Обнаружена сапрофитическая микробиота: Сапрофитическая микробиота СМБ (микрофлора). Что это такое, что значит

Содержание

что это, расшифровка, что показывает?

Многие женщины не понимают, какие дополнительные сведения может дать посев из цервикального канала, если они уже прошли гинекологический осмотр и даже посетили УЗИ-кабинет.

Бактериальный посев помогает обнаружить микроорганизмы, поселившиеся на шейке матки, и определить их вид. Это исследования необходимо для диагностики инфекционных заболеваний.

Задачи исследования

Детородные органы женщины требуют много внимания, так как на них возложена очень ответственная функция.

Женщине, желающей оставаться здоровой, приходится проходить регулярные осмотры в женской консультации, сдавать анализы и внимательно следить за процессами, протекающими в организме.

При возникновении необычных симптомов в половых органах или отклонении от месячного цикла нужно обращаться к врачу для выявления причины изменения.

Бак посев из цервикального канала – доступное, безболезненное, простое исследование, которое в государственных медучреждениях делают бесплатно, а в частных лабораториях – за весьма умеренные деньги.

После получения результатов теста врач имеет возможность поставить диагноз и назначить компетентное лечение.

Почему речь зашла сразу о терапии, ведь посев может обнаружить и отсутствие заболеваний? Дело в том, что бактериологический посев из цервикального канала назначают, только когда для этого исследования есть весомые причины.

Это далеко не рядовой профилактический тест, а трудоемкий метод диагностики, перед которым всегда делают предварительное исследование на чистоту влагалищного слоя.

Если мазок будет недостаточно «чистым», то это однозначно говорит о бактериальной инфекции на шейке матки или во влагалище.

После теста на чистоту назначают посев на флору, с помощью которого можно определить, какие именно микроорганизмы преобладают во влагалище.

Биоматериал для посева из цервикального канала берут не со стенок влагалища, как для обычного мазка, а с места соединения шейки матки и влагалища.

Результаты теста покажут состояние цервикального участка и зараженность микроорганизмами.

Исследование не относится к числу профилактических – его назначают только по определенным показаниям, например, при обнаружении повышенного числа лейкоцитов в мазке.

В дерматовенерологии бакпосев из цервикального канала делается совместно с исследованием отделяемого уретры, влагалища, а иногда еще и кишечника.

Повышение лейкоцитов в мазке – симптом воспалительных процессов, среди которых есть опасные, требующие немедленного лечения: эндометрит, аднексит и другие.

Возбудителями инфекции являются патогенные и условно-патогенные микроскопические организмы: грибы, бактерии, простейшие.

Микроорганизмы способны быстро адаптироваться к антибиотикам и другим лекарственным препаратам, посев часто совмещают с исследованием на чувствительность флоры к антибиотикам.

После определения, к каким именно антибиотикам чувствительны микроорганизмы, обитающие в цервикальном канале, врачу остается только назначить курс лечения, а пациентке полностью его пройти, после чего инфекционное заболевание останется в прошлом.

Показатели нормальной микрофлоры

Содержимое цервикального канала не бывает стерильным. В любом случае влагалище и шейка матки заселены микроорганизмами.

Если микробы относятся к разряду условно-патогенных или факультативных, то никакой опасности не представляют.

В стандарте в посеве из цервикального канала должно обнаружиться много лактобактерий и бифидобактерий – полезных для женского здоровья микроорганизмов, представителей естественной влагалищной флоры.

Чего однозначно не должно быть в посеве из цервикального канала, так это кандид – микроскопических грибов.

Нежелательно присутствие большого количества обитателей кишечника: энтерококков, Escherichia coli.

В единичных количествах эти бактерии не угрожают женскому здоровью, но обнаруженные в посеве из цервикального канала в большом числе, они являются симптомами воспаления мочеполовой системы.

Даже одна единственная бактерия стафилококка, гонококка, трихомонады, лептотрикса, обнаруженная в посеве из цервикального канала, говорит об инфицировании шейки матки опасными патогенами. Особенно большую угрозу несут подобные инфекции дамам в положении.

В норме бифидо- и лактобактерий в посеве из цервикального канала должно быть не меньше 10*7. Расшифровку посева из цервикального канала по силам сделать только специалисту.

Люди без медобразования не смогут самостоятельно определить, микрофлора в норме или имеются отклонения.

У каждой женщины есть индивидуальные показатели, поэтому недостаточно просто сравнить полученные в результате посева из цервикального канала цифры с референсным интервалом.

Небольшое отклонение от нормы может быть естественным для конкретной пациентки. После бакпосева врач комплексно анализирует результаты влагалищного мазка и посева из цервикального канала.

Это нужно для сравнения флоры, обнаруженной сразу после взятия биоматериала, и бактерий, выросших на питательном составе.

Но есть критерии, которые однозначно не относятся к норме – болезнетворные микробы, находящиеся на этапе интенсивного развития.

Посев из цервикального канала помогает обнаружить не только присутствие патогенных микробов, но и, что не менее важно, определить этап их развития:

  • начальный этап – слабый рост микроорганизмов, который может проходить только на жидкой среде;
  • второй этап – бактерии размножаются более активно, способны осваивать твердые среды, образуют на них не более 10 колоний;
  • третий этап – количество колоний на твердых составах увеличивается до 100 – это говорит о присутствии воспалительного процесса;
  • заключительный этап – число колоний превышает 100.

Норма микроорганизмов в посеве из цервикального канала нарушается по гормональным, иммунным, гигиеническим причинам.

Кроме того, отклонения в составе микрофлоры являются симптомом женских недугов инфекционной природы.

Бакпосев при беременности

Анализ биоматериала из цервикального канала при беременности часто назначают будущим мамам, что справедливо вызывает у женщин опасения – не повредит ли забор биоматериала плоду?

Чтобы не тревожиться, достаточно знать анатомию малого таза. Цервикальный канал закрыт слизистым барьером, через который не может пробраться ни одна патогенная бактерия.

Зато окраска цервикального канала меняется уже на ранних сроках беременности, что может стать дополнительным симптомом присутствия в матке эмбриона.

Перед родами слизь из цервикального канала отходит, поэтому лечить микрофлору для достижения нужной степени чистоты мазка нужно непременно на ранних сроках беременности.

Кроме того, существует патология, при которой шейка матки под давлением растущего плода начинает раскрываться не перед родами, а начиная со второй половины беременности – в таких случаях оздоровление микрофлоры влагалища на поздних сроках будет невозможно.

Патогенные и условно-патогенные микроорганизмы проникнут в раскрывшуюся раньше времени шейку и начнется воспалительный процесс цервикального канала – цервицит, представляющий собой прямую угрозу для вынашивания плода.

Как подготовиться к анализу?

Врач выдает направление на посев из цервикального канала в следующих случаях:

  • женщина планирует беременность;
  • в мазке на чистоту обнаружены кокки или повышено количество лейкоцитов;
  • у женщины часто возникают гинекологические болезни;
  • для подтверждения диагноза «воспалительный процесс шейки матки».

Забор биоматериала для посева из цервикального канала проходит без обезболивания, особенная подготовка к процедуре не требуется.

Пациентке нужно только раздеться и лечь на гинекологическое кресло. Врач введет во влагалище одноразовое вагинальное зеркало, обеззараженным зондом быстро возьмет биоматериал и введет его в специальную среду, находящуюся в пробирке. Результаты теста будут готовы через 3 дня.

Важно: во время регул и несколько дней после них биоматериал из цервикального канала сдавать нельзя.

Видео:

Иногда в медучреждениях забор материала ведут не зондом, а щеточкой с несколькими рядами щетинок, которые вводят в цервикальный канал и делают вращательные движения. Щеточка, в отличие от зонда, позволяет взять большее количество слизи.

Питательная среда – смесь из растворенных в воде компонентов, являющихся факторами роста и питательными элементами для микроорганизмов. Вещества, входящие в состав питательной смеси, используются микробами для роста и расселения.

Чтобы правильно подготовиться к бакпосеву, женщина должна сутки воздерживаться от секса и заранее прекратить прием антибиотиков, если она ими лечится от каких-либо заболеваний.

Перед визитом к гинекологу нельзя спринцеваться, лечиться вагинальными препаратами, подмываться с мылом или другим моющим средством.

Во время спринцевания верхний слой слизи из цервикального канала частично вымывается, а результаты посева искажаются.

Аналогично искажают результаты посева из цервикального канала вагинальные свечи и кремы. Препараты этого типа содержат антибактериальные ингредиенты, влияющие на общую картину флоры.

После использования антибактериальных препаратов микрофлора на некоторое время приобретает нормальные параметры, а посев из канала не выявляет аномалий. Однако такая «норма» является временным явлением – через несколько суток патология возвращается.

Итак, целью посева из цервикального канала является идентификация микроорганизмов, населяющих канал шейки, и определение их количества.

Если в результате исследования обнаруживается патогенная и условно-патогенная микрофлора, то проводят выявление степени ее устойчивости к антибиотикам.

По результатам исследования назначают лечение, способствующее уничтожению патогенных микроорганизмов и восстановлению нормальной микрофлоры, состоящей из лакто- и бифидобактерий.

Вы здесь:

Вагинальные инфекции при беременности: что надо знать будущей маме

Знать в лицо

А что произойдет, если представителям нормальной микрофлоры влагалища не удастся справиться с появлением вредных бактерий? В этом случае у женщины могут начаться неприятности: молочница (другое название — кандидозный вульвовагинит, кандидоз, микоз), трихомонадный или неспецифический кольпит. Поговорим о каждой из них подробнее.

1) По статистике, около 70% женщин хотя бы раз в жизни лечились от молочницы. При этом у 40–50% представительниц прекрасного пола случались повторные вспышки болезни, а у 5% появилась неприятная хроническая форма кандидоза. Болезнь возникает из-за гормональных сбоев в организме, в результате ослабления иммунитета, после лечения антибиотиками. Обычно в качестве возбудителя молочницы выступают грибы, которые живут в самом организме, например в кишечнике. Однако иногда кандиды передаются от партнера к партнеру. Пока дрожжеподобных грибов во влагалище немного, они не вызывают проблем. Если по каким-то причинам они начинают размножаться, у женщины появляются «творожистые» (густые и с хлопьями) выделения белого цвета, сильный зуд в области половых органов, а иногда даже жжение в момент похода в туалет «по-маленькому». У мужчин кандиды вызывают воспаление головки полового члена, крайней плоти и мочевыделительных органов.

Бывает, что молочница преследует будущую маму всю беременность и трудно поддается лечению. Несмотря на кажущуюся безобидность, лечить ее нужно всегда. Кроме дискомфортных ощущений, она вызывает воспаление слизистой половых губ и влагалища. В результате слизистая становится более ранимой и может легко травмироваться во время родов. Кроме того, есть риск, что возбудитель инфекции из половых органов будущей мамы доберется за время родов до ребенка. Поэтому на 36-й неделе беременности у всех женщин берут мазок из влагалища на флору и при необходимости назначают лечение. Иногда справиться с ситуацией удается местными средствами (свечами), но также часто приходится назначать и таблетки.

2) Неспецифический (бактериальный) вагинит, или кольпит, начинается из-за размножения вредных микроорганизмов — стафилококков, стрептококков, кишечных бактерий, микоплазм. В результате у женщины появляются необычные выделения из влагалища: желтые, с гноем. Кроме того, пациентка может пожаловаться на то, что ей приходится часто бегать в туалет «по-маленькому», а во время полового контакта появляется боль. С обнаружением бактериального вагиноза, даже если у будущей мамы нет никаких жалоб и диагноз ставится по результатам мазка, ей назначают лечение.

3) Трихомониаз (специалисты называют его еще трихомонадным вагинитом, или кольпитом) относится к болезням, которые как раз передаются половым путем. Его вызывают простейшие паразиты — трихомонады, которые могут встречаться на влажных полотенцах, купальниках или унитазах в общественных местах. Начало болезни характеризуется зудом, жжением в области влагалища, болью в момент посещения туалета «по-маленькому». Плюс к этому у женщины появляются обильные белые, иногда пенистые выделения с неприятным запахом. Поскольку в некоторых случаях проблема может никак не беспокоить будущую маму, диагностическим тестом, на основании которого принимается решение о необходимости лечения, станет метод посева микроорганизмов с определением их чувствительности к антибиотикам.

Неспецифический вагинит, как и все перечисленные выше проблемы, обязательно нужно лечить на любом сроке беременности, и вот почему. Во время беременности мазок на влагалищную флору берется трижды — в I, II и III триместрах. Очень важны будут его результаты ближе в сроку родов. Дело в том, что этот процесс провоцирует распространение имеющейся в организме инфекции, ведь роды сопровождаются кровопотерей, оставляют после себя раневые поверхности; плюс к этому, стерильная в норме полость матки во время движения ребенка по родовым путям сообщается с нестерильным влагалищем, и все это создает условия для распространения опасных микробов из влагалища вверх — в матку и к ребенку.

помогите расшифровать

Вопрос создается. Пожалуйста, подождите…

Только зарегистрированные пользователи могу задавать вопрос.
Зарегистрируйтесь на портале, задавайте вопросы и получайте ответы от квалифицированных специалистов!

Напоминаем, что стоимость публикации вопроса — 10 бонусов.

Зарегистрироваться
Как получить бонусы

К сожалению, у вас недостаточно бонусов для оплаты вопроса.
Напоминаем, что стоимость публикации вопроса — 10 бонусов.

Как получить бонусы

Раздел медицины*:
— Не указано —КоронавирусАкушерствоАллергология, иммунологияАнестезиологияВенерологияВертебрологияВетеринарияГастроэнтерологияГематологияГепатологияГериатрияГинекологияГирудотерапияГомеопатияДерматологияДиетологияИглотерапия и РефлексотерапияИнфекционные и паразитарные болезниКардиологияКардиохирургияКосметологияЛабораторная и функциональная диагностикаЛечение травмЛогопедияМаммологияМануальная терапияМРТ, КТ диагностикаНаркологияНеврологияНейрохирургияНетрадиционные методы леченияНефрологияОбщая хирургияОнкологияОстеопатияОториноларингологияОфтальмологияПедиатрияПлазмаферезПластическая хирургияПодологияПроктологияПсихиатрияПсихологияПсихотерапияПульмонология, фтизиатрияРадиология и лучевая терапияРеабилитологияРеаниматология и интенсивная терапияРевматологияРепродукция и генетикаСексологияСомнологияСпортивная медицинаСтоматологияСурдологияТерапияТравматология и ортопедияТрансфузиологияТрихологияУЗИУльтразвуковая диагностикаУрология и андрологияФармакологияФизиотерапияФлебологияЧелюстно-лицевая хирургияЭндокринологияЗатрудняюсь выбрать (будет выбрана терапия)

Кому адресован вопросВопрос адресован:
ВсемКонсультантам

Консультант, которому задается вопрос:
Всем. ..Агабекян Нонна Вачагановна (Акушер, Гинеколог)Айзикович Борис Леонидович (Педиатр)Акмалов Эдуард Альбертович (Аллерголог, Врач спортивной медицины)Александров Павел Андреевич (Венеролог, Гепатолог, Инфекционист, Паразитолог, Эпидемиолог)Аристова Анастасия Михайловна (Андролог, Уролог, Хирург)Афанасьева Дарья Львовна (Кардиолог, Терапевт)Беляева Елена Александровна (Гинеколог, Невролог, Рефлексотерапевт)Бушаева Ольга Владимировна (Пульмонолог, Терапевт)Врублевская Елена (Педиатр)Гензе Ольга Владимировна (Генетик, Педиатр)Горохова Юлия Игоревна (Венеролог, Врач общей практики, Дерматолог)Григорьева Алла Сергеевна (Врач общей практики, Терапевт)Демидова Елена Леонидовна (Психолог, Психотерапевт)Денищук Иван Сергеевич (Андролог, Уролог)Димина Тамара Олеговна (Акушер, Аллерголог, Ангиохирург)Довгаль Анастасия Юрьевна (Маммолог, Онколог, Радиолог)Долгова Юлия Владимировна (Педиатр)Дьяконова Мария Алексеевна (Гериатр, Терапевт)Загумённая Анна Юрьевна (Врач спортивной медицины, Гирудотерапевт, Диетолог, Косметолог, Терапевт)Згоба Марьяна Игоревна (Окулист (Офтальмолог))Зинченко Вадим Васильевич (Рентгенолог, Хирург)Зорий Евген Владимирович (Невролог, Психолог, Терапевт, Хирург)Извозчикова Нина Владиславовна (Гастроэнтеролог, Дерматолог, Иммунолог, Инфекционист, Пульмонолог)Илона Игоревна (Врач общей практики, Гастроэнтеролог, Терапевт, Эндокринолог)Калягина Екатерина (Другая специальность)Карпенко Алик Викторович (Ортопед, Травматолог)Касимов Анар Физули оглы (Онколог, Хирург)Киреев Сергей Александрович (Психиатр, Психолог, Психотерапевт)Кирнос Марина Станиславовна (Стоматолог, Стоматолог детский, Стоматолог-терапевт)Колобова Юлия Сергеевна (Венеролог, Дерматолог, Косметолог, Миколог, Трихолог)Копежанова Гульсум (Акушер, Гинеколог)Кравцов Александр Васильевич (Нарколог, Психиатр)Красильников Андрей Викторович (Врач ультразвуковой диагностики, Медицинский директор, Флеболог, Хирург)Кряжевских Инна Петровна (Терапевт, Гастроэнтеролог)Кудряшова Светлана Петровна (Эндокринолог)Куртанидзе Ираклий Малхазович (Окулист (Офтальмолог))Кущ Елена Владимировна (Диетолог, Терапевт)Лазарева Татьяна Сергеевна (ЛОР (Оториноларинголог))Лаптева Лариса Ивановна (Невролог)Лебединская Татьяна Александровна (Психолог, Психотерапевт)Ледник Максим Леонидович (Венеролог, Дерматолог)Леонова Наталья Николаевна (Детский хирург)Литвиненко Станислав Григорьевич (Ортопед, Травматолог)Лямина Ирина Алексеевна (Акушер)Максименко Татьяна Константиновна (Инфекционист)МАЛЬКОВ РОМАН ЕВГЕНЬЕВИЧ (Диетолог, Остеопат, Реабилитолог)Мамедов Рамис (ЛОР (Оториноларинголог))Мартиросян Яков Ашотович (Детский хирург, Проктолог, Травматолог, Уролог, Хирург)Маряшина Юлия Александровна (Акушер, Венеролог, Врач ультразвуковой диагностики, Гинеколог, Педиатр)Матвеева Ярослава Дмитриевна (Педиатр)Мершед Хасан Имадович (Вертебролог, Нейрохирург)Миллер Ирина Васильевна (Невролог)Мильдзихова АЛЬБИНА Бексолтановна (Врач общей практики, Гинеколог, ЛОР (Оториноларинголог), Педиатр, Терапевт)Муратова Наталья Сергеевна (Врач общей практики, Диетолог)Мухорин Виктор Павлович (Нефролог)Наумов Алексей Алексеевич (Мануальный терапевт)Нетребин Антон Викторович (Акушер, Аллерголог, Ангиохирург)Никитина Анна Алексеевна (Окулист (Офтальмолог))Ольга Викторовна (Невролог, Неонатолог, Педиатр, Реабилитолог, Терапевт)Павлова Мария Игоревна (Стоматолог, Стоматолог-хирург, Челюстно-лицевой хирург)Панигрибко Сергей Леонидович (Венеролог, Дерматолог, Косметолог, Массажист, Миколог)Пантелеева Кристина Алексеевна (Невролог)Пастель Владимир Борисович (Ортопед, Ревматолог, Травматолог, Хирург)Паунок Анатолий Анатольевич (Андролог, Уролог)Першина Наталия Сергеевна (Невролог)Прокофьева Анастасия Михайловна (ЛОР (Оториноларинголог))Прохоров Иван Алексеевич (Нейрохирург, Хирург)Пушкарев Александр Вольдемарович (Гинеколог, Психотерапевт, Реабилитолог, Репродуктолог (ЭКО), Эндокринолог)Пьянцева Екатерина Вячеславна (Педиатр)Радевич Игорь Тадеушевич (Андролог, Венеролог, Сексолог, Уролог)Сапрыкина Ольга Александровна (Невролог)Семений Александр Тимофеевич (Врач общей практики, Реабилитолог, Терапевт)Сергейчик Никита Сергеевич (Анестезиолог, Гомеопат)Силуянова Валерия Викторовна (Акушер, Врач ультразвуковой диагностики, Гинеколог)Соболь Андрей Аркадьевич (Кардиолог, Нарколог, Невролог, Психиатр, Психотерапевт)Сошникова Наталия Владимировна (Эндокринолог)Степанова Татьяна Владимировна (ЛОР (Оториноларинголог))Степашкина Анастасия Сергеевна (Гематолог, Пульмонолог, Терапевт)Сурова Лидия (Гирудотерапевт, Невролог, Терапевт)Суханова Оксана Александровна (Клинический фармаколог, Психолог)Сухих Данил Витальевич (Психиатр)Тумарец Кирилл Михайлович (Врач лечебной физкультуры, Врач спортивной медицины, Кинезитерапевт, Реабилитолог, Физиотерапевт)Турлыбекова Венера Равильевна (Врач общей практики, Педиатр)Устимова Вера Николаевна (Гематолог, Терапевт, Трансфузиолог)Фатеева Анастасия Александровна (Гастроэнтеролог, Диетолог, Психотерапевт, Эндокринолог)Федотова Татьяна Владимировна (Врач ультразвуковой диагностики, Гематолог, Терапевт)Фоминов Олег Эдуардович (Сексолог)Фоминов Олег Эдуардович (Сексолог)Фурманова Елена Александровна (Аллерголог, Иммунолог, Инфекционист, Педиатр)Хасанов Эльзар Халитович (Андролог, Врач ультразвуковой диагностики, Онколог, Уролог, Хирург)Хасанова Гульнара Сунагатулловна (Акушер, Врач ультразвуковой диагностики)Чупанова Аида (Акушер, Гинеколог)Чупанова Аида Идаятовна (Акушер, Гинеколог, Репродуктолог (ЭКО))Швайликова Инна Евненьевна (Окулист (Офтальмолог))Шибанова Мария Александровна (Нефролог, Терапевт)Штемберг Любовь Валерьевна (Невролог)Щепетова Ольга Александровна (Терапевт)Ягудин Денар Лукманович (ЛОР (Оториноларинголог))Ярвела Марианна Юрьевна (Психолог)

Описание проблемы:

обсуждения, вопросы и ответы врачей.

Ангина, аденоиды, миндалины, тонзиллит сообщество ::

  • Уважаемые участники сообщества «Ангина, аденоиды, миндалины, тонзиллит»!
    В этой теме предлагаем вам размещать любые мысли и предложения о том, что вам было бы интересно прочитать или увидеть на портале,…

  • Нужна помощь! С утра проснулась с больным горлом, першит сил нет, кашляю из-за этого. Естественно, мне такое состояние совсем не нравится. Помогите советом, кто как и чем лечит горло???

  • Стабильно несколько раз за сезон обостряется, боюсь такими темпами скоро антибиотики перестанут помогать, сколько я их пью. ..

  • Здравствуйте. Подскажите, пожалуйста, что-нибудь эффективное от боли в горле? Препаратов разных много, не разбираюсь в этом. Болит только горло, глотать больно, красное, отекшее. Насморка, температуры…

  • Подскажите, пожалуйста. Нужно ли детям давать витамин д? просто в государственной поликлинике нам сказали, что можно спокойно жить без него, а в частной настоятельно педиатр советовала начать принимать

  • Здравствуйте ! Мне 47 лет , мужчина . В детстве часто болел ОРЗ , ОРВИ все переросло в хронический тонзиллит , после 20 лет эта болезнь пропала и не напоминала про себя до осени 2019 года ,…

  • Добрый день! Может ли таблетка выйти при кашле? Проглотила маленькую таблетку, запила глотком воды Чуть позже покашляла, может ли таблетка незаметно выскочить при кашле?

  • Dinar.ka пишет 20 декабря 2019, 14:03

    Добрый день. На протяжении года беспокоит скапливание слизи в горле, особенно усиливается ночью и с утра. Есть небольшой насморк, но лор утверждает, что это проблемы желудка. Гастроэнтеролог назначил ганатон….

  • добрый день, ребенку ( 4 года) назначили окуф терапию 3 поля (при аденоидах) и индуктотермию ( для профилактики) , можно ли их совмещать в один день (один прием),

  • Ольга пишет 23 сентября 2019, 14:34

    Добрый день! За полгода было 8 гнойных ангин, лечилось только с помощью антибиотиков, сдали анализ на антистриптолизин, по результатам превышение нормы в несколько раз, удалили гланды, прошло пол года…

  • seregei пишет 13 июня 2019, 06:17

    Здравствуйте доктор. Уже на протяжении нескольких лет меня беспокоит проблема с миндалинами. Посетил пять врачей, все говорят про хронический тонзиллит в декомпенсированной форме. Двое сказали удалить…

  • kibernet пишет 1 июня 2019, 20:38

    Здравствуйте, постоянно несколько месяцев (раньше не обращал внимание) красноватое горло и прыщики в горле еще рядом бывают беленькие маленькие вскакивают. Такое уже давно, бывает першение в горле, температуры…

  • Добрый день! Второй год пью новинет. Всегда пила по графику 21-7-21. Дело в том, что недавно ездила в отпуск и решила перенести месячные. Пропила две упаковки без перерыва, т.е. 42 дня. Далее как обычно…

  • прежде чем задать вопрос, расскажу немного о себе, мне 41 год, я инвалид 1 гр. не могу ходить и т.д., после черепно-мозговой травмы не работает левая сторона тела, поэтому и обращаюсь со своим вопросом…

  • pir100 пишет 17 марта 2019, 08:11

    эфективное средство от ангины

  • Ksenia пишет 31 января 2019, 14:45

    Переболела гнойной ангиной более недели назад,теперь болит челюсть в месте стыка верхней и нижней, рот открывается максимум на 2 см,больно жевать пищу,при наклона головы вниз нарастающая невыносимоя боль.

  • tattow пишет 22 декабря 2018, 10:54

    Здравствуйте скажите что может быть такое ребёнку 6 лет,поднялась температура 38,на следующей день уже не было её, посмотрела горло там на миндалине как два белых прыщика, на горло не жалуется, температуры…

  • selvin пишет 10 декабря 2018, 13:59

    После операции по удалению гланд прошёл почти месяц. Недавно сильно заболело горло и появились на шее пятно (как синяк или засос). Знакомая медсестра сказала, что это нормально типо процесс заживления. ..

  • Edyardovna пишет 5 декабря 2018, 10:05

    У моего уже «взрослого» сынишки (ему скоро 8 исполнится) сегодня начало горлышко болеть.Он с храбростью переносит ингаляции, полоскание содой и люголь. Но когда я об этом сказала подруге, она возмутилась,…

  • mandalinka пишет 3 декабря 2018, 21:01

    Чем можно снять острую боль в горле? У мужа сильно заболело горло, я скупила пол-аптеки всяких леденцов и пшикалок, а легче ему не становится. Даже просто воды попить целая история. Насколько он стойко…

  • Бессимптомная бактериурия при беременности: лечение и последствия


    Во время беременности женское здоровье подвергается серьезному испытанию: помимо резких гормональных изменений, организм будущей матери переживает глобальную перестройку со смещением внутренних органов из-за растущей матки, перераспределением ресурсов, которых теперь должно хватать на двоих. Поэтому неудивительно, что за 9 долгих месяцев у женщин «в положении» обостряется множество хронических недугов, и, кроме того, появляются отклонения в работе внутренних органов, для которых, казалось бы, нет никаких предпосылок. Одним из довольно распространенных спутников беременности является бактериурия, которая может протекать бессимптомно либо же сопровождаться определенным дискомфортом. Откуда в моче беременной появляется нетипичная микрофлора, чем грозит подобное отклонение будущей матери и ее малышу и как распознать бактериурию, если она протекает бессимптомно? Зная ответы на эти вопросы, вы сможете вовремя выявить заболевание и принять соответствующие меры по его устранению!


    Особенности патологии


    Если при беременности почки справляются с возложенными на них функциями, а мочеполовая система работает без «сбоев», моча, выделяющаяся из организма, лишена какой-либо микрофлоры, то есть стерильна. Однако при малейшем отклонении в функциональности внутренних органов выделительной системы в ней могут появляться всевозможные патогенные и условно-патогенные бактерии, наличие которых можно подтвердить как минимум двукратным анализом. Если каждая из анализируемых порций содержит не менее 100 тысяч бактерий одного типа в каждом миллилитре физиологической жидкости, врач диагностирует истинную бактериурию.


    Бактериурия во время беременности может протекать в двух формах:


    • бессимптомное заболевание, которое никак, кроме отклонений в результатах анализов, себя не проявляет;

    • бактериурия с характерной симптоматикой, при которой возможны болевые ощущения внизу живота, жжение при мочеиспускании, тянущие боли в спине, незначительной повышение температуры и т.д.


    Несмотря на то, что бессимптомная бактериурия не доставляет никакого дискомфорта будущей матери, такая форма заболевания является более коварной, чем симптоматическая, поскольку заподозрить появление патологии нереально. Поэтому во время беременности пациенткам приходится сдавать общий анализ мочи перед каждым приемом – только таким образом можно не упустить появление первых признаков недуга и своевременно принять меры.


    Откуда в моче могут появиться бактерии?


    Бактериурия, особенно бессимптомная – далеко не редкость во время беременности. По статистике, такое отклонение выявляется в среднем у 6-11% беременных на разных сроках. В некоторых случаях бактериурия может предшествовать зачатию, однако не выявляться вплоть до определенного момента: пока организм справляется с нагрузкой, иммунитету удается держать под контролем количество и локализацию патогенной микрофлоры, но при малейшем сбое недуг начинает себя проявлять, сначала в анализах, а затем и симптоматически.


    Обычно в анализах мочи при беременности появляются:


    • кишечная палочка,

    • стрептококки,

    • стафилококки,

    • энтерококки.


    Такая микрофлора не является чужеродной для организма – в норме эти патогены присутствуют в ЖКТ(в частности, в кишечнике), а также на коже и слизистых. Однако в моче их быть не должно – это свидетельствует о конкретной патологии.


    Сама по себе бактериурия при беременности не настолько опасна и довольно легко излечима, однако в некоторых случаях такое состояние является не конкретным заболеванием, а симптомом более серьезного нарушения. Так, микроорганизмы могут появиться на фоне инфекционных процессов в мочевыделительной системе, хронического пиелонефрита, камней в почках, расширения мочеточников или пузырно-мочеточниковом рефлюксе.


    Факторы, провоцирующие бессимптомную бактериурию у беременных


    В некоторых случаях бактериурия появляется сама по себе, без каких-либо других патологий. Особенно часто такое состояние возникает на фоне физиологических изменений, характерных для периода беременности. Для появления микроорганизмов во время вынашивания плода существует несколько предрасполагающих нюансов:


    • Изменения в мочеполовых органах. На фоне беременности обычно нарушается работа сфинктера мочевого пузыря, расширяются почечные чашечки и лоханки, снижается тонус мочеточников. Такая анатомическая особенность может провоцировать занос инфекции в выделительные органы и, как следствие, появление бессимптомной бактериурии.

    • Активный рост матки. Резкое увеличение матки вызывает смещение всех внутренних органов брюшной полости, но наибольшее давление приходится именно на почки и мочевой пузырь. Все это не может не сказываться на работоспособности выделительной системы, вызывая различные нарушения, в том числе и бактериурию.


    • Нарушение пищеварения. Частые запоры вследствие смещения толстой кишки и менее активной перистальтики – еще одна причина изменения состава мочи.

    • Гормональные изменения. Высокий уровень прогестерона в организме, характерный для нормального протекания беременности, снижает тонус мочеточников, в результате чего в моче могут появляться бактерии различного происхождения.

    • Состав мочи. При беременности pH мочи становится выше, в ней появляется более высокий процент эстрогенов. Такая среда является более благоприятной для микробного роста, поэтому число патогенных микроорганизмов возрастает в геометрической прогрессии.

    • Проблемы с иммунитетом. Во время вынашивания малыша эффективность иммунной системы снижается по многим причинам, поэтому организму становится сложнее противостоять патогенной микрофлоре.

    • Застой мочи. Низкий уровень тонуса мочевого пузыря провоцирует застойные процессы, при которых часть жидкости не выделяется во время мочеиспускания. Это позволяет микробам активно размножаться и развиваться, вызывая бессимптомную бактериурию.


    Опасно ли изменение микрофлоры для матери и плода?


    Сама по себе бактериурия не оказывает непосредственного влияния на плод, однако при беременности она может спровоцировать много неприятных последствий. Поскольку выделительная система соседствует с половой, патогенные бактерии могут распространиться на стенки матки, затронуть плодные оболочки и, соответственно, самого ребенка, находящегося в утробе. Такое состояние значительно увеличивает риски:


    • развития внутриутробной инфекции,

    • преждевременного разрыва плодных оболочек и, как следствие, родов,

    • появления на свет маловесных новорожденных массой тела менее 2,5 кг.


    Именно поэтому акушеры-гинекологи стараются отслеживать динамику анализов беременных, чтобы своевременно начать адекватную терапию бессимптомной бактериурии и помочь женщине доносить здорового малыша.


    Как подтвердить диагноз?


    Диагностировать бессимптомную бактериурию довольно сложно, поскольку она никак себя не проявляет. Заподозрить патологию можно только при выявлении в моче лейкоцитов или высокого количества микроорганизмов (более 105 на 1 мл).


    Важно! Даже если в одном из анализов появились бактерии, это еще не значит, что в организме беременной есть патологии – возможно, конкретная порция была отобрана некорректно. Поэтому для подтверждения диагноза требуется минимум 2 повторных анализа с интервалом не более 24 часов – только в этом случае речь может идти о постановке конкретного диагноза.


    При наличии подозрений беременной проводят специальный скрининговый тест с реактивом ТТХ, который при наличии бактериурии дает положительный результат. Для уточнения клинической формы болезни и степени ее развития требуется более комплексное обследование, которое обычно включает следующие мероприятия:


    • общий и биохимический анализы крови позволят выявить наличие инфекционных процессов, протекающих в бессимптомной форме;

    • биохимический анализ мочи и исследование суточного диуреза по Нечипоренко продемонстрируют, насколько качественно выделительная система справляется с возложенными на нее функциями;

    • бактериологический посев мочи подтвердит наличие бессимптомной бактериурии и поможет оценить чувствительность микроорганизмов к антибактериальной терапии;

    • ультразвук почек поможет наглядно продемонстрировать анатомические особенности и вероятные изменения в структуре органов при беременности;

    • допплерометрия выделительной системы позволит оценить кровоснабжение мочеполовой системы.


    Важно! Бактериологический посев следует повторять дважды с промежутком в 3-7 дней. Если количественное содержание бактерий и их чувствительность к антибиотикам окажется идентичной в обеих пробах, результат можно считать корректным.


    Лечение бессимптомной бактериурии


    При выявлении нетипичной микрофлоры в составе мочи лечение нужно начинать незамедлительно, поскольку это позволит предотвратить неприятные последствия как для самой женщины, так и для ее будущего ребенка. Адекватную методику, безопасную при беременности, может определить только лечащий врач на основе результатов клинических исследований и наличия осложнений, однако в большинстве случаев избежать антибактериальной терапии все же не получится – антибиотики являются наиболее эффективной и действенной мерой для устранения бессимптомной бактериурии.


    Прежде чем лечить патологию, необходимо дождаться результатов бактериологического посева, который подскажет, к какому конкретно типу антибиотиков чувствительны выявленные бактерии. И только после этого лечащий врач может выбрать наиболее безопасное средство для устранения бактериурии, которое не окажет негативного влияния на плод и при этом гарантирует эффективность терапии. Кроме того, может потребоваться вспомогательное лечение растительными препаратами и мочегонными сборами, которые положительно влияют на работу почек и сочетаются с назначенными медикаментозными средствами.


    Важно! Не стоит самостоятельно назначить себе почечные фиточаи и другие народные средства для лечения бессимптомной бактериурии – при беременности любое, даже самое безопасное на вид средство может оказать негативное воздействие на организм. Все, что вы принимаете, должно быть обязательно согласовано со специалистом!


    Кроме того, клинические рекомендации включают щадящую бессолевую диету и оптимальный питьевой режим с упором на полезные виды жидкостей (клюквенный или брусничный морсы, чистая питьевая вода, отвар шиповника и т. д.). Такой подход позволит избавиться от бессимптомной бактериурии при беременности быстро и без последствий!

    Мне нравится
    0


    Похожие посты


    Оставить комментарий

    Сапрофитическая микробиота что это такое

    что это такое, чем питаются, где обитают?

    В природе существуют организмы – бактерии, грибы, растения, животные – питающиеся готовыми органическими соединениями. Источником углерода для них служат частички отмерших или продукты жизнедеятельности живых созданий природы. Такие существа называются «сапрофиты». Что это такое? Попробуем выяснить в данной статье.

    Происхождение названия

    Название этой группы организмов происходит от двух греческих слов: «гнилой» и «растение». Отсюда можно буквально понимать смысл понятия. Сапрофиты используют в пищу продукты жизнедеятельности иных организмов, ткани растительного и животного происхождения, часто – отмершие.

    Роль сапрофитов

    Велика роль этих созданий природы в глобальном круговороте веществ. Каждый живой организм когда-нибудь должен умереть. Так уж устроено природой. Многие сапрофиты предназначены для утилизации отмерших тканей. Без них биосфера попросту бы захлебнулась в собственных отходах, а вся Земля была бы устлана продуктами жизнедеятельности и отходами различных организмов – живых и мертвых.

    Сапрофиты выполняют в природе роль дворников, очищающих место для новой жизни. Также они разлагают органические ткани на составляющие элементы, которые затем используются другими организмами для собственного питания и функционирования.

    Какие бактерии называют сапрофитами?

    Общее количество живущих на планете Земля бактерий поистине несметно, не поддается точному исчислению. Микроорганизмы, с точки зрения классификации в биологии, — самое многочисленное Царство. Большинство из ныне существующих бактерий являются сапрофитами.

    Основные функции

    Бактерии-сапрофиты: что это такое? Их предназначение – разлагать органику в водных средах и почве, участвовать в минерализации, круговороте химических элементов. Азотобактерии, например, принимают активное участие в процессе фиксации азота. Некоторые – важнейшие звенья в преобразовании углерода, серы, фосфора. А другие микроорганизмы «помогают» человеку готовить пищевые продукты. Ведь процесс молочнокислого брожения напрямую зависит от сапрофитов. Сметана, творог, сыр, ряженка, соления, слабый алкоголь – те продукты, которые без бактерий просто не смогли бы существовать.

    Сине-зеленые водоросли

    Эти цианобактерии участвуют в производстве кислорода. Ученые считают, что именно эти древнейшие микроорганизмы начали формировать несколько миллиардов лет тому назад атмосферу Земли. Ведь тогда еще не было деревьев и прочих растений, выделяющих в процессе фотосинтеза кислород. А бактерии существовали. Даже сейчас – ввиду их многочисленности – их доля в производстве данного газа является существенной.

    Грибы и растения-сапрофиты

    В царстве грибов также есть представители данной категории: мелкие и средние, даже крупные. Они используют в пищу палую листву, перегной, стволы и ветки, навоз, древесный уголь, перья и пух птиц, шерсть животных. В общем – всякую органику, им доступную. Например, опенок белый, ложноопенок серно-желтый, навозник лохматый, подосиновики, подберезовики и многие другие являются сапрофитами. Многие лесные грибы вступают с высшими растениями (деревьями, кустарниками) в симбиоз, производя из всевозможных остатков растений и животных удобрения, необходимые для питания растений.

    Огромное значение (часто – не совсем приятное) имеют всевозможные микроскопические сапрофиты-грибки. Они часто поселяются в продуктах питания, преобразовывая их своей жизнедеятельностью, творя как съедобные в дальнейшем, так и несъедобные продукты. Заплесневелый хлеб и прокисшее варенье, забродивший фруктовый сок, сгнившее яблоко – их «рук» дело. Из полезных – чайный гриб, индийский рисовый, грибковое брожение при производстве алкоголя.

    В Царстве растений также имеются сапрофиты. Что это такое? У этих представителей флоры отсутствуют, как правило, элементы фотосинтеза (пигменты) и данный процесс осуществляется за счет приспособленности к употреблению питания из грибов, например. Невозможность осуществления фотосинтеза может быть частичной. Так, некоторые виды орхидей только в определенной мере зависят от грибов, но могут осуществлять и фотосинтез дополнительно.

    Подобные растения называют микогетеротрофами. Они насчитывают более 400 всевозможных видов.

    Животные-сапрофиты. Что это такое?

    Среди представителей фауны также есть подобные организмы. Например, клещи-сапрофиты (семейство паукообразные). Эти членистоногие не имеют зависимости непосредственно от других организмов, но в готовых органических соединениях все же нуждаются. Они используют для своего питания разлагающиеся растительные или животные ткани. Сапрофитами являются более 150 видов клещей пылевых, некоторые из них считаются аллергенными. Их можно увидеть только под микроскопом, так как их размеры минимальны (средние — 0,2 мм). Продолжительность жизни животного – около четырех месяцев. За это время самка клеща успевает отложить до 300 яиц. А всего в одном грамме пыли может «квартироваться» до нескольких тысяч этих организмов. В пищу они употребляют чешуйки слоя кожи людей, которые присутствуют в изобилии там, где человек спит (по данным науки, человек может сбрасывать в год до 700 граммов отмерших частичек кожи, ими и питаются пылевые клещи-сапрофиты).

    Характеристики Staphylococcus saprophyticus, таксономия, морфология, патогенез / биология | Thpanorama

    Staphylococcus saprophyticus является бактерией, которая входит в группу стафилококков, называемых коагулазонегативными. Это микроорганизм, имеющий клиническое значение, поскольку он вызывает мочевые инфекции главным образом у молодых беременных или сексуально активных женщин..

    В то время как другие коагулазонегативные стафилококки могут вызывать внутрибольничные инфекции у госпитализированных пациентов с подавленной иммунной системой,
    Staphylococcus saprophyticus
    затрагивает в основном здоровых женщин в обществе. Кроме того, это вторая по частоте причина возникновения цистита после Кишечная палочка.

    Хотя он обычно присутствует в менее чем 100 000 колониеобразующих единиц на миллилитр мочи (КОЕ / мл), он постоянно обнаруживается в серийных образцах. Вот почему сказано, что S. saprophyticus это хорошо документированный патоген.

    Заболеваемость инфекциями мочевыводящих путей S. saprophyticus он значительно варьируется между различными группами пациентов и различными географическими районами. Это обычно связано с рецидивирующими инфекциями и камнями в почках.

    индекс

    • 1 Характеристики
    • 2 Морфология
    • 3 Таксономия
    • 4 Факторы вирулентности
    • 5 Патологии и клинические проявления
    • 6 Диагноз
    • 7 Лечение
    • 8 ссылок

    черты

    Staphylococcus saprophyticus является факультативным анаэробным микроорганизмом, который обитает в желудочно-кишечном тракте человека, при этом прямая кишка является наиболее частым местом колонизации, за которой следуют уретра, моча и шейка матки.

    Он также обитает в желудочно-кишечном тракте свиней и кур. Они могут быть переданы человеку через потребление того же.

    Люди, колонизированные этим микроорганизмом, не обязательно будут страдать от инфекций, вызванных этой бактерией..

    С другой стороны, Staphylococcus saprophyticus отличается от других коагулазонегативных стафилококков тем, что он почти всегда чувствителен к большинству антибиотиков, используемых при инфекциях мочевыводящих путей, за исключением налидиксовой кислоты и фосфомицина.

    Однако большинство штаммов уже устойчивы к пенициллину, а некоторые к другим бета-лактамам. Были обнаружены штаммы с устойчивостью к эритромицину, клиндамицину, хлорамфениколу и левофлоксацину..

    Устойчивость к этим антибиотикам обусловлена ​​главным образом двумя механизмами: насосами для активного изгнания антибиотика и модификации сайта связывания антибиотика с бактериальной рибосомой путем метилирования..

    Среди биохимических характеристик этого микроорганизма:

    -Проявляют отрицательную реакцию на следующие тесты: коагулаза, декарбоксилирование орнитина, восстановление нитратов до нитритов и ферментация ксилозы.

    -При этом он дает положительные результаты в следующих тестах: мочевина, каталаза, ферментация мальтозы и сахароза.

    -Некоторые тесты могут давать различные результаты, такие как случай ферментации лактозы и маннита и чувствительность к бацитрацину, который может быть чувствительным или устойчивым.

    -Кроме того, он чувствителен к полимиксину В и устойчив к новобиоцину.

    морфология

    Стафилококк коагулазный отрицательный, в том числе Staphylococcus saprophyticus, они морфологически похожи на S. aureus и может поделиться многими характеристиками вирулентности.

    Это грамположительные кокки, которые расположены в кластерах. Они не подвижны, они не образуют спор и не являются гемолитическими.

    таксономия

    Домен: Бактерии.

    Тип: Firmicutes.

    Класс: Кулинария.

    Заказ: бациллы.

    Семья: стафилококковые.

    Род стафилококка.

    Виды: сапрофит.

    Факторы вирулентности

    соблюдение

    Основным фактором вирулентности этой бактерии является ее способность специфически прикрепляться к уроэпителиальным, уретральным и периуретральным клеткам в больших количествах, чем другие стафилококки..

    Так много тропизма у указанных клеток, которые не придерживаются других типов клеток. Этот тропизм уроэпителиальных клеток может частично объяснить высокую частоту инфекций мочевыводящих путей, вызванных этим микроорганизмом.

    Производство мочевины

    Фермент уреазы, с другой стороны, является важным фактором вирулентности для других урогенитальных патогенов, таких как Proteus sp и Corynebacterium urealyticum, где S. saprophyticus он не остался позади и способен его производить.

    Уреаза является определяющим фактором инвазии ткани мочевого пузыря на животных моделях мочевой инфекции

    Микробиота, пробиотики. Что это такое и как они влияют на наше самочувствие | Правильное питание | Здоровье

    Рассказывает ведущий научный менеджер датской бионаучной компании Дорте Эскесен:

    – Учёные обнаружили новый орган в теле человека. От него зависит наш внешний вид, здоровье и даже настроение. Весит этот орган около трёх килограммов. Тем не менее, несмот­ря на столь внушительный вес, долгое время этот орган оставался незамеченным, ведь состоит он из невидимых простому глазу крошечных организмов, живущих у нас в кишечнике. Всемирная организация здравоохранения и Международная ассоциация по пробиотикам договорились об определении: пробиотиками называются живые микроорганизмы, использование которых в необходимом количестве оказывает лечебно-профилактическое действие на организм человека.

    А микробиота – это своеобразная экосистема, подверженная изменениям под воздействием многих факторов, среди которых диета и заболевания кишечника. Это совокупность микроорганизмов, которые находятся внутри человеческого тела и на его поверхности. Мы, люди, – это один вид. В нас 30 триллионов клеток, 2300 генов. Если взять микробиоту, то это в 3 раза больше клеток, в 100 раз больше генов и намного больше видов бактерий. Плюс к этому у каждого микробиота своя. Кроме того, это не статичное, а динамически развивающееся явление, в течение жизни микробиота меняется, и её можно менять. Если сосредоточиться на микробиоте желудочно-кишечного тракта, то мы, учёные, ЖКТ сейчас воспринимаем как наш второй мозг.

    Ольга Шаблинская, «Про Здоровье»: Ничего себе заявление…

    — Тем не менее это так. Восприятие желудочно-кишечного тракта как второго мозга связано с тем, что у ЖКТ помимо бактерий очень много компонентов. Там находятся нейроны, обеспечивающие взаимодействие кишечника и мозга, и 60–70% клеток, отвечающих за иммунную систему.

    Плюс к этому бактерии ЖКТ влияют на мозг несколькими способами. У нас есть нервы, которые идут от мозга в кишечник, и есть нервы, которые, наоборот, идут от кишечника в мозг. Также микробы ЖКТ производят вещества, попадающие в кровь и влияющие на мозг. И влияние это огромно. Если взять поверхность желудочно-кишечного тракта, то она будет размером с теннисный корт.

    Микробиоту (так как эти невидимые микроорганизмы живут у нас в кишечнике) учёные стали называть новым органом и утверждают: от него зависит, почему мы рано стареем, почему не можем похудеть, чувствуем депрессию и вечную обессиленность. И главное, о чём говорит научный мир: воздействуя на микробиоту, можно многое изменить.

    — Кто открыл пробиотики?

    — Думаю, вам, русским, будет приятно узнать, что идея использования пробиотиков и изучение микробиоты принадлежит российскому учёному Илье Мечникову. Занимаясь вопросами здоровья кишечника, Мечников говорил о том, что в этом органе человека существует очень большое количество вредных бактерий, производящих токсины, и именно эти бактерии ответственны за старение и болезни. И если найти способ заместить эти вредоносные бактерии полезными бактериями, это и будет способствовать долгожительству. Эта идея пришла Мечникову ещё и потому, что он изучил исследования одного болгарского студента, который, в свою очередь, заинтересовался тем фактом, что в Болгарии очень много людей, преодолевших порог столетия. Стали изучать, чем же питаются эти люди. И выяснилось, что у них в рационе очень много кисломолочной продукции. Таким образом, возникла мысль: использование молочнокислых бактерий может способствовать долгожительству, оздоровлению организма. И это так. Много научных исследований посвящено факту, что определённый состав микробиоты наблюдается у людей с такими заболеваниями, как диабет I типа, ожирение, метаболический синдром. Однако вопрос: «Что сначала – курица или яйцо?» – по-прежнему не решён. То ли такой специфический состав микробиоты связан с заболеванием, то ли это заболевание вызвано микробиотой.

    — Женщин не меньше, чем здоровье, волнует внешний вид кожи, её красота. Насколько содержащиеся в нашем кишечнике микроорганизмы влияют на неё?

    — Красота и молодость кожи зависят от микробиоты напрямую. Кожа, если хотите, – это вывернутый наизнанку кишечник. По тому, в каком состоянии кожный покров, можно сказать всё о вашем ЖКТ. Это истинное зеркало нашего здоровья. Например, если у вас проблемы с усвоением питательных веществ, это непременно проявится на лице. Виноваты патогенные бактерии и дрожжи, которые вытесняют здоровые бактерии. В итоге в кишечнике скап­ливаются токсины, что ведёт к воспалениям и акне. Если в ЖКТ не хватает здоровых бактерий, на коже появляются акне и воспаления. Именно с нарушениями баланса микробиоты связаны угревая болезнь и себорейный дерматит. Поэтому, если вам нужна здоровая кожа, пробиотики нужны обязательно. Они уменьшают процессы гниения и брожения при заболеваниях ЖКТ, угнетают размножение вредных микробов, стимулируют иммунитет, улучшают всасывание витаминов, минералов, белка и других полезных веществ. Косметологи и врачи много лет используют пробиотики в комплексной терапии по поддержанию молодости и красоты кожи. Внешний эффект налицо: благодаря пробиотикам снижается излишняя сальность кожи и волос, пробиотики повышают защитный резерв кожи при действии таких неблагоприятных факторов, как холод, ветер, бытовая химия. Так что состав микробиоты исключительно важен для женской красоты.

    — Дортен, откуда же изначально берётся микробиота, каковы её источники?

    — Ребёнок рождается со стерильным кишечником, с отсутствием микробиоты, которая затем наживается в течение первых трёх лет его жизни. В первые полгода жизни ребёнка, независимо от того, находится ли он на грудном вскармливании или питается молочной смесью, очень многое меняется в его микробиоте, и, конечно, продолжаются эти изменения, когда он начинает упот­реблять твёрдую пищу. И опять же независимо от того, появился этот ребёнок на свет вагинальным способом или при помощи кесарева сечения, рождение на свет – это очень серьёзное изменение среды, из которой он вышел и в которую попал. В течение первых 6 месяцев и далее в течение первых трёх лет жизни очень активно идёт формирование микробиоты. И, таким образом, к трём годам ребёнок достигает того состава микробиоты, с которым он входит во взрослую жизнь, и в этой взрослой жизни с этой микробиотой существует. Дальнейшие серьёзные изменения начнутся уже в старости. Но старость сейчас – понятие относительное, непонятно, с какого момента её считать. Но тем не менее ближе к концу жизни наблюдаются новые изменения.

    И надо сказать, что стабильный состав микробиоты исключительно важен для здоровья человека. В первую очередь для того, чтобы микробиота могла осуществлять возложенные на неё функции – в частности, функцию по перевариванию пищи, ведь мы с вами за нашу жизнь потребляем около 60 тонн еды.

    Кроме того, будучи снабжённой защитным механизмом, микробиота вступает в реакцию с иммунной системой, с нервными клетками, которые находятся в желудочно-кишечном тракте, а также может физически занять те места, которые могли бы занять патогены, болезнетворные микроорганизмы, и обеспечить целостность кишечника и кишечного барьера. Проще говоря, все микроорганизмы в нашем кишечнике можно разделить на два типа. Первый – бактерии, которые вредят, например, выделяющие органические кислоты, портящие наши зубы, если их не чис­тить. Второй тип – полезные бактерии, которые производят ферменты и переваривают еду, а также следят за бактериями-агрессорами, чтобы те не расплодились. От распространения антибиотиков, которыми напичканы сегодняшние продукты питания, страдают оба вида бактерий. Поэтому пробиотики так полезны – они борются с антибиотиками.

    — Вы сказали, что стабильный состав микробиоты исключительно важен для здоровья человека. Как этого достичь?

    — Говоря о стабильной микробиоте, нужно понимать, что это идеальная ситуация, недостижимая в нашей реальной жизни. Кишечник, будучи интерфейсом с окружающим миром, сталкивается с различными вызовами – не только с продуктами питания, но и с различными микроорганизмами, не все из которых дружественны к человеку. К нарушению равновесия, т. е. дисбиозу, приводят различные факторы: это может быть путешествие, наш новый рацион, стресс, заболевания, использование антибиотиков при лечении. В общем, самые различные факторы, которые приводят к нарушению баланса. И именно дисбиоз увязывают на сегодняшний день с такими заболеваниями, как диабет I и II типа, аллергические реакции, инфекционные болезни. И как раз тогда, когда нашей родной кишечной микробиоте нужны помощь и поддержка, роль палочки-выручалочки может сыграть пробиотик.

    Вагинальная микробиота | BIOCODEX BMI PRO

    Микробиота влагалища, также называемая флорой Дедерлейна, описывается с 1894 года. Это очень сложная экосистема, находящаяся в динамическом равновесии. Ее состав у разных людей варьирует в широких пределах1–2.

    Основным родом является Lactobacillus, вырабатывающие молочную кислоту и обеспечивающие pH 3,8–4,4 в нормальных условиях. Такой сдвиг pH в кислую сторону создает неблагоприятные условия для размножения условно патогенных микроорганизмов3–5. Вагинальная микробиота является ключевым фактором защиты от различных возбудителей бактериальной, грибковой и вирусной природы. Она также играет важнейшую роль в первичной колонизации новорожденных, что оказывает влияние на иммунную систему и на неврологическое развитие6. Наиболее часто встречающимися видами являются L. crispatus, L. iners, L. jensenii и L. gasseri. Они обладают антибактериальными свойствами, образуют биопленку и стимулируют иммунные механизмы, которые защищают слизистые оболочки влагалища7.

    Помимо упомянутых выше, были описаны почти 250 видов бактерий, прежде всего анаэробные бактерии, такие как Prevotella, Gardnerella vaginalis и Atopobium vaginae, а также Escherichia coli и дрожжевые грибки Candida albicans8. Их состав и количество варьируется в зависимости от генетических факторов, этнической принадлежности, медикаментозных факторов (антибиотики), окружающей среды и поведения (сексуальная активность, личная гигиена и т.  д.), а также зависит от состава микрофлоры ротовой полости и кишечника9.

    Вагинальная микробиота в течение жизни меняется (половые гормоны, менструация, беременность, менопауза и т. д.), и эти факторы влияют на состав данной экосистемы10.

    Хотя состав вагинальной микробиоты у разных женщин различен, для обеспечения здоровья половых путей необход

    САПРОФИТЫ — это… Что такое САПРОФИТЫ?

  • САПРОФИТЫ — Растения, грибы к пр., питающиеся разлагающимися веществами. Словарь иностранных слов, вошедших в состав русского языка. Чудинов А.Н., 1910. САПРОФИТЫ растения (грибы, бактерии и пр.), питающиеся разлагающимися веществами. Словарь иностранных… …   Словарь иностранных слов русского языка

  • Сапрофиты — см. в ст. Сапротрофы. Экологический энциклопедический словарь. Кишинев: Главная редакция Молдавской советской энциклопедии. И.И. Дедю. 1989. Сапрофиты (от греч. sapros гнилой и phyton растение) принадлежащие к сапротрофам расте …   Экологический словарь

  • САПРОФИТЫ — (от греч. sapros гнилой и phyton растение) растения, грибы и бактерии, питающиеся органическим веществом отмерших организмов. Гетеротрофы. Разлагают трупы и выделения животных, растительные остатки …   Большой Энциклопедический словарь

  • САПРОФИТЫ — САПРОФИТЫ, растения или грибы, питающиеся мертвыми и гниющими тканями растений или животных. Обычно не имеют ХЛОРОФИЛЛА. Разлагают трупы и выделения животных, а также растительные останки …   Научно-технический энциклопедический словарь

  • сапрофиты — (уст.) – организмы, питающиеся остатками растений и животных и превращающие органические вещества в неорганические. B общебиол. литературе в настоящее время термин употребляется редко; в микробиол. используется как антоним паразитов, т. е.… …   Словарь микробиологии

  • САПРОФИТЫ — гетеротрофные растительные организмы, использующие в качестве источника углеродного питания продукты распада мертвых растений и животных в отличие от паразитов, развивающихся на живых организмах. Преобладающая масса С. относится к бактериям и… …   Геологическая энциклопедия

  • Сапрофиты — растения, живущие на отмерших, разлагающихся органических веществах. К этому разряду относится большинство грибов (см.), которые по отсутствию в их составных частях хлорофилла (см.) пользуются для своего существования исключительно органическими… …   Энциклопедический словарь Ф.А. Брокгауза и И.А. Ефрона

  • сапрофиты — (от греч. saprós  гнилой и phytón  растение), растения, грибы и бактерии, питающиеся органическим веществом отмерших организмов. Гетеротрофы. Разлагают трупы и выделения животных, растительные остатки. * * * САПРОФИТЫ САПРОФИТЫ (от греч. sapros… …   Энциклопедический словарь

  • Сапрофиты — Пищевая цепь Продуценты Консументы Редуценты Редуценты (также деструкторы, сапротрофы, сапрофиты, сапрофаги) микроорганизмы (бактерии и грибы), разрушающие остатки мёртвых растений и животных и превращающие их в неорганические соединения. От… …   Википедия

  • сапрофиты — saprofitai statusas T sritis ekologija ir aplinkotyra apibrėžtis Organizmai (grybai, bakterijos, kai kurie dumbliai), mintantys negyvų organizmų tirpiomis organinėmis liekanomis. atitikmenys: angl. saprophytes vok. Saprophyten, m rus. сапрофиты …   Ekologijos terminų aiškinamasis žodynas

  • Сапрофитическая микробиота что это такое

    Сапрофитная микрофлора

    Как утверждают ученые, в нашей ротовой полости постоянно живет около 200-300 различных видов микроорганизмов. Однако изучены наукой остается только около 50. Причем нужно понимать, что часть из этих микроорганизмов являются нашими прямыми союзниками и друзьями, а часть самыми настоящими врагами.

    Можно для начала разговора о микрофлоре ротовой полости отметить, что многие микроорганизмы попадают туда вместе с пищей, водой, воздухом.

    Что касается благоприятной среды для размножения микроорганизмов, то отметим здесь:

    • Слизистую оболочку.
    • Межзубные промежутки.
    • Десневые карманы.

    То есть все образования, в которых могут задерживаться остатки пищи, являются отличной средой для развития микроорганизмов.

    Группы микрофлоры

    Разделить микрофлору ротовой полости можно условно на две группы:

    • Сапрофитная или постоянная микрофлора ротовой полости. Ее присутствие обязательно для нормального функционирования всей зубочелюстной системы. Сапрофитная флора во рту препятствует развитию патологических состояний и поддерживает бактериальное равновесие.
    • Патогенная микрофлора. Эта группа уже оказывает исключительно негативное влияние не только на полость рта, но и на весь организм в целом

    Важно! В идеальном состоянии патогенной микрофлоры быть, конечно, не должно, или необходимо ограничить ее присутствие до той степени, когда она не способна будет уже оказывать влияние.

    Видовой состав

    Видовой состав микрофлоры ротовой полости в норме должен отличаться стабильностью. В нем можно обнаружить различные микроорганизмы – бактерии, грибки, вирусы. Преобладающее положение занимают бактерии анаэробного типа дыхания, к ним относятся стрептококки лактобациллы, бактероиды, фузобактерии, порфиромонады, превотеллы, вейонеллы, спирохеты а также актиномицеты.

    Качественный и количественный составы микрофлоры полост

    Микробиота кишечника человека. Не думай о микробах свысока! — ФИТНЕС | ЗДОРОВЬЕ | СПОРТИВНОЕ ПИТАНИЕ | ВИТАМИНЫ | ТРЕНИРОВКИ | НОВОСТИ

     

    Благодаря этим идеям удалось победить многие эпидемии. К примеру, Роберт Кох открыл бациллу сибирской язвы, туберкулезную палочку, холерный вибрион, за что был награжден Нобелевской премией в 1905 году. Также он вместе со своим ассистентом Юлиусом Петри изобрел способ культивирования микробов в специальной лабораторной посуде (чашка Петри).

    За последние 30 лет ученые пришли к двум очень важным выводам. Во-первых, количество микробов, которые можно вырастить в чашке Петри, составляет малую часть от общего числа микроорганизмов, заселяющих тело человека. А во-вторых, пошатнулся тезис о тотальной вредоносности микробов для человека. Кроме действительно опасных микроорганизмов нас постоянно сопровождают те, которые помогают нам жить, быть сильными и здоровыми. Это и есть микробиота человека.

    Конечно, иногда еще выходят научные статьи, в которых микробы по старинке именуются заклятыми врагами и паразитами, но в целом отношение к ним среди врачей и биологов изменилось.

      

    Как генетики помогли микробиологам. Микробиота играет роль эндокринного органа

    Взглянуть иначе на бактерии позволило бурное развитие молекулярной генетики и информатики. На их стыке появилась геномика — наука, занимающаяся изучением генов и геномов. Итак, каким образом генетики помогли микробиологам? Здесь нужно упомянуть международный исследовательский проект «Геном человека» (The Human Genome Project, HGP), который стартовал в 1986 году. В то время группа ученых из США решила установить полную последовательность ДНК человека. Если кто не знает, геномом называют совокупность генов конкретного организма.

    Создатели проекта решили опробовать свои методы на чем-то простом, например, на бактериях, населяющих наше тело. Тогда стало понятно, что  их количество просто огромно, а большая часть находится в кишечнике. В теле человека массой 90 кг содержится 3 кг бактерий. Уже раздаются голоса ученых, которые называют это скопление бактерий частью нашего организма. Если эта концепция верна, то именно микробы — самый большой орган человека, а вовсе не мозг или сердце, как принято думать. Почему микробиоту можно считать органом, мы подробно расскажем ниже.

    Кроме того, выяснилось, что микробы вступают с нашим телом в различные взаимодействия, часто позитивные. Оказывается, обмен веществ обеспечивается во многом ферментами, которые вырабатываются микробами. Более того, от них зависят наши привычки, вкусовые пристрастия, поведение и даже настроение.

    С точки зрения микробиологии сейчас уже можно объяснить, почему пища, приготовленная дома, многим кажется вкуснее, чем где-либо ещё. Дело в том, что у членов одной семьи живут похожие бактерии. Ребенок с молоком матери впитывает и «семейные» микроорганизмы. Грубо говоря, это не у каждой конкретной семьи имеются определенные вкусовые пристрастия, а у микробов, которые населяют это семейство внутри.

    Другой важный аспект в сотрудничестве микробиологии и геномики — выявление микробов, отвечающих за здоровье кишечника. Ученые и врачи стараются сделать так, чтобы микробиота была в активном состоянии. Сейчас в этом направлении удалось многого добиться. Не случайно в США уже 30 лет развиваются удивительные технологии— передача бактерий от здорового человека больному. Сюда нужно отнести такой, мягко говоря, экзотический вид терапии как пересадка кала (фекальная трансплантация).

    Развитие информатики и генетики позволило изучать генетическое строение микроорганизмов. Благодаря этому ученые могут сравнить последовательность ДНК микробов больного и здорового человека. Еще геномика установила, что можно брать мазки для исследования бактерий с любой части тела.

      

    Для чего нужно понятие микробиота человека?

    Когда взгляды на влияние бактерий изменились, возникла потребность в новой терминологии. Поэтому современная наука сформулировала понятие микробиом или микробиота. Итак, микробиом человека — это сообщество микроорганизмов, своеобразная внутренняя экосистема. Она подвержена влиянию многих факторов, таких как режим питания, заболевания кишечника, прием лекарственных средств.

    Микробиота — это совокупность всех бактерий человека, а они есть почти во всем организме. Но установлено всего пять мест в нашем теле, которые особенно полюбились бактериям: кишечник, кожа, дыхательные пути, полость рта, мочеполовая система. При этом большая часть микробиома у человека сосредоточена в кишечнике.

    В среднем в теле каждого взрослого содержится 2 — 3 кг бактерий, а их число поистине огромно — оно  в десять раз превышает число наших собственных клеток. С учетом последних открытий в микробиологии выражение «богатый внутренний мир» можно понимать буквально.

     

     

    Микробы и люди: древний союз ради выживания

    Ученые считают, что микробы и люди прошли вместе значительный путь. Вероятно, это очень древний союз. Речь идет о совместной эволюции. Изучив некоторые виды обезьян, а точнее их бактерии, микробиологи выявили ген, который встречается в ДНК кишечных бактерий всех приматов, в том числе и человека. Биологи предполагают, что у нашего общего предка был небольшой набор бактерий, в том числе имелась та, которая включает обнаруженный ген. Около 15 миллионов лет понадобилось, чтобы  у приматов появилось современное разнообразие микробов. Установлено, что разным видам обезьян присущи свои бактерии.

    По сути, люди и микробиота — это симбиоз двух форм жизни. У этого древнего союза вполне понятное объяснение: микробам нужна среда обитания и еда, а человеческий организм идеально подходит для этого. Кроме того, в ходе эволюции два этих мира научились «договариваться» между собой. К примеру, бактерии воздействуют на иммунные клетки стенок кишечника таким образом, что немного снижают их активность. Вероятно, поэтому у детей, которые росли без матери и ее бактерий, чаще развиваются различные виды аллергии и аутоиммунных заболеваний.

    Теперь ученым ясно, что микробы действуют на людей двояко: одни из них помогают организму функционировать, а другие — разрушают его.

      

    Кишечник как эндокринный орган. Настроение зависит от бактерий?

    Особое значение для здоровья имеют микробы, населяющие пищеварительную систему. Они воздействуют на стенку кишечника с помощью особых веществ, при этом влияют на наш мозг. Когда ученые исследовали химический состав этих соединений, то были поражены. Оказалось, что бактерии продуцируют аналоги наших собственных гормонов: серотонина, тестостерона, норадреналина, дофамина, гистамина. Также ими выделяются различные ферменты и белки.

    Удивительный факт — наше настроение может зависеть от того, как работает микробиота кишечника. Оказалось, что микробы способны синтезировать бензодиазепины, которые обладают успокоительным эффектом и по формуле близки к феназепаму. И это далеко не весь список веществ, изучение микробиома человека продолжается. Таким образом, можно сказать, что кишечник — это дополнительный эндокринный орган. Эта функция кишечника формируется с самого рождения, когда ребенок получает с материнским молоком все необходимые ему полезные бактерии. А поэтому бездумное применение лекарств недопустимо, особенно это касается детей.

      

    Спортивные бактерии — миф или реальность?

    Ученые Гарвардского университета изучают влияние микробов на спортивные достижения. Звучит невероятно, не так ли? Исследовав микробиом гребцов и бегунов, они пришли к выводу, что существуют бактерии, ответственные за выносливость, быстрое восстановление и психологическую устойчивость. Также специалисты установили, что определенный вид активности формирует конкретную микробиоту. Они уверены, что существуют так называемые спортивные бактерии.

    Сотрудник Медицинской школы этого университета Джонатан Шейман вместе с помощниками изучил образцы кала, взятые у 20 бегунов, которые участвовали в Бостонском марафоне. При этом забор анализов делался до забега и после него. В итоге выяснилось, что после соревнования у атлетов стало больше микроорганизмов определенного типа. Уже давно известно, что есть бактерии, умеющие перерабатывать молочную кислоту. А как мы знаем, данная кислота является непременным спутником катаболических процессов и вырабатывается при активной физической нагрузке. «Спортивные бактерии» как раз и помогают организму справляться с крепатурой, снимая мышечную боль.

    Также ученых интересовало, насколько отличается микробиота у представителей разных видов спорта. Они сравнили микробы, живущие в теле бегунов-ультрамарофонцев и гребцов. В организме первых было обнаружено много бактерий, которые отвечают за переработку углеводов и клетчатки, что помогает преодолевать длинные дистанции.

    Ученые предполагают, что на основе обнаруженных микроорганизмов удастся создать биологически активные добавки, чтобы атлеты могли добиваться более высоких результатов.

      

    Активность в пожилом возрасте — дело бактерий

    Еще одно интересное исследование провели сотрудники Школы медицины Университета Эмори в США. Они считают, что удалось найти способ, который поможет людям сохранять активность в пожилом возрасте. Большую часть работы проделал профессор патологии и лабораторной медицины Дэниэл Калман.

    Ученый с помощниками уделил особое внимание бактериям желудочно-кишечного тракта, производящим индолы. Эти ароматические вещества получаются в ходе распада аминокислоты триптофан, имеют запах капусты. Данные соединения широко применяется в парфюмерии и фармацевтике. Кстати, ближайший родственник индолов — гормон ауксин, который помогает растениям лучше развиваться.

    Проводя опыты над круглыми червями (нематодами), профессор обнаружил, что индолы помогают им реже болеть. В ходе эксперимента одних червей кормили бактериями, способными производить индолы, а других — обычными. Особого эффекта Калману удалось добиться в опыте с пожилыми червями. Обычно те мало двигаются, плохо едят, болеют, а при повышенной температуре в комнате сразу погибают.

    После того, как они получили полезные бактерии, их активность намного повысилась. Также эти черви старели медленнее своих собратьев и охотно употребляли пищу, хорошо переносили жару. При этом нематоды сохраняли способность к воспроизведению в 2,4 раза дольше по сравнению с контрольной группой. Похожим образом реагировали на данные бактерии мыши и мухи-дрозофилы. Получается, что активность в пожилом возрасте во многом зависит от того, насколько здорова микробиота.

      

     

     

    Микроорганизмы сапрофитные

    Микроорганизмы служат удобной моделью для изучения влияния различных факторов на живую клетку. Поэтому А.Л.Чижевский, являющийся пионером в изучении влияния Солнца на биосферу (первая его работа опубликована в 1915 г.), по совету К.Э.Циолковского поставил опыты с сапрофитными и патогенными микроорганизмами, экранированными свинцом, также исследовались раковая ткань и прорастающие семена растений. Полученные результаты дали основания сделать вывод: под защитой свинца заметно ускоряется рост и размножение клеток растений, опухоли и микроорганизмов.[ …]

    К сапрофитным микроорганизмам относят мезофильных аэробных и факультативных анаэробов, способных расти на питательном агаре данного состава при температуре (37 ± 2) “С в течение 24 ч, образуя колонии, видимые при увеличении в 2 раза.[ …]

    Число сапрофитных бактерий в питьевой водопроводной воде ежедневно контролируется в соответствии с ГОСТ 2874-73. Обычно в питьевой воде содержатся единичные клетки (не более нескольких десятков в 1 мл). По данным А. С. Разумова (1962), в хлорированной водопроводной воде число сапрофитных бактерий составляет лишь 0,1—0,001% от всего ее микронаселения, определяемого прямым микроскопическим методом, т. е. основная часть микрофлоры водопроводной воды состоит из микроорганизмов, не учитываемых на питательном агаре и не изученных ни в количественном, ни в качественном отношении.[ …]

    Число сапрофитных микроорганизмов коррелирует с количеством легкоусвояемых органических веществ в такой «голодной» среде, как вода. Изменение этого числа является одним из чувствительных показателей повышения трофности водоемов, последствия которого («цветение» воды, обусловленное массовым развитием фитопланктона, ухудшение органолептических свойств воды за счет привкусов, запахов, развитие анаэробных процессов и др.) неблагоприятны в гигиеническом отношении.[ …]

    Аэробные сапрофитные микроорганизмы содержались в биопленке в небольшом количестве, по-видимому, их роль в окислении сероводорода была незначительной. [ …]

    Анаэробные сапрофитные микроорганизмы могут служить индикаторами кислородного режима в слоях загрузки. В наибольшем количестве они содержались на глубине 0,5—1 м, что указывает на дефицит кислорода в этом слое биофильтра.[ …]

    Антагонисты — микроорганизмы, тормозящие или замедляющие жизнедеятельность других организмов (например, сапрофитные бактерии активного ила -антагонисты хламидобактерий, вызывающих его вспухание).[ …]

    Динамику развития сапрофитных микроорганизмов используют в качестве косвенного показателя присутствия в воде легкоусвояемых органических веществ в количествах, которые удается обнаружить обычными методами санитарно-химического анализа.[ …]

    Изучение динамики сапрофитных микроорганизмов вошло в схему разработки предельно-допустимых концентраций (ПДК) вредных веществ в воде и почве. Этот тест позволяет оценивать влияние вредных веществ на процессы самоочищения, санитарный режим водоемов.[ …]

    Ю. Т. Лошаков (1962) выращивал сапрофитные микроорганизмы, сконцентрированные из воды на мембранных фильтрах, на питательном агаре. После инкубации посевов при 37°С в течение 24 ч и при 20°С —■ 48 ч фильтры с выросшими колониями переносили на смоченную 1% раствором ТТХ фильтровальную бумагу, вложенную в чашку Петри. При дополнительной инкубации этих чашек в течение 90 мин при той же температуре, при которой происходило выращивание посевов, выросшие колонии окрашивались в ярко-красный цвет и легко подсчитывались.[ …]

    Интересно отметить, что эти же сапрофитные виды альтернарий обычно встречаются на листьях здоровых растений в качестве эпифитов. Там они развиты слабо, так как располагают ограниченным количеством питательных веществ, присутствующих на листовой поверхности, и подавляются специфическими веществами, выделяемыми растением. Можно полагать, что при ослаблении растения они получают шанс для более интенсивного развития. Пока это свойство эпифитных микроорганизмов недостаточно изучено, но полезные свойства эпифитной микофлоры уже отмечены. Эпифит-ные организмы способны подавлять развитие патогенов, попадающих на листья. Это установлено на примере альтернарий.[ …]

    Наши опыты показали, что достаточно 30-минутного контакта серебра в концентрация 0,1-0,2 мг/л со взвесью выделенных от больных штаммов дизентерии и бршного тифа для ях полной инактивации.[ …]

    Грибы —нитевидные гетеротрофные сапрофитные микроорганизмы, обильно населяющие почву (до 1 млн на 1 г почвы), особенно горизонты, обогащенные мертвыми растительными остатками (лесная подстилка, опад). Они активно участвуют в процессах минерализации и гумификации органических веществ. При этом имеет место последовательная смена одних групп грибов другими в процессе разложения органических веществ.[ …]

    Данных о влиянии метакриламида на сапрофитные бактерии и микроорганизмы в литературе не имеется.[ …]

    Результаты наблюдений за развитием сапрофитных бактерий в растворе дихлоруксусной кислоты представлены та рис. 12. Из приведенного рисунка видно, что концентрации дихлоруксусной кислоты до 100 мг/л не тормозят развития сапрофитных бактерий; при концентрациях 300 и 500 мг/л развитие бактерий несколько замедляется, а доза 1000 мг/л резко тормозит процесс развития микроорганизмов. [ …]

    Стандартный метод определения числа сапрофитных микроорганизмов за многие годы применения в практике санитарно-бактериологического анализа не претерпел существенных изменений. Это связано, вероятно, с тем, что этим методом определяют не какую-либо таксономическую единицу, а группу микроорганизмов, объединяемых едиными требованиями к условиям питания, температуре инкубации, близким по интенсивности развития при этих условиях. Сравнимые результаты могут быть получены только при строгом соблюдении всех условий метода — стандартная питательная среда, единая температура и сроки выращивания.[ …]

    Усовершенствование методов определения сапрофитных микроорганизмов в основном направлено на упрощение анализа, приспособление его к полевым условиям. Время исследования при этом существенно не сокращается (20—24 ч).[ …]

    Бытовые сточные воды содержат различные микроорганизмы: бактерии, дрожжевые и плесневые грибки, мелкие водоросли, яйца гельминтов, вирусы и др. Эти воды являются эпидемиологически опасными для человека и животных, так как в своем составе наряду с сапрофитными содержат патогенные (болезнетворные) организмы. В них могут встретиться возбудители всех болезней, обитающие в желудочно-кишечном тракте.[ …]

    Наблюдения за количественным изменением сапрофитной микрофлоры (рис. 26) показали, что четыреххлористый углерод при концентрациях до 50 мг/л не влияет на развитие микроорганизмов, а при 100 и 200 мг/л тормозящее действие его незначительно. Это вещество не усваивается бактериями.[ …]

    Взаимоотношение почвенных цианобактерий с сапрофитными микромицетами носит характер метабиоза и реже — антагонизма. Выявлена приуроченность некоторых видов грибов к определенным видам цианобактерий. Уникальная способность цианобактерий осуществлять оксигенный фотосинтез и фиксацию молекулярного азота является важным фактором формирования активных микробных комплексов. Гетеротрофные микроорганизмы могут образовывать с цианобактериями устойчивые сообщества, в которых последние занимают доминирующее положение. Следовательно, цианобактерии служат дополнительным источником органического вещества как энергетического материала для гетеротрофных микроорганизмов и, в итоге, способствуют повышению плодородия обедненных от эрозии почв. [ …]

    Препарат «Деворойл» получен на основе сообщества микроорганизмов дрожжей и бактерий Rhodococcus sp., Rhodococcus maris, Rhodococcus erythropolis, Pseudomonas stutzeri, Candida sp., растущих на углеводородах различных классов и их производных, устойчивых к повышенной солености (до 150 г/л NaCl), к резким колебаниям температуры — от 5 до +40°С, с активностью в широком диапазоне pH (от 4,5 до 9,5), при интенсивности загрязнения почвы нефтью более 5%. Высокая эффективность применения «Деворойла», по данным разработчиков, определяется тем, что в состав препарата входят лиофильные и гидрофильные микроорганизмы: бактерии, окисляющие нефтяные алканы с длиной углеродной цепи С49-С430 и ароматические соединения, в частности, фенол, крезол и пирокатехин; дрожжи, характеризующиеся высокой нефтеокисляющей активностью и способные выделять в среду аминокислоты, витамины и поверхностно-активные вещества. Используемые другими представителями почвенного биоценоза продукты жизнедеятельности бактерий и сами клетки отмирающих бактерий легко усваиваются сапрофитной микрофлорой биоценоза [2]. [ …]

    Кислород воздуха способствует жизнедеятельности сапрофитным микроорганизмам, частично подавляя развитие патогенных микроорганизмов. Аэрация способствует также большему контакту активного ила с загрязнениями сточной жидкости.[ …]

    В настоящее время найдены фаги, лизирую-щие клетки микроорганизмов, принадлежащих ко всем систематическим группам, как патоген ных для человека, животных и растений, так и сапрофитных (непатогенных).[ …]

    Опыты, выясняющие влияние метакриламида На развитие микроорганизмов, были поставлены при следующих концентрациях вещества: 25, 50, 100, 300, 500 и 1000 мг/л. По ходу опыта во всех опытных сосудах, кроме биологических анализов, проводились химические определения: pH, азота аммонийного, азота нитритов и нитратов и бромирующихся веществ (как показатель изменения вещества в растворе). Наблюдения за ходом изменения количества сапрофитных бактерий в этой серии опытов представлены на рис. 36.[ …]

    Количество бактерий, растущих,на МПА, называют общим счетом сапрофитных бактерий или, более кратко, общим счетом, хотя сапрофитные микроорганизмы составляют лишь 0,001—0,01 часть всех микробов, содержащихся в воде. [ …]

    Приблизительно таким же образом происходит перестройка среди сапрофитных микроорганизмов, особенно резко выраженная при использовании фумигантов (Буткевич, 1956; Поулсон, 1976), протравителей семян, фунгицидов и бактерицидов (Клинцаре, 1983). В этих случах нередко доминирующее положение надолго занимают 1—2 вида, причем в сукцессии микроорганизмов после внесения этих веществ с течением времени происходит смена доминирующих видов (Поулсон, 1979).[ …]

    Подробную качественную и количественную характеристику различных групп сапрофитных микроорганизмов можно использовать для дополнения и уточнения санитарной оценки водоемов. Преобладание кокковых бактерий свойственно чистым водоемам. Палочковидные формы преобладают в водах, более богатых растворенными органическими веществами. О загрязнении воды частицами почвы свидетельствуют колонии Вас. тусоь беэ — волокнистые нити, быстро разрастающиеся по поверхности агара. Актиномицеты, также характерные обитатели почвы, образуют плотные небольшие колонии из тонких ветвящихся нитей, при более длительном выращивании покрытых мучнистым налетом из конидий. Среда вокруг них приобретает различную окраску. Актиномицеты могут придавать воде трудно устранимые при очистке землистые запахи. Плесневые грибы свидетельствуют о загрязнении воды, из воздуха. Некоторые специфические микроогранизмы могут быть показателями загрязнения воды сточными водами от отдельных производств, например, колонии дрожжеподобных грибов.[ …]

    Корш (1970) предложила модифицированный питательный агар с ТТХ для определения сапрофитных микроорганизмов с помощью мембранных фильтров в полевых и экспедиционных условиях. Применение мембранных фильтров для выделения сапрофитов из воды значительно сокращает расход посуды, питательной среды и дает экономию рабочего времени.[ …]

    Метод мембранных фильтров позволяет при необходимости дифференцировать выросшие микроорганизмы по различным признакам, что перспективно для более глубокого изучения видового состава сапрофитных бактерий.[ …]

    Наряду с описанными существует очень много микобактерий совершенно безвредных. Это — сапрофитные формы. Большая часть их обитает в почве, где принимает активное участие в минерализации органических остатков. Они могут разлагать такие вещества, которые недоступны другим микроорганизмам или плохо усваиваются, например нефтяные остатки, воск, гуминовые соединения и др. Микобактерии прекрасно развиваются в почве с минимальной влажностью, при температуре, которая задерживает рост других организмов, а также в почвах с большим содержанием солей. Благодаря этим особенностям микобактерии играют особенно важную роль в превращении органических веществ в засушливых жарких районах, а также засоленных почвах.[ …]

    Организмы, осуществляющие разложение, или биодеградацию, образуют конечное звено в пищевой цепи. Это в основном сапрофитные микроорганизмы (гетеротрофные бактерии, дрожжи или грибы).[ …]

    С помощью переносной лаборатории, укомплектованной в соответствии с п. 2.2, выполняют посев проб воды для определения числа сапрофитных микроорганизмов и БГКП по пп. 4. 1.1; 4.1.2.[ …]

    Все это указывает на глубокие изменения в почве после девятилетнего ежегодного применения гербицидов. В результате резко меняются условия существования микроорганизмов, количество и качество энергетического материала, поступающего в почву. Если в контроле приток свежего органического вещества обеспечивается за счет высших травянистых растений, то в варианте с гербицидами главным образом за счет опавшей хвои, мхов и некоторых видов синезеленых водорослей. Это обусловливает относительное снижение численности сапрофитных грибов и бактерий, использующих легкодоступные органические вещества, с одной стороны, и возрастание числа микроорганизмов, разрушающих гуматы, — с другой. Таким образом, происходят качественные сдвиги: доминирующее положение в сообществе почвенных микроорганизмов занимает автохтонная группировка, разлагающая почвенный перегной.[ …]

    Начиная с работ Пастера и Коха многими авторами было предложено большое количество твердых, жидких и полужидких питательных сред для выделения и культивирования различных микроорганизмов. Само собой разумеется, что состав этих питательных сред зависит от тех питательных веществ, в которых нуждается изучаемая группа микроорганизмов. Поскольку различные группы микроорганизмов сильно отличаются друг от друга в потребности в питательных веществах для своего развития, то и состав питательных сред может резко отличаться друг от друга. Некоторые питательные среды пригодны для развития большого количества разнообразных микроорганизмов и употребляются для учета сапрофитных видов в воде и почве. Другие предназначены для развития какой-нибудь одной специфической группы организмов. Такие среды называются элективными или избирательными, и состав их согласуется со специфическими физиологическими особенностями данной группы организмов.[ …]

    Паразитизм у энтомопатогенных бактерий сопровождается развитием у них биохимической дифференциации, выражающейся в более узкой специализации питания. Облигатные формы этих микроорганизмов характеризуются зависимостью от многих аминокислот, витаминов и других факторов роста, тогда как сапрофитные и условно патогенные энтомопатогенные виды, как правило, являются ауксоавтотроф-ными, т. е. не нуждаются в дополнительных факторах роста.[ …]

    Первые микробы, по мнению Опарина, были анаэробами, так как кислорода на поверхности планеты еще не было. Затем, с появлением в составе атмосферы кислорода, часть анаэробов стала аэробами. По типу питания древнейшими микроорганизмами следует считать автотрофов. Затем, с появлением на земле растений и животных создались условия для гетеротро-фов. Сначала они вели сапрофитный образ жизни, т. е. использовали в качестве источника питания — неживые органические вещества. Затем часть сапрофитов приспособилась к жизни на поверхности и внутри других организмов, растительных и животных. Так появились паратрофы или паразиты. Что касается вирусов, то, несмотря на то, что они организованы более примитивно, чем микробы, вирусологи считают, что вирусы появились намного позже. Простота вирусов носит вторичный характер, т. е. она возникла в результате упрощения вследствие паразитического питания.[ …]

    Большое санитарное значение в этой связи приобретают процессы самоочищения почвы — биохимические реакции, осуществляемые почвенными организмами, в результате которых происходит гумификация и минерализация органических соединений. Обсемененность почвы сапрофитными микроорганизмами позволяет в определенной степени судить о загрязнении почвы органическими веществами (табл. 46).[ …]

    Следовательно, гриб из почвы заражает растение-хозяина, быстро убивает его и возвращается в почву, совершая как бы отдельные набеги на соседние территории, но не задерживаясь там после их разграбления. Такие набеги вызваны стремлением уйти от конкуренции с многочисленными почвенными микроорганизмами. Ведь почва буквально насыщена сапрофитными микроорганизмами (в 1 г почвы обитают миллионы бактерий и актиномицетов, десятки и сотни тысяч зародышей грибов). Всем им нужны богатые органическим веществом растительные остатки; многие микроорганизмы выделяют антибиотики, губительно действующие на соседей.[ …]

    Результаты исследования показали, что главными загрязнителями почв г. Петрозаводск являются тяжелые металлы, сера. На отдельных участках отмечали увеличение содержания тяжелых металлов выше установленных норм ПДК для почв. Вместе с тем, исчезновения важнейших экологотрофических групп микроорганизмов не происходило. Это указывает на их высокие адаптационные возможности к изменению почвенно-химической обстановки и способности сохранять главную функцию в почве-трансформацию органического вещества и адсорбцию металлов, попадающих на почвы, тем самым, предотвращать их быстрое продвижение по трофическим цепям. Результаты свидетельствуют, что полифункциональный характер пыли оказывает селективное влияние на споровые микроорганизмы. Выявили устойчивый блок в комплексе спорообразующих сапрофитных бактерий. Однако в дальнейших биомониторинговых исследованиях необходимо обращать внимание не только на доминирующие биотипы, но и виды-сателлиты, чувствительность которых к изменению в педосфере может быть иной: они могут сохранять стабильность и быть «донорами» генофонда при экологической катастрофе.[ …]

    При этом свежие, только что выделенные штаммы устойчивее старых, лабораторных штаммов [1301. Серебро не убивает спорообразующих бактерий, но прорастание спор в присутствии ионов серебра задерживается [131 ]. По мнению некоторых исследователей (Либ, Крузе, Фишер и др.), на кислотоустойчивые, туберкулезные бактерии, а также сапрофитные водные бактерии серебро почти не действует. Как правило, патогенные микроорганизмы более чувствительны к серебру, чем сапрофиты.[ …]

    Микоплазмы встречаются в разных источниках: в почве, сточных водах, загрязненных культурах тканей животных. Микоплазмы являются возбудителями заболеваний растений, домашней птицы, животных и человека (уретрит, плевропневмония и др.). Доказано, что непатогенные виды микоплазм способны существовать в почвах, паразитируя на других микроорганизмах (бактериях, низших грибах), способствуя существованию в природе сложных ассоциаций, описываемых в качестве самостоятельных организмов (Ме1аШ етшп, ОаШопе11а и др., аккумулирующие железо и марганец бактерий). Есть сведения в пользу существования сапрофитных форм микоплазм.[ …]

    Гриб сохраняется на растительных остатках в виде микросклероциев, обильно образующихся при попадании в почву. Имеются сведения о сохранении гриба в форме микросклероциев на отмерших растительных остатках от 5—6 до 14—15 лет, а в виде спор и мицелия — в течение нескольких дней или недель (не более 3—4 месяцев). На выживание в почве микросклероциев оказывает влияние комплекс условий, создающихся в ней. Ведущую роль при этом играют устанавливающиеся взаимоотношения между сапрофитной и патогенной микофлорой. Жизнедеятельность почвенных микроорганизмов тормозит прорастание инфекционных зачатков (в нашем случае — микросклероциев). Это предохраняет их от преждевременного прорастания и гибели. До тех пор, пока микросклеро-ции находятся в состояпии покоя, они неуязвимы для окружающей микрофлоры.[ …]

    Субстратами, резко отличными от илов, где слои обитания микробов по крупицам «лепятся» осадками из толщи воды, • являются горные породы, частично выветренные (рухляки), породы из шахт, выброшенные при добыче руд, сами стенки штолен и естественные разломы земной коры. Все это — своеобразная среда обитания микрофлоры, арена деятельности преимущественно хемотрофпых и миксотроф-ных бактерий, добывающих энергию при окислении неорганических веществ (соединений железа, марганца, серы). Содержание сапрофитных бактерий в горных породах невелико, около 2—3 тыс. клеток в 1 г субстрата. В нефтеносных породах даже на глубине 500 и 700 м насчитывается 30—100 млн. клеток в 1 г породы. Глубинные воды практически лишены микроорганизмов (3—300 клеток). Микрофлора горных пород активно участвует в их выветривании (разрушении) за счет продуктов жизнедеятельности, в том числе серной и других кислот. Легко догадаться, что такие вещества, как торф, бурый и каменный уголь, содержащие лигнин и гумусовые кислоты, также являются пригодными для микробов субстратами. Нефть и углеводороды успешно осваиваются микроорганизмами. Именно с этими процессами связаны надежды (и уже реальные успехи) современного человечества на получение промышленным путем микробной массы (белка) из нефтяных продуктов для использования в качестве корма и пищи. Микробы способны окислять сульфидные руды, выщелачивая серу и повышая содержание металла в них (в первую очередь цветных и редких металлов). Эти процессы лежат в основе активно развивающейся отрасли промышленности — гидрометаллургии, осваивающей с помощью микробов бедные и трудно-перерабатываемые руды. [ …]

    Сапрофиты (пылевые клещи). Что это такое, чем они опасны и как бороться с клещами-сапрофитами?

    Незримые монстры ждут своего часа, таясь под подушками и в недрах кроватей… Начало мистической истории? Вовсе нет, суровая реальность, с которой мы сталкиваемся каждый раз, когда переступаем порог своего дома. Речь идет о пылевых клещах-сапрофитах, миллиардами обитающих даже в благоустроенных и чистых домах.

    Клещ-сапрофит: динозавр размером с пылинку

    Эти микроскопические членистоногие из семейства паукообразных выглядят поистине пугающе: несколько пар тонких ножек и крупное тельце со своеобразными хоботками. А если учесть, что они обладают аппетитом, достойным плотоядных динозавров, то соседство с подобными монстрами становится все более неприятным. Питаются клещи-сапрофиты отмершими частичками нашей кожи. Хорошо, что размер они имеют микроскопический, около 0,1–0,5 мм, иначе в нашем распоряжении стало бы гораздо больше сюжетов для ночных кошмаров. Каждая особь живет в среднем 4 месяца, за это время самка клеща-сапрофита откладывает до 300 яиц: то есть масштабы проблемы склонны к быстрому росту. Если взять всего несколько граммов обычной пыли, то в ней, скорее всего, будет несколько тысяч клещей. Что уж говорить о наших матрасах, где мы сами создаем сапрофитам идеальные условия для жизни. А им нужно совсем немного: тепло (20–25°C), умеренная влажность (60–80%) и… еда! Когда вы ложитесь в кровать, то обеспечиваете им все три условия. Кстати, хорошими манерами наши клещи не отличаются, поэтому «уборной» считают ту территорию, где и находятся в данный момент. Так что места обитания сапрофитов переполнены их фекалиями, которые они производят в количестве, примерно в 200 раз превышающем их собственный вес.

    Природа задумывала таких клещей как своеобразных помощников процесса разложения. Но перебравшись из гнездовий птиц, где они изначально проживали, в людские жилища, сапрофиты стали настоящей проблемой, угрожающей здоровью каждого человека. Всего в природе существует около 150 видов подобных клещей, но наиболее опасными «соседями» являются Dermatophagoides pteronyssinus и Dermatophagoides farinae, то есть дерматофагоидные или пироглифидные. Именно они становятся причиной проблем с самочувствием у человека.

    Пылевые клещи и аллергия

    Слово «клещ» вызывает у большинства людей неприятные ассоциации с кровососущими насекомыми, о которых не понаслышке известно каждому любителю прогулок по паркам и лесам. Клещи-сапрофиты выгодно отличаются от своих собратьев тем, что не способны напрямую причинить человеку вред. Но, к сожалению, сам факт их существования доставляет нам множество проблем. Экскременты пылевых клещей очень токсичны, они способны вызывать сильную аллергию (особенно у людей, склонных к респираторным заболеваниям), а также ухудшать состояние кожи, ускоряя процесс отмирания ее клеток.

    Каждый раз, когда вы заправляете постель, продукты жизнедеятельности клещей оказываются в воздухе, в буквальном смысле отравляя вам жизнь. Слишком маленький размер подобных частиц позволяет им подолгу не оседать, поэтому если в вашем доме есть пылевые клещи, то вы вдыхаете дикую смесь экскрементов и омертвевших частиц панцирей практически постоянно.

    Согласно исследованиям 80% пациентов с бронхиальной астмой имеют аллергию на продукты жизнедеятельности клещей-сапрофитов, которые иногда и являются причиной возникновения заболевания. Кроме того, около 25% населения крупных городов страдает от аллергии, причиной или усугубляющим фактором которой становятся эти создания.

    Это интересно!

    Согласно исследованиям ученых из Мюнхена, люди, которые провели все свое детство в сельской местности, отличаются слабой восприимчивостью к влиянию пылевых клещей и их экскрементов. Дело в том, что они подвергались их «атакам» с самых ранних дней, выработав иммунитет.

    Не следует думать, что просто поменяв постельное белье, вы тут же окажетесь в безопасности. Клещи-сапрофиты часто выбирают себе такие места обитания, где поменьше света и неблагоприятных влияний внешней среды. Поэтому заползают поглубже внутрь матраса, подушки и одеяла, отнюдь не брезгуя ковром, вашим любимым пледом и даже одеждой. Чтобы вовремя и с наибольшей эффективностью противостоять такой напасти, нужно знать о признаках, свидетельствующих о наличии пылевых клещей у вас дома.

    Как узнать, что в доме «поселились» клещи-сапрофиты?

    Прежде всего нужно обратить внимание на первые признаки аллергии. К ним относятся:

    • круглогодичный насморк;
    • частое чихание;
    • кашель;
    • затрудненное дыхание;
    • слезотечение;
    • отечность.

    Если эти симптомы самостоятельны и беспокоят вас без видимой причины (особенно утром), то самое время начать бороться с невидимыми провокаторами — пылевыми клещами.

    Как избавиться от пылевого клеща?

    Существенно сократить количество клещей-сапрофитов помогают следующие меры:

    • Проводите регулярную влажную уборку с использованием 20-процентного раствора поваренной соли. Сухая уборка с помощью обычного пылесоса принесет мало пользы. Большинство моделей даже могут усугубить ситуацию, разнося пыль и клещей по всей квартире. Дело в том, что большинство фильтров не способны задерживать столь маленькие частицы, поэтому пройдя сквозь недра пылесоса, экскременты клещей надолго «повиснут» в воздухе.
    • Почаще проветривайте постельные принадлежности, включая подушки и матрасы. Клещи-сапрофиты не выносят яркого света, свежего воздуха и температуры, которая выходит за границы 20–25°C.
    • Можно воспользоваться услугой ультрафиолетовой чистки подушек. Но следует иметь в виду, что для полноценной борьбы с пылевыми клещами вам нужно подвергать предмет излучению не менее нескольких часов.
    • Покупайте новый матрас не реже чем раз в 8–10 лет, а подушку меняйте уже после двух лет использования.
    • Окончательно избавиться от клещей-сапрофитов помогут лишь аппараты со специальной многоступенчатой системой фильтрации. На российском рынке такой тип моделей представлен пылесосами Rainbow, которые собирают 99,997% микрочастиц размером до 0,3 микрон, одновременно очищая и увлажняя воздух. Пылесос оснащен различными насадками для уборки в труднодоступных местах, а также (что очень важно для борьбы с пылевыми клещами!) — насадкой для глубинной очистки мягкой мебели.

    Надеемся, что статья помогла вам получить общее представление об опасности пылевых клещей-сапрофитов и причинах странного насморка и кашля у вас или ваших близких. Кто предупрежден — тот вооружен. Чем раньше вы начнете борьбу с этими опасными микроорганизмами, тем меньше вреда они успеют вам нанести.

    А знаете ли вы…

    А знаете ли вы…

    А знаете ли вы…

    А знаете ли вы…

    А знаете ли вы…

    А знаете ли вы…

    А знаете ли вы…

    А знаете ли вы…

    Сапрофитные характеристики, экологическая функция, питание, среда обитания / биология | Thpanorama

    saprófitos это организмы, которые получают свою энергию из неживой материи в состоянии разложения. Эти живые существа взаимодействуют с окружающей средой на микроскопическом уровне. К этой группе относятся грибки, некоторые бактерии и водные плесени..

    Их роль в экологическом балансе очень важна, поскольку они являются первым шагом в процессе распада неживого материала. Во многих случаях только сапрофиты способны метаболизировать некоторые соединения, превращая их в продукты многократного использования..

    Таким образом, эти организмы возвращают в окружающую среду в виде свободных ионов компоненты детрита. Это позволяет замкнуть циклы питательных веществ.

    Сапрофиты в трофической цепи рассматриваются как микропотребляющие. Причина в том, что они берут свои питательные вещества из детритовой массы, которая пострадала от последствий разложения..

    индекс

    • 1 Характеристики
      • 1.1 Гетеротрофы
      • 1.2 Осмотрофы
      • 1.3 Клеточная стенка
      • 1.4 Плазматическая мембрана
      • 1.5 Изменить подложку
    • 2 Экологическая функция
      • 2.1 Биотехнология
    • 3 Питание
      • 3.1 Адаптации у грибов
    • 4 Хабитат
      • 4. 1 -Событие сапрофитного гриба
    • 5 Пример сапрофитных организмов
      • 5.1 Грибы
      • 5.2 Плесень (оомицеты)
      • 5.3 Бактерии
    • 6 Biormendment
    • 7 ссылок

    черты

    гетеротрофный

    Сапрофиты гетеротрофны, потому что они получают свою энергию от мертвого органического вещества или от массы детрита. Из этих разложенных материалов извлекаются различные соединения, которые используются для выполнения жизненно важных функций организма..

    Osmótrofos

    Эти организмы поглощают питательные вещества путем осмоса. Здесь градиент концентрации вещества в двух разных средах играет важную роль для транспорта питательных веществ..

    Получение органических питательных веществ в тех организмах, которые являются как осмотическими, так и гетеротрофными, зависит от внешнего пищеварения. В этом случае ферменты способствуют деградации молекул.

    Клеточная стенка

    Клетки грибов, бактерий и плесени имеют устойчивую клеточную стенку. Это потому, что они должны противостоять осмотическим силам и силам роста клеток. Стенка расположена снаружи от клеточной мембраны.

    Грибы представляют собой клеточную стенку, состоящую из хитина. У водорослей они часто состоят из гликопротеинов и полисахаридов, а в некоторых случаях из диоксида кремния..

    Плазменная мембрана

    Плазматическая мембрана у сапрофитных организмов обладает избирательной проницаемостью. Это позволяет через диффузию проходить через нее только определенные типы молекул или ионов..

    Изменить подложку

    Некоторые виды сапрофитных грибов модифицируют рН среды. Это особенность зеленых грибов (dematiaceae), которые входят в состав рода Penicillium..

    Бактерии, принадлежащие к роду Pseudomonas, меняют цвет среды, в которой они находятся. Первоначально он желтый и становится красным из-за метаболизма, который выполняет бактерия.

    Экологическая функция

    Сапрофиты играют очень важную роль для экосистемы; они являются частью организмов, которые замыкают естественный цикл материи. Когда они разрушают организмы, которые уже завершили свой жизненный цикл, они получают питательные вещества, которые рециркулируют, высвобождаются и возвращаются в окружающую среду. Там они снова доступны для других живых существ.

    Разложившиеся материалы содержат питательные вещества, такие как железо, кальций, калий и фосфор. Это основа для роста растений.

    Клеточная стенка растений состоит из целлюлозы. Эту молекулу очень трудно эффективно обработать подавляющим большинством организмов. Тем не менее, грибы обладают группой ферментов, которые позволяют им переваривать такую ​​сложную структуру.

    Конечным продуктом этого процесса являются простые молекулы углеводов. Углекислый газ выделяется в окружающую среду, где он улавливается растениями в качестве основного элемента процесса фотосинтеза.

    Многие из компонентов живых существ могут разрушаться почти исключительно сапрофитами, такими как лигнин. Это органический полимер, который содержится в опорных тканях растений и некоторых водорослей. .

    биотехнология

    Ацидофильные бактерии могут выдерживать высокие концентрации некоторых металлов. Thiobacillus ferrooxidans был использован для детоксикации ионов металлов в кислых водах металлических рудников.

    Секретируемые ферменты могут участвовать в процессе восстановления ионов металлов, присутствующих в сточных водах шахт.

    Бактерия Magnetospirillum Magnumum Он производит магнитные минералы, такие как магнетит. Они образуют осадочные остатки, которые указывают на местные изменения окружающей среды.

    Археологи используют эти биоматериалы для установления экологической истории региона..

    питание

    Сапрофиты можно разделить на две группы:

    Вынужденные сапрофиты, которые получают свои питательные вещества исключительно путем разложения органического вещества без жизни. В другую группу входят те организмы, которые сапрофитны только на этапе своей жизни и становятся факультативны

    Паразиты и сапрофиты

    В зависимости от источника готовых органических веществ гетеротрофы в свою очередь делятся на сапрофитов и паразитов.

    Сапрофиты — это такие гетеротрофные растительные организмы, которые питаются за счет мертвого органического вещества, извлекаемого из почвы (почвенные грибы, бактерии), отмерших растений, из готовой сельскохозяйственной продукции (плесневые грибы, сапрофитные бактерии) и т. п.

    Паразиты — это гетеротрофные организмы, развивающиеся всю жизнь или хотя бы часть ее на поверхности или внутри других живых организмов и извлекающие питательные вещества не из мертвых, а из живых клеток. Живое растение, служащее местом поселения и источником питания для другого организма, принято называть хозяином, растением-хозяином, или питающим растением. Паразитами являются многие грибы, вызывающие различные болезни растений (ржавчинные, головневые, мучнисторосяные) некоторые цветковые паразиты. Паразитизм же — это тип отношения одного организма (паразита) к другому (хозяину), при котором один живет за счет другого, питаясь его соками и тканями. Такое резкое деление гетеротрофных организмов на паразитов и сапрофитов легко проводится для типичных представителей, на самом деле их различить относительно трудно, так как многие паразиты довольно часто ведут полусапрофитный образ жизни, поселяясь на отмирающих частях растения; представители же сапрофитов нередко поселяются на живых растениях, которые по какой-либо причине ослаблены. Причиной такого перехода могут быть возрастные особенности растения или стадии развития возбудителя болезни: многие конидиальные стадии сумчатых грибов известны как паразиты, а в совершенной стадии развития грибы ведут сапрофитный образ жизни на опавших листьях (Venturia inaequalis Wint.). Поэтому возникает необходимость установления промежуточных групп и групп с различной паразитической активностью — облигатные и факультативные паразиты и сапрофиты.

    Облигатные, или обязательные, паразиты — это такие организмы, которые способны использовать для своей жизнедеятельности только содержимое живых клеток растения и с отмиранием растения они погибают. На всех стадиях своего онтогенеза они ведут паразитический образ жизни и в сапрофитных условиях на естественных и искусственных питательных средах не развиваются. Примером облигатных паразитов являются пероноспоровые, ржавчинные и мучнисторосяные грибы.

    Факультативные или условные, сапрофиты, или полупаразиты, — это такие организмы, которые обычно развиваются на живых растениях и ведут паразитический образ жизни в какой-нибудь стадии индивидуального развития, но при отсутствии растения-хозяина и в других стадиях могут питаться сапрофитно и вести сапрофитный образ жизни. Такие организмы можно выращивать в чистых культурах на искусственных питательных средах. К ним относятся большинство сумчатых грибов, которые в конидиальной стадии паразиты, а в сумчатой — сапрофиты, а также некоторые трутовики на деревьях.

    Факультативные паразиты, или полусапрофиты, — организмы, нормально ведущие сапрофитный образ жизни, но в подходящих условиях в одной из стадий индивидуального развития поселяющиеся на живых тканях растений. В качестве примера могут быть названы грибы: Rhizopus — это обычный сапрофит, но встречается на плодах, вызывая их гниль; на початках кукурузы (Rh. maydis Brud.) — вызы

    Микрофлора влагалища: последствия отклонений от нормы


    Микрофлора (биоценоз) влагалища является естественной защитой женских половых органов от патогенных микроорганизмов. Состав микрофлоры у каждой женщины индивидуален и подвержен периодическим изменениям. Он зависит от возраста, фазы менструального цикла, климатических условий и ряда других факторов. Влияние на микрофлору может оказывать даже материал нижнего белья и косметические средства, используемые для повседневной гигиены.


    Норма и патологии


    В норме основу микрофлоры составляют лактобактерии. Еще одно их название – палочки Дедерлейна. Они создают во влагалище уровень pH, который подавляет развитие условно-патогенной микрофлоры. Помимо лактобактерий во влагалище имеются и бифидумбактерии, которые также препятствуют размножению болезнетворных бактерий. В норме условно-патогенные микроорганизмы все же присутствуют, но в незначительном количестве, так как их рост подавляется.


    В случае нарушения нормальной микрофлоры влагалища патогенные микроорганизмы начинают активно развиваться. Это приводит к появлению таких заболеваний, как вульговагинальный кандидоз, бактериальный вагиноз, аэробный вагинит и другие.


    Симптомы нарушения микрофлоры влагалища


    Если женщина замечает, что количество выделений из влагалища увеличилось, они имеют желтый или серый оттенок, неприятный запах, необходимо обратиться к врачу и сдать анализы. Также поводом для обращения к специалисту должен стать зуд и болезненные ощущения в вульве. Такие симптомы указывают на то, что нарушение микрофлоры влагалища уже привело к развитию бактериального вагиноза или других заболеваний. Кроме того, такие симптомы могут быть вызваны венерическими инфекциями, поэтому тянуть с визитом к врачу не стоит.


    Нарушение нормальной микрофлоры влагалища может быть вызвано разными причинами. Это переохлаждение, прием некоторых лекарственных препаратов, гормональные нарушения, нерегулярная половая жизнь, недостаточно тщательное соблюдение личной гигиены и прочее.


    Современная диагностика на страже женского здоровья


    Если женщина обнаруживает у себя симптомы нарушения микрофлоры, необходимо сдать специальный анализ, который носит название флороценоз. Это лабораторное исследование мазка из влагалища, в ходе которого определяется соотношение концентрации ДНК лактобактерий и ДНК распространенных видов патогенной микрофлоры.


    Также такое исследование необходимо на этапе планирования беременности, во время вынашивания малыша и перед инвазивными манипуляциями на органах малого таза. По результатам анализа врач поставит точный диагноз и подберет лечение, которое позволит максимально быстро восстановить биоценоз влагалища и избавиться от неприятных симптомов.

    Ранняя диагностика дает возможность справиться с воспалительным процессом и другими проблемами в кратчайшие сроки, избежать появления осложнений. Самолечение недопустимо, так как правильно трактовать результаты исследований может только врач.

    Комплексная оценка микрофлоры влагалища:
    Флороценоз и Микроскопия

    Микробиом полости рта: раскрытие основ

    J Oral Maxillofac Pathol. 2019 январь-апрель; 23 (1): 122–128.

    Priya Nimish Deo

    Отделение оральной патологии и микробиологии, Бхарати Видьяпит (считается университетом), Стоматологический колледж и больница, Пуна, Махараштра, Индия

    Ревати Дешмук

    eth Отделение оральной патологии и микробиологической микробиологии, Бахарати Университет), Стоматологический колледж и больница, Пуна, Махараштра, Индия

    Кафедра патологии полости рта и микробиологии, Бхарати Видьяпит (Предполагается, что университет), Стоматологический колледж и больница, Пуна, Махараштра, Индия

    Адрес для корреспонденции: ДокторПрия Нимиш Део, «Девашиш», участок № 378, переулок № 16, Общество Махатм, Котруд, Пуна — 411 038, Махараштра, Индия. E-mail: [email protected]

    Поступило 5 декабря 2018 г .; Принято 8 февраля 2019 г. , и основываться на работе в некоммерческих целях при условии предоставления соответствующего кредита и лицензирования новых творений на идентичных условиях.

    Эта статья цитируется в других статьях в PMC.

    Abstract

    Микробиота полости рта является второй по величине и разнообразием после кишечника, в которой обитает более 700 видов бактерий. Он питает множество микроорганизмов, включая бактерии, грибы, вирусы и простейшие. Рот с его различными нишами представляет собой исключительно сложную среду обитания, где микробы колонизируют твердые поверхности зубов и мягкие ткани слизистой оболочки полости рта. Микробиом полости рта не только является точкой инициации пищеварения, но и играет решающую роль в поддержании здоровья полости рта и системы.Благодаря простоте сбора образцов микробиом стал наиболее хорошо изученным на сегодняшний день. Раньше изучение микробиома ограничивалось обычными методами, зависящими от культуры, но культивировать многочисленную микрофлору, присутствующую в полости рта, было невозможно. Следовательно, изучение микробиома было трудным. Появление новых геномных технологий, включая секвенирование следующего поколения и биоинформатику, выявило сложности микробиома полости рта. Он предоставил мощные средства изучения микробиома.Понимание микробиома полости рта в отношении здоровья и болезней даст дальнейшие направления для изучения функциональных и метаболических изменений, связанных с болезненными состояниями, и определения молекулярных сигнатур для разработки лекарств и целевых методов лечения, которые в конечном итоге помогут в предоставлении персонализированной и точной медицины. Эта обзорная статья представляет собой попытку объяснить различные аспекты микробиома полости рта в состоянии здоровья.

    Ключевые слова: 16S рРНК, база данных орального микробиома человека, микробиом, секвенирование нового поколения

    ВВЕДЕНИЕ

    Сообщество микробных жителей в нашем организме называется микробиомом.Термин «микробиом» был введен Джошуа Ледербергом, лауреатом Нобелевской премии, для описания экологического сообщества симбиотических, комменсальных и патогенных микроорганизмов. Эти микроорганизмы буквально разделяют пространство нашего тела. [1] Количество микробов, присутствующих в нашем организме, почти такое же или даже больше по сравнению с количеством наших клеток. [2]

    Микробиом полости рта, микробиота ротовой полости или микрофлора ротовой полости относятся к микроорганизмам, обнаруживаемым в ротовой полости человека. [3] Микробиом полости рта был впервые идентифицирован голландцем Энтони ван Левенгук, который первым определил микробиом полости рта с помощью сконструированного им микроскопа.[4] Его называли отцом микробиологии и пионером, открывшим как протисты, так и бактерии. [5] В 1674 году он обнаружил свой зубной налет и сообщил, что «маленькие живые животные красиво движутся». [6]

    Геном — это генетический материал организма. Это полный набор ДНК, включая все ее гены.

    Микробиом полости рта определяется как коллективный геном микроорганизмов, обитающих в полости рта. После кишечника это второе по величине микробное сообщество человека. По сравнению с другими участками тела они демонстрируют поразительное разнообразие предсказанных функций белков. Микробиом человека состоит из основного микробиома и изменчивого микробиома. Основной микробиом является общим для всех людей, тогда как изменчивый микробиом уникален для отдельных людей в зависимости от образа жизни и физиологических различий. В ротовой полости есть два типа поверхностей, на которых могут колонизировать бактерии: твердые и мягкие ткани зубов и слизистая оболочка полости рта соответственно. [7] Зубы, язык, щеки, десневая борозда, миндалины, твердое и мягкое небо создают богатую среду, в которой могут процветать микроорганизмы.[8] Поверхности ротовой полости покрыты множеством бактерий, пресловутой бактериальной биопленкой. [9]

    Полость рта и связанные с ней области носоглотки создают идеальную среду для роста микроорганизмов. Нормальная температура полости рта в среднем составляет 37 ° C без значительных изменений, что обеспечивает бактериям стабильную среду для выживания. Слюна также имеет стабильный pH 6,5–7, подходящий для большинства видов бактерий. Он сохраняет бактерии гидратированными, а также служит средой для транспортировки питательных веществ к микроорганизмам.[10]

    РАЗВИТИЕ МИКРОБИОМА РТА

    Матка плода обычно стерильна. [11,12,13] Однако недавние исследования показали колонизацию внутриутробной среды, особенно околоплодных вод, микроорганизмами полости рта, вплоть до 70% беременных [14] Ребенок вступает в контакт с микрофлорой матки и влагалища матери во время родов, а позже — с микроорганизмами атмосферы при рождении. Обычно ротовая полость новорожденного стерильна, несмотря на большую вероятность заражения.Рот регулярно заражается микроорганизмами с момента первого кормления, и начинается процесс приобретения резидентной микрофлоры полости рта. [12]

    Fusobacterium nucleatum был наиболее часто встречающимся культивируемым микроорганизмом. На любой поверхности появляется резидентная микрофлора в результате последовательной передачи микроорганизмов к месту потенциальной колонизации. Хотя основным средством передачи является слюна, также происходит пассивная передача от матери, от микроорганизмов, присутствующих в воде, молоке и окружающей среде.[11,12,13]

    При рождении или вскоре после него начинается колонизация. Первоначальные колонизаторы сразу после рождения называются видами-первопроходцами, например, Streptococcus salivarius . Ротовая полость поражена в основном аэробами к 1 st году и может включать Streptococcus, Lactobacillus, Actinomyces, Neisseria и Veillonella . Как только начинается прорезывание зуба, эти организмы могут колонизировать не шелушащиеся поверхности. После прорезывания всех зубов создается больше поверхностей для колонизации.Происходит развитие десневых щелей для колонизации пародонтальных микробов. Накопление налета наблюдается на разных участках зуба, таких как гладкие поверхности, ямки и трещины, для образования различных микробных колоний. В результате этого процесса развивается высокое видовое разнообразие и микробная последовательность. С возрастом, когда все зубы потеряны, флора становится похожей на флору ребенка до прорезывания зубов. [6]

    Бактерии образуют мультиродовые сообщества, прикрепляясь не только к поверхностям ротовой полости, но и друг к другу.На их состав и стабильность влияют конкретные партнерские отношения [15]. На формирование и развитие сообществ влияют такие факторы, как избирательное прилипание к поверхности зубов или эпителию, специфическое межклеточное связывание как движущая сила раннего состава сообщества и взаимодействие между организмами, которое приводит к изменениям в местной среде, представляющей первый шаг на пути к заболеваниям полости рта. [16]

    СОСТАВ МИКРОБИОМА РТА

    В полости рта присутствует широкий спектр микроорганизмов.Он находится в постоянном контакте с окружающей средой и, как было показано, уязвим к ее воздействию. [17]

    Микробиом человека состоит из основного микробиома и изменчивого микробиома. Основной микробиом состоит из преобладающих видов, которые существуют в разных частях тела в здоровых условиях. Изменчивый микробиом эволюционировал в ответ на уникальный образ жизни и генотипические детерминанты и присущ только человеку. [18]

    Микробная экология полости рта сложна и представляет собой богатую биологическую среду с характерными нишами, которые обеспечивают уникальную среду для колонизации микробов.Эти ниши включают десневую борозду, язык, щеку, твердое и мягкое небо, дно рта, горло, слюну и зубы. [8,19]

    Различные поверхности во рту заселяются преимущественно бактерии полости рта благодаря специфическим адгезинам на их поверхности, которые связываются с дополнительными рецепторами на поверхности полости рта. [20]

    Нормальный микробиом состоит из бактерий, грибов, вирусов, архей и простейших. Однако отчеты о нормальном микробиоме ограничиваются бактериомом, а о микобиомно-грибном микробиоме очень мало отчетов.[7]

    Ротовая полость является одним из наиболее хорошо изученных микробиомов на сегодняшний день с 392 таксонами, которые имеют по крайней мере один эталонный геном, а общее количество геномов в полости рта приближается к 1500. [21]

    В нем идентифицировано около 700 видов прокариот. Эти виды принадлежат к 185 родам и 12 типам, из которых приблизительно 54% ​​имеют официальные названия, 14% не имеют названия (но культивируются) и 32% известны только как некультивируемые филотипы [9]. Двенадцать флей — это Firmicutes, Fusobacteria, Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes, Chlamydiae, Chloroflexi, Spirochaetes, SR1, Synergistetes, Saccharibacteria (TM7) и Gracilibacteria (GN02).[22] На уровне рода существует консервативное микробное сообщество полости рта в здоровом рту. Разнообразие микробиома индивидуально и зависит от места, несмотря на сходство. Язык имеет многочисленные сосочки с небольшим количеством анаэробных участков и, следовательно, содержит разнообразную микрофлору, в которую также входят анаэробы. Области с низким микробным разнообразием — слизистые оболочки щеки и неба. [23]

    Микробиом полости рта может демонстрировать большие и быстрые изменения в составе и активности как в пространственном, так и во временном отношении и динамично развиваться вместе с хозяином. Эта множественная неравновесная динамика является результатом многих факторов, таких как временная частота хозяина и диеты, реакция на изменения pH, взаимодействия между бактериями и, в более широком временном интервале, генные мутации и горизонтальный перенос генов, которые увеличиваются. новые свойства деформации. [21]

    Между микроорганизмами в полости рта существуют симбиотические отношения, основанные на взаимной выгоде. Комменсальные популяции не причиняют вреда и контролируют патогенные виды, не позволяя им прилипать к слизистой оболочке.Бактерии становятся патогенными только после того, как преодолевают барьер комменсалов, вызывая инфекцию и болезнь. [24]

    Основные роды бактерий, обнаруженные в здоровой полости рта, следующие: [12]

    Грамположительные:

    1. Кокки — Абиотрофия, Пептострептококк, Streptococcus, Stomatococcus

    2. Rodomyces — Коринебактерии, Eubacterium, Lactobacillus, Propionibacterium, Pseudoramibacter, Rothia.

    Грамотрицательные:

    1. Кокки — Moraxella, Neisseria, Veillonella

    2. Палочки — Кампилобактер, Капноцитофага, Десульфобактер, Десульфовибрио, Сеикенобиотериа, Сеикенобелла, Фустоакенелла Трепонема, волинелла.

    НЕБАКТЕРИАЛЬНЫЕ ЧЛЕНЫ ПОЛОСТИ РТА

    Полость рта содержит различные формы микробов, таких как простейшие, грибы и вирусы. Entamoeba gingivalis и Trichomonas tenax являются наиболее часто встречающимися простейшими и в основном сапрофитными. Candida разновидностей являются наиболее распространенными грибами, встречающимися в полости рта. Ghannoum et al. провела независимые от культуры исследования на двадцати здоровых хозяевах и сообщила о 85 родах грибов. Основными наблюдаемыми видами были виды, принадлежащие Candida, Cladosporium, Aureobasidium, Saccharomycetales, Aspergillus, Fusarium и Cryptococcus .[25]

    Среда обитания ротовой полости имеет самое высокое альфа-разнообразие в организме, демонстрируя самое высокое функциональное богатство на уровне таксономических единиц после образцов стула. Более низкое альфа-разнообразие проявляется в микробиоте кожи и влагалища. У оральных участков самое низкое бета-разнообразие, когда сравниваются образцы из одних и тех же участков среди людей (бета-разнообразие), что означает, что члены популяции имеют относительно похожие организмы в оральных участках, чем в других участках тела. [26] Таксономическое разнообразие в выборке — это альфа-разнообразие, а между выборками — бета-разнообразие.[27]

    ФУНКЦИИ МИКРОБИОМА РТА

    Физиология и экология микробиоты тесно связаны с физиологией и экологией хозяина как в микронном масштабе, так и в масштабе хозяина. На укрепление здоровья или прогрессирование заболевания критически влияет микробиота. [28] Микробиом полости рта обычно существует в виде биопленки. Он играет решающую роль в поддержании гомеостаза полости рта, защите полости рта и предотвращении развития заболеваний. Знание идентичности микробиома и соседей, с которыми они обычно взаимодействуют, необходимо для механистического понимания ключевых игроков. [29]

    Микробные сообщества, присутствующие в организме человека, играют роль в критических, физиологических, метаболических и иммунологических функциях, которые включают переваривание пищи и питание; выработка энергии, дифференциация и созревание слизистой оболочки хозяина и его иммунной системы; контроль накопления жира и регуляция метаболизма; переработка и детоксикация химических веществ из окружающей среды; барьерная функция кожи и слизистых оболочек; поддержание иммунной системы и баланс между провоспалительными и противовоспалительными процессами; продвижение микроорганизмов (устойчивость к колонизации) и предотвращение инвазии и роста болезней.[1]

    ПРОЕКТ ЧЕЛОВЕЧЕСКОГО МИКРОБИОМА

    В 2008 году Национальный институт здравоохранения запустил Проект человеческого микробиома (HMP), признавая важность изучения микробиома человека. [8]

    Последние разработки в области биоинформатики улучшили возможности изучения микробиома человека. Эти достижения привели к появлению большого количества геномных и метагеномных исследований, изучающих роль микробов в различных экосистемах. [30]

    HMP — это совокупность нескольких проектов, которые в настоящее время запускаются одновременно в нескольких частях мира, включая США, Европейский Союз и Азию, а не единого проекта.[31] Понимая, что> 99% микробов из окружающей среды не могут быть легко культивированы, экологи-микробиологи разработали подходы к изучению микроорганизмов in situ , главным образом путем секвенирования гена рибосомной РНК 16S (16S). Это таксономический и филогенетический маркер для идентификации членов микробных сообществ. [32]

    В связи с появлением высокопроизводительного секвенирования ДНК исследования того, что составляет нормальный микробиом полости рта, значительно расширились.[33]

    Девять участков ротовой полости были взяты у здоровых добровольцев в HMP. Этими участками были язык, спинка, твердое небо, слизистая оболочка щеки, ороговевшие десны или десны, небные миндалины, горло, над- и поддесневой налет и слюна. К. Ли Бихан и Мете (2013) изучили базу данных HMP и обнаружили относительно стабильный и небольшой основной микробиом полости рта, присутствующий в большинстве образцов, но в небольшом количестве. [34]

    БАЗА ДАННЫХ ОРАЛЬНЫХ МИКРОБИОМОВ ЧЕЛОВЕКА

    База данных орального микробиома человека (HOMD) предоставляет репозиторий последовательностей орального бактериального генома и подробный ресурс, состоящий из описаний оральных бактериальных таксонов, инструмент идентификации 16S рРНК.[35]

    Это уникальная база данных, запущенная в 2010 году Национальным институтом стоматологических и черепно-лицевых исследований для хранения информации о культивируемых и некультивируемых изолятах, полученных из орального происхождения. [36]

    Расширенный HOMD (eHOMD) создан с целью предоставить научному сообществу исчерпывающую и тщательно подобранную информацию о видах бактерий, присутствующих в воздушно-пищеварительном тракте человека (ADT), который включает верхние пищеварительные и верхние дыхательные пути, глотку, носовые ходы. , пазухи и пищевод и полость рта.Последовательности генома для бактерий ADT, определенные различными проектами, такими как — часть проекта HOMD — Проект человеческого микробиома и другие проекты секвенирования, добавляются в eHOMD по мере их появления. [36]

    eHOMD содержит информацию примерно о 772 видах прокариот, из которых 70% пригодны для культивирования, а 30% относятся к классу некультивируемых микроорганизмов вместе с полногеномными последовательностями 482 таксонов. Из 70% культивируемых видов 57% уже получили свои названия.Профилирование 16S рДНК здоровой полости рта классифицировало обитающие бактерии на шесть широких типов, а именно: Firmicutes, Actinobacteria, Proteobacteria, Fusobacteria, Bacteroidetes и Spirochaetes , составляющие 96% от общего числа бактерий полости рта. [37]

    МЕТОДЫ ИЗУЧЕНИЯ МИКРОБИОМА РТА

    Традиционные методы идентификации микробов включали методы культивирования, которые развивались от культурально-зависимых исследований одного вида до сложных in vitro многовидовых сообществ.Независимая от культуры характеристика всей микробиоты in vivo и анализ экспрессии отдельного гена с помощью мета-анализа стали возможными благодаря технологическим достижениям [38].

    В последние годы наибольший прогресс, вероятно, связан с развитием не зависящих от культуры методов «омики». Сюда входит изучение ДНК, РНК, белков или метаболитов всего микробного сообщества. [39]

    Две области исследований, которые возникли для обнаружения и идентификации присутствия микробов в организме и понимания природы активности микробиома в здоровье и болезни, — это микробиомика и метагеномика.[18]

    Метагеномика — это набор методов, которые обнаруживают бактерии, которые нельзя культивировать. Он также определяет геномное разнообразие микробов, применяя возможности геномного анализа ко всему сообществу микробов. [40]

    Метагеномика дает информацию не только о видах присутствующих организмов, но и об их функциональном потенциале посредством анализа генов метаболических путей. Он также предоставляет информацию об использовании баз данных последовательностей, кодирующих белки. Он секвенирует всю ДНК из заданного образца.[41]

    Из-за простоты получения образцов микробиом полости рта, возможно, является хорошо изученным микробиомом человека на сегодняшний день. [42]

    Культура и микроскопия

    Исторические методы идентификации бактериальных таксонов зависели от культуры. К ним относятся микроскопия, биохимические и другие фенотипические тесты, использование сахара, условия роста и чувствительность к антибиотикам. [43] Фактическое разнообразие микробиома полости рта не может быть полностью выявлено методами культивирования.Усилия многочисленных исследователей к настоящему времени изолировали, культивировали, идентифицировали, охарактеризовали и классифицировали приблизительно 50% из 700 видов бактерий, которые обычно присутствуют в полости рта. [20]

    Основная трудность с традиционными культурами и аналитическими технологиями на основе культивирования заключается в том, что многие виды бактерий в биологических образцах невозможно культивировать, что делает эти подходы непригодными для исследований. [38]

    Методы на основе геля

    Благодаря нескольким методам, не зависящим от культуры, стал возможен высокопроизводительный анализ микробных сообществ. Различные используемые методы включают денатурирующий гель-электрофорез в градиенте температуры (DGGE), гель-электрофорез в температурном градиенте и полиморфизм длины рестрикционных фрагментов (RELP). [43]

    Методы на основе полимеразной цепной реакции

    Обычная полимеразная цепная реакция (ПЦР), количественная ПЦР в реальном времени, ПЦР-DGGE, случайная амплифицированная полиморфная ДНК / произвольно примированная ПЦР, ПЦР на основе повторяющихся элементов, мультилокусное типирование последовательностей, ПЦР-RELP и terminal-RELP — это различные методы на основе ПЦР, доступные для идентификации микробов.[20]

    ДНК-микромассивы

    В научном сообществе филогенетические ДНК-микромассивы были признаны ценными инструментами для высокопроизводительного, систематического и количественного анализа бактериальных сообществ в различных микробных экосистемах, включая микробиоту полости рта. [44]

    Секвенирование 16S рРНК

    Два основных подхода к секвенированию ДНК, которые обычно применяются для изучения некультивируемых микробных сообществ полости рта, — это анализ последовательности 16S рРНК и метагеномика. Секвенирование 16S рРНК включает секвенирование консервативного гена 16S рРНК, тогда как метагеномика включает полногеномное секвенирование дробовика (WGS). Все образцы ДНК случайным образом разрезаются методом «дробовика». Затем выполняется либо классическое секвенирование по Сэнгеру, либо NGS. [45] Профилирование гена 16S рДНК используется в большинстве недавних исследований для оценки организмов, присутствующих в образце, или, если требуется полное профилирование содержания генов в данной среде обитания, выполняется метагеномика дробовика [46].

    Почему 16S рРНК? (1) Он присутствует почти во всех бактериях, часто существует в виде мультигенного семейства или оперонов; (2) функция гена 16S рРНК не изменилась с течением времени, что позволяет предположить, что случайные изменения в последовательности являются более точной мерой времени (эволюции), и (3) ген 16S рРНК (1500 п.н.) достаточно велик для целей информатики.[47]

    Это высококонсервативный ген; следовательно, использование его в качестве маркера более выгодно, чем использование всего генома, поскольку в нашей базе данных референсный ген с меньшей вероятностью будет отличаться от гена бактерий, собранных из образцов окружающей среды. [48]

    Секвенирование 16S рРНК определяет только присутствие или численность видов бактерий. Таким образом, это позволяет исследователям делать выводы только на основе наблюдений. Секвенирование метагеномики дробовика также выявит связанные метаболические пути.[49]

    Профилирование 16S рРНК обеспечивает таксономический состав, тогда как данные метагеномики WGS могут предоставить не только таксономию, но и биологические функциональные профили микробных сообществ. [50]

    Платформы секвенирования нового поколения

    Методы секвенирования следующего поколения (NGS) произвели революцию в изучении микробного разнообразия за последнее десятилетие. Это позволило завершить крупномасштабные проекты секвенирования за несколько дней, а иногда и часов.

    Основные технологии NGS следующие:

    1. 454 пиросеквенирование

    2. Applied Biosystems

    3. Illumina

    4. Pacific Biosciences

    5. Oxford Nanopore.

    Для содержательной интерпретации NGS-анализ требует обширных возможностей биоинформатики, включая контроль качества данных, выравнивание и сопоставление с хорошими эталонными геномами, фильтрацию для считывания хорошего качества, удаление химер и нормализацию по выборкам и популяциям. [43]

    С помощью этих инструментов исследователи получили возможность профилировать микробиомы и метагеномы на беспрецедентной глубине. Высокая пропускная способность и тот факт, что не нужно нацеливаться на определенные таксоны, являются основными преимуществами NGS.[51]

    Выбор, который делается на каждом этапе, от дизайна исследования до анализа, может повлиять на результаты независимо от методологии, используемой для их характеристики, или типов целевых микроорганизмов. показывает этапы проведения исследования микробиома. [53]

    Общий обзор рабочего процесса для анализа микробных сообществ на основе генов 16S рРНК и метагеномики с указанием наиболее важных шагов и соображений для каждого этапа процесса (любезно предоставлено Bik EM. The Hoops, Hopes and Hypes of Human Microbiome Research.Yale J Biol Med 2016; 89: 363-373)

    Рекомендуемые методы исследования микробиома следующие: [52]

    1. Уменьшите смешивающие факторы, тщательно разработав исследование

    2. Последовательность в применении экспериментальные и аналитические методы

    3. Хорошее ведение записей, позволяющее использовать все возможные метаданные в статистических моделях

    4. Сопоставление программного обеспечения и статистических инструментов с наборами сгенерированных данных

    5. Вести подробные записи биографии -информатика этапов анализа

    6. Размещение всех данных в стандартных форматах в общедоступных базах данных.

    ЗАКЛЮЧЕНИЕ

    Микробиом полости рта — захватывающая и постоянно расширяющаяся область исследований. Микробиом полости рта имеет решающее значение для здоровья, поскольку может вызывать как заболевания полости рта, так и системные заболевания. Он находится внутри биопленок по всей полости рта и образует экосистему, которая поддерживает здоровье в состоянии равновесия. Однако определенные дисбалансы в этом состоянии равновесия позволяют патогенам проявляться и вызывать болезнь. Нарушение микробиома полости рта приводит к дисбактериозу. Идентификация микробиома в состоянии здоровья является первым шагом исследования микробиома человека, после которого необходимо понять роль микробиома в изменении функциональных и метаболических путей, связанных с болезненными состояниями.

    Исследования микробиома в настоящее время находятся на очень ранней стадии. Проводится много исследований, и данные постоянно добавляются. Однако результаты, полученные в различных исследованиях, противоречат друг другу. Это может быть связано с используемыми методами, методами стандартизации, размером выборки и т. Д. Требуются исследования с большим размером выборки, включающие различные участки в области здоровья и болезни, которые могут разработать согласованные модели для получения конкретных данных. Это позволит дополнительно идентифицировать различные биомаркеры и помочь в выборе целевого лечения и персонализированной медицины для лучшего ведения пациентов в клинической практике.

    Финансовая поддержка и спонсорство

    Нет.

    Конфликты интересов

    Конфликты интересов отсутствуют.

    ССЫЛКИ

    1. Килиан М., Чаппл И.Л., Ханниг М., Марш П.Д., Мерик В., Педерсен А.М. и др. Микробиом полости рта — обновление для специалистов в области стоматологии. Бр Дент Дж. 2016; 221: 657–66. [PubMed] [Google Scholar] 2. Скотти Э., Буэ С., Сассо Г.Л., Занетти Ф., Белкастро В., Пуссен С. и др. Изучение микробиома в здоровье и болезни: значение для токсикологии.Toxicol Res и Appl. 2017; 1: 1–37. [Google Scholar] 3. Гао Л., Сюй Т., Хуанг Г, Цзян С., Гу И, Чен Ф и др. Микробиомы полости рта: все большее и большее значение для полости рта и всего тела. Белковая клетка. 2018; 9: 488–500. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 4. Ямасита Ю., Такешита Т. Микробиом полости рта и здоровье человека. J Oral Sci. 2017; 59: 201–6. [PubMed] [Google Scholar] 5. Лейн Н. Невидимый мир: размышления о Левенгуке (1677 г.), «о маленьких животных» Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci.2015; 370 pii: 20140344. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 6. Патил С., Рао Р.С., Амрута Н., Санкет Д.С. Микробная флора ротовой полости в норме. Мир J Dent. 2013; 4: 262–6. [Google Scholar] 7. Заура Э., Нику Э.А., Кром Б.П., Кейсер Б.Дж. Приобретение и поддержание нормального микробиома полости рта: текущая перспектива. Front Cell Infect Microbiol. 2014; 4: 85. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 9. Чжао Х., Чу М., Хуанг З., Ян Х, Ран С., Ху Б. и др. Вариации микробиоты полости рта, связанные с раком полости рта.Научный доклад 2017; 7: 11773. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 10. Лим Y, Totsika M, Morrison M, Punyadeera C. Микробиом полости рта: новый резервуар биомаркеров для рака полости рта и ротоглотки. Тераностика. 2017; 7: 4313–21. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 11. Совмя Ю. Обзор микрофлоры ротовой полости человека. Res Rev.2016; 4: 1–5. [Google Scholar] 12. Марш П.Д. Роль микрофлоры полости рта в здоровье. Microbial Ecol Health Dis. 2009; 12: 130–7. [Google Scholar] 13. Батабьял Б., Чакраборти С., Бисвас С.Роль микрофлоры полости рта в человеческой популяции: краткий обзор. Int J Pharm Life Sci. 2012; 3: 2220–7. [Google Scholar] 14. Сампайо-Майя Б., Монтейро-Силва Ф. Приобретение и созревание микробиома полости рта в детстве: обновление. Dent Res J (Исфахан) 2014; 11: 291–301. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 15. Коненен Э. Развитие бактериальной флоры полости рта у детей раннего возраста. Ann Med. 2000. 32: 107–12. [PubMed] [Google Scholar] 17. Деммитт Б.А., Корли Р.П., Хьюибрегтсе Б.М., Келлер М.К., Хьюитт Дж. К., Маккуин М.Б. и др.Генетические влияния на микробиом ротовой полости человека. BMC Genomics. 2017; 18: 659. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 18. Зарко М.Ф., Вес Т.Дж., Гинзбург Г.С. Микробиом полости рта в здоровье и болезнях и потенциальное влияние на персонализированную стоматологию. Oral Dis. 2012; 18: 109–20. [PubMed] [Google Scholar] 19. Бенн А., Хенг Н., Бродбент Дж. М., Томсон В. М.. Изучение микробиома полости рта человека: проблемы и эволюция решений. Ост Дент Дж. 2018; 63: 14–24. [PubMed] [Google Scholar] 20. Аас Дж. А., Пастер Б. Дж., Стокс Л. Н., Олсен И., Дьюхерст Ф. Э.Определение нормальной бактериальной флоры полости рта. J Clin Microbiol. 2005; 43: 5721–32. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 22. Перера М., Аль-Хебши Н.Н., Speicher DJ, Перера И., Джонсон Н.В. Возникающая роль бактерий в канцерогенезе полости рта: обзор со специальной ссылкой на периопатогенные бактерии. J Oral Microbiol. 2016; 8: 32762. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 25. Шарма Н., Бхатия С., Содхи А.С., Батра Н. Микробиом полости рта и здоровье. AIMS Microbiol. 2018; 4: 42–66. [Google Scholar] 28.Марк Уэлч JL, Россетти BJ, Рикен CW, Dewhirst FE, Borisy GG. Биогеография микробиома ротовой полости человека в микронном масштабе. Proc Natl Acad Sci U S. A. 2016; 113: E791–800. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 29. Цзя Джи, Чжи А., Лай П.Ф., Ван Джи, Ся Й, Сюн Зи и др. Микробиота полости рта — механистическая роль в системных заболеваниях. Бр Дент Дж. 2018; 224: 447–55. [PubMed] [Google Scholar] 30. Гилберт JA, Dupont CL. Микробная метагеномика: за пределами генома. Ann Rev Mar Sci. 2011; 3: 347–71. [PubMed] [Google Scholar] 31.Тернбо П.Дж., Лей Р.Э., Хамади М., Лиггетт К.Ф., Найт Р., Гордон Д.И. Проект человеческого микробиома: исследование микробной части нас самих в меняющемся мире. Природа. 2007; 449: 804–10. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 32. Геверс Д., Найт Р., Петросино Дж. Ф., Хуанг К., Макгуайр А. Л., Биррен Б. В. и др. Проект микробиома человека: общественный ресурс для здорового микробиома человека. PLoS Biol. 2012; 10: e1001377. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 33. Уорнер С. Зубной камень и эволюция микробиома полости рта человека.J Calif Dent Assoc. 2016; 44: 411–20. [PubMed] [Google Scholar] 34. Эймс Нью-Джерси, Рануччи А., Морияма Б., Валлен Г.Р. Микробиом человека и понимание гена 16S рРНК в трансляционной медицине. Nurs Res. 2017; 66: 184–97. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 35. Wade WG. Микробиом полости рта в здоровье и болезни. Pharmacol Res. 2013; 69: 137–43. [PubMed] [Google Scholar] 36. Chen T, Yu WH, Izard J, Baranova OV, Lakshmanan A, Dewhirst FE, et al. База данных микробиома ротовой полости человека: доступный в Интернете ресурс для изучения таксономической и геномной информации о микробах полости рта.База данных (Оксфорд) 2010; 2010: baq013. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 37. Верма Д., Гарг П.К., Дубей А.К. Изучение микробиома полости рта человека. Arch Microbiol. 2018; 200: 525–40. [PubMed] [Google Scholar] 38. Пожитков А.Е., Бейклер Т., Флеммиг Т., Нобл П.А. Высокопроизводительные методы анализа микробиома ротовой полости человека. Периодонтол 2000. 2011; 55: 70–86. [PubMed] [Google Scholar] 39. Мира А. Исследования микробиома полости рта: потенциальное диагностическое и терапевтическое значение. Adv Dent Res. 2018; 29: 71–7.[PubMed] [Google Scholar] 42. Shaw PL. Микробиом полости рта. Emerg Top Life Sci. 2017; 1: 287–96. [Google Scholar] 43. Кришнан К., Чен Т., Пастер Б.Дж. Практическое руководство по микробиому полости рта и его связи со здоровьем и болезнями. Oral Dis. 2017; 23: 276–86. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 44. Parolin C, Giordani B, Ñahui Palomino RA, Biagi E, Severgnini M, Consolandi C и др. Разработка и проверка ДНК-микрочипа для филогенетического анализа бактериальных сообществ в различных образцах полости рта и зубных имплантатах.Научный доклад 2017; 7: 6280. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 46. Кучински Дж., Стомбо Дж., Уолтерс В.А., Гонсалес А., Капорасо Дж. Г., Найт Р. Использование QIIME для анализа последовательностей генов 16S рРНК из микробных сообществ. Текущие протоколы в биоинформатике. 2011; 36: 10.7.1–10.7.20. Doi: 10.1002 / 0471250953.bi1007s36. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 47. Янда Дж. М., Abbott SL. Секвенирование гена 16S рРНК для идентификации бактерий в диагностической лаборатории: плюсы, опасности и подводные камни. J Clin Microbiol.2007; 45: 2761–4. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 48. Tran Q, Pham DT, Phan V. Использование гена 16S рРНК в качестве маркера для обнаружения неизвестных бактерий в микробных сообществах. BMC Bioinformatics. 2017; 18: 499. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 49. Ле Барс П., Матаморос С., Монтасье Е., Ле Вакон Ф, Потель Г., Суайдан А. и др. Микробиота полости рта: между здоровьем, заболеваниями полости рта и раком пищеварительного тракта. Может J Microbiol. 2017; 63: 475–92. [PubMed] [Google Scholar] 51. Заура Э., Кейсер Б.Дж., Хусе С.М., Крилаард В.Определение здорового «основного микробиома» микробных сообществ полости рта. BMC Microbiol. 2009; 9: 259. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar] 52. Goodrich JK, Di Rienzi SC, Poole AC, Koren O, Walters WA, Caporaso JG и др. Проведение исследования микробиома. Клетка. 2014; 158: 250–62. [Бесплатная статья PMC] [PubMed] [Google Scholar]

    Микробиом кожи человека | Nature Reviews Microbiology

  • 1

    Шаршмидт Т. К. и Фишбах М. А. Что живет на нашей коже: экология, геномика и терапевтические возможности микробиома кожи. Drug Discov. Сегодня Дис. Мех. 10 , e83 – e89 (2013).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 2

    Белкайд Ю. и Сегре Дж. А. Диалог между микробиотой кожи и иммунитетом. Наука 346 , 954–959 (2014).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 3

    Грайс, Э. А. Пересечение микробиома и хозяина на границе раздела кожи: идеи, основанные на геноме и метагеноме. Genome Res. 25 , 1514–1520 (2015).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 4

    Kong, H.H. et al. Временные сдвиги в микробиоме кожи, связанные с обострениями болезни и лечением у детей с атопическим дерматитом. Genome Res. 22 , 850–859 (2012). Это первое исследование, в котором у людей с атопическим дерматитом были взяты образцы и секвенированы образцы кожи.

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 5

    Паулино, Л. К., Ценг, К. Х., Стробер, Б. Э. и Блазер, М. Дж. Молекулярный анализ грибковой микробиоты в образцах здоровой кожи человека и псориатических поражениях. J. Clin. Microbiol. 44 , 2933–2941 (2006).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 6

    Kong, H.Х. и Сегре, Дж. А. Микробиом кожи: оглядываясь назад, чтобы двигаться вперед. J. Invest. Дерматол. 132 , 933–939 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 7

    Вёзе, К. Р. и Фокс, Г. Э. Филогенетическая структура прокариотического домена: первичные царства. Proc. Natl Acad. Sci. США 74 , 5088–5090 (1977). Это первое исследование, в котором ген 16S рРНК использовался для определения филогении микроорганизма.

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 9

    Meisel, J. S. et al. На исследования микробиома кожи сильно влияет дизайн эксперимента. J. Invest. Дерматол. 136 , 947–956 (2016). В этой статье описывается, как методология может повлиять на исследования микробиома кожи.

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 10

    Zeeuwen, P. L. et al. Ответ Meisel et al. J. Investigative Dermatol. 137 , 961–962 (2017).

    Артикул
    CAS

    Google ученый

  • 11

    Кастелино, М.и другие. Оптимизация методов исследования микробиома кожи: выбор праймера и сравнение платформы 454 с платформой MiSeq. BMC Microbiol. 17 , 23 (2017).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 12

    Schloss, P. D. et al. Представляем mothur: программное обеспечение с открытым исходным кодом, независимое от платформы, поддерживаемое сообществом для описания и сравнения микробных сообществ. Заявл. Environ. Microbiol. 75 , 7537–7541 (2009).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 14

    Брукс, Дж.P. et al. Правда о метагеномике: количественная оценка и противодействие систематической ошибке в исследованиях 16S рРНК. BMC Microbiol. 15 , 66 (2015).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 15

    Юань, С., Коэн, Д. Б., Равель, Дж., Абдо, З. и Форни, Л. Дж. Оценка методов выделения и очистки ДНК из микробиома человека. PLoS ONE 7 , e33865 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 17

    Conlan, S. et al. Staphylococcus epidermidis Анализ пангеномной последовательности выявляет разнообразие кожных комменсальных изолятов и изолятов, связанных с госпитальной инфекцией. Genome Biol. 13 , R64 (2012).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 18

    Tomida, S. et al. Пангеномный и сравнительный анализ генома propionibacterium acnes выявил его геномное разнообразие в микробиоме кожи здорового и больного человека. mBio 4 , e000030-13 (2013).

    Артикул
    CAS

    Google ученый

  • 19

    Бози, Э.и другие. Сравнительное моделирование в масштабе генома штаммов Staphylococcus aureus выявляет штамм-специфические метаболические возможности, связанные с патогенностью. Proc. Natl Acad. Sci. США 113 , E3801 – E3809 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 20

    Костелло, Э. К. и др. Изменчивость бактериального сообщества в среде обитания человеческого тела в пространстве и времени. Наука 326 , 1694–1697 (2009).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 22

    Грайс, Э. А. и Сегре, Дж. А. Микробиом кожи. Нат.Rev. Microbiol. 9 , 244–253 (2011).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 23

    Oh, J. et al. Биогеография и функция формы индивидуальности в метагеноме кожи человека. Nature 514 , 59–64 (2014).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 25

    Oh, J. et al. Временная стабильность микробиома кожи человека. Cell 165 , 854–866 (2016). Вместе со ссылкой 23, эти исследования исследуют микробиом здоровой кожи человека с помощью метагеномного секвенирования дробовика.

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 26

    Ханниган, Г. Д. и др. Двухцепочечный ДНК-виром кожи человека: топографическое и временное разнообразие, генетическое обогащение и динамические ассоциации с микробиомом хозяина. мБио 6 , e01578-15 (2015).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 27

    Фенг, Х., Шуда, М., Чанг, Ю. и Мур, П. С. Клональная интеграция полиомавируса в карциному из клеток Меркеля человека. Наука 319 , 1096–1100 (2008).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 28

    Schloissnig, S. et al. Пейзаж геномных вариаций микробиома кишечника человека. Природа 493 , 45–50 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 29

    Фейт, Дж.J. et al. Долгосрочная стабильность микробиоты кишечника человека. Наука 341 , 1237439 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 30

    Tsai, Y.C. et al. Устранение сложности метагеномов кожи человека с помощью секвенирования одной молекулы. мБио 7 , e01948-15 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 31

    Голландия, К.Т., Гринман, Дж. И Канлифф, У. Дж. Рост кожных пропионибактерий на синтетической среде; урожайность роста и производство экзоферментов. J. Appl. Бактериол. 47 , 383–394 (1979).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 33

    Марплс Р. Р., Даунинг Д. Т. и Клигман А. М. Контроль свободных жирных кислот в поверхностных липидах человека с помощью Corynebacterium acnes . J. Invest. Дерматол. 56 , 127–131 (1971).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 34

    Ingham, E., Holland, K. T., Gowland, G.& Cunliffe, W.J. Частичная очистка и характеристика липазы (EC 3.1.1.3) из Propionibacterium acnes . J. General Microbiol. 124 , 393–401 (1981).

    CAS

    Google ученый

  • 35

    Гриббон, Э. М., Канлифф, У. Дж. И Холланд, К. Т. Взаимодействие Propionibacterium acnes с кожными липидами in vitro . J. General Microbiol. 139 , 1745–1751 (1993).

    Артикул
    CAS

    Google ученый

  • 36

    Mukherjee, S. et al. Уровни кожного сала и гидратации в определенных областях человеческого лица в значительной степени предсказывают природу и разнообразие микробиома кожи лица. Sci. Отчет 6 , 36062 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 37

    Webster, G. F., Ruggieri, M.Р. и МакГинли, К. Дж. Корреляция популяций Propionibacterium acnes с наличием триглицеридов на коже нечеловеческого происхождения. Заявл. Environ. Microbiol. 41 , 1269–1270 (1981).

    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 38

    Wu, G. et al. Сравнительная геномика для всего рода Malassezia очерчивает его филогению, физиологию и адаптацию ниши на коже человека. PLoS Genet. 11 , e1005614 (2015).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 39

    Dominguez-Bello, M. G. et al. Способ доставки определяет приобретение и структуру исходной микробиоты в различных средах обитания новорожденных. Proc. Natl Acad. Sci. США 107 , 11971–11975 (2010).

    Артикул
    PubMed

    Google ученый

  • 40

    Мюллер Н.Т., Бакач, Э., Комбеллик, Дж., Григорян, З., Домингес-Белло, М. Г. Развитие микробиома младенца: мама имеет значение. Trends Mol. Med. 21 , 109–117 (2015).

    Артикул
    PubMed

    Google ученый

  • 41

    Яцуненко Т. и др. Микробиом кишечника человека в зависимости от возраста и географии. Природа 486 , 222–227 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 42

    Фейт, Дж.Дж., Коломбел, Дж. Ф. и Гордон, Дж. I. Идентификация штаммов, которые способствуют возникновению сложных заболеваний, посредством изучения микробной наследственности. Proc. Natl Acad. Sci. США 112 , 633–640 (2015).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 43

    О, Дж., Конлан, С., Полли, Э. К., Сегре, Дж. А. и Конг, Х. Х. Изменения в коже человека и микробиоте ноздрей здоровых детей и взрослых. Genome Med. 4 , 77 (2012).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 44

    Джо, Дж. Х. и др. Разнообразные грибковые сообщества кожи человека у детей сходятся во взрослом возрасте. J. Invest. Дерматол. 136 , 2356–2363 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 46

    Гавличкова Б., Чайка В. А. и Фридрих М. Эпидемиологические тенденции микозов кожи во всем мире. Микозы 51 (Приложение 4), 2–15 (2008).

    Артикул
    PubMed

    Google ученый

  • 47

    Зеебахер, К., Бушара, Дж. П. и Миньон, Б. Обновления по эпидемиологии дерматофитных инфекций. Mycopathologia 166 , 335–352 (2008).

    Артикул
    PubMed

    Google ученый

  • 49

    фон Эйфф, К., Беккер, К., Машка, К., Стаммер, Х. и Петерс, Г. Носовое носительство как источник бактериемии Staphylococcus aureus . N. Engl. J. Med. 344 , 11–16 (2001).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 50

    Weidenmaier, C., Goerke, C. & Wolz, C. Staphylococcus aureus Детерминанты носовой колонизации. Trends Microbiol. 20 , 243–250 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 51

    Bode, L.G. et al. Профилактика инфекций в области хирургического вмешательства у носителей инфекции Staphylococcus aureus . N. Engl. J. Med. 362 , 9–17 (2010).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 52

    ДеЛео, Ф. Р., Отто, М., Крейсвирт, Б. Н. и Чемберс, Х. Ф. Связанный с сообществом метициллин-устойчивый Staphylococcus aureus . Ланцет 375 , 1557–1568 (2010).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 53

    Проктор Р.А. Проблемы универсальной вакцины Staphylococcus aureus . Clin. Заразить. Dis. 54 , 1179–1186 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 54

    Янсен, К. У., Гирдженти, Д.К., Скалли И. Л. и Андерсон А. С. Обзор вакцины: «Вакцины против Staphyloccocus aureus: проблемы и перспективы». Вакцина 31 , 2723–2730 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 55

    Pamer, E.G. Восстановление кишечной микробиоты для борьбы с устойчивыми к антибиотикам патогенами. Наука 352 , 535–538 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 56

    Линг, Л.L. et al. Новый антибиотик убивает патогены без обнаруживаемой устойчивости. Природа 517 , 455–459 (2015).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 57

    Iwase, T. et al. Staphylococcus epidermidis Esp ингибирует Staphylococcus aureus образование биопленок и колонизацию носа. Природа 465 , 346–349 (2010).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 58

    Сугимото, С.и другие. Staphylococcus epidermidis Esp разлагает специфические белки, связанные с образованием биопленок Staphylococcus aureus и взаимодействием между хозяином и патогеном. J. Bacteriol. 195 , 1645–1655 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 59

    Zipperer, A. et al. Комменсалы человека, продуцирующие новый антибиотик, ухудшают колонизацию патогенов. Природа 535 , 511–516 (2016). Вместе со ссылкой 57, эти исследования показывают, как комменсальные микроорганизмы кожи продуцируют противомикробные препараты против S. aureus .

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 60

    Nakatsuji, T. et al. Противомикробные препараты из комменсальных бактерий кожи человека защищают от Staphylococcus aureus и недостаточны при атопическом дерматите. Sci. Transl Med. 9 , eaah5680 (2017). Это первое исследование, в котором использовалась аутотрансплантация микроорганизмов на кожу.

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 61

    Wollenberg, M. S. et al. Копропорфирин III, продуцируемый пропионибактериями, вызывает агрегацию Staphylococcus aureus и образование биопленок. мБио 5 , e01286-14 (2014).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 62

    Рэмси, М.М., Фрейре, М. О., Габрильска, Р. А., Рамбо, К. П. и Лемон, К. П. Staphylococcus aureus смещается в сторону комменсализма в ответ на видов Corynebacterium . Фронт. Microbiol. 7 , 1230 (2016).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 63

    Бомар, Л., Брюггер, С. Д., Йост, Б. Х., Дэвис, С. С. и Лемон, К. П. Corynebacterium accolens выделяет свободные от пневмококков жирные кислоты из ноздрей человека и триацилглицерины на поверхности кожи. мБио 7 , e01725-15 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 64

    Christensen, G.J. et al. Антагонизм между Staphylococcus epidermidis и Propionibacterium acnes и его геномная основа. BMC Genom. 17 , 152 (2016).

    Артикул
    CAS

    Google ученый

  • 65

    Янек Д., Zipperer, A., Kulik, A., Krismer, B. & Peschel, A. Высокая частота и разнообразие антимикробной активности, продуцируемой назальным штаммом Staphylococcus против бактериальных конкурентов. PLoS Pathog. 12 , e1005812 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 66

    Yassour, M. et al. Естественная история микробиома кишечника младенца и влияние лечения антибиотиками на разнообразие и стабильность штаммов бактерий. Sci. Transl Med. 8 , 343ra81 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 67

    Atarashi, K. et al. Индукция Treg рационально подобранной смесью штаммов Clostridia из микробиоты человека. Природа 500 , 232–236 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 68

    Баффи, К.G. & Pamer, E. G. Устойчивость к колонизации, опосредованной микробиотой, против кишечных патогенов. Нат. Rev. Immunol. 13 , 790–801 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 69

    Iebba, V. et al. Эубиоз и дисбактериоз: две стороны микробиоты. New Microbiol. 39 , 1–12 (2016).

    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 70

    Лейден, Дж.Дж., МакГинли, К. Дж., Миллс, О. Х. и Клигман, А. М. Уровни пропионибактерий у пациентов с вульгарными угрями и без них. J. Invest. Дерматол. 65 , 382–384 (1975).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 71

    Фитц-Гиббон, С. и др. Популяции штаммов Propionibacterium acnes в микробиоме кожи человека, связанные с акне. J. Invest. Дерматол. 133 , 2152–2160 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 72

    Канг Д., Ши, Б., Эрфе, М. С., Крафт, Н. и Ли, Н. Витамин B12 модулирует транскриптом микробиоты кожи в патогенезе угрей. Sci. Transl Med. 7 , 293ra103 (2015). Это первое исследование секвенирования РНК кожи, в котором сравнивается экспрессия микробных генов у людей с акне и без них.

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 73

    Пикардо, М., Оттавиани, М., Камера, Э. и Мастрофранческо, А. Липиды сальных желез. Дерматоэндокринол. 1 , 68–71 (2009).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 74

    Jahns, A.C. et al. Повышенная частота встречаемости биопленок Propionibacterium acnes при вульгарных угрях: исследование случай-контроль. Br. J. Dermatol. 167 , 50–58 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 75

    Ломхольт, Х.Б. и Килиан, М. Популяционный генетический анализ Propionibacterium acnes позволяет идентифицировать субпопуляции и эпидемические клоны, связанные с акне. PLoS ONE 5 , e12277 (2010).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 76

    McDowell, A. et al. Расширенная схема мультилокусного типирования последовательностей для Propionibacterium acnes : исследование «патогенных», «комменсальных» и устойчивых к антибиотикам штаммов. PLoS ONE 7 , e41480 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 77

    МакДауэлл, А., Надь, И., Мадьяри, М., Барнард, Э. и Патрик, С. Условно-патогенетический патоген Propionibacterium acnes : понимание типирования, болезней человека, клональной диверсификации и эволюции фактора CAMP . PLoS ONE 8 , e70897 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 78

    Омер, Х., МакДауэлл, А. и Алексеев, О. А. Понимание роли Propionibacterium acnes при вульгарных угрях: критическая важность методологии взятия проб кожи. Clin. Дерматол. 35 , 118–129 (2017).

    Артикул
    PubMed

    Google ученый

  • 79

    Балта И. и Озугуз П. Индуцированная витамином B12 угревая сыпь. Cutane. Окулярный токсикол. 33 , 94–95 (2014).

    Артикул

    Google ученый

  • 80

    Шерерц, Э.F. Угревая сыпь, вызванная «мегадозой» витаминов B6 и B12. Кутис 48 , 119–120 (1991).

    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 81

    Dupre, A., Albarel, N., Bonafe, J. L., Christol, B. & Lassere, J. Угри, вызванные витамином B-12. Кутис 24 , 210–211 (1979).

    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 82

    Браун-Фалько, О.И Линке, Х. Проблема витаминов B6 / B12 прыщей. Публикация о медикаментозных угрях [на немецком языке]. MMW Munch. Med. Wochenschr. 118 , 155–160 (1976).

    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 83

    Пьюссан, А., Ванбремерш, Ф., Монфорт, Дж. И Ламбертон, Дж. Н. Новый ятрогенный дерматоз: угри, вызванные витамином B 12 [французский язык]. Бык. Soc. Пт. Дерматол. Сифилигр. 74 , 813–815 (1967).

    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 84

    Johnson, T., Kang, D., Barnard, E. & Li, H. Различия в уровне штаммов в производстве и регуляции порфиринов у Propionibacterium acnes проливают свет на ассоциации заболеваний. мСфера 1 , e00023-15 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 85

    Палмер, К.N. et al. Распространенные варианты с потерей функции белка эпидермального барьера филаггрина являются основным предрасполагающим фактором для атопического дерматита. Нат. Genet. 38 , 441–446 (2006).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 86

    Консорциум EArly по генетике и эпидемиологии жизненного цикла (EAGLE) Eczema Consortium. Исследование ассоциации нескольких геномов с участием 21 000 случаев и 95 000 контролей выявило новые локусы риска атопического дерматита. Нат. Genet. 47 , 1449–1456 (2015).

  • 87

    Лейден, Дж. Дж., Марплс, Р. Р. и Клигман, А. М. Staphylococcus aureus в поражениях атопического дерматита. Br. J. Dermatol. 90 , 525–530 (1974).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 88

    Хуанг, Дж. Т., Абрамс, М., Тлуган, Б., Радемейкер, А. и Паллер, А. С. Лечение колонизации Staphylococcus aureus при атопическом дерматите снижает тяжесть заболевания. Педиатрия 123 , e808–814 (2009).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 89

    Bath-Hextall, F. J., Birnie, A. J., Ravenscroft, J. C. & Williams, H. C. Вмешательства по снижению Staphylococcus aureus при лечении атопической экземы: обновленный Кокрановский обзор. Br. J. Dermatol. 163 , 12–26 (2010).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 90

    Берд, А.L. et al. Staphylococcus aureus и Staphylococcus epidermidis Разнообразие штаммов , лежащих в основе педиатрического атопического дерматита. Sci. Transl Med. 9 , eaal4651 (2017).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 91

    Kennedy, E. A. et al. Микробиом кожи до развития атопического дерматита: ранняя колонизация комменсальными стафилококками через 2 месяца связана с более низким риском атопического дерматита через 1 год. J. Allergy Clin. Иммунол. 139 , 166–172 (2017).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 92

    Chng, K. R. et al. Профилирование всего метагенома выявляет подверженность микробиома кожи к обострению атопического дерматита. Нат. Microbiol. 1 , 16106 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 93

    Ганский, И.и другие. Биоразнообразие окружающей среды, микробиота человека и аллергия взаимосвязаны. Proc. Natl Acad. Sci. США 109 , 8334–8339 (2012).

    Артикул
    PubMed

    Google ученый

  • 94

    Фирквист Н. и др. Виды Acinetobacter в микробиоте кожи защищают от аллергической сенсибилизации и воспаления. J. Allergy Clin. Иммунол. 134 , 1301–1309.e11 (2014).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 95

    Zeeuwen, P.L. et al. Грамположительные анаэробные кокки недостаточно представлены в микробиоме кожи человека с дефицитом филаггрина. J. Allergy Clin. Иммунол. 139 , 1368–1371 (2017).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 96

    Накамура Ю. и др. Staphylococcus дельта-токсин вызывает аллергические кожные заболевания, активируя тучные клетки. Природа 503 , 397–401 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 97

    Нибур, М.и другие. Альфа-токсин стафилококка является сильным индуктором интерлейкина-17 у человека. Заражение. Иммун. 79 , 1615–1622 (2011).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 98

    Kaesler, S. et al. Staphylococcus aureus Липотейхоевая кислота, производная , вызывает временный паралич Т-клеток независимо от Toll-подобного рецептора 2. J. Allergy Clin. Иммунол. 138 , 780–790.e6 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 99

    Zhang, L.J. et al. Кожные адипоциты защищают от инвазивной кожной инфекции Staphylococcus aureus . Наука 347 , 67–71 (2015).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 100

    Nakatsuji, T. et al. Золотистый стафилококк использует дефекты эпидермального барьера при атопическом дерматите для запуска экспрессии цитокинов. J. Invest. Дерматол. 136 , 2192–2200 (2016).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 101

    Кобаяши Т. и др. Дисбиоз и колонизация золотистого стафилококка вызывает воспаление при атопическом дерматите. Иммунитет 42 , 756–766 (2015). Это исследование демонстрирует, как преобладание S. aureus может вызывать воспаление кожи в животной модели с измененной целостностью барьера.

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 102

    Oh, J. et al. Измененный ландшафт микробиома кожи человека у пациентов с первичным иммунодефицитом. Genome Res. 23 , 2103–2114 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 103

    Smeekens, S.P. et al.Дисбаланс микробиома кожи у пациентов с дефектами STAT1 / STAT3 нарушает врожденные защитные реакции хозяина. J. Врожденный иммунитет. 6 , 253–262 (2014).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 104

    Chu, E. Y. et al. Кожные проявления синдрома дефицита DOCK8. Arch. Дерматол. 148 , 79–84 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 105

    Промперс, Л.и другие. Высокая распространенность ишемии, инфекции и серьезных сопутствующих заболеваний у пациентов с диабетической стопой в Европе. Исходные результаты исследования Eurodiale. Diabetologia 50 , 18–25 (2007).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 106

    Валенси, П., Жирод, И., Барон, Ф., Моро-Дефарж, Т. и Гийон, П. Качество жизни и клинические корреляты у пациентов с язвами диабетической стопы. Diabetes Metab. 31 , 263–271 (2005).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 107

    Ramsey, S. D. et al. Заболеваемость, исходы и стоимость язв стопы у пациентов с диабетом. Уход за диабетом 22 , 382–387 (1999).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 108

    Гарднер, С. Э., Хиллис, С.Л., Хейлманн, К., Сегре, Дж. А. и Грайс, Е. А. Микробиом нейропатической диабетической язвы стопы связан с клиническими факторами. Диабет 62 , 923–930 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 109

    Loesche, M. et al. Временная стабильность микробиоты хронической раны связана с плохим заживлением. J. Invest. Дерматол. 137 , 237–244 (2017).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 110

    Martinez, C. et al. Нестабильный состав фекальной микробиоты при язвенном колите в период клинической ремиссии. Am. J. Gastroenterol. 103 , 643–648 (2008).

    Артикул
    PubMed

    Google ученый

  • 111

    Kalan, L. et al. Новое определение микробиома хронических ран: грибковые сообщества распространены, динамичны и связаны с замедленным заживлением. мБио 7 , e01058-16 (2016).

    Артикул
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 112

    Korem, T. et al. Динамика роста микробиоты кишечника в условиях здоровья и болезней, полученная на основе единичных метагеномных образцов. Наука 349 , 1101–1106 (2015).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 113

    Сегре, Дж.А. Формирование эпидермального барьера и восстановление при кожных заболеваниях. J. Clin. Вкладывать деньги. 116 , 1150–1158 (2006).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 114

    Галло, Р. Л. и Хупер, Л. В. Эпителиальная антимикробная защита кожи и кишечника. Нат. Rev. Immunol. 12 , 503–516 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 115

    Kong, H.H. et al. Исследование микробиома кожи: метод безумия. J. Invest. Дерматол. 137 , 561–568 (2017).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 116

    Алексеев О.А. Бактериальный ландшафт кожи человека: лес за деревьями. Exp. Дерматол. 22 , 443–446 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 117

    Алексеев, О.A. & Jahns, A. C. Отбор проб и обнаружение кожи Propionibacterium acnes : текущее состояние. Анаэроб 18 , 479–483 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 118

    Grice, E.A. et al. Профиль разнообразия микробиоты кожи человека. Genome Res. 18 , 1043–1050 (2008).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 119

    Накацудзи, Т.и другие. Микробиом простирается до субэпидермальных отделов нормальной кожи. Нат. Commun. 4 , 1431 (2013).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 120

    Zeeuwen, P. L. et al. Динамика микробиома эпидермиса человека после нарушения кожного барьера. Genome Biol. 13 , R101 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 121

    Надь, И.и другие. Propionibacterium acnes и липополисахарид вызывают экспрессию антимикробных пептидов и провоспалительных цитокинов / хемокинов в себоцитах человека. Microbes Infect. 8 , 2195–2205 (2006).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 122

    Naik, S. et al. Взаимодействие комменсальных и дендритных клеток определяет уникальную защитную иммунную подпись кожи. Природа 520 , 104–108 (2015).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 123

    Naik, S. et al. Компартментарный контроль кожного иммунитета резидентными комменсалами. Наука 337 , 1115–1119 (2012). Это исследование показывает, что кожные комменсалы могут способствовать кожному адаптивному иммунитету к патогенам.

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 124

    Прабхудас, М.и другие. Проблемы детского иммунитета: последствия для ответа на инфекцию и вакцины. Нат. Иммунол. 12 , 189–194 (2011).

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 125

    Scharschmidt, T.C. et al. Волна регуляторных Т-клеток в коже новорожденного опосредует толерантность к комменсальным микробам. Иммунитет 43 , 1011–1021 (2015). Это исследование описывает, как FoxP3 + Т-клетки накапливаются в коже новорожденных и способствуют толерантности к комменсалам.

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 126

    Белкайд Ю. и Тамутунур С. Влияние кожных микроорганизмов на кожный иммунитет. Нат. Rev. Immunol. 16 , 353–366 (2016). Это заметный обзор роли различных микроорганизмов в обучении врожденных и адаптивных компонентов иммунной системы кожи.

    Артикул
    CAS
    PubMed

    Google ученый

  • 127

    Белкайд, Ю.И Харрисон, О. Дж. Гомеостатический иммунитет и микробиота. Иммунитет 46 , 562–576 (2017).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 128

    Hand, T. W. et al. Острая желудочно-кишечная инфекция вызывает долгоживущие Т-клеточные ответы, специфичные для микробиоты. Наука 337 , 1553–1556 (2012).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 129

    Отто, М. Staphylococcus epidermidis — «случайный» возбудитель. Нат. Rev. Microbiol. 7 , 555–567 (2009).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • 130

    Ньюэлл, Э. В. и Дэвис, М. М. За пределами модельных антигенов: высокоразмерные методы анализа антиген-специфических Т-клеток. Нат. Biotechnol. 32 , 149–157 (2014).

    Артикул
    CAS
    PubMed
    PubMed Central

    Google ученый

  • Сапрофит — обзор | Темы ScienceDirect

    4.65.7.2 Способы заражения и генетика устойчивости

    Fusarium culmorum выживает как сапрофит в почве или на растительных остатках как паразит, где гриб производит макроконидии, основной источник инокулята для болезней гнили ушей и гнили. Макроконидии откладываются на шелке кукурузы или соцветиях мелких зерновых злаков под воздействием ветра или дождя, а заражение происходит при прямом проникновении гиф в ткань растения или через устьица. Патоген также может передаваться системно через зараженные семена.Первоначальное распространение патогена на поверхности хозяина зависит от уровня влажности и температуры в месте заражения. Адгезия спор и образование зародышевых трубок оптимальны при 15 ° C.

    Макроконидии прорастают между 6 и 24 часами на внутренних поверхностях чешуек, чешуек, палеа и завязи пшеницы. Через два дня после инокуляции гриб образует плотную мицелиальную массу и проникающие гифы, которые непосредственно проникают в клетки эпидермиса. Гидролитическое разложение кутикулы, пектинов в средней ламелле и полисахаридов клеточной стенки на F.culmorum встречается в колосьях пшеницы. Кроме того, патоген откладывает неспецифические токсины хозяина, включая DON, NIV и ZEN, в ткани хозяина. ДОН является фитотоксичным и увеличивает серьезность болезней пшеницы и, возможно, кукурузы и ячменя. 5 Биосинтез DON индуцируется растительными полиаминами, ROS или осмотическим стрессом посредством передачи сигналов каскада MAPK. После проникновения в соцветия пшеницы гифы в течение короткого времени проводили биотрофный рост в межклеточных пространствах. Патоген распространяется внутри- и внутриклеточно в направлении узлов рахиллы / рахиса и колонизирует ткани сосудистой и корковой паренхимы.В конце концов, грибок поражает неинфицированные колючки. Колонизация происходит на шипах / ядрах, а также в эпидермальных клетках, на семенных оболочках и эпикутикулярных клетках.

    Токсин напрямую взаимодействует с мембранами растительных клеток, цитоплазматическими органеллами и рибосомальной пептидилтрансферазой (Rpl3), что приводит к гибели клеток. Во время колонизации грибами ДОН перемещается в соседние здоровые ткани из загрязненных тканей и вызывает повреждение клеток и высвобождение питательных веществ, включая аминокислоты, жирные кислоты, сахара и ионы, которые используются грибком и усиливают его распространение от шипа к позвоночнику. пшеница.

    После своего первоначального укоренения в кукурузном шелке, мицелий F. culmorum распространяется внутри и снаружи на шелк и растет к початкам, где он колонизирует ядра и межъядерные пространства.

    Fusarium culmorum также является случайным возбудителем коричневой гнили, корневой гнили и болезней проростков пшеницы и ячменя, особенно в районах с низким и средним количеством осадков. Заражение сеянцев может быть инициировано зараженными семенами или зараженными почвой инокулятами.В последнем случае гифы проникновения могут проникать через устьица на гипокотили и распространяться к корням, побегам и колеоптилям, где происходит колонизация паразитов, что может привести к гибели проростков.

    Растения используют физические и биохимические барьеры для сопротивления инфекции. Во время реакций болезни или резистентности происходит обширный перекрестный диалог между патогенами и компонентами растений. Устойчивость к F. culmorum проявляется по нескольким признакам. Были описаны пять типов устойчивости у пшеницы (типы I, II, III, IV и V) и два типа устойчивости у кукурузы (ядро и шелк). 6 Многочисленные компоненты и молекулярные механизмы, участвующие в устойчивости к F. culmorum индуцированной FHB или колосовой гнили, были идентифицированы на различных уровнях взаимодействия между патогеном и хозяином. Компоненты, участвующие в устойчивости к FHB / гнили ушей, могут быть предварительно сформированы или продуцированы конститутивно (фитоактивные вещества) или могут быть индуцированы при инфицировании патогеном и включают: ингибиторы прорастания спор, компоненты клеточной стенки, малые противогрибковые белки, а также пептиды и ферменты, которые ингибируют функцию грибов.

    Состав стенок растительных клеток играет важную роль в защитных механизмах, которые препятствуют проникновению грибов или распространению гиф (устойчивость типа I). В ответ на атаку патогена свойства клеточной стенки могут быть изменены за счет накопления каллозы, фенольных соединений, лигнинов или структурных белков, которые вносят вклад в защитный ответ. Тионины и богатые гидроксипролином гликопротеины (HRGP) накапливаются в устойчивой пшенице после инокуляции F. culmorum и локализуются на клеточных стенках инфицированных тканей.Накопление флавоноидов в семенниках ячменя подавляет распространение грибов и образование макроспор, а накопление бензоксазиноидов, феруловой кислоты и p -кумаровой кислоты выше у устойчивых / толерантных генотипов пшеницы. Анализы in vitro показали, что фенольные смолы блокируют рост грибов.

    Устойчивость к распространению болезни (устойчивость типа II) связана с отложением 1,3-бета-глюканов в пшенице из сосочков. Накопление белка PR наблюдалось после инокуляции пшеницы Triticum kiharae F.culmorum. Анализы in vitro с неочищенными экстрактами семян T. kiharae показали противогрибковую активность в отношении F. culmorum , что указывает на то, что этот вид может быть полезным источником для селекции устойчивости.

    Пуроиндолины, низкомолекулярные, богатые цистеином белки, содержащиеся в семенах пшеницы, взаимодействуют с клеточными стенками грибов и снижают рост грибков in vitro. . Сигнальные молекулы, JA и ET, передают связанные с защитой сообщения в дистальные части инфицированных тканей, что приводит к устойчивости широкого спектра против некротрофных патогенов.В Arabidopsis два основных гена устойчивости широкого спектра ( NRP1 и EDS11 ) обеспечивают устойчивость цветков против F. culmorum и снижают накопление ДОН. Добавление этрела (предшественник ET) подавляло рост, споруляцию и прорастание спор в семенах пшеницы F. culmorum .

    Токсины, продуцируемые F. culmorum (в основном ДОН, НИВ и ЗЕН) во время патогенеза, оказывают цитотоксическое действие на растения, людей и животных.ДОН — это фактор вирулентности заболевания FHB, приводящий к усилению роста грибков. 7 Выращивание устойчивых к токсинам сельскохозяйственных культур с детоксикационными возможностями — это стратегии повышения устойчивости к F. culmorum . В пшенице, кукурузе и ячмене существуют различные механизмы снижения количества токсинов, включая конъюгацию с глюкозой и вмешательство в биосинтез токсинов. Поскольку синтез трихотецена включает ряд реакций оксигенации, различные вторичные метаболиты растительного происхождения с антиоксидантной активностью, такие как фенольные соединения и каротиноиды, могут снижать накопление токсинов.Другие механизмы восстановления / детоксикации трихотецена, такие как ацетилирование, отток и деэпоксидирование, не были обнаружены в злаках, но были описаны у других организмов. Некоторые из этих генов были выделены и экспрессированы в злаках для снижения уровня токсинов.

    Взаимодействия хозяина и микробиоты: от теории холобионтов к анализу | Microbiome

  • 1.

    McFall-Ngai M, Hadfield MG, Bosch TCG, Carey HV, Domazet-Lošo T., Douglas AE, Dubilier N, Eberl G, Fukami T., Gilbert SF, et al.Животные в бактериальном мире — новый императив для наук о жизни. Труды Национальной академии наук. 2013. 110 (9): 3229–36.

    CAS
    Статья

    Google ученый

  • 2.

    Фостер К.Р., Шлютер Дж., Койт К.З., Ракофф-Нахум С. Эволюция микробиома хозяина как экосистемы на привязи. Природа. 2017; 548: 43.

    CAS
    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 3.

    Selosse M-A, Bessis A, Pozo MJ. Микробное праймирование иммунитета растений и животных: симбионты как сигналы развития. Trends Microbiol. 2014; 22 (11): 607–13.

    CAS
    PubMed
    Статья

    Google ученый

  • 4.

    Bordenstein SR, Theis KR. Биология хозяина в свете микробиома: десять принципов голобионтов и гологеномов. Plos Biology. 2015; 13 (8): e1002226.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 5.

    Faure D, Simon JC, Heulin T. Holobiont: концептуальная основа для изучения экоэволюционных и функциональных последствий взаимодействия хозяина и микробиоты во всех экосистемах. Новый фитолог. 2018; 218: 1321–4.

    PubMed
    Статья

    Google ученый

  • 6.

    Маргулис Л. Симбиоз как источник эволюционных инноваций: видообразование и морфогенез. В: Cambridge MA MLFR, редактор. Симбиогенез и симбионтизм: MIT Press; 1991 г.п. 1–14.

  • 7.

    Розенберг Э., Корен О., Решеф Л., Эфрони Р., Зильбер-Розенберг И. Роль микроорганизмов в здоровье, болезнях и эволюции кораллов. Обзоры природы микробиологии. 2007; 5: 355.

    CAS
    PubMed
    Статья

    Google ученый

  • 8.

    Зильбер-Розенберг И., Розенберг Э. Роль микроорганизмов в эволюции животных и растений: теория эволюции гологенома. FEMS Microbiol Rev.2008; 32 (5): 723–35.

    CAS
    PubMed
    Статья

    Google ученый

  • 9.

    Хаттенхауэр С., Геверс Д., Найт Р., Абубукер С., Бэджер Дж. Х., Чинвалла А. Т., Кризи Х. Х., Эрл А. М., Фитцджеральд М. Г., Фултон Р. С. и др. Структура, функции и разнообразие микробиома здорового человека. Природа. 2012. 486 (7402): 207–14.

    CAS
    Статья

    Google ученый

  • 10.

    Ллойд-Прайс Дж., Абу-Али Дж., Хаттенхауэр К.Здоровый микробиом человека. Genome Med. 2016; 8 (1): 51.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 11.

    Egerton FN. История экологических наук, часть 52: Исследования симбиоза. Bull Ecol Soc Am. 2015; 96 (1): 80–139.

    Артикул

    Google ученый

  • 12.

    Хартманн А., Ротбаллер М., Шмид М. Лоренц Хилтнер, пионер в исследованиях микробной экологии ризосферы и бактериологии почвы.Почва растений. 2008. 312 (1): 7–14.

    CAS
    Статья

    Google ученый

  • 13.

    Сапп Дж. Пол Бюхнер (1886–1978) и наследственный симбиоз у насекомых. Int Microbiol. 2002. 5 (3): 145–50.

    PubMed
    Статья

    Google ученый

  • 14.

    Сегата Н. На пути к разрешенной деформации сравнительной метагеномики. mSystems. 2018; 3 (2): e00190–17.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 15.

    Guyomar C, Legeai F, Jousselin E, Mougel C, Lemaitre C, Simon JC. Многоуровневая характеристика разнообразия симбионтов в комплексе гороховой тли с помощью метагеномных подходов. Микробиом. 2018; 6 (1): 181.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 16.

    Менг А., Марше С., Корре Е., Петерлонго П., Альберти А., Да Силва С., Винкер П., Пеллетье Е., Проберт И., Деселле Дж. И др. Подход de novo к разделению идентичности и функции партнера в системах холобионтов.Микробиом. 2018; 6 (1): 105.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 17.

    Янг Э., Кэри М., Мехарг А.А., Мехарг С. Микробиом и экотипическая адаптация Holcus lanatus (L.) к экстремальным значениям рН почвы, исследованные с помощью секвенирования транскриптома. Микробиом. 2018; 6 (1): 48.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 18.

    Cregger MA, Veach AM, Yang ZK, Crouch MJ, Vilgalys R, Tuskan GA, Schadt CW. Холобионт Populus: анализ влияния растительных ниш и генотипа на микробиом. Микробиом. 2018; 6 (1): 31.

    CAS
    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 19.

    Калленс М., Ватанабе Х., Като Ю., Миура Дж., Декастекер Э. Состав посевного материала микробиоты влияет на сборку холобионтов и рост хозяев в дафнии. Микробиом.2018; 6 (1): 56.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 20.

    Бренер-Раффалли К., Клерисси К., Видаль-Дюпиол Дж., Аджеруд М., Бономм Ф., Пратлонг М., Аурель Д., Митта Дж., Тулза Е. Температурный режим и клады хозяев, а не география, движут Симбиодиний и бактериальные сообщества в склерактиниевом коралле Pocillopora damicornis sensu lato. Микробиом. 2018; 6 (1): 39.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 21.

    Ваннье Н., Мони К., Биттебьер А.К., Мишон-Кудуэль С., Бигет М., Ванденкоорнхейз П. Путешествие микроорганизмов между поколениями растений. Микробиом. 2018; 6 (1): 79.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 22.

    van de Water JAJM, Allemand D, Ferrier-Pagès C. Взаимодействия хозяина-микроба у октокоральных голобионтов — последние достижения и перспективы. Микробиом. 2018; 6 (1): 64.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 23.

    Sorek M, Schnytzer Y, Ben-Asher HW, Caspi VC, Chen C-S, Miller DJ, Levy O. Задавая темп: ритмическое поведение хозяина и паттерны экспрессии генов в факультативно симбиотической книдарии Aiptasia в значительной степени определяются Symbiodinium. Микробиом. 2018; 6 (1): 83.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 24.

    Пита Л., Рикс Л., Слаби Б.М., Франке А., Хентшель У. Губчатый холобионт в меняющемся океане: от микробов до экосистем.Микробиом. 2018; 6 (1): 46.

    CAS
    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 25.

    Раванбахш М., Сасидхаран Р., Военек LACJ, Ковальчук Г.А., Жуссет А. Микробная модуляция передачи сигналов этилена в растениях: экологические и эволюционные последствия. Микробиом. 2018; 6 (1): 52.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 26.

    Геган М., Зуаш К., Демишель С., Минар Дж., Тран Ван В., Потье П., Мавингуи П., Валиенте Моро К.Комариный холобионт: свежий взгляд на взаимодействие комаров и микробиоты. Микробиом. 2018; 6 (1): 49.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 27.

    Бредон М., Диттмер Дж., Ноэль К., Мумен Б., Бушон Д. Деградация лигноцеллюлозы на уровне холобионта: совместная работа у ключевого почвенного беспозвоночного. Микробиом. 2018; 6 (1): 162.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 28.

    ван де Гухте М., Блоттьер Х.М., Доре Дж. Люди как холобионты: значение для профилактики и лечения. Микробиом. 2018; 6 (1): 81.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 29.

    Броберг М., Дунан Дж., Мундт Ф., Денман С., Макдональд Дж. Комплексный многомерный анализ взаимодействий хозяина и микробиоты при остром упадке дуба. Микробиом. 2018; 6 (1): 21.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 30.

    Хассани М.А., Дуран П., Хаккард С. Микробные взаимодействия внутри холобионта растения. Микробиом. 2018; 6 (1): 58.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 31.

    Моран Н.А., Слоан Д.Б. Концепция гологенома: полезная или пустая? PLOS Биология. 2015; 13 (12): e1002311.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 32.

    Дуглас А.Е., Веррен Дж. Х.Дыры в хологеноме: почему симбиоз хозяин-микроб не холобионты. mBio. 2016; 7 (2): e02099–15.

    CAS
    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 33.

    Розенберг Э., Зильбер-Розенберг И. Концепция эволюции гологенома через 10 лет. Микробиом. 2018; 6 (1): 78.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 34.

    Ситараман Р.Прокариотический горизонтальный перенос генов в человеческом холобионте: эколого-эволюционные выводы, последствия и возможности. Микробиом. 2018; 6 (1): 163.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 35.

    Перес-Харамильо Дж. Э., Каррион В. Дж., Де Холландер М., Рааймакерс Дж. М.. Дикая сторона микробиомов растений. Микробиом. 2018; 6 (1): 143.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 36.

    Севеллек М., Дером Н., Бернатчез Л. Холобионты и экологическое видообразование: кишечная микробиота пар озерных сигов. Микробиом. 2018; 6 (1): 47.

    PubMed
    PubMed Central
    Статья

    Google ученый

  • 37.

    Brucker RM, Bordenstein SR. Видообразование путем симбиоза. Тенденции в экологии и эволюции. 2012. 27 (8): 443–51.

    Артикул

    Google ученый

  • 38.

    Вавре Ф, Кремер Н. Влияние микробов на эволюционную диверсификацию насекомых: от паттернов к механизмам. Curr Opin Insect Sci. 2014; 4 (Приложение C): 29–34.

    PubMed
    Статья

    Google ученый

  • Я проанализировал бактерии в кишечнике. И это может быть будущее медицины | Microbiology

    Все мы знакомы с «внутренними чувствами», «кишечными реакциями» и «внутренними инстинктами», но насколько мы действительно знаем или заботимся о своем кишечнике? По мере того, как мы все больше осознаем, что кладем в желудок, поразительно, насколько мы остаемся в неведении относительно того, что происходит в нашем кишечнике.И оказывается, там очень много всего происходит.

    Микробиологи добились поразительных успехов в раскрытии наших сокровенных секретов. Оказывается, глубоко внутри нас существует сложная экосистема, в которой обитает фантастическое разнообразие форм жизни, из которых очень мало принадлежит нашему виду.

    Большинству из нас, подозрительных к инородным телам, трудно понять, что в самой своей сути мы меньше — или, скорее, намного больше — люди. Но на самом деле в кишечнике живет около 100 триллионов организмов.Если сложить их все вместе, они будут размером с футбольный мяч. Что касается клеток, то количество микробов превышает число человеческих собратьев примерно в три раза. Что касается генов, микробное преимущество составляет примерно 300 к одному.

    Это означает, что существует огромное количество нас, которые, так сказать, не являются нами. Это поднимает целый ряд интересных философских и анатомических вопросов, из которых наиболее актуальным может быть: стоит ли нам беспокоиться?

    Ну, я не особо беспокоился о бактериях, пока не проверил содержимое кишечника.Я довольно спокойно относился к тому, что до тех пор, пока уборная регулярно отбеливалась, я чистил зубы и содержал кухонные поверхности в достаточной чистоте, тогда мне не приходилось слишком много думать о том, что происходит на микробном уровне. Но нет ничего лучше, чем погрузить свои фекалии в контейнер из плексигласа, чтобы заставить вас остановиться и задуматься о том, чем мы полны. Именно с этой неприятной задачей я столкнулся в октябре прошлого года, когда собрал образец стула для отправки в холодном виде в Институт бионаук при Университетском колледже Корка в Ирландии.

    Институт является одним из ведущих европейских центров по изучению того, что сейчас называется микробиомом, то есть всех бактерий, вирусов, грибов, архей и эукариот, населяющих человеческое тело, внутри и снаружи. Упрощенный взгляд на этих гостей традиционно был сосредоточен на их паразитарных или патогенных аспектах. Либо они довольно безобидно проехались на машине бесплатно, либо были прямой угрозой для хозяина.

    Но в последнее время эта огромная армия микробов рассматривается как жизненно важный компонент в обеспечении и поддержании здоровья человека.Микробиом настолько важен, что теперь он рассматривается учеными как отдельный орган со своей собственной динамической метаболической активностью. Но что именно это за деятельность и все ли это будет планироваться вместе со мной?

    Пол О’Тул — профессор Центра пищевой фармакологии, который является частью Института бионаук в Корке. Увлеченный марафонец, он выглядит так, будто знает кое-что о стойкости кишечника. Он координировал финансируемое государством исследование, запущенное незадолго до краха ирландской экономики, под названием Eldermet, которое было направлено на то, чтобы помочь пищевой промышленности Ирландии разрабатывать продукты питания для пожилых людей.Для этого им нужна была база знаний о микробиоте кишечника. Поэтому О’Тул начал изучать, как диета влияет на микробиоту пожилого населения Ирландии.

    В его карьере есть элемент браконьера, превратившегося в егеря, потому что он начинал как бактериальный враг. «Я провел около 15 лет, работая с патогенами, которых вы пытаетесь убить», — говорит он мне в своем офисе. «Я защитил докторскую диссертацию по стафилококку. Один организм, один ген. Я работал над состоянием, называемым синдромом ошпаренной кожи, при котором стафилококки заражают пупочную культю, и если они производят токсин, вся кожа ребенка отслаивается.»

    От борьбы со стафилококками он перешел на пробиотики — организмы, которые должны быть полезны для нас, — которые в коммерческой форме разливали в капсулы и йогурты и рекламировали широкой публике как» дружественные бактерии «. Но он обнаружил, что он сам не мог эффективно изучать пробиотики изолированно, потому что их польза часто была косвенной.

    «Я понял, что мне нужно изучить всю картину, — говорит он. начинает становиться предметом интенсивных биомедицинских исследований.

    Есть две лаборатории, объясняет О’Тул, которые обрабатывали мой образец. Первой была лаборатория мокрого типа, где в результате различных молекулярных атак была извлечена ДНК, 95% которой были бактериальными. Затем это было отправлено внешней компании для секвенирования — было более 30 000 последовательностей — а затем огромный файл данных был обработан тем, что О’Тул назвал «кучкой компьютерных ботаников, которые сидят весь день и генерируют статистику» в институте. лаборатория данных.

    Всего год назад этот процесс стоил более 400 фунтов стерлингов.Теперь это можно сделать всего за 15 фунтов стерлингов. В результате вы получите пару круговых диаграмм, в которых перечислены микробиоты кишечника на разных филогенетических уровнях, а также повествовательное объяснение их значения. Филогенетические уровни в данном случае просто относятся к разным уровням разрешения.

    В самом широком смысле, на уровне филума, моя микробиота, как и все остальные, преобладала двух типов: фирмикуты и бактероиды. Западная диета, под которой мы обычно подразумеваем североамериканскую диету, богата жирами и белками.В этой диете бактероиды обычно составляют более 55% микробиоты кишечника, а иногда и 80% в самой Северной Америке. В Европе средние цифры варьируются от страны к стране. В моем случае у меня было 34%.

    Противоположностью североамериканской диете является то, что О’Тул называет «естественной диетой». «Наши предшественники на равнинах Африки не жевали гамбургеры», — объясняет он. «Они бегали вокруг, ели растительную пищу и листья, а иногда и белку, если им повезло.»

    На растительной диете микробиота склоняется в пользу другого основного типа, фирмикутов. Некоторые сложные углеводы в растениях не могут усваиваться одним нашим телом. Они должны расщепляться кишечной микробиотой, которые производят ферменты, которые расщепляют длинные цепи и сбраживают их в короткоцепочечные жирные кислоты, такие как бутират, производимый исключительно бактериями, ацетат и пропионат.

    Эти жирные кислоты полезны для организма. Бутират, например, обеспечивает источник энергии, к которому клетки нашего кишечника могут получить прямой доступ.Он также контролирует пролиферацию клеток в кишечнике и, как полагают, обладает антиканцерогенными свойствами. Все это означало, что моя оценка в 51% фирмикутов была хорошим знаком.

    Если посмотреть на уровень родов, который предлагает более детальное рассмотрение моего микробного состава, хорошие новости продолжаются. У меня было в три раза больше розбурии, продуцирующей бутират, чем у здоровой когорты, использованной в исследовании О’Тула. Гораздо больше лачноспир, чем обычно, но гораздо меньше бактероидов (не путать с бактероидетами) и алистипов — как выразился О’Тул, выражаясь более научными терминами, «ублюдок всех».

    И снова положительные результаты. Lachnospira разлагают пектины и ферментируют пищевые волокна, и у меня их в три раза больше, чем обычно. Бактероиды часто ассоциируются с диетами, основанными на мясе, с высоким содержанием белка и высоким содержанием жиров, точно так же, как алистипы чаще встречаются у людей, которые едят меньше растительной пищи. В целом это означало, что мое чутье — несмотря на отсутствие шести кубиков — вероятно, в хорошей форме. Конечно, это не то, чем можно похвастаться на званых обедах. «У меня намного больше, чем в среднем, количество лачноспиры» — вряд ли разговорный прием, который впечатлит немикробиологов, даже если вам удастся правильно произнести это слово.Но точно так же, как мы теперь знаем, что высокого холестерина следует избегать, так же скоро мы можем начать осознавать, какие виды бактерий являются маркерами хорошего здоровья, особенно с учетом снижения стоимости тестирования.

    Однако были один или два результата, которые О’Тул пытался понять. В частности, мой высокий уровень natranaerobius, рода бактерий, которые процветают в высокощелочной среде с высоким содержанием соли. Я ела много суши? Нет, хотя я люблю рыбу, я предпочитаю ее приготовить.Я приготовил много рыбы? Не чаще одного раза в неделю.

    Хотя он не нашел ничего зловещего в натранаэробиусе, его обеспокоило то, что он не мог понять причину его изобилия в моем кишечнике. Но к тому времени ему удалось сделать слепой прогноз относительно моей диеты, который оказался невероятно точным. Он видел очень мало свидетельств мясоедения — я не ел мяса 30 лет. Но было много доказательств высокого содержания клетчатки, что хорошо, потому что клетчаткой питаются бактерии. Если мы не кормим бактерии, они питаются нами, особенно слизистой оболочкой толстого кишечника.Были также свидетельства наличия большого количества рыбы и большого количества овощей. Все это в точности соответствует моей диете.

    Я полагаю, что его предсказание так верно, должно быть, приятно.

    «Это немного жутковато, — соглашается он. «Но это заставило меня задуматься о пользе этого. Я имею в виду, что рассказывать людям, что они едят, не особо полезно».

    О’Тул интересуется диагностическим потенциалом микробиома. «Мы могли бы, вероятно, предположить, что ваши воспалительные параметры,» говорит он, фиксируя меня с одним из тех выражений, в которых специализируется GP, когда отрываясь от изучения ваших медицинских заметок: нейтральное, неуступчивого и тревогой-индуцирующей.Я не только не знаю, каковы мои воспалительные параметры, я не знаю, что означают воспалительные параметры.

    О’Тул объясняет, что между микробиотой кишечника и воспалением, саркопенией и когнитивной функцией была установлена ​​значительная связь.

    «Воспаление, — говорит он, — это не опухоль большого пальца. Воспаление означает, насколько активирована ваша иммунная система. Я предполагаю, что ваши воспалительные маркеры находятся на исходном уровне. Плоские. У пожилых людей это не так. Иммунная система обычно включена, и это плохо, потому что, если она включена, когда они заболевают зимним гриппом, вся их энергия тратится на погоню за призраками.Итак, вы хотите уменьшить воспаление ».

    Саркопения означает потерю мышечной массы. Это происходит по мере того, как мы стареем, потому что организм становится менее эффективным в превращении белка в мышцы, поэтому пожилым людям нужно иметь больше белка». считают, что сужение кишечных бактерий у пожилых людей делает кишечник менее эффективным для поглощения белков «, — говорит О’Тул.

    Когнитивная функция частично связана с тем, что известно как ось мозг-кишечник. мучения »и« интуиция »предполагают, что действительно существует тесная связь между мозгом и кишечником.Наш кишечник остро реагирует на изменения в наших эмоциях и психическом состоянии. Но это улица с двусторонним движением: исследования показывают, что наш мозг и эмоции также чувствительны к тому, что происходит в нашем кишечнике.

    Обычно когнитивные функции с возрастом снижаются медленно, но в некоторых случаях могут быстро ускориться.

    «Существуют физиологические причины, такие как болезнь Альцгеймера и старческое слабоумие, которые объясняют быстрое когнитивное нарушение», — говорит О’Тул. «Но на скорость потери также могут влиять соединения, производимые бактериями, и это то, к чему мы стремимся.Бактерии производят химические вещества, которые являются аналогами — другими словами, они выглядят идентичными нормальным передатчикам человека. Мы надеемся, что сможем улучшить способность пожилых людей обрабатывать данные ».

    Общим для всех этих проблем, особенно среди пожилых людей, является сужение кишечной микробиоты, которое, в свою очередь, обычно является результатом сужения О’Тул неоднократно подчеркивал этот момент.

    «Разнообразие — ключ к успеху. То, что мы видим у людей, соблюдающих узкое разнообразие диет, — это коллапс микробиоты.Хорошей аналогией может служить экосистема, подобная тропическому лесу, где взаимодействует множество растений и животных. Он эволюционировал в течение десятков тысяч лет, затем вырубается один из ключевых видов, дерево, и наступает экологический коллапс.

    «И если у вас был джентльмен, чья жена умерла, и она все готовила, а затем он внезапно ест тосты и мармелад, разнообразие кишечной микробиоты исчезнет — потому что разнообразие диеты коррелирует с разнообразием микробиоты — и вы это сделаете. получить ряд связанных с этим проблем со здоровьем.

    Далее он говорит мне, что мое микробное разнообразие впечатляюще велико и что, в качестве резюме, он мог бы предположить, что моя диета «чертовски хороша». Забудьте о диете 5-2, я внезапно чувствую, что пишу книга-бестселлер по диете под названием « Кишки: микробиологическое руководство по здоровому питанию» . В определенном смысле, конечно, это не большое достижение. Исследования показывают, что изменение диеты занимает лишь короткое время, чтобы резко изменить микробиоту, хотя она возвращается обратно так же быстро, как только отказ от диеты.

    Но эта внешне поверхностная связь между пищей и микробами на самом деле довольно глубокая, потому что сначала она говорит о совместной эволюции с человеческим телом на протяжении десятков тысяч лет. Как и все организмы и виды, люди эволюционировали, чтобы иметь определенные отношения с определенным набором микробов.

    На Земле существуют сотни тысяч видов микробов, но только около тысячи из них имеют связь с людьми. Таким образом, во-вторых, это говорит о том, что нам нужно перестать думать о себе как о сущностях, отдельных от микробов, колонизировавших наши тела.

    «Мы прошли период медицины, когда мы разработали антибиотики», — говорит О’Тул. «До Второй мировой войны мы умирали от таких глупостей, как пневмония и галопирующая сепсис из небольшой раны. Так что антибиотики имели большой успех. патогены. Но теперь у нас есть более разумное понимание людей как химер ».

    Жизнь без микробов была бы несчастливой. Тесты показали, что мышь, выращенная в лаборатории, лишенной бактерий, не может развить надлежащую иммунную систему или эффективную пищеварительную систему.Чтобы извлечь калории, ему нужно потреблять намного больше еды. Люди впервые заселяются микробами во время рождения. Затем через грудное молоко, которое содержит как пробиотики (полезные микробы), так и пребиотики (соединения, которые способствуют росту пробиотиков).

    «Имеются убедительные доказательства, — говорит О’Тул, — что взрыв аутоиммунных заболеваний и заболеваний, связанных с нарушением иммунной регуляции, в западном обществе может быть вызван подавлением кишечных бактерий с младенчества и далее.

    « Иммунная система у младенцев » вероятно, учат различать «я» и «не-я» в контексте бактерий.В публикации Nature есть две недавние статьи, в которых показано, что бутират важен для включения регуляторных Т-клеток, ветви иммунных клеток, которые контролируют процессы, участвующие в воспалительном заболевании кишечника и синдроме раздраженного кишечника ».

    Это занимает около двух лет. от рождения через процесс отбора ребенка для достижения зрелого микробиома. Есть несколько явлений, которые могут способствовать уменьшению микробов в детстве. Одним из них является увеличение числа случаев кесарева сечения.

    «Младенцы, которые ранее были колонизированы в родовых путях микробиотой своей матери, теперь имеют микробиоту кишечника, которая больше похожа на стенки больницы, чем на микробиоту влагалища матери».

    Другая проблема — недостаток грудного молока, и третья — увеличение использования антибиотиков. О’Тул говорит, что одно исследование показывает, что повторное использование антибиотиков склоняет микробиоту к той, которая способствует ожирению. На самом деле, по всему миру существует множество исследований, которые все еще находятся в зачаточном состоянии, но которые указывают на взаимосвязь между микробиотой и такими разнообразными заболеваниями и жалобами, как синдром раздраженного кишечника, воспалительные заболевания кишечника, диабет второго типа, болезнь Паркинсона, болезнь Альцгеймера, аутизм, депрессия. , сердечно-сосудистые заболевания и рак толстой кишки.

    Но пока ни одно из этих утверждений не является окончательным, а многое является предположительным. После первоначальных заявлений о потенциальной пользе исследований микробиома для здоровья — тех, которые, как правило, помогают финансировать — возникла небольшая скептическая реакция.

    В нескольких статьях указывалось, что было много преувеличений, но недостаточно существа. И пока медики не торопятся выпускать специалистов по микробиому.

    «Медицина, как известно, медленно принимает новые идеи, — говорит О’Тул.Он цитирует случай Барри Маршалла, австралийского врача, утверждение которого об установлении бактериальной причины пептических язв и рака желудка было всесторонне высмеяно медицинским истеблишментом в 1980-х годах. «Примерно 20 лет спустя он получил Нобелевскую премию».

    Проблема, по его словам, в том, что микробиологи очень хорошо умеют обнаруживать кишечные бактерии и определять, какую роль они могут играть, но они медленно разрабатывают механизмы для установления прочных причинно-следственных связей и практического применения.

    «Я лично надеюсь, что это не станет решением для всего, потому что это не будет правдоподобным, это просто неправда. Существует множество доказательств того, что большинство основных болезней человека имеют физиологическую основу или образ жизни, но в некоторых случаях это возможно. те, что микробиота кишечника является модулирующим фактором, который способствует общему риску ».

    Прямо сейчас О’Тул хотел бы уменьшить низкое разнообразие микробиоты у пожилых людей с помощью пищевых добавок. «Но мы обеспокоены тем, что, как заявляет Всемирный фонд дикой природы, исчезновение может быть навсегда.Что, если у пожилого человека отсутствует особенно полезная бактерия, мы не сможем вернуть ее с помощью одной диеты ».

    Решением в этом случае может быть трансплантация фекальной микробиоты, которую О’Тул услужливо разъясняет, — идея пересадить чужой фекалий реципиенту «. Что аккуратно возвращает нас к тому, с чего я начал. Если сбор собственных экскрементов противоречит интуиции, то инъекция их кому-то другому противоречит всем приличным человеческим инстинктам. в Северной Америке и О’Тул предполагает, что такие трансплантаты могут помочь предотвратить изъязвление толстой кишки — состояние, которое чуть не убило моего отца несколько лет назад.В конце концов, все сводится к тому, что вы вставляете и вынимаете. И в этом неутомимом жизненном цикле мы не должны ужасаться, если даже наши отходы не пойдут впустую.

    Обратите внимание: Институт бионаук не может предложить индивидуальный анализ и сделал это только для целей этой статьи.

    МИКРОБИОТА КОЖИ И ТЕСТИРОВАНИЕ КОСМЕТИКИ, проведенное Skinobs через Teknoscienze • Skinobs, Косметическое тестирование

    С момента открытия кишечной микробиоты возник вопрос микробиоты кожи (микроорганизмов, бактерий, вирусов, грибов, дрожжей). под каждой губой.В нашем теле живут 100 триллионов бактерий, и каждый хочет узнать больше о влиянии косметики на экосистему кожных бактерий и о том, как эти явления можно измерить?

    Обычно микрофлору делят на 2 группы:

    • преходящая флора , сапрофитные и патогенные микроорганизмы с Staphylococcus, aureus, Escherichia coli, Pseudomonas aeruginosa и виды Bacillus…
    • Резидентная флора, патогенных и комменсальных микроорганизмов с Proteobacteria, epidermidis, S.hominis Propionibacterium, Corynebacterium, Dermabacter, Brevibacterium, Micrococcus, P. aeruginosa, Pityrosporum, Malassezia, Demodex…

    Эта бактериальная экосистема синтезирует множество элементов, которые имеют важную метаболическую активность для здоровья нашей кожи. Может понадобиться , чтобы защитить, сбалансировать и активировать его на косметической стороне. Проще говоря, цель личной гигиены — уменьшить количество «плохих» бактерий и защитить «хорошие»! Но понятия «плохо» или «хорошо» относительны в зависимости от физиологического состояния кожи.Теперь все не так просто!

    Баланс кожной микрофлоры (500 видов бактерий) зависит от нескольких условий ее экосистемы: температуры, pH, гормонов, света, ультрафиолета, липидов, белков, воды…
    На него в основном влияют генетика, образ жизни и диета. Каждый человек имеет свой собственный состав кожной флоры, распределенный от эпидермиса до дермы, который на протяжении всей жизни качественно стабилен, как личный микробный след . Эта микрофлора кожи имеет фундаментальное значение для гомеостаза кожи и участвует в иммунных и барьерных функциях.

    Различные бактериальные заболевания могут рассматриваться как источник кожных дисфункций, таких как акне, экзема или атопический дерматит, изменяя этот драгоценный баланс.

    Косметика ищет 3 основных преимущества:

    • ребалансировка,
    • похожий на пробиотик
    • антимикробное действие.

    Является ли микробиот эпохи новой революцией в косметике?

    В настоящее время подход к поддержке этой косметической деятельности все еще находится на начальной стадии.Многие испытательные лаборатории изучают эти новые заявления в направлении метагеномной области. Изучение кожной флоры является сложным, и не всегда легко понять ее функции и взаимодействие с метаболизмом кожи. Первый способ — проанализировать геном бактерий кожной флоры. Это живой слой кожи, который можно открыть как новый континент тела.

    Какие методы существуют сегодня для оценки микробиоты кожи благодаря тестированию на людях?

    Поскольку важное внутрииндивидуальное разнообразие кожной флоры также связано с высоким уровнем межиндивидуальной вариабельности, протоколы будут сравнивать мазки с кожи обработанной зоны и необработанной зоны или зоны плацебо до и после лечения. .Есть возможность оценить баланс изменений. Чтобы углубиться в эту объективацию, можно также изучить микробиот и кожу одновременно и исследовать, какие функции и метаболические пути затронуты.

    Две основные возможности диагностики:

    1. Метод подсчета на уровне клеток , Zurko Research, Bio-ec

    2. Количественные методы на молекулярном уровне

    Анализы позволяют проводить таксономический анализ бактерий, определяя, какие бактерии можно найти.Затем геном бактерий, чтобы лучше узнать их действие. Теперь известна основная часть кожных бактерий.

    • ПЦР по Phylogene
    • рРНК, Dermscan, Dermatec, Intertek, Bio-ec…
    • S16 рДНК + ITS секвенирование: микробиоты + грибы, индекс бактериального разнообразия по Dermatec, Phylogene, Intertek, Inra geT-IT.
    • Масс-спектрометрия: Cosmepar, Spincontrol…
    • Нано ЖХ-МС / МС высокого разрешения от Phylogene, Dermatec, Intertek.
    • Многокомпонентный подход (оценка механизмов) от Phylogene, Oxiproteomics.

    Микробиота будет играть ключевую роль в косметике завтрашнего дня. Мы переходим к персонализированной и профилактической косметике. Обоснование претензий будет развиваться вместе с регулированием и развитием продуктов. Мы должны помнить о разнообразии и балансе кожной флоры при будущих разработках активных веществ и средств личной гигиены. Может быть, однажды нам стоит измерить их влияние на микробиоту, прежде чем выпускать продукты на рынок.

    Полная статья

    Подробнее…

    Skinobs Poster-Boost Your test 2018.Тестирование микробиотов.VDEF Skinobs Poster-Boost Your test 2018. Microbiote Context.VDEF

    Skinobs Poster-Boost Your test 2018. Тестирование микробиотов. VDEF

    Легко находите методы и CRO, которые подтверждают утверждения вашего продукта

    База данных Skinobs и бесплатное подключение: skinobs.com

    Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности. Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.


    Настройка вашего браузера для приема файлов cookie

    Существует множество причин, по которым cookie не может быть установлен правильно. Ниже приведены наиболее частые причины:

    • В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки своего браузера, чтобы он принимал файлы cookie, или чтобы спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
    • Ваш браузер спрашивает вас, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались.
      Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, используйте кнопку «Назад» и примите файлы cookie.
    • Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Если вы подозреваете это, попробуйте другой браузер.
    • Дата на вашем компьютере в прошлом. Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г.,
      браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы исправить это, установите правильное время и дату на своем компьютере.
    • Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie.
      Вы должны отключить приложение при входе в систему или уточнить у системного администратора.

    Почему этому сайту требуются файлы cookie?

    Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу. Чтобы предоставить доступ без файлов cookie
    потребует, чтобы сайт создавал новый сеанс для каждой посещаемой страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.


    Что сохраняется в файле cookie?

    Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в cookie; никакая другая информация не фиксируется.

    Как правило, в файле cookie может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта. Например, сайт
    не может определить ваше имя электронной почты, пока вы не введете его.

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *