает большую прочность, а также лучший внешний вид.